ShRNA

Små hårnåle-RNA'er eller shRNA'er ( kort hårnåle-RNA, lille hårnåle-RNA, kort hårnåle-RNA ) er korte ribonukleinsyremolekyler , der danner tætte hårnåle (stammeløkkestrukturer) i den sekundære struktur .  ShRNA kan bruges til at undertrykke genekspression gennem RNA-interferens . Korte hårnåle-RNA'er indføres i celler ved hjælp af vektorer , hvori deres kodende sekvenser er under kontrol af konstitutivt aktive (såsom U6) eller inducerbare promotorer . Sådanne vektorer indeholder sædvanligvis nukleotidsekvenser, der gør det muligt for dem at integrere i cellegenomet og derved give arvelig undertrykkelse af ekspressionen af ​​målgenet [1] .

Små hårnåledannende RNA'er transskriberes af RNA-polymerase III . Dannelsen af ​​shRNA i pattedyrsceller udløser nogle gange et interferonrespons for at beskytte cellen, som i tilfælde af et viralt angreb. Sådanne processer observeres ikke i tilfælde af miRNA'er ( miRNA'er ), som transskriberes af RNA-polymerase II [2] .

Efter transskription er afsluttet, skæres små hårnåle-RNA'er af cellulære enzymer for at danne små interfererende RNA'er ( siRNA ) .  Små interfererende RNA'er er en del af det RNA-inducerede gennedlukningskompleks (RISC). Dette kompleks binder til mRNA'er , der er komplementære til siRNA'er og skærer dem.

Små hårnåle-RNA'er bruges også i planter. I dette tilfælde anvendes  traditionelt den konstitutivt aktive CaMV35S promotor fra blomkålsmosaikvirus 35S promotor [ 3 ] .

Noter

1. ↑ Paddison P., Caudy A., Bernstein E., Hannon G., Conklin D. Short hairpin RNA'er (shRNA'er) inducerer sekvensspecifik silencing i pattedyrsceller  // Genes Dev  .  : journal. - 2002. - Bd. 16 , nr. 8 . - S. 948-958 . - doi : 10.1101/gad.981002 . — PMID 11959843 .
2. ↑ Cao W., Hunter R., Strnatka D., McQueen C., Erickson R. DNA-konstruktioner designet til at producere korte hårnåle, interfererende RNA'er i transgene mus viser nogle gange tidlig dødelighed og et interferonrespons  //  J. Appl. Genet. : journal. - 2005. - Bd. 46 , nr. 2 . - S. 217-225 . — PMID 15876690 .
3. ↑ McIntyre G., Fanning G. Design og kloningsstrategier til konstruktion af shRNA-ekspressionsvektorer  //  BMC Biotechnol. : journal. - 2006. - Bd. 6 . — S. 1 . - doi : 10.1186/1472-6750-6-1 . — PMID 16396676 .  (utilgængeligt link)