| PubMed | |
|---|---|
| URL | ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ |
| Kommerciel | Ikke |
| Site type | Database over videnskabelige tidsskrifter |
| Registrering | Eventuelt |
| Sprog) | engelsk |
| Ejer | Nationalt Center for Bioteknologisk Information |
| Begyndelse af arbejdet | 1997 |
| Nuværende status | Fungerer |
| Land | |
| Mediefiler på Wikimedia Commons | |
PubMed er en gratis biomedicinsk forskningssøgemaskine skabt af National Center for Biotechnology Information ( NCBI) i 1997 . Portalen besøges dagligt af omkring 2,5 millioner brugere [1] [2] .
PubMed giver adgang til flere databaser på én gang, men MEDLINE- samlingen betragtes som den vigtigste , der indeholder mere end 30 millioner citater inden for natur-, kemi-, adfærdsvidenskab , inklusive bioteknik og biofysik [3] . Over tid blev PreMEDLINE, OLDMEDLINE og NCBI bogsamlingen [4] [5] [6] integreret i PubMed . PubMed giver også adgang til PubMed Central [4] online repository .
Portalen har haft en fundamental indflydelse på naturvidenskabernes udvikling ved at give forskere mulighed for frit at søge efter den information, de har brug for, og udbrede principperne for evidensbaseret medicin og åben videnskab [7] .
PubMeds historie går tilbage til slutningen af det 19. århundrede, hvor feltkirurgen John Shaw Billings med kollegaen Robert Fletcher indekserede Military Medical Librarys samling . Den bestod på det tidspunkt af mere end 50.000 bøger, blade og pjecer inden for medicin og naturvidenskab. Det første af 15 bind af kataloget blev udgivet i 1880, det sidste i 1895. I alt fra 1880 til 1961 blev der udgivet fem serier af indekskataloget [8] .
For at gøre det lettere for klinikere og forskere at finde information, begyndte biblioteket siden 1879 at udgive Index Medicus , et månedligt bibliografisk indeks , der indeholdt information om de seneste numre af tidsskrifter, efterhånden som de blev tilgængelige for biblioteket. I 1927 blev Index Medicus fusioneret med American Medical Associations tilsvarende kvartalsvise kvartalsvise kumulative indeks Medicus . I slutningen af hvert år var der også et kumulativt indeks over alle månedlige udgaver af Index Medicus kaldet The Cumulated Index Medicus . For at forskeren i juni 1930 kunne finde den litteratur, han havde brug for, måtte han først gennemse de seks bind af Index Medicus i de seneste måneder, og derefter bindene af Cumulated Index Medicus udgivet i tidligere år [8] .
I 1956 blev United States National Library of Medicine ( NLM ) grundlagt ved lov fra Kongressen . Under hendes ledelse, i 1964, introducerede de mekaniserede metoder til indeksering af bibliotekskataloger. MEDLARS bibliografiske database blev snart oprettet og erstattede Index Medicus [8] [9] . Det var dog stadig en vanskelig opgave at søge gennem MEDLARS: specialuddannede specialister skulle oversætte hver søgeforespørgsel til maskinkode , stanse de nødvendige kort, sammensætte søgeresultatpakker og indtaste dem i systemet. Computeren søgte derefter automatisk i databasen lagret på magnetbånd og hentede de tilsvarende poster. Efterfølgende kunne de printes og sendes med pakkepost. Den gennemsnitlige ekspeditionstid mellem indsendelse af en anmodning og modtagelse af resultater var 4-6 uger, så enhver søgningsjustering krævede yderligere tid. På trods af manglerne var processen mindre besværlig end at manuelt søge i mængderne af Index Medicus [8] .
I 1971 indledte National Center for Biotechnology Information (NCBI) ved US National Library of Medicine (NLM) oprettelsen af MEDLINE , en online søgemaskine til biomedicinsk litteratur. MEDLINE har gjort det muligt for biblioteker at udføre bibliografiske søgninger i realtid af katalogindekserede citater. MEDLINE blev drevet af ELHILL -søgesoftwaren , som tillod søgninger efter titel, forfatter, titler, udgivelsesdatoer. Rygradsforbindelsen til byer i USA og Europa blev leveret af det kommercielle netværk Tymshare . På tidspunktet for dets oprettelse var MEDLINE en af de største maskinlæsbare databaser i verden med over 1,5 millioner citater i den medicinske litteratur [8] .
I første omgang var MEDLINE kun tilgængelig på medicinske biblioteker, hvor personalet behandlede forskeres ansøgninger og konverterede forespørgsler ved hjælp af emneoverskrifter. De udførte derefter søgninger ved hjælp af terminaler forbundet til NLM-computeren. Tilslutningstiden var for dyr at spilde, så brugerne konsulterede trykte katalogmængder, før de sendte en anmodning om at udarbejde den mest effektive søgestrategi. For at forbedre tilgængeligheden lancerede NLM Entrez , en tekstsøgemaskine baseret på proprietær software. For hurtigt at finde information brugte Entrez et indekseringssystem [10] [4] [5] , der tillod direkte adgang til databasen [11] . Brugere kunne forfine deres søgetermer og ikke udskrive mere end 25 resultater med fuldstændige bibliografiske data. Yderligere citater var tilgængelige efter anmodning gennem pressetjenesten, som efterfølgende sendte dem. Efter to års levering af gratis tjenester indførte NLM et gebyr for brugen af MEDLINE. De oprindelige omkostninger var $6 pr. time for forbindelse til terminalen og ¢10 pr. side for selvstændig udskrivning. I 1976 blev taksten forhøjet til $12 i timen [8] .
Den 26. juni 1997 annoncerede den amerikanske vicepræsident Al Gore oprettelsen af PubMed, en webbaseret søgemaskine til MEDLINEs naturvidenskabelige database, ved en ceremoni i Capitol [10] . Hovedmålet med projektet var at give åben adgang til information inden for biomedicin [6] . PubMed har udvidet Entrez ved at linke MEDLINE-artikler til udgiver-understøttede fuldtekst-websteder. På tidspunktet for dets start indeholdt PubMed citater fra over 4.000 tidsskrifter udgivet siden 1965, herunder Cell , Journal of Biological Chemistry , Journal of Cell Biology , The New England Journal of Medicine and Science [5] [12] .
I årenes løb har PubMed gennemgået adskillige transformationer for at blive mere end en grænseflade til MEDLINE-citationssøgning. PreMEDLINE, OLDMEDLINE databaserne samt bøger fra samlingen af National Center for Biotechnology Information [4] [5] [6] blev integreret i PubMed . PubMed giver også adgang til PubMed Central -databasen over biomedicinske artikler i fuld tekst [4] .
PubMed-søgemaskinen giver adgang til den største database med biomedicinske citater og er et væsentligt værktøj til arbejdet for specialister inden for naturvidenskab [13] .
PubMed dokumenterer medicinske og biologiske artikler fra den specialiserede litteratur og giver også links til fuldtekstartikler. PubMed omfatter data fra følgende områder: medicin , tandpleje , veterinærmedicin , almen sundhed , psykologi , biologi , genetik , biokemi , cytologi , bioteknologi , biomedicin osv. Der er dokumenteret ca. 3800 biomedicinske publikationer. PubMed-databasen vokser med 500.000 dokumenter årligt. Søgningen er baseret på princippet om Medical Subject Headings (MeSH).
Hver artikel tildeles et unikt PMID identifikationsnummer ( PubMed Identifier - PubMed identifier ) [14] .
MEDLINE er PubMeds nøgledatabase. Den indeholder opdateret information til specialister inden for grundforskning , lægehjælp, social hygiejne og sundhedsorganisation . MEDLINE omfatter data om værker inden for natur-, kemi-, adfærdsvidenskab , såvel som bioteknik og biofysik [9] . Alle tidsskrifter og artikler inkluderet i MEDLINE kontrolleres omhyggeligt for kvaliteten af den anvendte litteratur, indhold, volumen, tilgængelighed af artikler på fremmedsprog, peer review [4] [7] [10] . Udgivere sender elektroniske metadata direkte til NLM, hvorefter bibliotekspersonalet manuelt indekserer indgående emner - kontroller for fejl og tildel Medical Subject Headings (MeSH).
MEDLINE indeholder kun information om metadata, men i forbindelse med indeksering tilføjes links til den fulde version til værker med åben adgang [9] . Det meste af materialet kommer fra engelsksprogede kilder eller har abstracts på engelsk [10] . Fra juni 2022 indeholdt MEDLINE-portalen mere end 30 millioner citater af biomedicinsk litteratur [15] .
PubMed integrerer PreMEDLINE, en database med citater fra videnskabelige artikler, der allerede er indsendt til MEDLINE, men som endnu ikke er blevet indekseret. Efter behandling uploades de automatisk til MEDLINE og fjernes fra PreMEDLINE. Databasen bruges oftest til at søge efter referencemateriale om "hot topics". Bibliografiske beskrivelser fra PreMEDLINE-databasen har et særligt mærke [PubMed - i proces] [16] .
I 2003 blev OLDMEDLINE-databasen integreret i PubMed. Den indeholder citater af artikler publiceret i internationale biomedicinske tidsskrifter inden for medicin, præklinisk forskning og relaterede sundhedsvidenskaber, som blev publiceret i trykte indeks 1953-1965 [17] . Det tyske institut for medicinske journaler og information (DMDI) sammen med MEDLARS International Center i Tyskland og US National Library of Medicine, kompilerede OLDMEDLINE i midten af 1990'erne. DMDI ejede bånd, der indeholdt de originale Cumulated Index Medicus (CIM) data for 1953-1965, som efterfølgende blev konverteret og overført til NLM. OLDMEDLINE-citater blev oprettet ved hjælp af andre standarder end MEDLINE. De kumulative ændringer og forbedringer, der blev foretaget i andre NLM-filer under den årlige vedligeholdelse, mangler også i OLDMEDLINE-citater. Nogle sektioner kan indeholde forældede eller fejlagtige oplysninger. Databasen afspejler hovedsageligt indholdet af de originale trykte indekser, som blev oprettet i overensstemmelse med datidens politikker og procedurer [17] [16] .
National Center for Biotechnology Information (NCBI) Bookshelf er et gratis online arkiv med over 6.000 bøger og artikler om videnskab og sundhedsvidenskab. Den opstår i 1999 med en samling af disciplinære lærebøger og nøgletekster inden for disse områder. Efterfølgende blev den suppleret med en samling tematiske monografier i åben adgang. Forfattere, redaktører, sponsorer og udgivere leverer værkets fuldtekstindhold i XML -format på egen hånd . Dette giver dem en række fordele, hvoraf den vigtigste er udvidelsen af kredsen af potentielle læsere [18] .
PubMed giver ikke adgang til fuldtekstversioner af artikler, men det giver links til PubMed Central (PMC), et gratis online forskningslager [ 19] [20] [21] . PMC blev grundlagt i 1999 på initiativ af direktøren for National Institutes of Health (NIH) Harold Varmus [6] og lanceret i 2000. Forud for oprettelsen af PubMed Central var forskere tvunget til selvstændigt at søge efter fulde versioner af artikler på udgiverwebsteder. De fleste af disse publikationer var dog skjult bag betalingsmuren . Med fremkomsten af online-depotet kan brugere direkte få fuldtekstversioner af papirer (hvis de er gjort offentligt tilgængelige) ved at klikke på linket fra PubMed [22] .
I 2008 annoncerede National Institutes of Health implementeringen af en åben adgangspolitik. En af dens bestemmelser var den obligatoriske placering i PubMed Central af kopier af papirer offentliggjort med NIH-bevillinger [19] . Fra 2019 bestod PMC-samlingen af cirka 88% af tidsskriftsartikler inkluderet i PubMed-databaserne og 12% af individuelle artikler, der faldt ind under NIH's mandat [4] [23] . Fra juni 2022 er over 8 millioner papirer blevet arkiveret hos PMC [24] .
Nogle forskere har kritiseret integrationen af PubMed og PubMed Central for at have publikationer fra rovtidsskrifter i sidstnævnte . En undersøgelse fra 2017 viste således, at mere end 10% af rovtidsskrifter i nogle relaterede discipliner er indekseret i PubMed. I april 2017 var disse tal steget til 23,7% for job inden for rehabilitering, 16% for neurovidenskab og 24,7% for neurovidenskab [25] [4] .
Citater fra så unikke databaser som HealthSTAR, AIDSLINE, HISTLINE, SPACELINE, BIOETHICSLINE [10] [8] [26] [9] er også integreret i PubMed .
PubMed-hjemmesiden indeholder et simpelt søgefelt og hyperlinks til manualer, værktøjer og andre ressourcer. Efter at brugeren har indtastet et spørgsmål, finjusterer PubMed automatisk det gennem MeSH ( Medical Subject Headings ) identifikationssystemet. Dette giver mulighed for den mest grundige søgning af alt materiale i relaterede databaser [27] [9] [8] .
PubMed viser derefter resultaterne. Som standard sorterer systemet resultaterne efter dato, de blev tilføjet til PubMed og præsenterer dem i et resuméformat med 20 artikler pr. side. Brugere har adgang til artiklens titel, forfatterliste, informationskilde (f.eks. tidsskriftstitel efterfulgt af udgivelsesdato, bind, nummer, sider) og et unikt PubMed-postnummer eller PubMed- id (PMID). For artikler på et andet sprog end engelsk er titlen oversat til engelsk og sat i parentes. I dette tilfælde er originalsproget angivet som en ekstra post. Navnet på kladden for hver post vises i forkortet form [8] .
Resultatsiden giver også brugeren værktøjer og muligheder for at filtrere efter publikationstype og dato. Hvis antallet af publicerede artikler er højt nok, vises et søjlediagram i øverste højre hjørne af siden , der illustrerer tendensen i deres brug over de seneste år. Alle data kan downloades i CSV -format . PubMed viser også artiklens abstrakt, hovedforfatterkontakt, link til den fulde tekst og relaterede citater [8] .
PubMed gemmer ikke selve artiklernes fulde tekst. Men hvis den fulde version af værket er tilgængelig på udgiverens hjemmeside, genererer systemet automatisk et link til det, selvom artiklen er skjult bag en betalingsmur . Hvis fuldtekstversionen er hostet i PubMed Central-depotet, vil et link til den fulde tekst vises, når dets abstrakt vises i PubMed [8] .
PubMed-hjemmesiden indeholder et simpelt søgefelt og hyperlinks til manualer, værktøjer og andre ressourcer. Efter at brugeren har indtastet et spørgsmål, finjusterer PubMed automatisk det gennem MeSH ( Medical Subject Headings ) identifikationssystemet. Dette giver mulighed for den mest grundige søgning af alt materiale i relaterede databaser [27] [9] [8] .
PubMed viser derefter resultaterne. Som standard sorterer systemet resultaterne efter dato, de blev tilføjet til PubMed og præsenterer dem i et resuméformat med 20 artikler pr. side. Brugere har adgang til artiklens titel, forfatterliste, informationskilde (f.eks. tidsskriftstitel efterfulgt af udgivelsesdato, bind, nummer, sider) og et unikt PubMed-postnummer eller PubMed- id (PMID). For artikler på et andet sprog end engelsk er titlen oversat til engelsk og sat i parentes. I dette tilfælde er originalsproget angivet som en ekstra post. Navnet på kladden for hver post vises i forkortet form [8] .
Resultatsiden giver også brugeren værktøjer og muligheder for at filtrere efter publikationstype og dato. Hvis antallet af publicerede artikler er højt nok, vises et søjlediagram i øverste højre hjørne af siden , der illustrerer tendensen i deres brug over de seneste år. Alle data kan downloades i CSV -format . PubMed viser også artiklens abstrakt, hovedforfatterkontakt, link til den fulde tekst og relaterede citater [8] .
PubMed gemmer ikke selve artiklernes fulde tekst. Men hvis den fulde version af værket er tilgængelig på udgiverens hjemmeside, genererer systemet automatisk et link til det, selvom artiklen er skjult bag en betalingsmur . Hvis fuldtekstversionen er hostet i PubMed Central-depotet, vil et link til den fulde tekst vises, når dets abstrakt vises i PubMed [8] .
Til indeksering af artikler i PubMed er Medical Subject Headings-systemet integreret . MeSH giver dig mulighed for at oprette et standard ordforrådssystem, der letter effektiv informationssøgning. Et eksempel er ordene " telemedicin " og "telesundhed", som ofte bruges i flæng. MeSH-databasen indeholder kontrolleret ordforråd og indeksudtryk. Den kan tilgås fra PubMeds hjemmeside. Der er tre hovedbegreber i MeSH: emneoverskrifter (deskriptorer), inputbetingelser og underoverskrifter (kvalifikationer) [28] [29] . MeSH giver dig mulighed for at håndtere problemet med inkonsekvent terminologi i biomedicinsk arbejde, hvilket har stor indflydelse på nøjagtigheden af forespørgsler [30] .
NLM-medarbejdere identificerer manuelt MeSH-termer (normalt 10-12) i hvert indkommende papir [31] . Dette giver dig mulighed for at foruddefinere termer og integrere synonymer. For eksempel er forespørgslen "hjerteanfald" indekseret i MeSH som "myokardieinfarkt" [31] .
Efter at brugeren har indtastet en forespørgsel, inkluderer PubMed automatisk alternative stavemåder og MeSH-udtryk forbundet med den anmodede sætning. Brug af MeSH til søgning gør det mere nøjagtigt [31] . Begreberne er ordnet hierarkisk efter emnekategorier. For at udvide eller indsnævre søgningen kan brugere selvstændigt vælge termer placeret over eller under i strukturen [32] .
MeSH giver dig også mulighed for at fokusere din søgning på specifikke emner, såsom økonomien ved telemedicin til diabetes. For at gøre dette skal brugere først søge efter ordet "telemedicin", men før de indsender MeSH-udtrykket til konstruktøren, skal du vælge en undertekst (kvalifikation) ved at markere de relevante afkrydsningsfelter. Dette vil resultere i en kombination af MeSH-termen og underteksten i søgebyggervinduet, i dette tilfælde: "Telemedicin/Economics"[Mesh]. MeSH underoverskrifter er tilføjet emneoverskriften med en skråstreg (/). Søgeforespørgslen forbliver i søgeværktøjsvinduet, hvilket giver brugerne mulighed for at tilføje andre termer til forespørgslen. Søgeforespørgslen kan derefter udfyldes med MeSH-udtrykket for diabetes, dvs. "Diabetes Mellitus" [Mesh], og kombinationen af de to termer kan indsendes til PubMed-søgninger. Denne metode vil reducere antallet af resultater betydeligt sammenlignet med at bruge MeSH-udtrykket uden en kvalificerer. Resultaterne vil dog være mere specifikke og derfor mere relevante for forespørgslen [28] .
Portalgrænsefladen har flere gange gennemgået store ændringer. I 2000 blev dens design fuldstændig ændret, filtre efter sprog og årstal blev tilføjet, samt funktionen til at se søgehistorikken, gemme, analysere og udskrive udvalgte citater til et eller flere søgeresultater [6] .
I begyndelsen af 2020 blev der lanceret en opdateret version, som fik blandede anmeldelser fra brugere, der er vant til den gamle grænseflade [2] . De tre hovedfunktioner "Brug af PubMed", "PubMed-værktøjer" og "Yderligere ressourcer" er blevet ændret til "Lær", "Find", "Download" og "Udforsk". Den nye version fokuserer på den accelererede søgning efter information og er mere praktisk i mobilversionen. En funktion "Resultater efter år" er også blevet tilføjet, så brugeren kan spore brugstendenser. Artikeltype, teksttilstedeværelse, alder og sprogfiltre er nogle af de populære værktøjer, der er overført fra den gamle version af PubMed [33] .
askMEDLINE er et fritekstsøgeværktøj til MEDLINE/PubMed. Den blev skabt på basis af PICO ( Engelsk Patient, Intervention, Comparison, Outcome eller "Patient, Intervention, Comparison, Outcome"), en MEDLINE/PubMed søgemetode udviklet til travle klinikere, der er interesseret i praksis med evidensbaseret medicin , men ikke bekendt med kontrollerede ordforråd, der kunne gøre søgning mere effektiv [34] . AskMEDLINE-brugere kan indtaste et klinisk spørgsmål på "samtalesprog", og søgemaskinen finder automatisk de relevante tidsskriftsartikler [34] .
askMEDLINE er baseret på en flertrins søgestrategi. I det første trin ignorerer parseren tegnsætning og fjerner ord fundet i stopordslisten. Parseren, et PHP -script, sender derefter den ændrede anmodning til E-Utilities PubMed Entrez. XML-filen (Extensible Markup Language) returneret af E-Utilities angiver kategorien for hvert udtryk i forespørgslen. Udtryk markeret med "Alle felter" betyder, at de hverken er termer for medicinske emneoverskrifter (MeSH) eller MeSH-underoverskrifter. Hvis ordet "Alle felter" er i støtteordbogen, forbliver det i forespørgslen; hvis det ikke er, fjernes det. De resterende vilkår sendes tilbage til PubMed via E-Utilities. Hvis antallet af log-hentninger efter første runde er mellem 1 og 50.000 , vises de første 20 resultater, og søgningen afsluttes [34] .
Søgningen kan fortsætte til anden runde, hvis der blev brugt for mange filtre i første runde, hvilket resulterede i, at der ikke blev fundet nok papirer, eller hvis antallet af søgeforespørgsler i første runde oversteg 50.000 artikler (hvilket indikerer, at søgningen var for bred) [ 34] .
Alene i det første år modtog askMEDLINE mere end 15.000 henvendelser, hovedsagelig i form af spørgsmål eller komplekse sætninger. De mest efterspurgte spørgsmål handlede om terapi [35] .
Min NCBISiden 2010 har PubMed-brugere været i stand til at oprette deres egne konti takket være My NCBI -funktionen . Den personlige tilgang gjorde det muligt at gemme relevante citater og søgninger, indstille unikke søgeparametre og indstille søgeadvarsler og bruge andre avancerede muligheder i PubMed [36] . Fra 1. juni 2021 vil NCBI-konti ikke længere være tilgængelige. Brugere blev bedt om at logge ind via eRA Commons, ORCID , Google , Login.gov eller Einstein AD [37] legitimationsoplysninger .
Link udLinkOut forbinder PubMed med alle ressourcer eksternt i forhold til NCBI. Programmet giver brugerne adgang til fuldtekstversioner af artikler placeret på udgivelsesportaler. Fra juni 2022 leverede 4271 udgivere data til LinkOut på regelmæssig basis [38] [39] .
Pub crawlerPubMed er integreret med PubCrawler -webtjenesten , som giver brugerne mulighed for at oprette personlige websider. PubCrawler eksisterede oprindeligt som et Perl -script, der automatisk sporer nye resultater for foruddefinerede forespørgsler i PubMed via Entrez NCBI-søgemaskinen. Men snart besluttede dets skabere at gøre det åbent for andre brugere. Når de er registreret, kan brugere konfigurere deres anmodninger om PubMed gennem PubCrawler-konfiguratoren. Efter at have modtaget resultaterne, sammenligner systemet dem automatisk med de tidligere anmodninger fra brugeren, og efterlader kun uviste værker. Tjenesten giver dig således mulighed for at spore nye artikler og anbefalinger. PubCrawler fungerer også som et automatisk advarselssystem, der sender korte meddelelser eller e-mails med de seneste opdateringer, efterhånden som de bliver tilgængelige [40] .
PubMed CommonsI 2013 lancerede NCBI en pilotversion af PubMed Commons. Tjenesten gav brugere mulighed for offentligt at kommentere på abstracts placeret i databasen. Skaberne søgte at skabe et rum for diskussion om videnskabelige værker [41] og dermed bekæmpe problemet med den videnskabelige videns irreproducerbarhed [42] , men tjenesten vakte ikke opsigt blandt forskere. På trods af dette forlængede skaberne af projektet i 2015 finansieringen af PubMed Commons med endnu et år. Men i denne periode blev kommentarer kun overladt til 6.000 ud af 28 millioner artikler, og i 2018 blev der truffet en endelig beslutning om at afslutte tjenesten [43] . Brugere blev opfordret til at skifte til en lignende platform , PubPeer , som gjorde det muligt for kommentatorer at forblive anonyme [44] .
PubMed IdentifierPubMed Identifier eller PMID er et 1 til 8-cifret lagernummer til styring af poster i PubMed. En identifikator tildeles hvert værk, der er indekseret i databasen, hvorved ethvert citat kan findes ved hjælp af PMID. Med stigningen i samlingen blev det i 2012 besluttet at udvide PMID-identifikationen og tilføje en ti-tusindedel (f.eks. PMID-10097079.2). Før 2004 indeholdt mange poster et unikt MEDLINE-id ud over PMID, men dette er siden blevet opgivet [45] .
PubMed MobileI 2012 blev PubMed-appen til iOS udgivet [46] .
I 2015 blev en mobilversion tilgængelig for brugere, der tjekker webstedet fra mobile enheder - PubMed Mobile [47] . 2020-opdateringen forbedrede PubMed Mobiles oplevelse på enheder med et portrætformat [33] .
PubMed er et af de vigtigste søgeværktøjer til den biomedicinske litteratur og er blevet sammenlignet med Googles naturvidenskabelige søgemaskine [7] [48] . Platformen giver brugere gratis adgang til en database med citater fra millioner af videnskabelige publikationer i næsten al engelsksproget biomedicinsk forskning [49] . Ifølge 2017-data besøgte omkring 2,5 millioner brugere portalen dagligt [1] .
Oftest bruges PubMed af forskere og fagfolk inden for biomedicin og naturvidenskab. Medlemmer af den brede offentlighed kan dog nemt finde information om banebrydende forskning om enhver sygdom [50] . Alle indekserede værker i MEDLINE opfylder strenge kriterier, så udgivere, bibliotekarer og forfattere bruger ressourcen til at verificere kvaliteten af deres kilder [4] .
PubMed fremmer principperne om åben videnskab og fri adgang til videnskabelig viden. Portalen er knyttet til PubMed Central, det første online forskningslitteraturdepot. I 2005 indførte NIH en politik om at kræve, at peer-reviewede primære kopier indsendes til PubMeds centrale database [51] . Dermed bliver al statsfinansieret forskning tilgængelig for offentligheden. Dette hjælper praktikere med at få adgang til nøglematerialer inden for deres felt og bekæmpe betalingsmure. Åben adgang øger også sandsynligheden for at citere forfatterens værk [4] [19] .
PubMed-databaser bruges også ofte til scientometriske analyser . For eksempel har Verum Analytics, en Connecticut -baseret kommerciel virksomhed, udviklet et værktøj til at analysere og forbedre reproducerbarheden af artikler baseret på måledata om de artikler, hvori de er citeret [52] .