Syndekan 1

Syndekan 1
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolSDC1  ; CD138; SDC; SYND1; Syndecan
Eksterne ID'erOMIM:  186355 MGI :  1349162 HomoloGene :  2252 GeneCards : SDC1 Gen
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez638220969
EnsembleENSG00000115884ENSMUSG00000020592
UniProtP18827P18828
RefSeq (mRNA)NM_001006946NM_011519
RefSeq (protein)NP_001006947NP_035649
Locus (UCSC)Chr 2:
20,4 – 20,43 Mb
Chr 12:
8,77 – 8,79 Mb
Søg i PubMed[en][2]

Syndecan 1 ( engelsk  syndecan 1; CD138 ) er et membranprotein , en proteoglycan af syndecanfamilien eller transmembrane heparansulfatproteoglycaner. I alt 4 proteiner af denne familie er blevet beskrevet. Humant genprodukt SDC1 .

Funktioner

Proteinet er en transmembran heparansulfat proteoglycan, et medlem af syndecanfamilien. Syndecans medierer cellebinding, cellesignalering og organisering af cytoskelettet . De er receptorer for Tat -proteinet fra HIV -viruset . Syndecan 1 er involveret i celleproliferation, cellemigration og cellulær interaktion med ekstracellulære matrixproteiner. [en]

Struktur

Syndecan 1 bærer heparansulfat- og chondroitinsulfatkæder , som giver kommunikation mellem cytoskelettet og den ekstracellulære matrix. Binder til CDCP1 .

Spaltning af ektodomænet fører til dannelsen af ​​en opløselig form af proteinet. Spaltning kan forekomme under påvirkning af heparanase, thrombin og epidermal vækstfaktor, såvel som under stress og under sårheling.

Proteinet består af 288 aminosyrer, proteindelens molekylvægt er 32,5 kDa. Inkluderer et N-terminalt ekstracellulært domæne (232 aminosyrer), et enkelt spiralformet transmembranfragment og en lille cytosolisk region. Der er 6 glycosyleringssteder på det ekstracellulære domæne : 3 O -chondroitinsulfatkædebindingssteder, 2 O -heparansulfatkædebindingssteder og 1 N -glycosyleringssted . Det cytosoliske fragment indeholder en phosphoryleret tyrosin .

Ansøgning

Syndecan 1 bruges som markør for plasmaceller [2] , hvis cellerne vides at stamme fra blodceller. [3]

Se også

Noter

  1. Entrez Gene: SDC1 syndecan 1 .
  2. ↑ Rawstron AC Immunfænotypning af plasmaceller  (neopr.)  // Curr Protoc Cytom. - 2006. - Maj ( bind kapitel 6 ). — C. Enhed6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
  3. O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndecan-1), en plasmacellemarkør immunhistokemisk profil i hæmatopoietiske og ikke-hæmatopoietiske neoplasmer   // Am . J. Clin. Pathol.  : journal. - 2004. - Februar ( bind 121 , nr. 2 ). - S. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Arkiveret fra originalen den 9. juni 2011.  (utilgængeligt link)

Litteratur

Links