E-boks

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 21. januar 2022; verifikation kræver 1 redigering .

E-box (Enhancer Box) er en DNA-sekvens, der findes i visse promotorregioner i eukaryoter , der fungerer som et proteinbindingssted og har vist sig at regulere genekspression i neuroner , muskler og andet væv. [1] Specifikationen for en sådan DNA-sekvens er CANNTG (hvor N kan være et hvilket som helst nukleotid ), med en palindromisk kanonisk sekvens . CACGTG [2] genkendes og bindes af transkriptionsfaktorer for at initiere gentranskription . Når først transkriptionsfaktorer binder til promotorer via E-boksen, kan andre enzymer binde til promotoren og lette transkriptionen af ​​mRNA fra DNA .

Discovery

E-boksen blev opdaget i et samarbejde mellem Susumu Tonegawa og  Walter Gilbert Laboratories i 1985 som et kontrolelement for tungkæde- immunoglobulinforstærkere .  [3] [4] De fandt, at en region på 140 basepar i det vævsspecifikke transkriptionsforstærkerelement var tilstrækkeligt til at øge forskellige niveauer af transkription i forskellige væv og sekvenser. De antog, at proteiner fremstillet af visse væv er involveret i disse forstærkere for at aktivere sæt af gener, når celler differentierer.

I 1989 opdagede David Baltimores laboratorium de første to E-box-associerede proteiner, E12 og E47. [5] Disse immunoglobulinforstærkere kan kobles som proteinheterodimerer via bHLH - domæner. I 1990, ved at bruge et andet E-protein, ITF-2A (senere omdøbt til E2-2Alt), fandt man ud af, at det var muligt at binde et immunglobulin til letkædeforstærkere . [6] To år senere blev et tredje E-boks-bindende protein, HEB, opdaget, da man undersøgte et cDNA - bibliotek fra HeLa - celler. [7] E2-2 - splejsningsvarianten blev opdaget i 1997, og promotorhæmning af muskelspecialiserede gener blev fundet . [otte]

Siden da har forskere fastslået, at E-boxen påvirker gentranskriptionen i nogle eukaryoter og fundet E-box - bindingsfaktorer, der identificerer E-Box konsensuelle sekvenser [9] Især flere eksperimenter har vist, at E-boksen er en integreret del af den transskription-translationelle tilbagekoblingsløkke, der indeholder det cirkadiske ur.

Sammenkædning med en E-boks

E-boks bindende proteiner spiller en vigtig rolle i reguleringen af ​​transkriptionel aktivitet. Disse proteiner indeholder normalt et grundlæggende helix -loop-helix protein strukturelt motiv , der tillader dem at binde som dimerer .  [10] Dette motiv består af to amfipatiske α-helixer adskilt af en lille sekvens af aminosyrer, der danner en eller flere β-drejninger. I hydrofobe interaktioner mellem disse a-helixer stabiliseres dimerisering. Derudover har hver bHLH- monomer en kerneregion, der hjælper med gensidig genkendelse mellem bHLH- monomeren og E-boksen (kerneregionen interagerer med den store rille af DNA ). Afhængigt af DNA- motivet ("CAGCTG" eller "CACGTG") har bHLH -proteinet et andet sæt af basiske rester.

E-boks-binding moduleres i mus med Zn2 + . CT-rige regioner (CTRR'er), der er placeret ca. 23 nukleotider opstrøms for E-boksen, er essentielle for E-boks binding, transaktivering (øgning af hastigheden af ​​genetisk ekspression) og transskription af de cirkadiske gener BMAL1 / NPAS2 og BMAL1 / CLOCK komplekser. [elleve]

Bindingsspecificiteten af ​​forskellige E-bokse afspejles i deres funktion. E-bokse med forskellige funktioner har forskellige mængder og typer af bindingsfaktorer. [12]

E-boksens konsensussekvens er normalt CANNTG; Der er dog andre E-bokse med lignende sekvenser, kaldet ikke-kanoniske E-bokse. De omfatter, men er ikke begrænset til:

Rolle i det cirkadiske ur

Forbindelsen mellem E-box-genregulering og det cirkadiske ur blev opdaget i 1997, da Hao, Allen og Hardin (Department of Biology ved Texas A&M University) analyserede rytmiciteten af ​​genoscillationsperioden i Drosophila melanogaster . [16] De fandt et circadian transkriptionsforstærker-gen i et 69 bp DNA- fragment . Afhængigt af proteinniveauer øger enhanceren mRNA-transkriptionsniveauer i både LD (lys-mørke) og DD (konstant mørke) forhold. Forstærkeren var nødvendig for at øge niveauet af genekspression, men ikke for døgnrytmen. Det fungerer også uafhængigt som målet for BMAL1 / CLOCK - komplekset.

E-boks spiller en vigtig rolle i cirkadiske gener ; Indtil videre er ni gatede døgngener blevet identificeret: PER1 , Per2 , BHLHB2 , BHLHB3 , CRY1 , DBP , Nr1d1 , Nr1d2 og RORC . [17] Da E-boksen er forbundet med flere døgngener, er det muligt, at generne og proteinerne forbundet med den er "vigtige og sårbare punkter i døgnsystemet". [atten]

E-boksen er en af ​​de fem største familier af cirkadisk fase transkriptionsfaktorer og findes i de fleste væv. [19] I alt 320 E-bokse, der styrer gener, findes i SCN ( suprachiasmatic nucleus ), lever , aorta , binyrer , WAT ( hvidt fedtvæv ), hjerne , atrium , ventrikel , præfrontal cortex , skeletmuskulatur , BAT ( brunt fedtvæv ) og knogler i kraniehvælvingen.

E-boksen, ligesom CLOCK -afhængige elementer (EL-box; GGCACGAGGC ), er også vigtig for at opretholde døgnrytmen i ur-kontrolgener . I lighed med en normal E-boks kan en E-boks-lignende urkontroller også inducere BMAL1 /CLOCK-transskription, som derefter kan føre til ekspression i andre EL-bokse, der indeholder gener (Ank, DBP, Nr1d1). [20] Der er dog forskelle mellem EL-boksen og den almindelige E-boks. Undertrykkelse af Dec1 og DEC2 har en stærkere effekt på E-boksen end på EL-boksen. Derudover viser Hes1, som kan binde til en anden konsensussekvens (CACNAG, kendt som N-box), en undertrykkelseseffekt i EL-boksen, men ikke i E-boksen.

Både den ikke-kanoniske E-boks og den E-boks-lignende sekvens er kritiske for den cirkadiske oscillation. Nyere forskning på dette område antager, at hver kanonisk eller ikke-kanonisk E-boks, der følger en lignende E-boks-sekvens, med et 6- bp interval mellem dem, er en nødvendig kombination for døgntransskription. [21] Silicoanalyse viser også, at intervallet eksisterede i andre kendte ur-kontrollerende gener.

Proteiners rolle i E-boksbinding

Der er flere proteiner, der binder til E - boksen og påvirker gentranskriptionen .

CLOCK-BMAL1 kompleks

Dette kompleks er en integreret del af pattedyrets døgncyklus og er afgørende for at opretholde døgnrytmen.

Ved at vide, at binding aktiverer gentranskription i promotorregionen , opdagede forskere i 2002, at DEC1 og DEC2 (bHLH-transkriptionsfaktorer) undertrykker CLOCK-BMAL1-komplekset gennem direkte interaktion på BMAL1 og/eller konkurrence om E-boks-elementer. De konkluderede, at DEC1 og DEC2 var regulatorer af pattedyrets molekylære ur. [22]

I 2006 fandt Ripperger og Schibler ud af, at E-box-binding af dette kompleks accelererer DBP -cirkadisk transkription og kromatinovergange ( ændringen fra kromatin til fakultativ heterochromatin ). [23] Det blev konkluderet, at CLOCK regulerer DBP-ekspression ved at binde til E-box-motiverne af enhancer-regioner placeret i den første og anden intron .

C-Myc (onkogen)

C-Myc, genet der koder for transkriptionsfaktoren Myc , spiller en vigtig rolle i reguleringen af ​​pattedyrcelleproliferation og apoptose .

I 1991 testede forskere, om c-Myc kunne binde til DNA ved at dimerisere det med E12. Dimerer af det kimære E6-protein er i stand til at binde til E-box-elementet (GGCCACGTGACC), som er blevet genkendt af andre HLH-proteiner. [24] Udtryk af E6 undertrykte c-Myc-funktionen, der bestemte forholdet mellem de to.

I 1996 blev det opdaget, at Myc heterodimeriserer med MAX , og at dette heterodimere kompleks kan binde til E-box CAC(G/A)TG-sekvensen og aktivere transkription. [25]

I 1998 blev det konkluderet, at funktionen af ​​c - Myc afhænger af aktiveringen af ​​transkriptionen af ​​visse gener via E-boks-elementer. [26]

MyoD

MyoD kommer fra Mrf bHLH-familien og dens hovedrolle er i myogenese, dannelsen af ​​muskelvæv. [9] Andre medlemmer af denne familie inkluderer myogenin, Myf5 , Myf6 , Mist1 og NEX-1.

Når MyoD binder til E-box CANNTG-motivet, initieres muskeldifferentiering og ekspression af muskelspecifikke proteiner. [27] Forskerne fjernede forskellige dele af det rekombinante MyoD og konkluderede, at MyoD bruger de inkluderede elementer til at forbinde E-boksen og tetraplex-strukturen af ​​promotorsekvensen af ​​det muskelspecifikke α7- integrin - gen og det sarkomeriske sMtCK .

MyoD regulerer HB-EGF ( Heparin-bindende EGF-lignende vækstfaktor ), et medlem af EGF ( Epidermal Growth Factor ) familien, og stimulerer cellevækst og -proliferation. [9] Det spiller en vigtig rolle i udviklingen af ​​hepatocellulært karcinom , prostatacancer , brystkræft , esophageal cancer og gastrisk cancer .

MyoD kan også binde til ikke-kanoniske MyoG E-bokse og regulere dets udtryk. [28]

MyoG

MyoG tilhører MyoD-familien af ​​transkriptionsfaktorer. Den MyoG -bindende E-boks er essentiel for neuromuskulær forbindelsesdannelse som en HDAC- Dach2 -myogenin signalvej i skeletmuskelgenekspression . [29] Reduceret MyoG-ekspression blev fundet hos patienter med symptomatisk muskelatrofi. [tredive]

MyoG og MyoD har også vist sig at have myoblastdifferentiering . [31] De virker ved at transaktivere cathepsin B -promotoraktivitet og inducere dets ekspression i mRNA .

E47

E47 produceres ved alternativ splejsning af E2A i E47-specifikt kodede bHLH- exoner . Dens rolle er at regulere vævsspecifik genekspression og differentiering. Mange kinaser er blevet forbundet med E47, herunder 3PK og MK2. Disse to proteiner danner et kompleks med E47 og reducerer dets transkriptionelle aktivitet. [32] CKII og PKA er også blevet vist in vitro for at phosphorylere E47. [33] [34] [35]

Som med andre proteinbindende E-bokse, binder E47 også til CANNTG-sekvensen i E-boksen. Hos homozygote E2A knockout-mus standses B-celleudvikling før DJ-placeringsstadiet, og B-celler kan ikke modnes. [36] E47 har vist sig at binde som en heterodimer (med E12) [37] eller som en homodimer (men svagere). [38]

Nylig forskning

Selvom det strukturelle grundlag for interaktionen af ​​BMAL1/CLOCK med E-boksen er ukendt, har nyere undersøgelser vist, at bHLH-motiverne i BMAL1/CLOCK-proteindomænerne minder meget om bHLH'erne i andre E-box-krystalliserede proteiner, som f.eks. Myc /Max. [39] Dette tyder på, at specifikke baser er nødvendige for at understøtte denne høje bindingsaffinitet. Derudover er sekvensrestriktioner i området omkring den cirkadiske E-boks ikke fuldt ud forstået: dette menes at være nødvendigt, men ikke tilstrækkeligt; E-bokse skal placeres tilfældigt fra hinanden i den genetiske sekvens, for at der kan forekomme døgntransskription . Nylige undersøgelser af E-bokse har fokuseret på at finde mere bindbare proteiner samt opdage flere mekanismer til bindingsinhibering.

En nylig undersøgelse fra Universitetet i Uppsala i Sverige forbinder AST2-Rack1-komplekset med hæmning af bindingen af ​​BMAL1-CLOCK-komplekset til E-boksen. [40] Forskere undersøgte rollen af ​​Astakine-2 i melatonin -induceret døgnregulering hos krebsdyr og fandt ud af, at AST2 er påkrævet for at hæmme bindingen af ​​BMAL1-CLOCK komplekset til E-boksen. Derudover fandt de ud af, at melatoninsekretion er ansvarlig for regulering af AST2-ekspression og antog, at hæmning af E-boks-binding påvirker CLOCK i ethvert dyr med AST2-molekyler.

Forskere ved Nanjing University School of Medicine fandt ud af, at FBXL3 (F-box/leucin-rige proteingentagelser) amplitude udtrykkes gennem E-boksen. [41] De undersøgte mus med FBXL3-mangel og fandt ud af, at de regulerer en feedback-loop i døgnrytmer , hvilket påvirker døgnrytmen.

En undersøgelse offentliggjort den 4. april 2013 af forskere fra Harvard Medical School fandt, at nukleotiderne på hver side af E-boksen påvirker hvilke transkriptionsfaktorer, der kan binde til selve E-boksen. [42] Disse nukleotider definerer det 3-D rumlige arrangement af strengen i DNA og begrænser bindingsstørrelsen af ​​transkriptionsfaktorer. Undersøgelsen viste også forskelle i matrixbinding mellem in vivo og in vitro ( in vivo og in vitro ).

Noter

  1. ↑ Massari, M.E.; Murre, C. Helix-loop-helix-proteiner: regulatorer af transkription i eukaryote organismer   // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2000. - Vol. 20 , nej. 2 . - S. 429-440 . - doi : 10.1128/mcb.20.2.429-440.2000 . — PMID 10611221 .
  2. ↑ Chaudhary, J; Skinner, M K. Grundlæggende helix-loop-helix-proteiner kan virke ved E-boksen i serumresponselementet af c-fos-promotoren for at påvirke hormon-induceret promotoraktivering i Sertoli-celler  //  Mol Endocrinol : journal. - 1999. - Maj ( bind 13 , nr. 5 ). - s. 774-786 . - doi : 10.1210/mend.13.5.0271 . — PMID 10319327 .
  3. ↑ Ephrussi, A; Kirke, G.M.; Tonegawa, S; Gilbert, W. B afstamningsspecifikke interaktioner af en immunoglobulinforstærker med cellulære faktorer in vivo  //  Science: journal. - 1985. - Bd. 227 , nr. 4683 . - S. 134-140 . - doi : 10.1126/science.3917574 . — PMID 3917574 .
  4. ↑ Kirke, GM; Ephrussi, A; Gilbert, W; Tonegawa, S. Celletype-specifikke kontakter til immunoglobulinforstærkere i kerner  (engelsk)  // Nature : journal. - 1985. - Bd. 313 , nr. 6005 . - S. 798-801 . - doi : 10.1038/313798a0 . — . — PMID 3919308 .
  5. ↑ Murre, C; McCaw, PS; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L.Y.; Cabrera, C.V.; Buskin, JN; Hauschka, SD; Lassar, A.B.; og andre; Weintraub, Harold; Baltimore, David et al. Interaktioner mellem heterologe helix-loop-helix-proteiner genererer komplekser, der binder specifikt til en fælles DNA-sekvens  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1989. - August ( vol. 58 , nr. 3 ). - S. 537-544 . - doi : 10.1016/0092-8674(89)90434-0 . — PMID 2503252 .
  6. ↑ Henthorn, P; Kiledjian, M; Kadesch, T. To distinkte transkriptionsfaktorer, der binder immunglobulinforstærkeren microE5/kappa 2-motiv  //  Science : journal. - 1990. - Bd. 247 , nr. 4941 . - S. 467-470 . - doi : 10.1126/science.2105528 . - . — PMID 2105528 .
  7. ↑ Hu SJ, Olson EN; Kingston, R E. HEB  //  Mol Cell Biol : journal. - 1992. - Bd. 12 , nr. 3 . - S. 1031-1042 . — PMID 1312219 .
  8. ↑ Chen, B; Lim, R W. Fysiske og funktionelle interaktioner mellem de transkriptionelle inhibitorer Id3 og ITF-2b. Bevis for en ny mekanisme, der regulerer muskelspecifik genekspression  // J Biol Chem  : tidsskrift  . - 1997. - Januar ( bind 272 , nr. 4 ). - P. 2459-2463 . doi : 10.1074 / jbc.272.4.2459 . — PMID 8999959 .
  9. ↑ 1 2 3 Mädge B.: E-Boks. I: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. doi : 10.1007/SpringerReference_173452
  10. ↑ Ellenberger, T; Fass, D; Arnaud, M; Harrison, S C. Krystalstruktur af transkriptionsfaktor E47: E-boksgenkendelse af en grundlæggende region helix-loop-helix dimer  // Genes Dev  : journal  . - 1994. - April ( bind 8 , nr. 8 ). - S. 970-980 . doi : 10.1101 / gad.8.8.970 . — PMID 7926781 .
  11. ↑ Muñoz; Michelle Brewer; Ruben Baler. Modulation af BMAL/CLOCK/E-Box kompleks aktivitet af et CT-rigt cis-virkende element   // Molekylær og cellulær endokrinologi : journal. - 2006. - Bd. 252 , nr. 1-2 . - S. 74-81 . - doi : 10.1016/j.mce.2006.03.007 . — PMID 16650525 .
  12. ↑ Bose; Boockfor FR Episoder af prolactin-genekspression i GH3-celler er afhængige af selektiv promotorbinding af flere cirkadiske elementer  //  Endocrinology : journal. - 2010. - Bd. 151 , nr. 5 . - P. 2287-2296 . - doi : 10.1210/en.2009-1252 . — PMID 20215567 .
  13. ↑ Yoo, S.H.; Ko, CH; Lowrey, P.L.; Buhr, E.D.; Sang, EJ; Chang, S.; Yoo, OJ; Yamazaki, S.; Lee, C.; og andre et al. En ikke-kanonisk E-boks-forstærker driver mus Periode2 døgnsvingninger in vivo  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2005. - Bd. 102 , nr. 7 . - P. 2608-2613 . - doi : 10.1073/pnas.0409763102 . — PMID 15699353 .
  14. ↑ Zhang, X.; Patel, S.P.; McCarthy, JJ; Rabchevsky, A.G.; Goldhamer, DJ; Esser, KA En ikke-kanonisk E-boks i MyoD-kerneforstærkeren er nødvendig for døgnrytmeekspression i skeletmuskulatur  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2012. - Bd. 40 , nej. 8 . - P. 3419-3430 . doi : 10.1093 / nar/gkr1297 . — PMID 22210883 .
  15. ↑ Enrique, Salero; Cecilio, Gimenez; Francisco, Zafra. {{{title}}}  (eng.)  // Biochem J. : journal. - 2003. - Marts ( bd. 370 , nr. 3 ). - S. 979-986 .
  16. ↑ Hao, H; Allen, D.L.; Hardin, PE. En døgnrytmeforstærker medierer PER-afhængig mRNA-cyklus i Drosophila melanogaster  //  Mol Cell Biol : journal. - 1997. - Juli ( bind 17 , nr. 7 ). - P. 3687-3693 . — PMID 9199302 .
  17. ↑ Panda, S; AntochMP; Miller BH; SuAI; Schook AB; Straume M; Schultz P.G.; Kay SA; TakahashiJS; Hogenesch JB Koordineret transkription af nøgleveje i musen ved det cirkadiske ur  (engelsk)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2002. - Maj ( vol. 109 , nr. 3 ). - S. 307-320 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)00722-5 . — PMID 12015981 .
  18. ↑ Herzog, Erik. Neuroner og netværk i daglige rytmer  (engelsk)  // Nature Reviews Neuroscience  : journal. - 2007. - Oktober ( bind 8 , nr. 10 ). - S. 790-802 . - doi : 10.1038/nrn2215 . — PMID 17882255 .
  19. ↑ Yan, juni; Haifang Wang; Yuting Liu; Chunxuan Shao. Analyse af genregulerende netværk i pattedyrs døgnrytme  // PLOS Computational Biology  : tidsskrift  . - 2008. - Oktober ( bind 4 , nr. 10 ). — P.e1000193 . - doi : 10.1371/journal.pcbi.1000193 . - . — PMID 18846204 .
  20. ↑ Ueshima, T; Kawamoto T; Honda KK; Noshiro M; Fujimoto K; Nakao S; Ichinose N; Hashimoto S; Gotoh O; Kato Y. Identifikation af et nyt urrelateret element EL-boks involveret i døgnregulering af BMAL1  / CLOCK og HES1  // Gene : journal. - Elsevier , 2012. - December ( vol. 510 , nr. 2 ). - S. 118-125 . - doi : 10.1016/j.gene.2012.08.022 . — PMID 22960268 .
  21. ↑ Nakahata, Y; Yoshida M; Takano A; Soma H; Yamamoto T; Yasuda A; Nakatsu T; Takumi T. En direkte gentagelse af E-boks-lignende elementer er påkrævet for celleautonom døgnrytme af urgener  (engelsk)  // BMC Mol Biol : journal. - 2008. - Januar ( bind 9 , nr. 1 ). — S. 1 . - doi : 10.1186/1471-2199-9-1 . — PMID 18177499 .
  22. ↑ Honma, S; Kawamoto, T; Takagi, Y; Fujimoto, K; Sato, F; Noshiro, M; Kato, Y; Honma, K. Dec1 og Dec2 er regulatorer af pattedyrets molekylære ur  //  Nature : journal. - 2002. - Bd. 419 , nr. 6909 . - s. 841-844 . - doi : 10.1038/nature01123 . — . — PMID 12397359 .
  23. ↑ Ripperger, J A.; Schibler, U. Rytmisk CLOCK-BMAL1-binding til flere E-boks-motiver driver circadian Dbp-transskription og kromatinovergange  (engelsk)  // Nat. Genet  : journal. - 2006. - Marts ( bind 38 , nr. 3 ). - S. 369-374 . - doi : 10.1038/ng1738 . — PMID 16474407 .
  24. ↑ Prendergast, GC; Ziff, E B. Methyleringsfølsom sekvensspecifik DNA-binding af c-Myc basisregionen  //  Science : journal. - 1991. - Januar ( bind 251 , nr. 4990 ). - S. 186-189 . - doi : 10.1126/science.1987636 . - . — PMID 1987636 .
  25. ↑ Desbarats, L; Gaubatz, S; Eilers, M. Diskriminering mellem forskellige E-boks-bindende proteiner ved et endogent målgen af ​​c-myc  // Genes Dev  : journal  . - 1996. - Februar ( bind 10 , nr. 4 ). - S. 447-460 . doi : 10.1101 / gad.10.4.447 . — PMID 8600028 .
  26. ↑ Xiao, Q; Claassen, G; Shi, J; Adachi, S; Seivy, J; Hann, S R. Transaktiveringsdefekt c-MycS bevarer evnen til at regulere spredning og apoptose  // Genes Dev  : journal  . - 1998. - December ( bind 12 , nr. 24 ). - S. 3803-3808 . doi : 10.1101 / gad.12.24.3803 . — PMID 9869633 .
  27. ↑ Shklover, J; Etzioni, S; Weisman-Shomer, P; Yafe, A; Bengal, E; Fry, M. MyoD bruger overlappende, men distinkte elementer til at binde E-box og tetraplex strukturer af regulatoriske sekvenser af muskelspecifikke gener  //  Nucleic Acids Res : journal. - 2007. - Bd. 35 , nr. 21 . - P. 7087-7095 . - doi : 10.1093/nar/gkm746 . — PMID 17942416 .
  28. ↑ Bergström, D.A.; Penn, BH; Strand, A.; Perry, R.L.; Rudnicki, M.A.; Tapscott, SJ Promotorspecifik regulering af MyoD-binding og signaltransduktion samarbejder om mønstergenekspression   // Mol . celle : journal. - 2002. - Bd. 9 , nr. 3 . - S. 587-600 . - doi : 10.1016/s1097-2765(02)00481-1 . — PMID 11931766 .
  29. ↑ Tang, H; Goldman, D. Aktivitetsafhængig genregulering i skeletmuskulatur medieres af en histon-deacetylase (HDAC)-Dach2-myogenin signaltransduktionskaskade  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2006. - Bd. 103 , nr. 45 . - P. 16977-16982 . - doi : 10.1073/pnas.0601565103 . - . — PMID 17075071 .
  30. ↑ Ramamoorthy, S; Donohue, M; Buck, M. Nedsat Jun-D og myogenin-ekspression i muskelsvind af human kakeksi   // American Physiological Society : journal. - 2009. - Bd. 297 , nr. 2 . - P.E392-401 . - doi : 10.1152/ajpendo.90529.2008 . — PMID 19470832 .
  31. ↑ Jane, D.T.; Morvay, L.C.; Koblinski, J.; Yan, S.; Saad, F.A.; Sloane, BF; og andre et al. Bevis for, at E-box-promotorelementer og MyoD-transkriptionsfaktorer spiller en rolle i induktionen af ​​cathepsin B-genekspression under human myoblastdifferentiering   // Biol . Chem. : journal. - 2002. - Bd. 383 , nr. 12 . - S. 1833-1844 . - doi : 10.1515/BC.2002.207 . — PMID 12553720 .
  32. ↑ Neufeld; b.; ; Hoffmeyer, A.; Jordan, BWM; Chen, P.; Dinev, D.; Ludwig, S.; Rapp, UR et al. Serin/threoninkinaser 3pK og MAPK-aktiveret proteinkinase 2 interagerer med den grundlæggende helix-loop-helix-transkriptionsfaktor E47 og undertrykker dens transkriptionelle aktivitet  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 27 . - S. 20239-20242 . - doi : 10.1074/jbc.C901040199 . — PMID 10781029 .
  33. ↑ Johnson; Wang X.; Hardy S.; Taparowsky, EJ; Konieczny, SF Kaseinkinase II øger de transkriptionelle aktiviteter af MRF4 og MyoD uafhængigt af deres direkte phosphorylering   // Mol . celle. Biol. : journal. - 1996. - Bd. 16 , nr. 4 . - S. 1604-1613 . — PMID 8657135 .
  34. ↑ Slone; Shen CP; McCarrick-Walmsley R.; Kadesch T. Fosforylering af E47 som en potentiel determinant for B-cellespecifik aktivitet   // Mol . celle. Biol. : journal. - 1996. - Bd. 16 , nr. 12 . - P. 6900-6908 . — PMID 8943345 .
  35. ↑ Shen; Kadesch T. B-cellespecifik DNA-binding med en E47 homodimer  (engelsk)  // Mol. celle. Biol. : journal. - 1995. - Bd. 15 , nr. 8 . - P. 4518-4524 . — PMID 7623842 .
  36. ↑ Bain; ; Izon, DJ; Amsen, D; Kruisbeek, A.M.; Weintraub, B.C.; Krop, I; Schlissel, MS; Feeney, AJ; Van Roon, M. et al. E2A-proteiner er nødvendige for korrekt B-celleudvikling og initiering af immunoglobulingen-omlejringer  // Celle  :  journal. - Cell Press , 1994. - Vol. 79 , nr. 5 . - S. 885-892 . - doi : 10.1016/0092-8674(94)90077-9 . — PMID 8001125 .
  37. ↑ Lasar; Davis R.L.; Wright W.E.; Kadesch T.; Murre C.; Voronova A.; Baltimore D.; Weintraub H. Funktionel aktivitet af myogene HLH-proteiner kræver hetero-oligomerisering med E12/E47-lignende proteiner in vivo  // Celle  :  journal. - Cell Press , 1991. - Vol. 66 , nr. 2 . - S. 305-315. . - doi : 10.1016/0092-8674(91)90620-e . — PMID 1649701 .
  38. ↑ Murre; McCaw PS, Vaessin H., Caudy M., Jan LY, Jan YN, Cabrera CV, Buskin JN, Hauschka SD, Lassar AB, ; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L.Y.; Jan, YN; Cabrera, C.V.; Buskin, JN; Hauschka, SD; Lassar, AB et al. Interaktioner mellem heterologe helix-loop-helix-proteiner genererer komplekser, der binder specifikt til en fælles DNA-sekvens  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1989. - Vol. 58 , nr. 3 . - S. 537-544 . - doi : 10.1016/0092-8674(89)90434-0 . — PMID 2503252 .
  39. ↑ Muñoz, E; Brewer, M; Baler, R. Circadian Transcription: THINKING OUTSIDE THE E-BOX  // J Biol Chem  : journal  . - 2002. - September ( bind 277 , nr. 39 ). - P. 36009-36017 . - doi : 10.1074/jbc.m203909200 . — PMID 12130638 .
  40. ↑ Wattanasurorot, A; Saelee, N; Phongdara, A; Roytrakul, S; Jiranavichpaisal, P; Söderhäll, K; Söderhäll, I. Astakine 2 — den mørke ridder, der forbinder melatonin med døgnregulering hos krebsdyr  //  PLOS - genetik : journal. - 2013. - Marts ( bind 3 , nr. 3 ). — P.e1003361 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1003361 .
  41. ↑ Shi, G; Xing, L; Liu, Z; Qu, Z; Wu, X; Dong, Z; Wang, X; Gao, X; Huang, M; og andre; Yang, L.; Liu, Y.; Ptacek, LJ; Xu, Y. et al. Dobbeltroller af FBXL3 i pattedyrs døgnrytme-feedback-sløjfer er vigtige for periodebestemmelse og robusthed af uret  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2013. - Bd. 110 , nr. 12 . - P. 4750-4755 . - doi : 10.1073/pnas.1302560110 . - . — PMID 23471982 .
  42. ↑ Gordân, R; Shen, N; Dror, I; Zhou, T; Horton, J; Rohs, R; Bulyk, M.L. Genomiske regioner, der flankerer e-boks-bindingssteder, påvirker DNA-bindingsspecificiteten af ​​bHLH-transkriptionsfaktorer gennem DNA-form   // Cell Rep : journal. - 2013. - April ( bind 3 , nr. 4 ). - S. 1093-1104 . - doi : 10.1016/j.celrep.2013.03.014 . — PMID 23562153 .
 Transskription (biologi)

Transskriptionsregulering _
prokaryoter
eukaryoter
Histonmodifikationsenzymer ( histoner / nukleosom )
_
_
DNA-methyleringDNA methyltransferase
Chromatin ombygning
CHD7
Fælles for
pro- og eukaryoter
Aktivering
IndvielseStartside for transskription
Forlængelse
Afslutning