Ro uafhængig opsigelse

Intern terminering , også ρ-uafhængig terminering , Rho - uafhængig terminering , er en  mekanisme til at stoppe gentranskription i prokaryoter [1] . Essensen af ​​denne mekanisme er som følger: mRNA indeholder en guanin-cytosin-beriget sekvens, som kan danne hårnåle -type strukturer på 7-20 basepar i længden. Guanin og cytosin danner tre hydrogenbindinger med hinanden og er derfor ret stærkt bundet [2] . Umiddelbart efter hårnålen er der et område beriget med uracil . Bindingerne mellem uracil og adenin er meget svage. Det RNA-polymerase -associerede protein ( nusA ) binder sig så tæt til hårnålen, at det får polymerasen til midlertidigt at lukke ned og transkriptionen til at ophøre [3] . På dette tidspunkt er polymerasen placeret på polyuracilregionen af ​​sekvensen. Svage adenin-uracil-bindinger reducerer destabiliseringsenergien af ​​RNA-DNA-dupleksen, hvilket giver dem mulighed for at svække spændingen af ​​polynukleotidkæden og dissociere fra RNA-polymerase [2] .

Rho-elementer, der ikke indeholder en polyuracilsekvens, er i stand til at stoppe RNA-polymerase, men den fortsætter normalt transkriptionen efter et stykke tid, fordi dupleksen er for stabil til at forårsage dissociation af RNA-polymerase og efterfølgende terminering.

Rho-uafhængig transkriptionel terminering er en almindelig mekanisme, der ligger til grund for aktiviteten af ​​cis -regulatoriske RNA- elementer såsom riboswitches .

Noter

1. ↑ Farnham, PJ; Platt, T. Rho-uafhængig terminering: dyadesymmetri i DNA får RNA-polymerase til at holde pause under transkription in vitro  //  Nucleic Acids Research : journal. - 1981. - 11. februar ( bind 9 , nr. 3 ). - S. 563-577 . doi : 10.1093 / nar/9.3.563 . — PMID 7012794 .
2. ↑ 1 2 Lewin, Benjamin. Gener IX  (neopr.) . — Sudbury, MA: Jones and Bartlett Publishers, 2007. - ISBN 0-7637-4063-2 .
3. ↑ Wilson KS, von Hippel PH Transskriptionsterminering ved iboende terminatorer: RNA-hårnålens rolle  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1995. - September ( bind 92 , nr. 19 ). - P. 8793-8797 . - doi : 10.1073/pnas.92.19.8793 . — PMID 7568019 .