MiRNA

MikroRNA'er ( engelsk  microRNA, miRNA ) er små ikke-kodende RNA-molekyler 18-25 nukleotider lange (i gennemsnit 22) fundet i planter , dyr og nogle vira , der er involveret i transkriptionel og post-transskriptionel regulering af genekspression ved RNA-interferens [1] [2] [3] . Ud over intracellulært blev der fundet ekstracellulært (cirkulerende) mikroRNA [4] .

MikroRNA'er kodes af det nukleare DNA fra planter og dyr og af det virale DNA fra nogle DNA-holdige vira. MikroRNA'er er involveret i undertrykkelsen af ​​genaktivitet: de parrer sig komplementært med mRNA - regioner og hæmmer deres translation . Derudover spaltes mikroRNA-mRNA-komplekser ofte hurtigt af cellen . Dette er et eksempel på målrettet nedbrydning, eftersom dannelsen af ​​disse komplekser er baseret på komplementariteten af ​​to RNA-molekyler [5] [6] . Der er også data, der indikerer muligheden for mikroRNA-interaktion direkte med DNA i processen med RNA-afhængig DNA-methylering , som er en af ​​nøglemekanismerne for genundertrykkelse , allelisk udelukkelse og forebyggelse af transposonaktivitet [7] .

I 2014 er mere end 1800 humane miRNA'er kendt [8] [9] . Dette tal kan dog stige betydeligt med forbedring af søgemetoder. Forskellige celler og væv syntetiserer forskellige sæt miRNA'er, så deres undersøgelse kan føre til opdagelsen af ​​nye molekyler [10] . Ifølge forskellige skøn er mikroRNA-mål fra 30 til 60 % af de humane gener, der koder for proteiner [11] [12] .

MikroRNA'er er meget konserverede blandt eukaryoter , og miRNA'er menes at repræsentere en vital og evolutionært gammel komponent i genekspressionsreguleringssystemet [13] [14] [15] [16] [17] . Selvom hovedkomponenterne i mikroRNAs livscyklus er de samme i planter og dyr, har sættet af mikroRNA'er i disse to kongeriger udviklet sig uafhængigt med forskellige funktionsmønstre [18] . Plante-mikroRNA'er er karakteriseret ved et fuldstændigt eller næsten fuldstændigt komplementært match til deres mål-mRNA'er, og de inducerer genundertrykkelse ved at udløse nedbrydningen af ​​måltranskripter [19] [20] . Bindingen af ​​mikroRNA'er til transkripter kan udføres både i de kodende og ikke-kodende regioner [20] . Dyre-miRNA'er er derimod i stand til at genkende det ønskede mRNA med mindst 6-8 nukleotider ved dets 5'-ende [11] [21] . Der er muligvis ikke en en-til-en overensstemmelse mellem et mikroRNA og dets mål-mRNA: et mikroRNA kan have flere mål-mRNA'er, og et mRNA kan have flere tilsvarende mikroRNA'er [22] [23] .

De første miRNA'er blev beskrevet i begyndelsen af ​​1990'erne [24] , men som en separat klasse af biologiske regulatoriske molekyler med specifikke funktioner begyndte de først at blive betragtet i begyndelsen af ​​2000'erne. Siden da er talrige funktioner af miRNA'er i negativ regulering (transkriptionel nedbrydning eller isolation, translationsundertrykkelse) og mulig involvering i positive reguleringsmekanismer (aktivering af transkription og translation) blevet etableret. Da mikroRNA'er er involveret i reguleringen af ​​genekspression, er de involveret i de fleste biologiske processer [25] [26] [27] [28] [29] [30] [31] . Forskellige celler og væv har forskellige sæt af miRNA'er [32] .

Abnormiteter i miRNA-ekspression er blevet vist i mange sygdomstilstande. Mulighederne for miRNA-terapi undersøges også [33] [34] [35] [36] .

Estimering af det samlede antal unikke mRNA'er, der er mål for et typisk miRNA, varierer afhængigt af metoden anvendt til vurderingen [37] . Ifølge estimater i 2004 kan kun 7 mRNA'er være mål for et typisk mikroRNA, senere estimater var højere [38] . Det er blevet fastslået, at hvert miRNA hos hvirveldyr i gennemsnit har cirka 200 måltransskriptioner [39] . Det er også kendt, at et miRNA kan undertrykke dannelsen af ​​hundredvis af proteiner [40] [41] , men en sådan undertrykkelse er relativt moderat (mindre end 2 gange fald i ekspression).

Historie

MikroRNA'er blev opdaget i 1993 af Victor Embros , Rosalind Lee og Rhoda Feinbraum, mens de studerede lin-14- genet involveret i udviklingen i nematoden Caenorhabditis elegans [24] . De fandt ud af, at mængden af ​​LIN-14-protein blev reguleret af et kort RNA-produkt af lin-4- genet . 61-nt-precursoren transskriberet fra lin-4- genet modnede til et 22-nt RNA-molekyle. Dette korte RNA-molekyle indeholdt sekvenser, der var delvist komplementære til nogle sekvenser i den 3'-utranslaterede region (3'-UTR) af mRNA transskriberet fra lin-14 . Komplementaritet viste sig at være en nødvendig og tilstrækkelig betingelse for at undertrykke translationen af ​​lin-14 mRNA til LIN-14 protein. Det lille lin-4-RNA var således det første miRNA, der blev opdaget, selvom man på det tidspunkt mente, at tilstedeværelsen af ​​sådanne RNA'er var et træk ved nematoden. Det var først i 2000, at et andet miRNA, let-7, blev beskrevet, der undertrykte ekspressionen af ​​lin-41 , lin-14 , lin-28 , lin-42 og daf-12 under overgangsstadierne i udviklingen af ​​Caenorhabditis elegans . Efterfølgende blev let-7 vist at være bevaret i mange arter [42] [43] , hvilket indikerer en bredere udbredelse af dette fænomen.

Opdagelsen af ​​let-7 blev efterfulgt af energisk forskning i en ny klasse af ikke-kodende små RNA'er, miRNA'er. Til dato er tusindvis af mikroRNA'er fra mennesker og andre arter blevet beskrevet, forskellige metoder til deres undersøgelse er blevet udviklet, og online databaser med miRNA-sekvenser er blevet oprettet (for eksempel miRBase ) [44] .

Nomenklatur

Ifølge de almindeligt accepterede nomenklaturregler tildeles navne til eksperimentelt identificerede og bekræftede mikroRNA'er før offentliggørelse af deres opdagelse [45] [46] . Præfikset "mir" er adskilt af en bindestreg efterfulgt af et tal, der angiver navngivningsrækkefølgen. For eksempel blev mir-122 opdaget og navngivet før mir-456. Præfikset "mir-" bruges til at henvise til præ-miRNA, "MIR-" til genet, der koder for mikroRNA, og "miR-" til den modne form. Et ekstra lille bogstav er tildelt navnet på miRNA'er med sekvenser, der adskiller sig med et eller to nukleotider. Således er miR-123a tæt beslægtet med miR-123b. Pre-miRNA'er, der giver anledning til 100% identiske mikroRNA'er, men er lokaliseret forskellige steder i genomet, har et ekstra ciffer i navnet, adskilt af en bindestreg. For eksempel giver hsa-mir-194-1 og hsa-mir-194-2 pre-miRNA'er anledning til identiske miRNA'er (hsa-miR-194), men de er placeret i forskellige regioner af genomet. Arten, hvorfra mikroRNA'et blev isoleret, er angivet i navnet med et præfiks på tre bogstaver, for eksempel humant hsa-miR-123 ( Homo sapiens ) og åre-miR-123 får ( Ovis aries ). For virale mikroRNA'er bruges ofte præfikset "v-", og for Drosophila mikroRNA'er bruges ofte "d". Når to modne mikroRNA'er dannes fra to forskellige ender af det originale præ-miRNA, tilføjes suffikset -3p eller -5p til dem. Tidligere blev betegnelserne "s" (sense) og "as" ( antisense ) også brugt. Når det relative ekspressionsniveau for to miRNA'er, der deler en fælles precursor, er kendt, så er det miRNA, der udtrykkes på et lavere niveau end miRNA'et fra den modsatte ende af hårnålen, markeret med en stjerne. MiR-123 og miR-123* har således et fælles initialt hårnåle -pre-miRNA, men mere miR-123 findes i cellen, dvs. dets ekspressionsniveau er højere [47] .

Uddannelse

De fleste af de beskrevne miRNA-gener er intergene eller orienteret i antisense-retningen med hensyn til nabogener, og derfor antages det, at de transskriberes som uafhængige enheder [48] [48] [49] [50] [51] . Men i nogle tilfælde transskriberes miRNA sammen med sit målgen, hvilket gør det muligt for deres fælles regulering [52] . Omkring 40% af miRNA'er er kodet af gener placeret i introner og ikke-proteinkodende gener, og i nogle tilfælde endda i exoner af lange ikke-proteinkodende gener [53] . I dette tilfælde er miRNA-gener som regel, men ikke altid, placeret i sense-orienteringen [54] [55] og reguleres derfor sammen med målgener [53] [56] [57] . Andre mikroRNA-gener deler en fælles promotor , hvor 42-48% af alle mikroRNA'er dannes fra polycistroniske enheder, der indeholder mange separate sløjfer, hvorfra modent mikroRNA behandles yderligere [49] [58] . De resulterende miRNA'er vil dog ikke nødvendigvis være homologe i struktur og funktion.

I promotorerne af miRNA-gener blev tilstedeværelsen af ​​motiver , der ligner motiverne i promotorerne af andre gener, aflæst af RNA-polymerase II , nemlig proteinkodende gener [49] [59] , vist . DNA-skabelonen er ikke den eneste faktor, der bestemmer den primære struktur af det resulterende mikroRNA: RNA-redigering ( IsomiR ) er vist for 6% af mikroRNA'er, dvs. stedspecifik modifikation af RNA, som gør det muligt at opnå forskellige RNA-produkter fra samme DNA skabelon. Dette gør det muligt at øge diversiteten og mulighederne for miRNA'er opnået fra et enkelt gen.

Transskription

MikroRNA-gener transskriberes normalt af RNA-polymerase II [49] [59] . Polymerasen binder sig ofte til en promotor, der støder op til DNA-kodende sekvens (et RNA-fragment aflæst fra denne sekvens vil blive en hårnål i præ-miRNA'et). Det resulterende transkript er kappet , polyadenyleret [49] [54] og splejset . Dyre-miRNA-transkription begynder med dannelsen af ​​et fragment ~80 nukleotider langt, som er en del af en af ​​hårnålegrenene, som igen er en del af en mikroRNA-precursor flere hundrede nukleotider lang, kaldet primær miRNA (pri-miRNA) [ 49] [54] . Hvis den oprindeligt dannede hårnål er placeret i 3'-UTR, så kan det resulterende transkript fungere som både pre-miRNA og mRNA [54] . Nogle miRNA'er transskriberes af RNA-polymerase III . Dette gælder især for de mikroRNA'er, hvis gener er under Alu-gentagelser , tRNA- gener og spredte gentagelser i pattedyr ( pattedyr bred interspersed repeat (MWIR) ) [60] . 

Nuklear behandling

Et pri-miRNA kan indeholde fra en til seks miRNA-prækursorer (pre-miRNA). Disse hårnålestrukturer består af 70 nukleotider hver. Dobbeltstrenget RNA i hårnåle genkendes af nukleare proteiner: DiGeorge Syndrome Critical Region 8 hos hvirveldyr (DGCR8, opkaldt efter DiGeorge syndrom ) eller Pasha hos hvirvelløse dyr . DGCR8 fungerer i et kompleks med Drosha  , et RNA-skærende protein, der danner den såkaldte "mikroprocessor" [61] . I dette kompleks orienterer DGCR8 det katalytiske domæne af RNase III , som er en del af Drosha, på en sådan måde, at det "skærer" hårnåle fra pri-mikroRNA og skærer RNA'et i en afstand på 11 nukleotider fra bunden af ​​hårnålen. Det resulterende produkt har 2 nukleotidudhæng ved 3'-enden, det har en 3'- hydroxyl- og en 5'- phosphatgruppe . Dette produkt omtales ofte som pre-miRNA (miRNA precursor).

Præ-mikroRNA'er, der splejser fra introner og ikke passerer gennem "mikroprocessoren", kaldes myrtroner . Man troede tidligere kun at finde myrtroner i Drosophila og Caenorhabditis elegans , men de er nu også blevet fundet hos pattedyr [62] .

Formodentlig gennemgår 16% af præ-miRNA'er nuklear RNA-redigering [63] [64] [65] . I det mest almindelige tilfælde katalyserer et enzym kendt som adenosindeaminase , der virker på RNA (ADAR'er), den hydrolytiske deaminering af adenosin (A) til inosin (I). RNA-redigering kan stoppe nuklear behandling (det sker f.eks. i tilfælde af pri-miR-142, som ødelægges af Tudor-SN RNase efter redigering) og påvirke efterfølgende hændelser, herunder cytoplasmatisk mikroRNA-behandling, samt ændre mål-mRNA'et af det bearbejdede miRNA (f.eks. i tilfælde af miR-376, som fungerer i centralnervesystemet ) [63] .

Nuklear eksport

Pre-miRNA'er eksporteres fra kernen via den nukleocytoplasmatiske bærer, Exportin-5- proteinet . Dette protein, som er et medlem af karyopherins -familien , genkender to "overhængende" nukleotider i 3'-enden af ​​pre-miRNA, som dukkede op, som det blev skrevet tidligere, da pri-miRNA blev skåret. Transport til cytoplasmaet medieret af Exportin-5 sker med forbrug af GTP -energi , med deltagelse af det GTP-bindende protein Ran [66] .

Cytoplasmatisk behandling

I cytoplasmaet spaltes præ-miRNA'et af Dicer -enzymet , som indeholder det katalytiske RNase III-center [67] . Denne endoribonuklease interagerer med 3'-enden af ​​hårnålen og skærer en løkke, der forbinder 3'- og 5'-enden af ​​hårnålen. Som følge heraf dannes en dupleks (miRNA:miRNA*), bestående af to mikroRNA-kæder, hver 22 nukleotider lang [67] . Processiviteten af ​​Dicer påvirkes af længden af ​​hårnålen og løkken, og ufuldkommenheden af ​​kædebinding i miRNA:miRNA*-dupleksen bidrager til deres adskillelse [67] [68] . Selvom hver af duplekskæderne potentielt kan fungere som et funktionelt miRNA, vil kun én af dem efterfølgende komme ind i det RNA-inducerede gen-nedlukningskompleks ( RNA-induced silencing complex (RISC) ), hvor mikroRNA'et og dets mål-mRNA interagerer . 

Uddannelse i planter

MikroRNA-biogenese i planter adskiller sig fra den i dyr, hovedsageligt i stadierne af nuklear forarbejdning og eksport. Hvis skæring hos dyr udføres af to forskellige enzymer og forskellige steder i cellen - inde i kernen og uden for den, så udføres begge stiklinger i planter af det samme enzym, homologt med Dicer of animals - Dicer-lignende1 (DL1) ). DL1 fungerer kun inde i plantecellekernen , hvilket tyder på, at begge reaktioner finder sted i kernen. I planter, før miRNA:miRNA*-duplekser transporteres ud af kernen, methyleres deres overhængende nukleotider i 3'-enden af ​​en RNA- methyltransferase kaldet Hua-Enhancer1 (HEN1). Dupleksen transporteres yderligere fra kernen til cytoplasmaet af Hasty-proteinet (HST), en homolog af Exportin-5, hvor dupleksen nedbrydes og det modne mikroRNA inkorporeres i RISC [69] .

RNA-induceret gennedlukningskompleks

Det modne mikroRNA er en del af det aktive RNA-inducerede gennedlukningskompleks (RISC), som også omfatter Dicer og mange andre proteiner [70] . RISC er også kendt som miRNA-ribonukleoproteinkompleks (microRNP, microRNP) [71] , og RISC indeholdende miRNA omtales nogle gange som miRISC.

Pre-miRNA-behandling af Dicer er sandsynligvis forbundet med duplex-nedbrydning. Kun én streng af dupleksen er inkluderet i miRISC, valgt på basis af dens termodynamiske ustabilitet og svagere baseparring sammenlignet med den anden streng [72] [73] [74] . Valget af kæde kan også påvirkes af tilstedeværelsen af ​​en hårnål [75] . Kredsløbet inkluderet i miRISC kaldes en "guide". Den anden kæde, kaldet "passagerkæden", har mindre energi i stabil tilstand (angivet med *) og nedbrydes normalt. I nogle tilfælde bliver begge strenge af dupleksen til funktionelle miRNA'er og virker på forskellige typer af mRNA [76] . MicroRNA inkluderet i RISC spiller rollen som en skabelon, der genkender en bestemt sekvens på mål-mRNA'et.

Proteiner fra Argonaute (Ago) -familien spiller en central rolle i RISC-funktionen . Disse proteiner er nødvendige for miRNA-induceret mRNA-knockout og har to bevarede mikroRNA-bindingssteder: PAZ- domænet , som interagerer med stedet i 3'-enden af ​​mikroRNA'et, og PIWI-domænet, som strukturelt ligner ribonuklease H og binder 5'-enden af ​​miRNA'et. Sammen binder de det modne miRNA og orienterer det passende til interaktion med mål-mRNA'et. Nogle proteiner fra Argonaute-familien, såsom human Ago2, spalter direkte måltranskriptet. Proteiner fra denne familie kan også rekruttere yderligere proteiner til at undertrykke translation [77] . Det humane genom koder for 8 proteiner af Argonaute-familien, klassificeret efter aminosyresekvenser i 2 grupper: AGO (4 proteiner udtrykt i alle pattedyrsceller, hos mennesker kaldes de E1F2C/hAgo) og PIWI (findes i celler i kimlinjen) og hæmatopoietiske celler) [71] [77] .

Yderligere komponenter i RISC er følgende proteiner: TRBP (protein, der binder det transaktiverende TAR RNA fra HIV -viruset ) [78] , PACT (proteinaktivator af interferon induceret af proteinkinase ), SMN-kompleks, FMRP, Tudor-SN, formodet DNA helicase MOV10, TNRC6B [66] [79] [80] .

Genlukning kan opnås ved at nedbryde mRNA'et eller forhindre dets translation. MiR16 indeholder således en sekvens, der er komplementær til det AU-rige element, der er til stede i 3'UTR af mange ustabile mRNA'er, såsom TNF-α eller GM-CSF. Hvis miRNA'et er fuldt komplementært til mål-mRNA'et, kan Ago2 skære mRNA'et og føre til dets direkte nedbrydning. Hvis der ikke er fuldstændig komplementaritet, opnås nedlukning ved at forhindre oversættelse [25] .

MicroRNA-stabilitet

Regulering af mikroRNA-stabilitet er nødvendig for hurtige ændringer i ekspressionen af ​​gener, der koder for mikroRNA'er. Under mikroRNA-modning i cytoplasmaet stabiliserer Argonaute-proteiner guidestrengen, mens "passager"-strengen i de fleste tilfælde ødelægges. Samtidig stabiliserer Argonaute miRNA'er med et større antal mål i længere tid, hvilket bidrager til nedbrydningen af ​​miRNA'er, der ikke har mål [81] .

MiRNA-nedbrydning i Caenorhabditis elegans medieres af 5'→3' exoribonuclease XRN2 , også kendt som Rat1p [82] . I planter nedbryder SDN-proteiner ( små  RNA-  nedbrydende nukleaser) mikroRNA'er i den modsatte (3'→5') retning. Gener, der er homologe med plante- SDN - gener, er også blevet identificeret i dyregenomer, men deres funktioner er endnu ikke blevet beskrevet [81] .

Nogle mikroRNA-modifikationer påvirker deres stabilitet. Som det er blevet vist i planten Arabidopsis thaliana , stabiliseres modne miRNA'er i planter ved tilsætning af methylgrupper til 3'-enden. Methylgrupper bundet til miRNA med en 2'-O-binding forhindrer tilføjelsen af ​​uridinphosphat (U)-rester af uridyltransferase , og denne modifikation er forbundet med mikroRNA-nedbrydning. Imidlertid kan uridinylering omvendt beskytte nogle miRNA'er; konsekvenserne af sådanne ændringer er endnu ikke helt klare. Uridinylering af mikroRNA'er i dyr er også kendt. Både plante- og dyremikroRNA'er kan ændres ved at tilføje adenosin - nukleotidenheder (A) til 3'-enden af ​​mikroRNA'et. Et yderligere adenosinfosfat knyttet til enden af ​​pattedyrs miR-122 (et mikroRNA, der er rigeligt i leveren , spiller en vigtig rolle i udviklingen af ​​hepatitis C ) stabiliserer molekylet; desuden er det kendt, at plante-miRNA'er med et ekstra adenosin-nukleotid i slutningen er mindre tilbøjelige til nedbrydning [81] .

Funktioner

Som nævnt ovenfor spiller miRNA'er en vigtig rolle i reguleringen af ​​genekspression. MikroRNA'er er komplementære til et specifikt fragment af en eller flere mRNA'er, mens animalske mikroRNA'er normalt er komplementære til 3'-UTR'en, mens plantemikroRNA'er normalt er komplementære til den kodende del af mRNA'et [83] . Fuldstændig eller næsten fuldstændig baseparring mellem miRNA og mål-mRNA udløser målnedbrydning [84] . Dette sker i planter [85] ; hos dyr interagerer mikroRNA ikke komplementært med alt mRNA, som i planter, men kun med en del af det; i stedet er nøjagtig overensstemmelse kun nødvendig i et lille område fra 2. til 7. nukleotid (den såkaldte "frøregion" af mikroRNA [11] [21] ) [86] . Dyre-miRNA'er, ud over at aktivere spaltningen af ​​måltranskriptet, blokerer i mange tilfælde translation [87] (dette fænomen er også kendt i planter, men det er meget mindre almindeligt hos dem [85] ). MikroRNA'er, der er delvist komplementære til deres mål, kan også aktivere mRNA -deadenylering , hvilket reducerer målets levetid [88] . Det er nu blevet fastslået, at mikroRNA forårsager nedbrydning af mål-mRNA'et, men mekanismen for translationel undertrykkelse (uanset om det kun udføres gennem ødelæggelse af mRNA, kun gennem undertrykkelse af translation af specielle faktorer, eller en kombination af begge mekanismer) diskuteres aktivt. Nylige undersøgelser af miR-430 i zebrafisk , såvel som bantam-miRNA og miR-9 i Drosophila cellekultur, har vist, at translationel undertrykkelse skyldes ødelæggelsen af ​​translationsinitieringskomplekset og ikke er forbundet med deadenylering [89 ] [90] .

Nogle gange forårsager mikroRNA'er også histonmodifikation og DNA-methylering i promotorregionen , hvilket påvirker ekspressionen af ​​målgener [ 92] [93] .

Ved hjælp af en generaliseret matematisk model blev 9 mekanismer for miRNA-virkning beskrevet og karakteriseret [91] :

  1. inhibering af vedhæftning af 40S-underenheden af ​​ribosomet i cap-regionen;
  2. hæmning af vedhæftning af den 60S ribosomale underenhed;
  3. undertrykkelse af forlængelse;
  4. dissociation af ribosomkomplekset (for tidlig afslutning);
  5. nedbrydning af co-translationelle hjælpeproteiner;
  6. gren af ​​P-legemer ;
  7. mRNA henfald (destabilisering);
  8. mRNA skæring;
  9. transkriptionsundertrykkelse gennem miRNA-medieret omlejring.

Disse mekanismer er ofte umulige at adskille ved hjælp af eksperimentelle data om reaktionshastighedskonstanter, selvom de adskiller sig i termodynamiske termer [91] .

I modsætning til plantemikroRNA'er virker dyremikroRNA'er på forskellige sæt gener [21] . Imidlertid er gener involveret i processer, der er fælles for alle celler, relativt sjældent målrettet af mikroRNA'er og er tilsyneladende under indflydelse af selektion, der forhindrer deres interaktion med mikroRNA'er [94] .

Det er kendt, at dobbeltstrengede RNA-molekyler (dsRNA) kan aktivere gener. dsRNA-mål er genpromotorer, der potentielt kan øge transkriptionen af ​​relaterede gener. Dette fænomen er blevet påvist i humane celler ved hjælp af kunstige dsRNA'er kaldet små aktiverende RNA (lille aktiverende RNA, saRNA) [95] såvel som i tilfælde af endogene miRNA'er [96] .

Interaktioner mellem mikroRNA'er og komplementære sekvenser i gener og endda pseudogener , der har homologe sekvenser, anses for at være en omvendt forbindelse mellem genparaloger , der regulerer genekspression . Disse mikroRNA'er, kaldet konkurrerende endogene RNA'er , binder til specifikke regulatoriske elementer af gener og pseudogener, hvilket kan tjene som en anden forklaring på tilstedeværelsen af ​​et stort antal ikke-kodende sekvenser i det eukaryote genom [97] .

Evolution

MikroRNA'er er vigtige fylogenetiske markører på grund af deres påfaldende langsomme udviklingshastighed [98] . Det menes, at miRNA'er, som regulatoriske elementer, udviklede sig fra interfererende RNA'er , der tidligere blev brugt til at beskytte mod eksogent genetisk materiale , såsom vira [99] . Nogle mikroRNA'er, såsom humane mikroRNA'er af hsa-mir-548-familien, kunne dog stamme fra miniature omvendte transposoner [100] . Deres udseende åbnede muligheder for udvikling af morfologisk diversitet, da reguleringen af ​​genekspression kunne blive mere subtil og rettet, hvilket er særligt vigtigt i processen med individuel udvikling af individuelle organer [101] og muligvis af hele organismer [102 ] . Faktisk har hurtige hastigheder af morfologiske ændringer en tendens til at korrelere med miRNA-akkumulering [98] [101] .

Nye miRNA-arter dukker op på mange måder. De kan opstå fra tilfældige hårnåle i den ikke-kodende region af DNA (dvs. introner eller intergene elementer), såvel som ved duplikering eller modifikation af eksisterende miRNA'er [103] . De kan også opstå fra omvendte duplikationer af proteinkodende sekvenser, da hårnåle kan dannes fra dem [104] . Udviklingshastigheden (dvs. nukleotiderstatning) i nyligt opståede miRNA'er er sammenlignelig med den i ikke-kodende DNA, hvilket indebærer evolution via neutral drift . Men i gamle miRNA'er er udviklingshastigheden meget lavere og kan være mindre end én udskiftning pr. hundrede millioner år [102] . Dette bekræfter, at når et mikroRNA erhverver en bestemt funktion, udsættes det for ekstremt streng selektion [103] og forbliver næsten uændret i fremtiden. Derudover er forskellige regioner inden for et miRNA-gen påvirket af forskellige evolutionære processer, hvor de regioner, der kræves til forarbejdning og funktion, er meget mere konserverede [105] . Sjældent forsvinder miRNA'er fra dyregenomet [102] , selvom miRNA'er, der for nylig er dukket op (og derfor ofte ikke-funktionelle), ofte går tabt [103] . I Arabidopsis thaliana er den beregnede mikroRNA-gentabsrate 1,2-3,3 gener pr. million år [106] . Dette gør mikroRNA-gener til praktiske fylogenetiske markører, og måske forklarer de kompleksiteten af ​​leddyrs fylogenetiske forhold [107] .

MikroRNA'er er kodet i genomerne af de fleste eukaryoter , fra brunalger [108] til dyr. Forskelle i funktionerne af mikroRNA'er og deres behandling indikerer dog, at de optrådte uafhængigt i dyr og planter [109] . Udover flercellede planter og dyr kendes mikroRNA'er også i nogle encellede organismer, for eksempel blev de fundet i algen Chlamydomonas reinhardtii [110] . Ingen miRNA'er er endnu blevet isoleret i svampe, men forskellige træk ved deres udvikling indikerer, at miRNA'er også kan være kodet af deres genomer [ 111 ] . Fra marts 2010 er miRNA'er blevet beskrevet i 5000 arter [112] . Selvom korte RNA-fragmenter spænder fra 50 til flere hundrede nukleotider i længden er udbredt i bakterier , er ægte miRNA'er fraværende i bakterier [113] .

MikroRNA af vira

Siden 2004 er over 200 mikroRNA'er blevet isoleret fra dobbeltstrengede DNA-vira , hovedsageligt herpesvira og polyomavira . Virale miRNA'er er 22 ± 3 nukleotider lange, binder til mRNA i 3'-UTR , hvilket forårsager transkriptødelæggelse eller blokerer translation, mens miRNA-binding til målet, som i dyr, kun er delvis. Til dato er mål kun blevet identificeret for et relativt lille antal virale mikroRNA'er, og de kan undertrykke ekspressionen af ​​både det virale gen og værtscellegenet. For eksempel koder SV40 og beslægtede polyomavira for miRNA'er, der undertrykker ekspressionen af ​​det virale store T -antigen , og i α-, β- og γ-herpesvira er rollen af ​​miRNA'er under overgangen fra det latente til det lytiske stadium blevet vist. . I human herpesvirus type 6 er ekspressionen af ​​transkriptionsfaktorer formodentlig under kontrol af virale miRNA'er. Selvom virale mikroRNA'ers rolle i værtscellens liv lige er begyndt at blive undersøgt, bekræfter talrige eksperimentelle data med sikkerhed virale mikroRNA'ers deltagelse i så fundamentale biologiske processer som immungenkendelsesreaktioner, celleoverlevelse, vævsregenerering , celleproliferation og -differentiering . [114] .

Forskningsmetoder

Mens forskere intensivt har studeret miRNA'ers rolle i fysiologiske og patologiske processer, er der udviklet adskillige teknikker til at isolere miRNA'er. Imidlertid blev stabiliteten af ​​isolerede mikroRNA'er ofte stillet spørgsmålstegn ved [115] . MikroRNA'er nedbrydes meget lettere end mRNA'er, dels på grund af deres længde, men også på grund af den konstante tilstedeværelse af RNaser. I denne henseende skal prøver afkøles i is, og kun RNase-frit udstyr bør bruges til at arbejde med miRNA'er [116] .

MikroRNA-ekspression kan kvantificeres i en to-trins polymerasekædereaktion (PCR): det første trin er revers transkription PCR , efterfulgt af real-time PCR . Der er variationer af denne metode til bestemmelse af den absolutte eller relative mængde miRNA'er [117] . MikroRNA'er kan også hybridiseres til mikroarrays med prøver på hundreder eller tusinder af mikroRNA-mål og dermed bestemme det relative indhold af mikroRNA'er i forskellige prøver [118] . Nye miRNA'er kan opdages og sekventeres ved hjælp af high-throughput- sekventeringsteknikker ( miRNA-sekventering ) [119] . MikroRNA-aktivitet kan eksperimentelt undertrykkes ved hjælp af oligonukleotider af en lukket nukleinsyre ( Eng.  Locked nucleinsyre, LNA ), morpholino [120] [121] såvel som et oligoribonukleotid med en 2'-O-methylgruppe [122 ] . Derudover kan miRNA slås fra ved hjælp af en komplementær oligonukleotid- antagonisme . MicroRNA-modning kan stoppes på flere punkter ved hjælp af sterisk blokerende oligonukleotider [123] . De kan også blokere mRNA-stedet for binding til miRNA [124] . LNA [125] eller morpholino [126] assays kan bruges til in situ mikroRNA detektion . Fordi LNA har en lukket konformation, har det forbedret hybridiseringskapacitet, sensitivitet og specificitet, hvilket gør det til en ideel probe til miRNA-detektion [127] .

High-throughput mikroRNA kvantificering er ofte meget vanskelig og fører desuden ofte til fejl, hvilket forklares med store afvigelser (sammenlignet med mRNA) koblet med metodiske problemer. I denne forbindelse er det vigtigt at studere niveauet af miRNA-ekspression, samt at studere virkningerne af mikroRNA'er på et givet ekspressionsniveau [128] [129] . For at sammenligne data om mRNA og miRNA, bruges specielle databaser, der forudsiger mål-mRNA'et for et givet mikroRNA baseret på dets sekvensdata [130] [131] . Der er også udviklet en række metoder til at bestemme målet for en given miRNA [132] . Selvom denne teknologi anvendes efter at miRNA'et af interesse er blevet isoleret (især på grund af høje ekspressionsniveauer), er der blevet foreslået en række ideer til analyseværktøjer, der er i stand til at kombinere mRNA- og miRNA-data [133] [134] .

Klinisk betydning

Da miRNA'er er involveret i den eukaryote celles normale funktion, kan forstyrrelser i deres arbejde føre til sygdomstilstande [135] . Den offentligt tilgængelige miR2Disease- database indeholder information om forholdet mellem mikroRNA-fejl og forskellige sygdomme [136] .

Arvelige sygdomme

En mutation i frøregionen (dvs. mRNA-binding) af miR-96 forårsager arveligt progressivt høretab [137] . En mutation, der påvirker frøregionen af ​​miR-184, fører til udviklingen af ​​arvelig keratoconus , som er forudgået af polær katarakt [138] . Deletion af miR-17 forårsager defekter i skeletvækst og udvikling [139] .

Kræft

Kronisk lymfatisk leukæmi [135] var den første menneskelige sygdom, for hvilken der blev etableret en sammenhæng med nedsat mikroRNA-funktion . Efterfølgende blev mange miRNA'er forbundet med nogle typer kræft [135] [140] [141] (nogle gange kaldes sådanne miRNA'er oncomires ). En af de første miRNA'er, der blev identificeret som et onkomire, var miRNA21, som forårsager flere typer kræft, såsom glioblastom og astrocytom [142] .

En undersøgelse af mus, der overproducerer c-Myc  , et protein, hvis muterede former er impliceret i udviklingen af ​​flere typer kræft, viste, at mikroRNA'er har en effekt på kræftudvikling. Hos mutante mus, der producerer et overskud af miRNA'er fundet i lymfomceller , udviklede sygdommen sig efter 50 dage, og døden indtraf efter yderligere 2 uger. Til sammenligning levede mus uden overskydende miRNA i mere end 100 dage [140] . Det har vist sig, at leukæmi kan være forårsaget af introduktionen af ​​det virale genom før mikroRNA-generne, da dette øger ekspressionen af ​​de tilsvarende mikroRNA-gener [143] .

I en anden undersøgelse viste det sig, at to typer mikroRNA'er undertrykker E2F1-proteinet, som regulerer celleproliferation. MicroRNA kan binde til mRNA, før det oversættes til proteiner, der tænder eller slukker for bestemte gener [144] .

Ved at måle aktiviteten af ​​217 gener, der koder for mikroRNA'er, blev visse specifikke kombinationer af genaktivitet identificeret, som er karakteristiske for en bestemt form for cancer. Kræfttyper kan klassificeres baseret på miRNA'er. Dette vil gøre det muligt for klinikere at bestemme fra hvilket væv tumoren har udviklet sig og at vælge det passende behandlingsforløb baseret på information om typen af ​​væv [145] . Det er blevet fastslået, at miRNA'er bestemmer, om kronisk lymfatisk leukæmi udvikler sig langsomt eller bliver aggressiv [141] .

Baseret på eksperimenter med transgene mus med overdreven eller utilstrækkelig ekspression af specifikke miRNA'er, var det muligt at forstå rollen af ​​små RNA'er i udviklingen af ​​forskellige maligne tumorer [146] . Der er gjort meget arbejde for at fastslå miRNA'ers rolle i cancerstamceller , som er særligt resistente over for kemoterapi og i stand til tilbagefald [147] .

I øjeblikket er der udviklet en mikroRNA-baseret test til påvisning af tyktarms- og endetarmskræft i de tidlige stadier og er under kliniske forsøg. I nyere undersøgelser har det vist sig, at plasmaprøver fra patienter med tidligt resecerbart stadium af tyktarms- og endetarmskræft (stadie II) adskiller sig fra dem hos raske mennesker af forskelligt køn og alder. Tilstrækkelig specificitet og selektivitet kan opnås med små (mindre end 1 ml) blodvolumener. Denne test kunne være en effektiv og bekvem metode til at identificere risikopatienter, som skal gennemgå en koloskopi [148] [149] .

En anden anvendelse af mikroRNA'er til diagnosticering og behandling af cancer kan være i deres anvendelse til prognose. Ved lungekræft NSCLC kan en lav koncentration af miR-324a således tjene som en indikator for dårlig overlevelse [150] , og en høj koncentration af miR-185 eller en lav koncentration af miR-133b indikerer tilstedeværelsen af ​​metastaser og følgelig dårlig overlevelse i colon og rektum [151] .

Optimal kræftbehandling kræver en præcis opdeling af patienter efter risiko. Patienter med en hurtig respons på indledende behandling kommer sig med en ufuldstændig behandlingsmulighed, så omfanget af sygdommen skal vurderes ordentligt. Ekstracellulære miRNA'er er mere stabile i plasma og overudtrykkes i cancer og kan måles i laboratoriet. I klassisk Hodgkins lymfom tjener miR-21, miR-494 og miR-1973 indeholdt i blodplasmaet som pålidelige markører, der indikerer tilstedeværelsen af ​​sygdommen [152] . Cirkulerende miRNA'er er vigtige for at stille en diagnose sammen med positronemissionstomografi og computertomografi. En yderligere fordel ved metoden er evnen til konstant at vurdere graden af ​​udvikling af sygdommen og at overvåge forekomsten af ​​tilbagefald på et tidligt stadium.

Nylige undersøgelser har vist, at miR-205 hæmmer udviklingen af ​​metastaser i brystkræft [153] . Fem medlemmer af microRNA-200-familien (miR-200a, miR-200b, miR-200c, miR-141 og miR-429) er nedreguleret i udviklingen af ​​maligne neoplasmer i brystet [154] .

Hjertesygdom

Den globale rolle af miRNA i hjertet blev etableret ved betinget inhibering af miRNA i rottehjertet. Det viste sig, at miRNA er nødvendigt for udviklingen af ​​hjertet [155] [156] . Det er blevet vist, at ekspressionsniveauer af visse mikroRNA'er ændres i forskellige hjertesygdomme, hvilket indikerer deres involvering i udviklingen af ​​kardiomyopatier [157] [158] [159] . Derudover har undersøgelser af mikroRNA'er i dyremodeller vist en anden rolle for mikroRNA'er i hjerteudvikling og i patologiske tilstande. MikroRNA'er tjener som de vigtigste faktorer i kardiogenese , hypertrofisk vækst og hjerteledning [156] [160] [161] [162] [163] [164] .

microRNA-712

Rotte-microRNA-712 er en potentiel biomarkør for åreforkalkning . Åreforkalkning er en kardiovaskulær sygdom ledsaget af tilsmudsning af blodkarrenes indre vægge med et lipidlag , på grund af hvilket karrets lumen ændrer form, og en inflammatorisk proces [165] . Den ikke-laminære ( turbulente ) væskestrøm (d-strøm) , der observeres på grund af en ændring i formen af ​​karrets lumen, genkendes af mekanoreceptorer af endotelceller . d-current udløser også ekspressionen af ​​en række pro-atherogene gener, herunder matrix metalloproteinaser (MMP'er) , som tjener som et pro-inflammatorisk og pro-angiogent signal. Disse fakta blev etableret ved kunstig fastklemning af musens halspulsårer for at reproducere virkningerne af d-strøm. Inden for 24 timer transformeres pre-miRNA-712 til en moden form som reaktion på d-strøm. Disse data understøttes også af det faktum, at miR-712-ekspression er positivt reguleret i endotelceller , der beklæder aortabuen i området med størst krumning, dvs. hvor d-strøm normalt observeres [166] .

MicroRNA-712-precursoren transskriberes normalt fra intern spacer 2 ( intern space region 2, ITS2 ) af rotte RN45s rRNA -genet .  Under RN45s- behandling nedbrydes ITS2-regionen normalt af XRN1- exonukleasen . Under d-strømforhold reduceres mængden af ​​XRN1, og yderligere akkumulering af miR-712 forekommer, ud over mekanismen beskrevet ovenfor [166] .

miR-712 er rettet mod vævsinhibitoren af ​​metalloproteinaser 3 (TIMP3 ) 166] .  Proteiner fra TIMP-gruppen regulerer normalt aktiviteten af ​​matrixmetalloproteinaser (MMP'er), som ødelægger den ekstracellulære matrix ( ECM ) . Den arterielle ECM består primært af kollagen- og elastinfibre , der giver strukturel støtte og modstandsdygtighed til arterievæggene [167] . Disse fibre spiller også en afgørende rolle i reguleringen af ​​inflammatoriske processer i blodkarvæggene og deres permeabilitet, faktorer, der er vigtige for udviklingen af ​​åreforkalkning [168] . TIMP3 , udtrykt af endotelceller, er det eneste medlem af gruppen, der er i stand til at binde til ECM [167] . I nærvær af d-strøm fører et fald i TIMP3- ekspression til ødelæggelse af ECM. Undertrykkelse af præ-miR-712 øger således TIMP3 -ekspression i celler, selv i nærvær af d-strøm [166] .  

TIMP3 nedregulerer også TNFα (en pro-inflammatorisk regulator) ekspression i d-strøm. Indholdet af TNFα ved d-strøm blev målt ved aktiviteten i blodet af enzymet , der omdanner TNFα - TACE ( engelsk  TNFα converting enzyme ). TNFa-koncentration faldt, hvis miR-712 blev nedreguleret, eller TIMP3 blev overudtrykt. Dette bekræfter, at miR-712 og TIMP3 regulerer TACE-aktivitet under d-strømforhold [166] .

Anti-miR-712 undertrykker effektivt d-strøm induceret af miR-712 og øger TIMP3 -ekspression . Anti-miR-712 undertrykker også vaskulær hyperpermeabilitet og reducerer derved deres skade under åreforkalkning og indtrængning af immunceller uden for karret og reducerer dermed den inflammatoriske proces [166] .

Den humane homolog af miR-712 blev fundet i et gen, der er homologt med RN45s , der giver dannelsen af ​​mikroRNA'er svarende til dem i rotter. Dette humane mikroRNA (miR-205) har en sekvens svarende til den for rotte miR-172; desuden er denne sekvens bevaret i de fleste hvirveldyr . miR-205 og miR-712 deler også mere end 50 % af signalmålene, inklusive TIMP3 [166] .

Det viste sig, at d-strøm reducerer ekspressionen af ​​XRN1 -genet hos mennesker, svarende til hvordan det forekommer i mus, hvilket indikerer en lignende rolle for XRN1 hos mennesker [166] . Mens den menneskelige homolog endnu ikke er fuldt ud forstået, kan opdagelsen og funktionen af ​​miR-712 danne grundlag for yderligere forskning om dets anvendelse som en biomarkør i en rottemodel for åreforkalkning.

Nervesystemet

MikroRNA'er spiller også en regulerende rolle i nervesystemet [169] . Neuronale mikroRNA'er er involveret i forskellige stadier af dannelsen af ​​neurale forbindelser, herunder dendritogenese (miR-132, miR-134 og miR-124), synapsedannelse og modning (disse processer synes at involvere miR-134 og miR-138) [170 ] . MiRNAs rolle i hukommelsesdannelse er blevet vist [171] [172] . Nogle undersøgelser peger på ændringer i miRNA-ekspression ved skizofreni [173] [174] .

Andre sygdomme

MikroRNA'er spiller en nøglerolle i differentieringen af ​​stamceller til adipocytter ( fedtvævsceller ) [175] . Undersøgelsen af ​​pluripotente stamcellers rolle i adipogenese blev udført på en kultur af udødelige celler afledt af knoglemarvsceller fra hMSC-Tert20-linjen [176] . Nedsat ekspression af miR-155, miR-221 og miR-222 blev fundet i udødelige celler, der passerede gennem differentieringsstadiet til adipocytter, hvilket indikerer, at disse mikroRNA'er fungerer som negative regulatorer af differentiering. Samtidig undertrykte den forskudte -ekspression af disse miRNA'er adipogenese signifikant og undertrykte inklusion af hovedregulatoren PPARy og CCAAT/ enhancer -bindende protein alfa ( CEBPA ) [177] . Dette giver muligheder for behandling af fedme på det genetiske niveau.

En anden gruppe af mikroRNA'er, der regulerer insulinresistens og er involveret i udviklingen af ​​fedme og diabetes, er let-7-familien. Let-7 akkumuleres i væv, når vi bliver ældre. Da let-7 blev ektopisk udtrykt for kunstigt at fremskynde aldring, blev mus insulinresistente, og at spise en meget nærende kost førte til udvikling af fedme og diabetes [178] . Hvis let-7 blev undertrykt af en specifik antagonist, blev mus tværtimod mere insulinfølsomme, og den meget nærende mad forårsagede ikke fedme og diabetes hos dem. Undertrykkelse af let-7 kan ikke kun forhindre udviklingen af ​​diabetes og fedme, men kan også bruges til at behandle disse sygdomme [179] . Derfor kunne nedregulering af let-7 være en ny behandling for fedme og type 2-diabetes.

MicroRNA miR-140 er involveret i patogenesen af ​​slidgigt ved at regulere ekspressionen af ​​ADAMTS5 -genet [180] . Mus, der ikke udtrykker miR-140, har nedsat chondrocytproliferation og har en dværgfænotype .

Noter

  1. ↑ Chen K., Rajewsky N. Udviklingen af ​​genregulering ved hjælp af transkriptionsfaktorer og mikroRNA'er  //  Nature Reviews Genetics. - 2007. - Bd. 8 , nr. 2 . - S. 93-103 .
  2. ↑ Finch ML, Marquardt JU, Yeoh GC, Callus BA Regulering af mikroRNA'er og deres rolle i leverudvikling, regenerering og sygdom // Int J Biochem Cell Biol. - 2014. - doi : 10.1016/j.biocel.2014.04.002 . — PMID 24731940 .
  3. ↑ Nukleinsyrer: fra A til Z / B. Appel [et al.]. - M. : Binom: Videnlaboratoriet, 2013. - 413 s. - 700 eksemplarer.  - ISBN 978-5-9963-0376-2 .
  4. ↑ ScienceDirect . Hentet 30. november 2016. Arkiveret fra originalen 23. august 2020.
  5. ↑ Bartel DP MicroRNAs: målgenkendelse og regulatoriske funktioner  // Celle  :  journal. - Cell Press , 2009. - Januar ( vol. 136 , nr. 2 ). - S. 215-233 . - doi : 10.1016/j.cell.2009.01.002 . — PMID 19167326 .
  6. ↑ Kusenda B., Mraz M., Mayer J., Pospisilova S. MicroRNA biogenese, funktionalitet og cancerrelevans  //  Biomed Pap Med Fac Univ Palacky Olomouc Tjekkiet : tidsskrift. - 2006. - November ( bind 150 , nr. 2 ). - S. 205-215 . - doi : 10.5507/bp.2006.029 . — PMID 17426780 .
  7. ↑ Galitsky V. A. Hypotese om mekanismen for initiering af de novo DNA-methylering og allelisk udelukkelse af små RNA'er  // Tsitology: journal. - 2008. - T. 50 , nr. 4 . - S. 277-286 .
  8. ↑ Homo sapiens miRNA'er i miRBase Arkiveret 27. marts 2014 på Wayback Machine ved Manchester University
  9. ↑ Peterson SM, Thompson JA, Ufkin ML, Sathyanarayana P., Liaw L., Congdon CB Fælles træk ved mikroRNA -målforudsigelsesværktøjer  // Front Genet. - 2014. - T. 5 . - S. 23 . - doi : 10.3389/fgene.2014.00023 . — PMID 24600468 .
  10. ↑ Friedländer MR., Lizano E., Houben AJ, Bezdan D., Báñez-Coronel M., Kudla G., Mateu-Huertas E., Kagerbauer B., González J., Chen KC, Leproust EM, Martí E., Estivill X. Beviser for biogenese af mere end 1.000 nye humane mikroRNA'er // Genome Biol. - 2014. - T. 15 , no. 4 . - S. R57 . — PMID 24708865 .
  11. ↑ 1 2 3 Lewis BP, Burge CB, Bartel DP Konserveret frøparring, ofte flankeret af adenosiner, indikerer, at tusindvis af menneskelige gener er mikroRNA-mål  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 120 , nr. 1 . - S. 15-20 . - doi : 10.1016/j.cell.2004.12.035 . — PMID 15652477 .
  12. ↑ Friedman RC, Farh KK, Burge CB, Bartel DP De fleste mammale mRNA'er er bevarede mål for mikroRNA'er  // Genome Res  . : journal. - 2009. - Januar ( bind 19 , nr. 1 ). - S. 92-105 . - doi : 10.1101/gr.082701.108 . — PMID 18955434 .
  13. ↑ Tanzer A., ​​Stadler PF Molekylær udvikling af en mikroRNA-klynge  //  J. Mol. Biol. : journal. - 2004. - Maj ( bd. 339 , nr. 2 ). - s. 327-335 . - doi : 10.1016/j.jmb.2004.03.065 . — PMID 15136036 .
  14. ↑ Molnár A., ​​​​Schwach F., Studholme DJ, Thuenemann EC, Baulcombe DC miRNA'er kontrollerer genekspression i den enkeltcellede algen Chlamydomonas reinhardtii  //  Nature: journal. - 2007. - Juni ( vol. 447 , nr. 7148 ). - S. 1126-1129 . - doi : 10.1038/nature05903 . - . — PMID 17538623 .
  15. ↑ Kren BT, Wong PY, Sarver A., ​​​​Zhang X., Zeng Y., Steer CJ MikroRNA'er identificeret i højt oprensede leverafledte mitokondrier kan spille en rolle i apoptose  // RNA  Biol : journal. - 2009. - Bd. 6 , nr. 1 . - S. 65-72 . doi : 10.4161 / rna.6.1.7534 . — PMID 19106625 .
  16. ↑ Lee CT, Risom T., Strauss WM Evolutionær konservering af mikroRNA-regulatoriske kredsløb: en undersøgelse af mikroRNA-genkompleksitet og konserverede mikroRNA-målinteraktioner gennem metazoan fylogeni  // DNA Cell Biol  . : journal. - 2007. - April ( bind 26 , nr. 4 ). - S. 209-218 . - doi : 10.1089/dna.2006.0545 . — PMID 17465887 .
  17. ↑ Lim LP, Lau NC, Weinstein EG, Abdelhakim A., Yekta S., Rhoades MW, Burge CB, Bartel DP The microRNAs of Caenorhabditis elegans  // Genes Dev  .  : journal. - 2003. - April ( bind 17 , nr. 8 ). - S. 991-1008 . - doi : 10.1101/gad.1074403 . — PMID 12672692 .
  18. ↑ Shabalina SA, Koonin EV Oprindelse og udvikling af eukaryotisk RNA-interferens  //  Trends in Ecology and Evolution. : journal. - 2008. - Oktober ( bind 10 , nr. 10 ). - s. 578-587 . - doi : 10.1016/j.tree.2008.06.005 . — PMID 18715673 .
  19. ↑ Brodersen P., Sakvarelidze-Achard L., Bruun-Rasmussen M., Dunoyer P., Yamamoto YY, Sieburth L., Voinnet O. Widespread translational inhibition by plant miRNAs and siRNAs  //  Science : journal. - 2008. - Maj ( vol. 320 , nr. 5880 ). - S. 1185-1190 . - doi : 10.1126/science.1159151 . - . — PMID 18483398 .
  20. ↑ 1 2 He L., Hannon GJ MikroRNA'er: små RNA'er med en stor rolle i genregulering  //  Nature: journal. - 2004. - Juli ( bind 5 , nr. 7 ). - S. 522-531 . doi : 10.1038 / nrg1379 . — PMID 15211354 .
  21. ↑ 1 2 3 Lewis BP, Shih IH, Jones-Rhoades M., Bartel DP, Burge CB Prediction of Mammalian MicroRNA Targets   // Cell . - Cell Press , 2003. - Vol. 115 , nr. 7 . - s. 787-798 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)01018-3 . — PMID 14697198 .
  22. ↑ Rajewsky, Nikolaus. mikroRNA-målforudsigelser hos dyr  // Nature Genetics  : tidsskrift  . — Bd. 38 , nr. 6s . -P.S8- S13 . - doi : 10.1038/ng1798 .
  23. ↑ Krek, Azra; Grün, Dominic; Poy, Matthew N; Wolf, Rachel; Rosenberg, Lauren; Epstein, Eric J; MacMenamin, Philip; da Piedade, Isabelle; Gunsalus, Kristin C; Stoffel, Markus; Rajewsky, Nikolaus. Kombinatoriske mikroRNA-målforudsigelser  // Nature Genetics  : tidsskrift  . — Bd. 37 , nr. 5 . - S. 495-500 . - doi : 10.1038/ng1536 . — PMID 15806104 .
  24. ↑ 1 2 Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. C. elegans heterokroniske gen lin-4 koder for små RNA'er med antisense komplementaritet til lin-14  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1993. - December ( vol. 75 , nr. 5 ). - S. 843-854 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . — PMID 8252621 .
  25. ↑ 1 2 Lim LP, Lau NC, Garrett-Engele P., Grimson A., Schelter JM, Castle J., Bartel DP, Linsley PS, Johnson JM Mikroarray-analyse viser, at nogle mikroRNA'er nedregulerer et stort antal mål  - mRNA'er  // Natur: tidsskrift. - 2005. - Februar ( bind 433 , nr. 7027 ). - s. 769-773 . - doi : 10.1038/nature03315 . — . — PMID 15685193 .
  26. ↑ Brennecke J., Hipfner DR, Stark A., Russell RB, Cohen SM bantam koder for et udviklingsreguleret mikroRNA, der kontrollerer celleproliferation og regulerer det proapoptotiske gen gemt i Drosophila  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2003. - April ( vol. 113 , nr. 1 ). - S. 25-36 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00231-9 . — PMID 12679032 .
  27. ↑ Cuellar TL, McManus MT MikroRNA'er og endokrin biologi  //  J. Endocrinol. : journal. - 2005. - December ( bd. 187 , nr. 3 ). - s. 327-332 . - doi : 10.1677/joe.1.06426 . — PMID 16423811 .
  28. ↑ Poy MN, Eliasson L., Krutzfeldt J., Kuwajima S., Ma X., Macdonald PE, Pfeffer S., Tuschl T., Rajewsky N., Rorsman P., Stoffel M. En pancreas-ø-specifik mikroRNA regulerer insuliner sekretion  (engelsk)  // Natur: journal. - 2004. - November ( bd. 432 , nr. 7014 ). - S. 226-230 . - doi : 10.1038/nature03076 . - . — PMID 15538371 .
  29. ↑ Chen CZ, Li L., Lodish HF, Bartel DP MicroRNAs modulerer hæmatopoietisk afstamningsdifferentiering  //  Science: journal. - 2004. - Januar ( bind 303 , nr. 5654 ). - S. 83-6 . - doi : 10.1126/science.1091903 . - . — PMID 14657504 .
  30. ↑ Wilfred BR, Wang WX, Nelson PT Energiserende miRNA-forskning: en gennemgang af miRNAs rolle i lipidmetabolisme med en forudsigelse om, at miR-103/107 regulerer menneskelige metaboliske veje   // Mol . Genet. Metab. : journal. - 2007. - Juli ( bd. 91 , nr. 3 ). - S. 209-217 . - doi : 10.1016/j.ymgme.2007.03.011 . — PMID 17521938 .
  31. ↑ Harfe BD, McManus MT, Mansfield JH, Hornstein E., Tabin CJ RNaseIII-enzymet Dicer er påkrævet til morfogenese, men ikke mønsterdannelse af hvirveldyrets lemmer   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2005. - August ( bind 102 , nr. 31 ). - P. 10898-10903 . - doi : 10.1073/pnas.0504834102 . — . — PMID 16040801 .
  32. ↑ Lagos-Quintana M., Rauhut R., Yalcin A., Meyer J., Lendeckel W., Tuschl T. Identifikation af vævsspecifikke mikroRNA'er fra mus   // Curr . Biol.  : journal. - 2002. - April ( bind 12 , nr. 9 ). - s. 735-739 . - doi : 10.1016/S0960-9822(02)00809-6 . — PMID 12007417 .
  33. ↑ Trang P., Weidhaas JB, Slack FJ MicroRNAs as potential cancer  therapeutics //  Onkogen. - 2008. - December ( bind 27 Suppl 2 ). - P.S52-7 . - doi : 10.1038/onc.2009.353 . — PMID 19956180 .
  34. ↑ Li C., Feng Y., Coukos G., Zhang L. Terapeutiske mikroRNA-strategier i human cancer  //  AAPS J : journal. - 2009. - December ( bind 11 , nr. 4 ). - s. 747-757 . - doi : 10.1208/s12248-009-9145-9 . — PMID 19876744 .
  35. ↑ Fasanaro P., Greco S., Ivan M., Capogrossi MC, Martelli F. mikroRNA: nye terapeutiske mål ved akutte iskæmiske sygdomme   // Pharmacol . Ther.  : journal. - 2010. - Januar ( bind 125 , nr. 1 ). - S. 92-104 . - doi : 10.1016/j.pharmthera.2009.10.003 . — PMID 19896977 .
  36. ↑ Hydbring, Per; Badalian-Meget, Gayane. Kliniske anvendelser af mikroRNA'er  (udefineret)  // F1000Forskning. - 2013. - August ( bind 2 ). - doi : 10.12688/f1000research.2-136.v2 .
  37. ↑ Thomson DW, Bracken CP, Goodall GJ Eksperimentelle strategier til mikroRNA-målidentifikation  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2011. - September ( bind 39 , nr. 16 ). - P. 6845-6853 . - doi : 10.1093/nar/gkr330 . — PMID 21652644 .
  38. ↑ John B., Enright AJ, Aravin A., Tuschl T., Sander C., Marks DS Human MicroRNA targets  // PLoS Biol  .  : journal. - 2004. - November ( bind 2 , nr. 11 ). —P.e363 . _ - doi : 10.1371/journal.pbio.0020363 . — PMID 15502875 .
  39. ↑ Krek A., Grün D., Poy MN, Wolf R., Rosenberg L., Epstein EJ, MacMenamin P., da Piedade I., Gunsalus KC, Stoffel M., Rajewsky N. Combinatorial microRNA target predictions   // Nat. Genet.  : journal. - 2005. - Maj ( bind 37 , nr. 5 ). - S. 495-500 . - doi : 10.1038/ng1536 . — PMID 15806104 .
  40. ↑ Selbach M., Schwanhäusser B., Thierfelder N., Fang Z., Khanin R., Rajewsky N. Udbredte ændringer i proteinsyntese induceret af mikroRNA'er  //  Nature : journal. - 2008. - September ( bind 455 , nr. 7209 ). - S. 58-63 . - doi : 10.1038/nature07228 . — PMID 18668040 .
  41. ↑ Baek D., Villén J., Shin C., Camargo FD, Gygi SP, Bartel DP Indvirkningen af ​​mikroRNA'er på proteinoutput   // Nature . - 2008. - September ( bind 455 , nr. 7209 ). - S. 64-71 . - doi : 10.1038/nature07242 . — PMID 18668037 .
  42. ↑ Reinhart BJ, Slack FJ, Basson M., Pasquinelli AE, Bettinger JC, Rougvie AE, Horvitz HR, Ruvkun G. The 21-nucleotide let-7 RNA regulates developmental timing in Caenorhabditis elegans  //  Nature : journal. - 2000. - Februar ( bind 403 , nr. 6772 ). - S. 901-906 . - doi : 10.1038/35002607 . - . — PMID 10706289 .
  43. ↑ Pasquinelli AE, Reinhart BJ, Slack F., Martindale MQ, Kuroda MI, Maller B., Hayward DC, Ball EE, Degnan B., Müller P., Spring J., Srinivasan A., Fishman M., Finnerty J. , Corbo J., Levine M., Leahy P., Davidson E., Ruvkun G. Konservering af sekvensen og den tidsmæssige ekspression af let-7 heterokronisk regulatorisk RNA  //  Nature: journal. - 2000. - November ( bind 408 , nr. 6808 ). - S. 86-9 . - doi : 10.1038/35040556 . — PMID 11081512 .
  44. ↑ Almeida MI, Reis RM, Calin GA MicroRNA-historie: opdagelse, nyere anvendelser og næste grænser // Mutat Res .. - 2011. - T. 717 . - S. 1-8 . - doi : 10.1016/j.mrfmmm.2011.03.009 .
  45. ↑ Ambros V., Bartel B., Bartel DP, Burge CB, Carrington JC, Chen X., Dreyfuss G., Eddy SR, Griffiths-Jones S., Marshall M., Matzke M., Ruvkun G., Tuschl T. Et ensartet system til mikroRNA-annotering   // RNA . - 2003. - Marts ( bind 9 , nr. 3 ). - S. 277-279 . - doi : 10.1261/rna.2183803 . — PMID 12592000 .
  46. ↑ Griffiths-Jones S., Grocock RJ, van Dongen S., Bateman A., Enright AJ miRBase: microRNA-sekvenser, mål og gennomenklatur  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2006. - Januar ( bind 34 , nr. Databaseudgave ). - P.D140-4 . - doi : 10.1093/nar/gkj112 . — PMID 16381832 .
  47. ↑ miRBase: Hvad betyder miRNA-navnene/identifikatorerne? . Hentet 7. maj 2014. Arkiveret fra originalen 7. oktober 2014.
  48. ↑ 1 2 Lau NC, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP En rigelig klasse af bittesmå RNA'er med sandsynlige regulatoriske roller i Caenorhabditis elegans  //  Science : journal. - 2001. - Oktober ( bind 294 , nr. 5543 ). - S. 858-862 . - doi : 10.1126/science.1065062 . - . — PMID 11679671 .
  49. ↑ 1 2 3 4 5 6 Lee Y., Kim M., Han J., Yeom KH, Lee S., Baek SH, Kim VN MikroRNA-gener transskriberes af RNA-polymerase II  // EMBO  J. : journal. - 2004. - Oktober ( bind 23 , nr. 20 ). - S. 4051-4060 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600385 . — PMID 15372072 .
  50. ↑ Lagos-Quintana M., Rauhut R., Lendeckel W., Tuschl T. Identifikation af nye gener, der koder for små udtrykte RNA'er  //  Science : journal. - 2001. - Oktober ( bind 294 , nr. 5543 ). - S. 853-858 . - doi : 10.1126/science.1064921 . - . — PMID 11679670 .
  51. ↑ Lee RC, Ambros V. En omfattende klasse af små RNA'er i Caenorhabditis elegans  //  Science : journal. - 2001. - Oktober ( bind 294 , nr. 5543 ). - s. 862-864 . - doi : 10.1126/science.1065329 . - . — PMID 11679672 .
  52. ↑ Mraz M., Dolezalova D., Plevova K., Stano Kozubik K., Mayerova V., Cerna K., Musilova K., Tichy B., Pavlova S., Borsky M., Verner J., Doubek M., Brychtova Y., Trbusek M., Hampl A., Mayer J., Pospisilova S. MicroRNA-650-ekspression er påvirket af immunoglobulingen-omlejring og påvirker biologien af ​​kronisk lymfatisk   leukæmi // Blod : journal. — American Society of Hematology, 2012. - Marts ( bd. 119 , nr. 9 ). - S. 2110-2113 . - doi : 10.1182/blood-2011-11-394874 . — PMID 22234685 .
  53. ↑ 1 2 Rodriguez A., Griffiths-Jones S., Ashurst JL, Bradley A. Identifikation af pattedyrs mikroRNA-værtsgener og transkriptionsenheder  // Genome Res  . : journal. - 2004. - Oktober ( bind 14 , nr. 10A ). - S. 1902-1910 . - doi : 10.1101/gr.2722704 . — PMID 15364901 .
  54. ↑ 1 2 3 4 Cai X., Hagedorn CH, Cullen BR Humane mikroRNA'er bearbejdes fra kappede, polyadenylerede transkripter, der også kan fungere som mRNA'er  //  RNA : journal. - 2004. - December ( bind 10 , nr. 12 ). - P. 1957-1966 . - doi : 10.1261/rna.7135204 . — PMID 15525708 .
  55. ↑ Weber MJ Nye mikroRNA-gener fra mennesker og mus fundet ved homologisøgning  // FEBS  J. : journal. - 2005. - Januar ( bind 272 , nr. 1 ). - S. 59-73 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.2004.04389.x . — PMID 15634332 .
  56. ↑ Kim YK, Kim VN Behandling af introniske mikroRNA'er  // EMBO  J. : journal. - 2007. - Februar ( bind 26 , nr. 3 ). - s. 775-783 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7601512 . — PMID 17255951 .
  57. ↑ Baskerville S., Bartel DP Mikroarray-profilering af mikroRNA'er afslører hyppig samekspression med nabo-miRNA'er og værtsgener  //  RNA: journal. - 2005. - Marts ( bind 11 , nr. 3 ). - S. 241-247 . - doi : 10.1261/rna.7240905 . — PMID 15701730 .
  58. ↑  Altuvia Y., Landgraf P., Lithwick G., Elefant N., Pfeffer S., Aravin A., Brownstein MJ, Tuschl T., Margalit H. Clustering and conservation patterns of human microRNAs  // Nucleic Acids Res. : journal. - 2005. - Bd. 33 , nr. 8 . - P. 2697-2706 . doi : 10.1093 / nar/gki567 . — PMID 15891114 .
  59. ↑ 1 2 Zhou X., Ruan J., Wang G., Zhang W. Karakterisering og identifikation af mikroRNA-kernepromotorer i fire  modelarter // PLoS Comput  . Biol.  : journal. - 2007. - Marts ( bind 3 , nr. 3 ). — P.e37 . - doi : 10.1371/journal.pcbi.0030037 . - . — PMID 17352530 .
  60. ↑ Faller M., Guo F. MikroRNA-biogenese: der er mere end én måde at flå en kat på   // Biochim . Biofys. Acta : journal. - 2008. - November ( bd. 1779 , nr. 11 ). - S. 663-667 . - doi : 10.1016/j.bbagrm.2008.08.005 . — PMID 18778799 .
  61. ↑ Gregory RI, Chendrimada TP, Shiekhattar R. MikroRNA-biogenese: isolering og karakterisering af mikroprocessorkomplekset  // Metoder Mol  . Biol. : journal. - 2006. - Bd. 342 . - S. 33-47 . — ISBN 1-59745-123-1 . - doi : 10.1385/1-59745-123-1:33 . — PMID 16957365 .
  62. ↑ Berezikov E., Chung WJ, Willis J., Cuppen E., Lai EC Mammalian mirtron-gener   // Mol . celle : journal. - 2007. - Oktober ( bind 28 , nr. 2 ). - s. 328-336 . - doi : 10.1016/j.molcel.2007.09.028 . — PMID 17964270 .
  63. ↑ 1 2 Kawahara Y., Megraw M., Kreider E., Iizasa H., Valente L., Hatzigeorgiou AG, Nishikura K. Frekvens og skæbne for mikroRNA-redigering i menneskelig hjerne  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2008. - September ( bind 36 , nr. 16 ). - P. 5270-5280 . doi : 10.1093 / nar/gkn479 . — PMID 18684997 .
  64. ↑ Winter J., Jung S., Keller S., Gregory RI, Diederichs S. Mange veje til modenhed: mikroRNA-biogeneseveje og deres regulering   // Nat . Celle biol.  : journal. - 2009. - Marts ( bind 11 , nr. 3 ). - S. 228-234 . - doi : 10.1038/ncb0309-228 . — PMID 19255566 .
  65. ↑ Ohman M. A-til-I-redigeringsudfordrer eller allieret til mikroRNA - processen  //  Biochimie : journal. - 2007. - Oktober ( bind 89 , nr. 10 ). - S. 1171-1176 . - doi : 10.1016/j.biochi.2007.06.002 . — PMID 17628290 .
  66. ↑ 1 2 Murchison EP, Hannon GJ miRNA'er på vej: miRNA-biogenese og RNAi-maskineriet   // Curr . Opin. Celle biol. : journal. - Elsevier , 2004. - Juni ( bind 16 , nr. 3 ). - S. 223-229 . - doi : 10.1016/j.ceb.2004.04.003 . — PMID 15145345 .
  67. ↑ 1 2 3 Lund E., Dahlberg JE Substratselektivitet af eksportin 5 og Dicer i biogenese af mikroRNA'er  //  Cold Spring Harb. Symp. kvant. Biol. : journal. - 2006. - Bd. 71 . - S. 59-66 . - doi : 10.1101/sqb.2006.71.050 . — PMID 17381281 .
  68. ↑ Ji X. Mekanismen for RNase III-handling: hvordan dicer terninger  (ubestemt)  // Curr. top. mikrobiol. Immunol.. - 2008. - T. Aktuelle emner i mikrobiologi og immunologi . - S. 99-116 . - ISBN 978-3-540-75156-4 . - doi : 10.1007/978-3-540-75157-1_5 . — PMID 18268841 .
  69. ↑ Lelandais-Brière C., Sorin C., Declerck M., Benslimane A., Crespi M., Hartmann C. Lille RNA-diversitet i planter og dens indvirkning på udvikling  // Current  Genomics : journal. - 2010. - Marts ( bind 11 , nr. 1 ). - S. 14-23 . - doi : 10.2174/138920210790217918 . — PMID 20808519 .
  70. ↑ Rana TM Belysning af stilheden: forståelse af strukturen og funktionen af ​​små RNA'er   // Nat . Rev. Mol. Celle biol.  : journal. - 2007. - Januar ( bind 8 , nr. 1 ). - S. 23-36 . - doi : 10.1038/nrm2085 . — PMID 17183358 .
  71. ↑ 1 2 Schwarz DS, Zamore PD Hvorfor lever miRNA'er i miRNP? (engelsk)  // Genes Dev.  : journal. - 2002. - Maj ( bind 16 , nr. 9 ). - S. 1025-1031 . - doi : 10.1101/gad.992502 . — PMID 12000786 .
  72. ↑ Krol J., Sobczak K., Wilczynska U., Drath M., Jasinska A., Kaczynska D., Krzyzosiak WJ Strukturelle træk ved mikroRNA (miRNA)-prækursorer og deres relevans for miRNA-biogenese og små interfererende RNA/kort hårnåle-RNA-design  (engelsk)  // J Biol Chem  : tidsskrift. - 2004. - Bd. 279 , nr. 40 . - P. 42230-42239 . - doi : 10.1074/jbc.M404931200 . — PMID 15292246 .
  73. ↑ Khvorova A. , Reynolds A., Jayasena SD Funktionelle siRNA'er og miRNA'er udviser streng bias   // Cell . - Cell Press , 2003. - Vol. 115 , nr. 2 . - S. 209-216 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00801-8 . — PMID 14567918 .
  74. ↑ Schwarz DS, Hutvágner G., Du T., Xu Z., Aronin N., Zamore PD Asymmetry in the assembly of the RNAi enzyme complex  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2003. - Vol. 115 , nr. 2 . - S. 199-208 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00759-1 . — PMID 14567917 .
  75. ↑ Lin SL, Chang D., Ying SY Asymmetri af introniske præ-miRNA-strukturer i funktionel RISC  -samling //  Gene : journal. — Elsevier , 2005. — Vol. 356 . - S. 32-8 . - doi : 10.1016/j.gene.2005.04.036 . — PMID 16005165 .
  76. ↑ Okamura K., Chung WJ, Lai EC De lange og korte af inverterede gentagelsesgener hos dyr  : mikroRNA'er, mirtroner og hårnåle-RNA'er  // Cellecyklus : journal. - 2008. - Bd. 7 , nr. 18 . - S. 2840-2845 . - doi : 10.4161/cc.7.18.6734 . — PMID 18769156 .
  77. ↑ 1 2 Pratt AJ, MacRae IJ Det RNA-inducerede lyddæmpningskompleks: en alsidig gendæmpningsmaskine  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2009. - Juli ( bd. 284 , nr. 27 ). - P. 17897-17901 . - doi : 10.1074/jbc.R900012200 . — PMID 19342379 .
  78. ↑ MacRae IJ, Ma E., Zhou M., Robinson CV, Doudna JA In vitro-rekonstitution af det menneskelige RISC-belastningskompleks  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2008. - Januar ( bind 105 , nr. 2 ). - S. 512-517 . - doi : 10.1073/pnas.0710869105 . - . — PMID 18178619 .
  79. ↑ Mourelatos Z., Dostie J., Paushkin S., Sharma A., Charroux B., Abel L., Rappsilber J., Mann M., Dreyfuss G. miRNP'er: en ny klasse af ribonukleoproteiner, der indeholder talrige  mikroRNA'er  // Genes Dev .  : journal. - 2002. - Marts ( bind 16 , nr. 6 ). - S. 720-728 . - doi : 10.1101/gad.974702 . — PMID 11914277 .
  80. ↑ Meister G., Landthaler M., Peters L., Chen P., Urlaub H., Lurhmann R., Tuschl T. Identification of Novel Argonaute-Associated Proteins  // Current Biology  : journal  . - Cell Press , 2005. - December ( bd. 15 , nr. 23 ). - S. 2149-2155 . - doi : 10.1016/j.cub.2005.10.048 . — PMID 16289642 .
  81. ↑ 1 2 3 Kai ZS, Pasquinelli AE MicroRNA assassins: faktorer, der regulerer forsvinden af ​​miRNA'er   // Nat . Struktur. Mol. Biol.  : journal. - 2010. - Januar ( bind 17 , nr. 1 ). - S. 5-10 . - doi : 10.1038/nsmb.1762 . — PMID 20051982 .
  82. ↑ Chatterjee S., Großhans H. Aktiv omsætning modulerer moden mikroRNA-aktivitet i Caenorhabditis elegans  //  Natur: journal. - 2009. - September ( vol. 461 , nr. 7263 ). - S. 546-459 . - doi : 10.1038/nature08349 . — . — PMID 19734881 .
  83. ↑ Wang XJ, Reyes JL, Chua NH, Gaasterland T. Forudsigelse og identifikation af Arabidopsis thaliana mikroRNA'er og deres mRNA-mål  // Genome Biol  . : journal. - 2004. - Bd. 5 , nr. 9 . — P.R65 . - doi : 10.1186/gb-2004-5-9-r65 . — PMID 15345049 .
  84. ↑ Kawasaki H., Taira K. MicroRNA-196 hæmmer HOXB8-ekspression i myeloid differentiering af HL60-celler  //  Nucleic Acids Symp Ser : journal. - 2004. - Bd. 48 , nr. 48 . - S. 211-212 . - doi : 10.1093/nass/48.1.211 . — PMID 17150553 .
  85. ↑ 1 2 Moxon S., Jing R., Szittya G., Schwach F., Rusholme Pilcher RL, Moulton V., Dalmay T.  Dyb sekventering af tomatkorte RNA'er identificerer mikroRNA'er rettet mod gener involveret i frugtmodning  // Genome Res. : journal. - 2008. - Oktober ( bind 18 , nr. 10 ). - S. 1602-1609 . - doi : 10.1101/gr.080127.108 . — PMID 18653800 .
  86. ↑ Mazière P., Enright AJ Forudsigelse af mikroRNA-mål  // Drug Discov  . I dag : journal. - 2007. - Juni ( bind 12 , nr. 11-12 ). - S. 452-458 . - doi : 10.1016/j.drudis.2007.04.002 . — PMID 17532529 .
  87. ↑ Williams AE Funktionelle aspekter af animalske mikroRNA'er   // Celle . Mol. livsvidenskab.  : journal. - 2008. - Februar ( bind 65 , nr. 4 ). - S. 545-562 . - doi : 10.1007/s00018-007-7355-9 . — PMID 17965831 .
  88. ↑ Eulalio A., Huntzinger E., Nishihara T., Rehwinkel J., Fauser M., Izaurralde E. Deadenylering er en udbredt effekt af miRNA-regulering  //  RNA : journal. - 2009. - Januar ( bind 15 , nr. 1 ). - S. 21-32 . - doi : 10.1261/rna.1399509 . — PMID 19029310 .
  89. ↑ Bazzini AA, Lee MT, Giraldez AJ Ribosomprofilering viser, at miR-430 reducerer translation, før det forårsager mRNA-henfald i zebrafisk  //  Science : journal. - 2012. - April ( bd. 336 , nr. 6078 ). - S. 233-237 . - doi : 10.1126/science.1215704 . - . — PMID 22422859 .
  90. ↑ Djuranovic S., Nahvi A., Green R. miRNA-medieret gendæmpning ved translationel undertrykkelse efterfulgt af mRNA-deadenylering og henfald  //  Science : journal. - 2012. - April ( bd. 336 , nr. 6078 ). - S. 237-240 . - doi : 10.1126/science.1215691 . - . — PMID 22499947 .
  91. ↑ 1 2 3 Morozova N., Zinovyev A., Nonne N., Pritchard LL, Gorban AN, Harel-Bellan A. Kinetiske signaturer af mikroRNA-virkningsmåder  (neopr.)  // RNA. - 2012. - September ( bind 18 , nr. 9 ). - S. 1635-1655 . - doi : 10.1261/rna.032284.112 . — PMID 22850425 .
  92. ↑ Tan Y., Zhang B., Wu T., Skogerbø G., Zhu X., Guo X., He S., Chen R. Transcriptional inhibiton of Hoxd4 expression by miRNA-10a in human breast cancer  celler  // BMC Mol . Biol. : journal. - 2009. - Bd. 10 . — S. 12 . - doi : 10.1186/1471-2199-10-12 . — PMID 19232136 .
  93. ↑ Hawkins PG, Morris KV RNA og transkriptionel modulering af genekspression  //  Cellecyklus : journal. - 2008. - Marts ( bind 7 , nr. 5 ). - S. 602-607 . - doi : 10.4161/cc.7.5.5522 . — PMID 18256543 .
  94. ↑ Stark A., Brennecke J., Bushati N., Russell RB, Cohen SM Animal MicroRNAs giver robusthed til genekspression og har en signifikant indflydelse på 3'UTR-evolution  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2005. - Vol. 123 , nr. 6 . - S. 1133-1146 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.11.023 . — PMID 16337999 .
  95. ↑ Li LC Lille RNA-medieret genaktivering // RNA og reguleringen af ​​genekspression: et skjult lag af  kompleksitet . – Caister Academic Press, 2008. - ISBN 978-1-904455-25-7 ]
  96. ↑ Place RF, Li LC, Pookot D., Noonan EJ, Dahiya R. MicroRNA-373 inducerer ekspression af gener med komplementære promotorsekvenser  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2008. - Bd. 105 , nr. 5 . - S. 1608-1613 . - doi : 10.1073/pnas.0707594105 . - . — PMID 18227514 .
  97. ↑ Salmena L., Poliseno L., Tay Y., Kats L., Pandolfi PP En ceRNA-hypotese: Rosetta-stenen i et skjult RNA-sprog? (engelsk)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2011. - August ( vol. 146 , nr. 3 ). - S. 353-358 . - doi : 10.1016/j.cell.2011.07.014 . — PMID 21802130 .
  98. ↑ 1 2 Wheeler BM, Heimberg AM, Moy VN, Sperling EA, Holstein TW, Heber S., Peterson KJ The deep evolution of metazoan microRNAs   // Evol . dev. : journal. - 2009. - Bd. 11 , nr. 1 . - S. 50-68 . - doi : 10.1111/j.1525-142X.2008.00302.x . — PMID 19196333 .
  99. ↑ Pashkovskiy, PP; Ryazansky, SS Biogenese, evolution og funktioner af plantemikroRNA'er  (engelsk)  // Biochemistry-Moscow: tidsskrift. - 2013. - Bd. 78 . - s. 627-637 . - doi : 10.1134/S0006297913060084 . — PMID 23980889 .
  100. ↑ Piriyapongsa J, Jordan IK. En familie af humane mikroRNA-gener fra miniature omvendt-gentagende transposerbare elementer  (engelsk)  // PLOS One . - Public Library of Science , 2007. - Vol. 2 , nr. 2 .
  101. ↑ 1 2 Heimberg AM, Sempere LF, Moy VN, Donoghue PC, Peterson KJ MicroRNAs og fremkomsten af ​​hvirveldyrs morfologiske kompleksitet  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2008. - Februar ( bind 105 , nr. 8 ). - S. 2946-2950 . - doi : 10.1073/pnas.0712259105 . - . — PMID 18287013 .
  102. ↑ 1 2 3 Peterson KJ, Dietrich MR, McPeek MA MikroRNA'er og metazoan makroevolution: indsigt i kanalisering, kompleksitet og den kambriske  eksplosion  // BioEssays : journal. - 2009. - Juli ( bind 31 , nr. 7 ). - s. 736-747 . - doi : 10.1002/bies.200900033 . — PMID 19472371 .
  103. ↑ 1 2 3 Nozawa M., Miura S., Nei M. Oprindelse og udvikling af mikroRNA-gener i Drosophila-arter  // Genome  Biol Evol : journal. - 2010. - Bd. 2 . - S. 180-189 . - doi : 10.1093/gbe/evq009 . — PMID 20624724 .
  104. ↑ Allen, E.; ZX Xie, AM Gustafson, GH Sung, JW Spatafora og JC Carrington. Udvikling af mikroRNA-gener ved inverteret duplikering af målgensekvenser i Arabidopsis thaliana  (engelsk)  // Nature Genetics  : tidsskrift. - 2004. - Bd. 36 , nr. 12 . - S. 1282-1290 . doi : 10.1038 / ng1478 . — PMID 15565108 .
  105. ↑ Warthmann, N.; S. Das, C. Lanz og D. Weigel. Sammenlignende analyse af MIR319a MicroRNA locus i Arabidopsis og beslægtede Brassicaceae  //  Molekylær biologi og evolution : journal. - Oxford University Press , 2008. - Vol. 25 , nr. 5 . - S. 892-902 . - doi : 10.1093/molbev/msn029 . — PMID 18296705 .
  106. ↑ Fahlgren, N.; S. Jogdeo, K. D. Kasschau, C. M. Sullivan, E. J. Chapman, S. Laubinger, L. M. Smith, M. Dasenko, S. A. Givan, D. Weigel og J. C. Carrington. MicroRNA-genudvikling i Arabidopsis lyrata og Arabidopsis thaliana  (engelsk)  // Plant Cell  : journal. - 2010. - Bd. 22 , nr. 4 . - S. 1074-1089 . - doi : 10.1105/tpc.110.073999 .
  107. ↑ Caravas J., Friedrich M. Af mider og tusindben: nylige fremskridt med at løse bunden af ​​leddyrtræet   // BioEssays : journal. - 2010. - Juni ( bind 32 , nr. 6 ). - S. 488-495 . - doi : 10.1002/bies.201000005 . — PMID 20486135 .
  108. ↑ Cock JM, Sterck L., Rouzé P., Scornet D., Allen AE, Amoutzias G., Anthouard V., Artiguenave F., Aury JM, Badger JH, et al . Ectocarpus-genomet og den uafhængige udvikling af multicellularitet i brunalger  (engelsk)  // Nature : journal. - 2010. - Juni ( bd. 465 , nr. 7298 ). - s. 617-621 . - doi : 10.1038/nature09016 . — . — PMID 20520714 .
  109. ↑ Cuperus, JT; N. Fahlgren og JC Carrington. Evolution og funktionel diversificering af MIRNA-gener  (engelsk)  // Plant Cell  : journal. - 2011. - Bd. 23 , nr. 2 . - S. 431-442 . - doi : 10.1105/tpc.110.082784 . — PMID 21317375 .
  110. ↑ Attila Molnar, Andrew Basset, Frank Schwach et al. Meget specifik gendæmpning af kunstige mikroRNA'er i den encellede alge Chlamydomonas reinhardtii  // The Plant Journal. - 2009. - doi : 10.1111/j.1365-313X.2008.03767.x .  (utilgængeligt link)
  111. ↑ Kanika Jain, B.B. Chattoo. Sammenlignende miRNA-analyse i patogene svampe . Arkiveret fra originalen den 26. april 2014.
  112. ↑ Diamant P.F. miRNAs' Terapeutiske Potentiale  (15. marts 2010), s. 1. Arkiveret fra originalen den 10. juli 2010. Hentet 10. juli 2010.
  113. ↑ Tjaden B., Goodwin SS, Opdyke JA, Guillier M., Fu DX, Gottesman S., Storz G. Målforudsigelse for små, ikke-kodende RNA'er i bakterier  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2006. - Bd. 34 , nr. 9 . - P. 2791-2802 . - doi : 10.1093/nar/gkl356 . — PMID 16717284 .
  114. ↑ Plaisance-Bonstaff K., Renne R. Virale miRNA'er // Metoder Mol Biol .. - 2011. - T. 721 . - S. 43-66 . - doi : 10.1007/978-1-61779-037-9_3 .
  115. ↑ Mraz M., Malinova K., Mayer J., Pospisilova S. MikroRNA-isolering og stabilitet i lagrede RNA-prøver   // Biochem . Biofys. Res. commun. : journal. - 2009. - December ( bind 390 , nr. 1 ). - S. 1-4 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2009.09.061 . — PMID 19769940 .
  116. ↑ Liu CG, Calin GA, Volinia S., Croce CM MicroRNA-ekspressionsprofilering ved hjælp af mikroarrays  // Nat  Protoc : journal. - 2008. - Bd. 3 , nr. 4 . - S. 563-578 . - doi : 10.1038/nprot.2008.14 . — PMID 18388938 .
  117. ↑ Chen C., Ridzon DA, Broomer AJ, Zhou Z., Lee DH, Nguyen JT, Barbisin M., Xu NL, Mahuvakar VR, Andersen MR, Lao KQ, Livak KJ, Guegler KJ Kvantificering i realtid af mikroRNA'er efter stamme -loop RT-PCR  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2005. - Bd. 33 , nr. 20 . — P. e179 . - doi : 10.1093/nar/gni178 . — PMID 16314309 .
  118. ↑ Shingara J., Keiger K., Shelton J., Laosinchai-Wolf W., Powers P., Conrad R., Brown D., Laborier E. En optimeret isolerings-  og /mærkningsplatform til nøjagtig mikroRNA-ekspressionsprofilering - 2005. - September ( bind 11 , nr. 9 ). - S. 1461-1470 . - doi : 10.1261/rna.2610405 . — PMID 16043497 .
  119. ↑ Buermans HP, Ariyurek Y., van Ommen G., den Dunnen JT, 't Hoen PA. Nye metoder til næste generations sekventeringsbaseret mikroRNA-ekspressionsprofilering  //  BMC Genomics : journal. - 2010. - December ( bind 11 ). - S. 716 . - doi : 10.1186/1471-2164-11-716 . — PMID 21171994 .
  120. ↑ Kloosterman WP, Wienholds E., Ketting RF, Plasterk RH Substratkrav til let-7-funktion i det udviklende zebrafiskembryo  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2004. - Bd. 32 , nr. 21 . - P. 6284-6291 . doi : 10.1093 / nar/gkh968 . — PMID 15585662 .
  121. ↑ Flynt AS, Li N., Thatcher EJ, Solnica-Krezel L., Patton JG Zebrafisk miR-214 modulerer Hedgehog-signalering for at specificere muskelcelleskæbne   // Nat . Genet.  : journal. - 2007. - Februar ( bind 39 , nr. 2 ). - S. 259-263 . - doi : 10.1038/ng1953 . — PMID 17220889 .
  122. ↑ Meister G., Landthaler M., Dorsett Y., Tuschl T. Sekvensspecifik inhibering af mikroRNA- og siRNA-induceret RNA-dæmpning  //  RNA : journal. - 2004. - Marts ( bind 10 , nr. 3 ). - S. 544-550 . - doi : 10.1261/rna.5235104 . — PMID 14970398 .
  123. ↑ Kloosterman WP, Lagendijk AK, Ketting RF, Moulton JD, Plasterk RH Målrettet inhibering af miRNA-modning med morpholinos afslører en rolle for miR-375 i udvikling af bugspytkirteløer  // PLoS Biol  .  : journal. - 2007. - August ( bind 5 , nr. 8 ). —P.e203 . _ - doi : 10.1371/journal.pbio.0050203 . — PMID 17676975 .
  124. ↑ Choi WY, Giraldez AJ, Schier AF Målbeskyttere afslører dæmpning og balancering af nodalagonist og antagonist af miR-430  //  Science : journal. - 2007. - Oktober ( bind 318 , nr. 5848 ). - S. 271-274 . - doi : 10.1126/science.1147535 . - . — PMID 17761850 .
  125. ↑ You Y., Moreira BG, Behlke MA, Owczarzy R.  Design af LNA-prober, der forbedrer mismatch-diskrimination  // Nucleic Acids Res : journal. - 2006. - Bd. 34 , nr. 8 . —P.e60 . _ doi : 10.1093 / nar/gkl175 . — PMID 16670427 .
  126. ↑ Lagendijk AK, Moulton JD, Bakkers J. Afslørende detaljer: hel mount mikroRNA in situ hybridiseringsprotokol for zebrafisk embryoner og voksent væv  //  Bio Open: journal. - 2012. - Bd. 1 , nr. 6 . - S. 566 . - doi : 10.1242/bio.2012810 .
  127. ↑ Kaur H., Arora A., Wengel J., Maiti S., Arora A., Wengel J., Maiti S. Termodynamiske, modion- og hydreringseffekter for inkorporering af låste nukleinsyrenukleotider i DNA-duplekser   // Biokemi: tidsskrift. - 2006. - Bd. 45 , nr. 23 . - P. 7347-7355 . - doi : 10.1021/bi060307w . — PMID 16752924 .
  128. ↑ Nielsen JA, Lau P., Maric D., Barker JL, Hudson LD Integrering af mikroRNA- og mRNA-ekspressionsprofiler af neuronale stamceller for at identificere regulatoriske netværk, der ligger til grund for begyndelsen af ​​cortical neurogenesis  //  BMC Neurosci: journal. - 2009. - Bd. 10 . — S. 98 . - doi : 10.1186/1471-2202-10-98 . — PMID 19689821 .
  129. ↑ Gupta A., Nagilla P., Le HS, Bunney C., Zych C., Thalamuthu A., Bar-Joseph Z., Mathavan S., Ayyavoo V. Komparativ ekspressionsprofil af miRNA og mRNA i primære perifere mononukleære blodceller inficeret med humant immundefektvirus (HIV-1)  (engelsk)  // PLoS ONE  : journal / Mammano, Fabrizio. - 2011. - Bd. 6 , nr. 7 . —P.e22730 . _ - doi : 10.1371/journal.pone.0022730 . — PMID 21829495 .
  130. ↑ Grimson A., Farh KK, Johnston WK, Garrett-Engele P., Lim LP, Bartel DP MicroRNA-målrettet specificitet hos pattedyr: determinanter hinsides frøparring   // Mol . celle : journal. - 2007. - Juli ( bind 27 , nr. 1 ). - S. 91-105 . - doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.017 . — PMID 17612493 .
  131. ↑ Griffiths-Jones S., Saini HK, van Dongen S., Enright AJ miRBase: tools for microRNA genomics  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2008. - Januar ( bind 36 , nr. Databaseudgave ). - P.D154-8 . - doi : 10.1093/nar/gkm952 . — PMID 17991681 .
  132. ↑ Zheng H., Fu R., Wang JT, Liu Q., Chen H., Jiang SW Advances in the Techniques for the Prediction of MicroRNA Targets  //  Int J Mol Sci. : journal. - 2013. - April ( bind 14 , nr. 4 ). - P. 8179-8187 . - doi : 10.3390/ijms14048179 . — PMID 23591837 .
  133. ↑ Nam S., Li M., Choi K., Balch C., Kim S., Nephew KP MikroRNA- og mRNA-integreret analyse (MMIA): et webværktøj til undersøgelse af biologiske funktioner af mikroRNA-ekspression  //  Nucleic Acids Res. : journal. - 2009. - Juli ( vol. 37 , nr. Webserverudgave ). —P.W356-62 . _ doi : 10.1093 / nar/gkp294 . — PMID 19420067 .
  134. ↑ Artmann S., Jung K., Bleckmann A., Beissbarth T. Detektion af samtidige gruppeeffekter i mikroRNA-ekspression og relaterede  målgensæt (engelsk)  // PLoS ONE  : journal / Provero, Paolo. - 2012. - Bd. 7 , nr. 6 . — P.e38365 . - doi : 10.1371/journal.pone.0038365 . - . — PMID 22723856 .
  135. ↑ 1 2 3 Mraz M. , Pospisilova S. MikroRNA'er i kronisk lymfatisk leukæmi: fra kausalitet til associationer og tilbage.  (engelsk)  // Ekspertgennemgang af hæmatologi. - 2012. - Bd. 5, nr. 6 . - s. 579-581. - doi : 10.1586/ehm.12.54 . — PMID 23216588 .
  136. ↑ Jiang Q., Wang Y., Hao Y., Juan L., Teng M., Zhang X., Li M., Wang G., Liu Y. miR2Disease: a manually curated database for microRNA-deregulation in human disease   // Nukleinsyreforskning : journal. - 2009. - Januar ( vol. (Databaseudgave) , nr. Databaseudgave ). - P.D98-104 . doi : 10.1093 / nar/gkn714 . — PMID 18927107 .
  137. ↑ Mencía A., Modamio-Høybjør S., Redshaw N., Morín M., Mayo-Merino F., Olavarrieta L., Aguirre LA, del Castillo I., Steel KP, Dalmay T., Moreno F., Moreno- Pelayo MA Mutationer i frøregionen af ​​human miR-96 er ansvarlige for ikke-syndromisk progressivt høretab   // Nat . Genet.  : journal. - 2009. - Maj ( bind 41 , nr. 5 ). - s. 609-613 . - doi : 10.1038/ng.355 . — PMID 19363479 .
  138. ↑ Hughes AE, Bradley DT, Campbell M., Lechner J., Dash DP, Simpson DA, Willoughby CE Mutation Ændring af miR-184 frøregionen forårsager familiær keratokonus med katarakt  // The American  Journal of Human Genetics : journal. - 2011. - Bd. 89 , nr. 5 . - s. 628-633 . - doi : 10.1016/j.ajhg.2011.09.014 . — PMID 21996275 .
  139. ↑ de Pontual L., Yao E., Callier P., Faivre L., Drouin V., Cariou S., Van Haeringen A., Geneviève D., Goldenberg A., Oufadem M., Manouvrier S., Munnich A. , Vidigal JA, Vekemans M., Lyonnet S., Henrion-Caude A., Ventura A., Amiel J. Germline deletion af miR-17∼92 klyngen forårsager skelet- og vækstdefekter hos mennesker  (engelsk)  // Nat. Genet.  : journal. - 2011. - Oktober ( bind 43 , nr. 10 ). - S. 1026-1030 . - doi : 10.1038/ng.915 . — PMID 21892160 .
  140. ↑ 1 2 He L., Thomson JM, Hemann MT, Hernando-Monge E., Mu D., Goodson S., Powers S., Cordon-Cardo C., Lowe SW, Hannon GJ, Hammond SM A microRNA polycistron as a potentielt menneskeligt onkogen  (engelsk)  // Nature : journal. - 2005. - Juni ( bd. 435 , nr. 7043 ). - s. 828-833 . - doi : 10.1038/nature03552 . — . — PMID 15944707 .
  141. ↑ 1 2 Mraz M., Pospisilova S., Malinova K., Slapak I., Mayer J. MicroRNAs in chronic lymfocytic leukaemia pathogenesis and disease subtypes   // Leuk . Lymfom : journal. - 2009. - Marts ( bind 50 , nr. 3 ). - S. 506-509 . - doi : 10.1080/10428190902763517 . — PMID 19347736 .
  142. ↑ Heidi G. Møller, Andreas P. Rasmussen, Hjalte H. Andersen, Kasper B. Johnsen, Michael Henriksen, Meg Duroux. En systematisk gennemgang af mikroRNA i Glioblastoma Multiforme: Mikromodulatorer i den mesenkymale tilstand af migration og invasion  // Mol Neurobiol. - 2013. - T. 47 , nr. 1 . - S. 131-144 . - doi : 10.1007/s12035-012-8349-7 .
  143. ↑ Cui JW, Li YJ, Sarkar A., ​​​​Brown J., Tan YH, Premyslova M., Michaud C., Iscove N., Wang GJ, Ben-David Y. Retroviral indsættelsesaktivering af Fli-3 locus i erythroleukæmier, der koder for en klynge af mikroRNA'er, der omdanner Epo-induceret differentiering til  proliferation //  Blod : journal. — American Society of Hematology, 2007. - juni ( vol. 110 , nr. 7 ). - S. 2631-2640 . - doi : 10.1182/blood-2006-10-053850 . — PMID 17586726 .
  144. ↑ O'Donnell KA, Wentzel EA, Zeller KI, Dang CV, Mendell JT . c-Myc-regulerede mikroRNA'er modulerer E2F1-ekspression   // Natur . - 2005. - Juni ( bd. 435 , nr. 7043 ). - s. 839-843 . - doi : 10.1038/nature03677 . — . — PMID 15944709 .
  145. ↑ Lu J., Getz G., Miska EA, Alvarez-Saavedra E., Lamb J., Peck D., Sweet-Cordero A., Ebert BL, Mak RH, Ferrando AA, Downing JR, Jacks T., Horvitz HR , Golub TR MicroRNA-ekspressionsprofiler klassificerer humane kræftformer  (engelsk)  // Nature : journal. - 2005. - Juni ( bd. 435 , nr. 7043 ). - s. 834-838 . - doi : 10.1038/nature03702 . — . — PMID 15944708 .
  146. ↑ Zanesi N., Pekarsky Y., Trapasso F., Calin G., Croce CM MicroRNA'er i musemodeller af lymfoide maligniteter  (neopr.)  // J Nucleic Acids Investig. - 2010. - T. 1 , nr. 1 . - S. 36-40 . doi : 10.4081 /jnai.2010.e8 . — PMID 21666870 .
  147. ↑ Jun Qian, Vinayakumar Siragam, Jiang Lin, Jichun Ma, Zhaoqun Deng. MikroRNAs rolle i dannelsen af ​​kræftstamceller: Future directions for miRNAs  (engelsk)  // Hypothesis : journal. - 2011. - Bd. 9 , nr. 1 . —P.e10 . _
  148. ↑ American Association for Cancer Research (29. september 2010). Screeningsværktøj kan påvise kolorektal cancer fra en lille blodprøve . Pressemeddelelse . Arkiveret fra originalen 14. maj 2011. Hentet 29. november 2010 .
  149. ↑ Nielsen BS, Jørgensen S., Fog JU, Søkilde R., Christensen IJ, Hansen U., Brünner N., Baker A., ​​​​Møller S., Nielsen HJ High levels of microRNA-21 in the stroma of colorectal cancers forudsige kort sygdomsfri overlevelse hos patienter med stadium II tyktarmskræft  (engelsk)  // Clin Exp Metastasis : journal. - 2010. - Oktober ( bind 28 , nr. 1 ). - S. 27-38 . - doi : 10.1007/s10585-010-9355-7 . — PMID 21069438 .
  150. ↑ Võsa U., Vooder T., Kolde R., Fischer K., Välk K., Tõnisson N., Roosipuu R., Vilo J., Metspalu A., Annilo T. Identifikation af miR-374a som en prognostisk markør for overlevelse hos patienter med ikke-småcellet lungekræft i tidligt stadie  //  Gener Kromosomer Kræft : journal. - 2011. - Oktober ( bind 50 , nr. 10 ). - s. 812-822 . - doi : 10.1002/gcc.20902 . — PMID 21748820 .
  151. ↑ Akçakaya P., Ekelund S., Kolosenko I., Caramuta S., Ozata DM, Xie H., Lindforss U., Olivecrona H., Lui WO miR-185 og miR-133b deregulering er forbundet med overordnet overlevelse og metastaser i kolorektal cancer  (engelsk)  // Int. J. Oncol. : journal. - 2011. - August ( bind 39 , nr. 2 ). - s. 311-318 . - doi : 10.3892/ijo.2011.1043 . — PMID 21573504 .
  152. ↑ Jones, K; Nourse JP, Keane C., Bhatnagar A., ​​Gandhi MK. Plasma MicroRNA Are Disease Response Biomarkers in Classical Hodgkin Lymphoma  //  Clin Can Res : journal. - 2014. - Januar ( bind 20 , nr. 1 ). - S. 253-264 . - doi : 10.1158/1078-0432.CCR-13-1024 . — PMID 24222179 .
  153. ↑ Wu H., Mo YY Targeting miR-205 in breast cancer  // Expert Opin  . Ther. Mål : journal. - 2009. - December ( bind 13 , nr. 12 ). - S. 1439-1448 . - doi : 10.1517/14728220903338777 . — PMID 19839716 .
  154. ↑ Gregory PA, Bert AG, Paterson EL, Barry SC, Tsykin A., Farshid G., Vadas MA, Khew-Goodall Y., Goodall GJ MiR-200-familien og miR-205 regulerer epitel- til mesenkymal overgang ved at målrette ZEB1 og SIP1  (engelsk)  // Nat. Celle biol.  : journal. - 2008. - Maj ( bind 10 , nr. 5 ). - S. 593-601 . - doi : 10.1038/ncb1722 . — PMID 18376396 .
  155. ↑ Chen JF, Murchison EP, Tang R., Callis TE, Tatsuguchi M., Deng Z., Rojas M., Hammond SM, Schneider MD, Selzman CH, Meissner G., Patterson C., Hannon GJ, Wang DZ Målrettet sletning af Dicer i hjertet fører til dilateret kardiomyopati og hjertesvigt  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2008. - Februar ( bind 105 , nr. 6 ). - S. 2111-2116 . - doi : 10.1073/pnas.0710228105 . - . — PMID 18256189 .
  156. ↑ 1 2 Zhao Y., Ransom JF, Li A., Vedantham V., von Drehle M., Muth AN, Tsuchihashi T., McManus MT, Schwartz RJ, Srivastava D. Dysregulering af kardiogenese, hjerteledning og cellecyklus i mus, der mangler miRNA-1-2  (engelsk)  // Celle  : journal. - Cell Press , 2007. - April ( vol. 129 , nr. 2 ). - s. 303-317 . - doi : 10.1016/j.cell.2007.03.030 . — PMID 17397913 .
  157. ↑ Thum T., Galuppo P., Wolf C., Fiedler J., Kneitz S., van Laake LW, Doevendans PA, Mummery CL, Borlak J., Haverich A., Gross C., Engelhardt S., Ertl G. , Bauersachs J. MicroRNAs in the human heart: a clue to føtal gene reprogramming in heart  failure //  Circulation : journal. Lippincott Williams & Wilkins, 2007. - Juli ( bd. 116 , nr. 3 ). - S. 258-267 . - doi : 10.1161/CIRCULATIONAHA.107.687947 . — PMID 17606841 .
  158. ↑ van Rooij E., Sutherland LB, Liu N., Williams AH, McAnally J., Gerard RD, Richardson JA, Olson EN Et signaturmønster af stress-responsive mikroRNA'er, der kan fremkalde hjertehypertrofi og   hjertesvigt // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidsskrift. - 2006. - November ( bind 103 , nr. 48 ). - P. 18255-18260 . - doi : 10.1073/pnas.0608791103 . - . — PMID 17108080 .
  159. ↑ Tatsuguchi M., Seok HY, Callis TE, Thomson JM, Chen JF, Newman M., Rojas M., Hammond SM, Wang DZ Ekspression af mikroRNA'er reguleres dynamisk under kardiomyocythypertrofi  //  J. Mol. celle. cardiol. : journal. - 2007. - Juni ( bind 42 , nr. 6 ). - S. 1137-1141 . - doi : 10.1016/j.yjmcc.2007.04.004 . — PMID 17498736 .
  160. ↑ Zhao Y., Samal E., Srivastava D. Serumresponsfaktor regulerer et muskelspecifikt mikroRNA, der er målrettet mod Hand2 under kardiogenese  //  Nature : journal. - 2005. - Juli ( bd. 436 , nr. 7048 ). - S. 214-220 . - doi : 10.1038/nature03817 . — . — PMID 15951802 .
  161. ↑ Xiao J., Luo X., Lin H., Zhang Y., Lu Y., Wang N., Zhang Y., Yang B., Wang Z. MicroRNA miR-133 undertrykker HERG K+-kanalekspression, hvilket bidrager til QT-forlængelse i diabetiske hjerter  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 2007. - April ( bd. 282 , nr. 17 ). - P. 12363-12367 . - doi : 10.1074/jbc.C700015200 . — PMID 17344217 .
  162. ↑ Yang B., Lin H., Xiao J., Lu Y., Luo X., Li B., Zhang Y., Xu C., Bai Y., Wang H., Chen G., Wang Z. Musklen -specifikt mikroRNA miR-1 regulerer hjertearytmogent potentiale ved at målrette mod GJA1 og KCNJ2  // Nat  . Med.  : journal. - 2007. - April ( bind 13 , nr. 4 ). - S. 486-491 . - doi : 10.1038/nm1569 . — PMID 17401374 .
  163. ↑ Carè A., Catalucci D., Felicetti F., Bonci D., Addario A., Gallo P., Bang ML, Segnalini P., Gu Y., Dalton ND, Elia L., Latronico MV, Høydal M., Autore C., Russo MA, Dorn GW, Ellingsen O., Ruiz-Lozano P., Peterson KL, Croce CM, Peschle C., Condorelli G. MicroRNA-133 kontrollerer hjertehypertrofi   // Nat . Med.  : journal. - 2007. - Maj ( bind 13 , nr. 5 ). - s. 613-618 . - doi : 10.1038/nm1582 . — PMID 17468766 .
  164. ↑ van Rooij E., Sutherland LB, Qi X., Richardson JA, Hill J., Olson EN Kontrol af stressafhængig hjertevækst og genekspression med et mikroRNA  //  Science : journal. - 2007. - April ( bd. 316 , nr. 5824 ). - S. 575-579 . - doi : 10.1126/science.1139089 . - . — PMID 17379774 .
  165. ↑ Insull W. Ateroskleroses patologi: Plaqueudvikling og plakresponser på medicinsk behandling // The American Journal of Medicine. - 2009. - T. 122 . - S. S3-S14 .
  166. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Son Dj, Kumar S., Takabe W., Kim CW, Ni CW, Alberts-Grill N., Jang IH, Kim S., Kim W., Kang SW, Baker AH, Seo JW, Ferrara KW og Jo H. Det atypiske meknosenstitive mikroRNA-712 afledt af præ-ribosomalt RNA inducerer endotelbetændelse og åreforkalkning  // Nature Communications  . - Nature Publishing Group , 2013. - Vol. 4 . - P. 3000 .
  167. ↑ 1 2 Basu R., Fan D., Kandalam V., Lee J., Das SS, Wang X., Baldwin TA, Oudit GY og Kassiri Z. Timp3-gen fører til dannelse af abdominal aortaaneurisme som svar på angiotensin II / / The Journal of Biological Chemistry. - 2012. - T. 287 . - S. 44083-44096 .
  168. ↑ Libby P. Inflammation in aterosclerosis   // Nature . - 2002. - Bd. 402 . - s. 868-874 .
  169. ↑ Maes OC, Chertkow HM, Wang E., Schipper HM MicroRNA: Impplications for Alzheimer Disease and other Human CNS Disorders  // Current  Genomics : journal. - 2009. - Maj ( bind 10 , nr. 3 ). - S. 154-168 . - doi : 10.2174/138920209788185252 . — PMID 19881909 .
  170. ↑ Schratt G. mikroRNA'er ved synapsen   // Nat . Rev. neurosci.  : journal. - 2009. - December ( bind 10 , nr. 12 ). - S. 842-849 . - doi : 10.1038/nrn2763 . — PMID 19888283 .
  171. ↑ Eloïse A. Kremer, Niharika Gaur, Melissa A. Lee, Olivia Engmann, Johannes Bohacek & Isabelle M. Mansuy. Samspil mellem TET'er og mikroRNA'er i den voksne hjerne til hukommelsesdannelse .
  172. ↑ Yu-Wen A. Huang, Claudia R. Ruiz, Elizabeth CH Eyler, Kathie Lin, Mollie K. Meffertemail. Dobbelt regulering af miRNA-biogenese genererer målspecificitet i neurotrophin-induceret proteinsyntese. - 2012. - T. 148 , nr. 5 . - S. 933-946 . - doi : 10.1016/j.cell.2012.01.036 .
  173. ↑ Feng J., Sun G., Yan J., Noltner K., Li W., Buzin CH, Longmate J., Heston LL, Rossi J., Sommer SS Evidens for X-kromosomal skizofreni forbundet med mikroRNA-ændringer  . )  / / PLoS ONE  : journal / Reif, Andreas. - 2009. - Bd. 4 , nr. 7 . — P.e6121 . - doi : 10.1371/journal.pone.0006121 . - . — PMID 19568434 .
  174. ↑ Beveridge NJ, Gardiner E., Carroll AP, Tooney PA, Cairns MJ Skizofreni er forbundet med en stigning i cortical microRNA biogenese   // Mol . Psykiatri : journal. - 2009. - September ( bind 15 , nr. 12 ). - S. 1176-1189 . - doi : 10.1038/mp.2009.84 . — PMID 19721432 .
  175. ↑ Romao JM, Jin W., Dodson MV, Hausman GJ, Moore SS, Guan LL MicroRNA-regulering i pattedyrsadipogenese   // Exp . Biol. Med. (Maywood) : journal. - 2011. - September ( bind 236 , nr. 9 ). - S. 997-1004 . - doi : 10.1258/ebm.2011.011101 . — PMID 21844119 .
  176. ↑ Skårn M., Namløs HM, Noordhuis P., Wang MY, Meza-Zepeda LA, Myklebost O. Adipocytdifferentiering af humane knoglemarvs-afledte stromaceller moduleres af microRNA-155, microRNA-221 og microRNA-  222.)  // Stamceller Dev. : journal. - 2012. - April ( bd. 21 , nr. 6 ). - s. 873-883 . - doi : 10.1089/scd.2010.0503 . — PMID 21756067 .
  177. ↑ Zuo Y., Qiang L., Farmer SR Aktivering af CCAAT/enhancer-bindende protein (C/EBP) alfa-ekspression af C/EBP beta under adipogenese kræver en peroxisomproliferator-aktiveret receptor-gamma-associeret undertrykkelse af HDAC1 ved C /ebp alfa-genpromotor  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2006. - Marts ( bd. 281 , nr. 12 ). - P. 7960-7967 . - doi : 10.1074/jbc.M510682200 . — PMID 16431920 .
  178. ↑ Zhu H., Shyh-Chang N., Segrè AV, Shinoda G., Shah SP, Einhorn WS, Takeuchi A., Engreitz JM, Hagan JP, Kharas MG, Urbach A., Thornton JE, Triboulet R., Gregory RI ; DIAGRAM Konsortium; MAGIC Investigators, Altshuler D., Daley GQ Lin28/let-7-aksen regulerer glukosemetabolisme  (engelsk)  // Cell . - Cell Press , 2011. - September ( vol. 147 , nr. 1 ). - S. 81-94 . - doi : 10.1016/j.cell.2011.08.033 . — PMID 21962509 .
  179. ↑ Frost RJ, Olson EN. Kontrol af glukosehomeostase og insulinfølsomhed af Let-7-familien af ​​mikroRNA'er  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2011. - December ( bind 108 , nr. 52 ). - S. 21075-21080 . - doi : 10.1073/pnas.1118922109 . — . — PMID 22160727 .
  180. ↑ Shigeru Miyaki, Tomoyuki Nakasa, Shuhei Otsuki, Shawn P. Grogan, Reiji Higashiyama, Atsushi Inoue, Yoshio Kato, Tempei Sato, Martin K. Lotz, Hiroshi Asahara. MicroRNA-140 udtrykkes i differentierede humane artikulære chondrocytter og modulerer IL-1-responser  // Arthritis Rheum .. - 2009. - V. 60 , nr. 9 . - S. 2723-2730 . - doi : 10.1002/art.24745 .

Litteratur

Links

  Gå til Wikidata-elementet  Ordbøger og encyklopædier
I bibliografiske kataloger
 Typer af RNA
Protein biosyntese
RNA-behandling
Regulering af genekspression
cis-regulerende elementer
Parasitiske elementer
Andet
 Nukleinsyretyper _
Nitrogenholdige baser
Nukleosider
Nukleotider
RNA
DNA
Analoger
Vektortyper _