Integrin alfa-5

Integrin alfa-5
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolITGA5  ; CD49e; FNRA; VLA5A
Eksterne ID'erOMIM:  135620 MGI :  96604 HomoloGene :  20508 ChEMBL : 3955 GeneCards : ITGA5 Gen
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez367816402
EnsembleENSG00000161638ENSMUSG00000000555
UniProtP08648P11688
RefSeq (mRNA)NM_002205NM_010577
RefSeq (protein)NP_002196NP_034707
Locus (UCSC)Chr 12:
54,79 – 54,81 Mb
Chr 15:
103,34 – 103,37 Mb
Søg i PubMed[en][2]


Integrin alpha-5 (α5, CD49e ) er et membranprotein , et glycoprotein fra integrin - superfamilien , et produkt af ITGA5 -genet , en alfa-underenhed af integrinet α5β1 ( VLA-5 ), en af ​​de vigtigste fibronectin -receptorer . Spiller en rolle i intercellulære interaktioner.

Funktioner

Integrin alpha-5/ beta-1 (α5β1, engelsk  meget sent antigen-5 , VLA-5 ) er en receptor for fibronectin og fibrinogen . Genkender den specifikke aminosyresekvens glycin-prolin-arginin (RGD) i en lang række ligander. Under HIV-infektion øger interaktion med det virale Tat-peptid angiogenese i Kaposis sarkom [1] .

Interagerer med intracellulære proteiner HPS5 , NISCH , såvel som med RAB21 og COMP. Binder til Tat-peptidet af HIV-1-virus.

Struktur

Integrin alpha-5 er et stort protein, består af 1008 aminosyrer , molekylvægten af ​​proteindelen er 114,5 kDa . Den N-terminale region (954 aminosyrer) er ekstracellulær, efterfulgt af et enkelt transmembranfragment og et kort intracellulært fragment (28 aminosyrer). Det ekstracellulære fragment inkluderer 7 FG-GAP-gentagelser, et SG1-motiv involveret i interaktion med chondroitinsulfater og fra 5 til 15 N-glycosyleringssteder . Det cytosoliske sted inkluderer GFFKR- motivet og HPS5-bindingsstedet.

I processen med begrænset proteolyse hydrolyseres den intramolekylære binding, og der dannes tunge og lette kæder, forbundet med en disulfidbinding [2] .

Noter

  1. Uniprot-databaseindgang for CD49e (adgangsnummer P08648) . Hentet 21. februar 2012. Arkiveret fra originalen 2. februar 2017.
  2. Entrez-gen: ITGA5-integrin, alfa 5 (fibronektinreceptor, alfa-polypeptid) .

Se også

Bibliografi

Links