Transskriptionsfaktorer

Transkriptionsfaktorer (transkriptionsfaktorer) er proteiner , der styrer syntesen af ​​mRNA , såvel som andre typer RNA [1] på DNA- skabelonen ( transkription ) ved at binde til specifikke DNA-regioner [2] [3] . Transkriptionsfaktorer udfører deres funktion enten alene eller i kombination med andre proteiner. De giver et fald ( repressorer ) eller en stigning ( aktivatorer ) i bindingskonstanten for RNA-polymerase til de regulerende sekvenser af det regulerede gen [4] [5] [6] .

Det definerende træk ved transkriptionsfaktorer er tilstedeværelsen i deres sammensætning af et eller flere DNA-bindende domæner , der interagerer med karakteristiske DNA-regioner placeret i de regulerende regioner af gener. Andre proteiner, der spiller en nøglerolle i reguleringen af ​​genekspression , såsom coaktivatorer , histonacetylaser , kinaser , methylaser , har ikke DNA-bindende domæner og kan derfor ikke klassificeres som transkriptionsfaktorer [7] [8] [9] .

Konservering i forskellige organismer

Transkriptionsfaktorer er afgørende for reguleringen af ​​genekspression og findes i alle levende organismer. Deres antal, både absolutte og specifikke, stiger med størrelsen af ​​genomet [10] .

Der er fundet mere end 2600 proteiner i det menneskelige genom , som har et DNA-bindende domæne, og de fleste af dem er formodentlig transkriptionsfaktorer [11] . Som følge heraf koder omkring 10% af alle gener i genomet for transskriptionsfaktorer. De er således den største familie af humane proteiner [12] . Desuden reguleres aktiviteten af ​​mange gener af virksomhedsinteraktionen af ​​et stort antal forskellige transkriptionsfaktorer, hvilket gør det muligt for hvert af generne at give en unik måde at regulere på under udviklingen af ​​organismen [9] .

Funktioner

Transkriptionsfaktorer er en af ​​de grupper af proteiner, der giver læsning og fortolkning af genetisk information. De binder DNA og hjælper med at starte et program til at øge eller mindske gentransskription. De er således afgørende for kroppens normale funktion på alle niveauer. De vigtigste af de processer, hvori transkriptionsfaktorer er involveret, er anført nedenfor.

Regulering af basal genekspression

Baggrundstransskriptionel aktivitet er tilvejebragt af et sæt TF'er, der er fælles for alle gener. En vigtig klasse af eukaryote transkriptionsfaktorer er GTF'er (generelle transkriptionsfaktorer) [13] [14] . Mange af dets repræsentanter binder ikke direkte DNA, men er en del af transkriptionsinitieringskomplekset (præ-initieringskompleks), som direkte interagerer med RNA-polymerase. De mest almindelige GTF'er er TFIIA , TFIIB , TFIID (binding til den såkaldte TATA-boks ( promoter element )), TFIIE , TFIIF og TFIIH [15] .

Ud over de TF'er, der kræves til ekspression af alle gener, er der også specifikke transkriptionsfaktorer, der sikrer, at visse gener tændes/slukkes på det rigtige tidspunkt.

Regulering af ontogeni

Mange TF'er af flercellede organismer er involveret i deres udvikling [16] . I overensstemmelse med det genetiske program og/eller som reaktion på ydre påvirkninger initierer eller undertrykker de transkriptionen af ​​visse gener, hvilket medfører ændringer i cellemorfologi, celledifferentiering, morfogenese , organogenese osv. For eksempel er homeobox TF-familien kritisk for dannelsen af ​​den korrekte kropsmorfologi i organismer fra Drosophila til mennesker [17] [18] . Mutationer i generne af disse proteiner ( homotiske mutationer ) i Drosophila fører til alvorlige forstyrrelser i differentieringen af ​​kropssegmenter af disse insekter (for eksempel udvikling af ben i stedet for antenner).

Et andet eksempel på denne gruppe af TF'er er genproduktet fra den kønsbestemmende region Y (SRY, kønsbestemmende region Y), som spiller en vigtig rolle i bestemmelsen af ​​menneskelig køn. [19]

Respons på ekstracellulære signaler

Den koordinerede regulering af interaktionen mellem celler i en multicellulær organisme udføres ved frigivelse af specielle molekyler ( hormoner , cytokiner osv.), som forårsager en signaleringskaskade i målceller. Hvis et signal forårsager en ændring i ekspressionsniveauet af visse gener, er TF'er ofte det sidste led i kaskaden [20] . Østrogensignalvejen er et eksempel på en kort kaskade, der involverer østrogenreceptor-transkriptionsfaktoren: østrogen udskilles af placenta- og ovarievæv, krydser plasmamembranen af ​​modtagerceller og binder til dets receptor i cytoplasmaet. Østrogenreceptoren trænger ind i kernen og binder sig til en specifik DNA-region, hvilket ændrer den transskriptionelle regulering af det tilsvarende gen [21] .

Reaktion på miljøændringer

TF'er er ikke de eneste sidste led i signaleringskaskader, der opstår som reaktion på forskellige eksterne stimuli, men de kan også være effektorer i miljøfremkaldte signalkaskader. For eksempel aktiverer varmechokfaktor (HSF) gener for varmechokproteiner, der giver overlevelse ved forhøjede temperaturer (for eksempel chaperoner ) [22] , hypoxi-induceret faktor (HIF) - med et fald i iltkoncentrationen [23] ; SREBP-protein (sterol regulatory element binding protein) hjælper med at opretholde det nødvendige lipidindhold i celler [24] .

Cellecykluskontrol

Mange TF'er, især onkogener og tumorsuppressorer, er involveret i cellecyklusregulering . De bestemmer overgangen fra en fase af cellecyklussen til en anden, hyppigheden af ​​delinger og vækstintensiteten. En af de mest kendte sådanne TF'er er Myc -onkogenet , som spiller en vigtig rolle i cellevækst og initiering af apoptose .

Forordning

Alle generelle biologiske processer har regulering og kontrol på flere niveauer. Dette gælder også for TF'er - TF'er regulerer ikke kun niveauet af akkumulering af proteiner og RNA i cellen, men regulerer også aktiviteten af ​​deres egne gener (ofte ved hjælp af andre TF'er). De vigtigste metoder til regulering af TF-aktivitet er kort beskrevet nedenfor.

Fælles for alle proteiner

Niveauet af TF-akkumulering i cellen reguleres på samme måde som i andre proteiner ved at kontrollere transkription, mRNA-nedbrydning, translation , proteinefterbehandling, dets intracellulære lokalisering og nedbrydning. Selvregulering er mulig ifølge princippet om negativ feedback  - TF undertrykker aktiviteten af ​​det gen, der koder for det.

Intranuklear lokalisering

I eukaryote organismer er processerne med transkription og translation rumligt adskilt - de forekommer i henholdsvis kernen og cytoplasmaet . Efter syntese skal TF'er komme ind i kernen ved at bryde gennem den dobbelte membran. Mange proteiner, der fungerer i kernen, har et nuklear lokaliseringssignal  , en specifik region af polypeptidkæden, der adresserer proteinet til kernen. For mange TF'er er translokation en nøglefaktor i reguleringen af ​​deres aktivitet [25] . Vigtige klasser af TF, såsom nogle nukleare receptorer, skal først binde den endogene agonistligand i cytoplasmaet og først derefter transporteres til kernen [25] .

Aktivering

TF'er kan aktiveres/deaktiveres ved at påvirke deres signalfølsomme domæne på forskellige måder:

• ligandbinding - et stof, der er nødvendigt for at fungere, ikke en del af polypeptidet (for eksempel Zn 2+ ioner )
• phosphorylering [26] [27]  — mange TF'er skal phosphoryleres for at kunne binde DNA.
• interaktion med andre TF'er og/eller coregulatoriske proteiner.

Tilgængelighed af DNA-bindingsstedet

I eukaryoter findes gener, der ikke transskriberes kontinuerligt, ofte i heterochromatin (dele af DNA tæt pakket af histonbinding og organiseret i kompakte kromatinfibriller). DNA i heterochromatin er utilgængeligt for mange transkriptionsfaktorer. For at TF'er kan binde til DNA, skal heterochromatin transformeres til euchromatin , normalt gennem histonmodifikationer. Kromatins frihed fra nukleosomer spiller også en vigtig rolle ved binding af TF til DNA . Kromatin fri for nukleosomer kaldes åben kromatin og binder transkriptionsfaktorer meget hyppigere end nukleosombundet kromatin. Omfordeling af nukleosomer udføres af kromatin-remodelleringsfaktorer . TF-bindingsstedet på DNA kan være utilgængeligt, selvom det er bundet af en anden transkriptionsfaktor. Par af transkriptionsfaktorer kan spille en antagonistisk rolle (aktivator-repressor) i reguleringen af ​​aktiviteten af ​​ét gen.

Tilstedeværelse af andre cofaktorer/transkriptionsfaktorer

De fleste TF'er fungerer ikke alene. Ofte skal en stor mængde TF binde til dets regulatoriske elementer for at aktivere transskription af et gen. Binding af TF forårsager rekruttering af mellemliggende proteiner såsom cofaktorer, hvilket fører til samling af præ-initieringskomplekset og binding til RNA-polymerasepromotoren.

Struktur

TF'er er modulopbyggede og indeholder følgende domæner [2] :

• DNA-bindende domæne (DBD)  - interagerer med specifikke DNA-sekvenser, der er karakteristiske for promotorer og forstærkere . Specificiteten af ​​genkendelse af visse sekvenser bestemmer sættet af gener, der er underlagt regulering af denne TF;
• transaktiverende domæne (TAD)  - indeholder bindingssteder for andre proteiner, for eksempel transkriptionelle coregulatorer [28] ;
• et signalgenkendelsesdomæne (SSD) (f.eks. et ligandbindende domæne), som er følsomt over for eksterne signaler og er ansvarligt for signalering til andre komponenter i transkriptionskomplekset, hvilket forårsager en stigning eller et fald i ekspressionsniveauet.

DNA-bindende domæne

Den strukturelle og funktionelle enhed (domæne) af transkriptionsfaktorer, der binder DNA, kaldes det DNA-bindende domæne. Nedenfor er en liste over de vigtigste familier af DNA-bindende domæner/TF'er:

TF-bindingssteder

DNA-regioner, der interagerer med transkriptionsfaktorer, kaldes TF-bindingssteder. Interaktionen skyldes elektrostatiske kræfter , hydrogenbindinger og van der Waals-kræfter . På grund af disse kræfters virksomheds, sterisk bestemte virkning, som er bestemt af proteinmolekylets rumlige struktur, kan TF kun binde til bestemte DNA-regioner. Ikke alle nukleotidbaser i DNA inkluderet i TF-bindingsstedet har samme betydning i interaktionen med proteinet. Som et resultat er TF'er normalt ikke forbundet med et websted med en strengt defineret primær struktur, men med en gruppe af strukturer med tæt lighed, hver med en forskellig grad af affinitet. For eksempel, selvom konsensussekvensen for bindingsstedet for TATA-bindende proteiner er TATAAAA, kan de også interagere med TATATAT og TATATAA.

På grund af det faktum, at TF'er interagerer med korte DNA-fragmenter af en heterogen struktur, kan potentielle TF-bindingssteder optræde tilfældigt i et ret langt DNA-molekyle. Det er dog usandsynligt, at TF'er interagerer med alle relevante elementer i genomet.

Forskellige restriktioner, såsom tilgængelighed på stedet og tilstedeværelsen af ​​cofaktorer, kan lette målretningen af ​​TF til de ønskede DNA-regioner. Baseret på genomsekvensen er det således vanskeligt pålideligt at forudsige det virkelige sted for TF-binding til DNA in vivo . Yderligere specificitet af TF kan medieres af tilstedeværelsen af ​​flere DNA-bindingsdomæner inden for et enkelt protein, som interagerer med to eller flere tilstødende sekvenser samtidigt.

Kliniske aspekter

På grund af TFs nøglerolle i processen med realisering af arvelig information, kan nogle menneskelige sygdomme være forårsaget af mutationer i TF-gener. Følgende er nogle af de mest undersøgte overtrædelser af denne art:

• Rett syndrom . Mutationer i TF MECP2 -genet er forbundet med Rett syndrom, en lidelse i udviklingen af ​​nervesystemet [36] .
• Diabetes . En sjælden form for diabetes kaldet MODY (Maturity onset diabetes of the young) kan skyldes mutationer i generne fra nogle TF'er [37] .
• Udviklingsmæssig verbal dyspraksi . (krænkelse af talefunktioner). Mutationer i FOXP2 TF-genet er forbundet med udviklingen af ​​denne sygdom, hvor en person ikke kan udføre koordinerede bevægelser, der er nødvendige for talefunktion [38] [39] .
• Autoimmune sygdomme . Mutationer i FOXP3 TF-genet er forbundet med den autoimmune sygdom IPEX (immun dysregulation polyendocrinopathy enteropathy X-linked syndrome) [39] .
• Kræft . Mange transkriptionsfaktorer er onkogener eller tumorundertrykkere, og deres mutation eller fejlregulering kan føre til udvikling af cancer. For eksempel er Li-Fraumeni syndrom forårsaget af mutationer i p53 tumor suppressorgenet [40] .

Klassifikation

TF'er kan klassificeres efter (1) virkningsmekanisme, (2) regulatorisk funktion, (3) struktur af det DNA-bindende domæne, såvel som naturligt og (5) kunstigt.

Virkningsmekanisme

På dette grundlag skelnes der mellem tre klasser af TF:

• Større transkriptionsfaktorer (GTF'er) involveret i dannelsen af ​​initieringskomplekset. De vigtigste af disse er TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF og TFIIH. De er til stede i alle celler og interagerer med promotorkernen af ​​gener transskriberet af klasse 2 RNA-polymerase.
• TF'er, der interagerer med opstrømsregioner af DNA (regioner placeret opstrøms for promotoren, liggende i forhold til den på den anden side af genets kodende region ).
• Inducerbare TF'er ligner den tidligere klasse, men kræver aktivering eller inhibering.

Funktion

1. Konstitutiv  - altid til stede i alle celler - de vigtigste transkriptionsfaktorer, Sp1 , NF1 , CCAAT .
2. Aktiveret (aktiv under visse betingelser)
   1. At deltage i udviklingen af ​​organismen (cellespecifik) - ekspression er strengt kontrolleret, men efter at være begyndt at blive udtrykt, kræver det ikke yderligere aktivering - GATA, HNF, PIT-1, MyoD, Myf5, Hox, Winged Helix.
   2. Signalafhængig  - kræver et eksternt signal for at aktivere
      1. ekstracellulære signalafhængige  - nukleare receptorer
      2. intracellulært signalafhængig  - aktiveret af intracellulære forbindelser med lav molekylvægt - SREBP , p53 , enkelte nukleare receptorer
      3. membranbundet receptorafhængig  - phosphoryleret af kinaser fra signalkaskaden
         1. residente nukleare faktorer  - er i kernen uanset aktivering - CREB, AP-1, Mef2
         2. latente cytoplasmatiske faktorer  - i en inaktiv tilstand er lokaliseret i cytoplasmaet, efter aktivering transporteres de til kernen - STAT, R-SMAD, NF-kB , Notch , TUBBY, NFAT.

Strukturel klassifikation

Transkriptionsfaktorer klassificeres baseret på ligheden af ​​primær struktur (hvilket indebærer lighed af tertiær struktur) af DNA-bindende domæner [41] [42] [43] .

• 1 Superklasse: Basic Domains ( Basic-helix-loop-helix )
  • 1.1 Klasse: Leucin lynlås ( bZIP )
    • 1.1.1 Familie: AP-1 (lignende) komponenter; omfatter ( c-Fos / c-jun )
    • 1.1.2 Familie: CREB
    • 1.1.3 Familie: C/EBP- lignende faktorer
    • 1.1.4 Familie: bZIP/ PAR
    • 1.1.5 Familie: Plante G-boks bindingsfaktorer
    • 1.1.6 Familie: Kun postnummer
  • 1.2 Klasse: Helix-loop-helix ( bHLH )
    • 1.2.1 Familie: Allestedsnærværende (Klasse A) faktorer
    • 1.2.2 Familie: Myogene transkriptionsfaktorer ( MyoD )
    • 1.2.3 Familie: Achaete-Scute
    • 1.2.4 Familie: Tal/Twist/Atonal/Hen
  • 1.3 Grade: Helix-loop-helix / leucin lynlåsfaktorer ( bHLH-ZIP )
    • 1.3.1 Familie: Allestedsnærværende bHLH-ZIP-faktorer; indbefatter USF ( USF1 , USF2 ); SREBP ( SREBP )
    • 1.3.2 Familie: Cellecykluskontrollerende faktorer; inkluderer c-Myc
  • 1.4 Karakter: NF-1
    • 1.4.1 Familie: NF-1 ( NFIC )
  • 1.5 Klasse: RF-X
    • 1.5.1 Familie: RF-X ( NFX2 , NFX3 , NFX5 )
  • 1.6 Klasse: bHSH
• 2 Superklasse: Zink-koordinerende DNA-bindende domæner
  • 2.1 Klasse: Cys4 zinkfinger af nuklear receptortype
    • 2.1.1 Familie: Steroidhormonreceptorer
    • 2.1.2 Familie: Thyroidhormon-receptorlignende faktorer
  • 2.2 Klasse: forskellige Cys4 zinkfingre
    • 2.2.1 Familie: GATA-faktorer
  • 2.3 Klasse: Cys2His2 zink finger domæne
    • 2.3.1 Familie: Allestedsnærværende faktorer, omfatter TFIIA , Sp1
    • 2.3.2 Familie: Udviklings-/cellecyklusregulatorer; omfatter Kruppel
    • 2.3.4 Familie: Store faktorer med NF-6B-lignende bindingsegenskaber
  • 2.4 Klasse: Cys6 cystein-zink klynge
  • 2.5 Klasse: Zinkfingre af vekslende sammensætning
• 3 Superklasse: Spiral-sving-spiral
  • 3.1 Klasse: Homeodomæne
    • 3.1.1 Familie: Kun Homeo-domæne; inkluderer Ubx
    • 3.1.2 Familie: POU-domænefaktorer ; okt _
    • 3.1.3 Familie: Homeo-domæne med LIM-region
    • 3.1.4 Familie: homeo-domæne plus zinkfingermotiver
  • 3.2 Klasse: Parret boks
    • 3.2.1 Familie: Parret plus homeo-domæne
    • 3.2.2 Familie: Kun parret domæne
  • 3.3 Klasse: Gaffelhoved / vinget helix
    • 3.3.1 Familie: Udviklingsregulatorer; gaffelhoved _
    • 3.3.2 Familie: Vævsspecifikke regulatorer
    • 3.3.3 Familie: Cellecykluskontrollerende faktorer
    • 3.3.0 Familie: Andre regulatorer
  • 3.4 Klasse: Varmechokfaktorer
    • 3.4.1 Familie: HSF
  • 3.5 Klasse: Tryptofanklynger
    • 3.5.1 Familie: Myb
    • 3.5.2 Familie: Ets-type
    • 3.5.3 Familie: Interferon regulatoriske faktorer
  • 3.6 Klasse: TEA (transcriptional enhancer factor) domæne
    • 3.6.1 Familie: TEA ( TEAD1 , TEAD2 , TEAD3 , TEAD4 )
• 4 Superklasse: beta-Scaffold Factors med Minor Groove-kontakter
  • 4.1 Klasse: RHR (Rel homologi region)
    • 4.1.1 Familie: Rel/ ankyrin ; NF-kappaB
    • 4.1.2 Familie: kun ankyrin
    • 4.1.3 Familie: NF-AT ( Kernefaktor af aktiverede T - celler ) ( NFATC1 , NFATC2 , NFATC3 )
  • 4.2 Klasse: STAT
    • 4.2.1 Familie: STAT
  • 4.3 Klasse: p53
    • 4.3.1 Familie: s53
  • 4.4 Klasse: MADS boks
    • 4.4.1 Familie: Regulatorer af differentiering; omfatter ( Mef2 )
      • 4.4.2 Familie: Respondere på eksterne signaler, SRF ( serumresponsfaktor ) ( SRF )
  • 4.5 Klasse: beta-Barrel alfa-helix transkriptionsfaktorer
  • 4.6 Klasse: TATA-bindende proteiner
    • 4.6.1 Familie: TBP
    • 4.7.1 Familie: SOX-gener , SRY
    • 4.7.2 Familie: TCF-1 ( TCF1 )
    • 4.7.3 Familie: HMG2-relateret, SSRP1
    • 4.7.5 Familie: MATA
  • 4.8 Klasse: Heteromere CCAAT-faktorer
    • 4.8.1 Familie: Heteromere CCAAT-faktorer
  • 4.9 Klasse: Grainyhead
    • 4.9.1 Familie: Grainyhead
  • 4.10 Klasse: Cold-shock domæne faktorer
    • 4.10.1 Familie: csd
  • 4.11 Klasse: Runt
    • 4.11.1 Familie: Runt
• 0 Superklasse: Andre transskriptionsfaktorer
  • 0.1 Klasse: Kobbernæveproteiner
  • 0,2 Klasse: HMGI(Y) ( HMGA1 )
    • 0.2.1 Familie: HMGI(Y)
  • 0.3 Klasse: Lommedomæne
  • 0,4 Klasse: E1A-lignende faktorer
  • 0,5 Klasse: AP2/EREBP-relaterede faktorer
    • 0.5.1 Familie: AP2
    • 0.5.2 Familie: EREBP
    • 0.5.3 Superfamilie: AP2/B3
      • 0.5.3.1 Familie: ARF
      • 0.5.3.2 Familie: ABI
      • 0.5.3.3 Familie: RAV

Kunstige transskriptionsfaktorer

CRISPR -systemet kan tilpasses til at fungere som en transkriptionsfaktor (crisprTF). For at gøre dette modificeres et CRISPR-associeret protein kendt som Cas9 , så når det først binder til DNA, kan det ikke længere spalte det. Derefter tilføjes et segment til det, som aktiverer eller undertrykker genekspression ved at modulere cellens transkriptionelle mekanisme [44] [45] [46] [47] . I modsætning til transkriptionsfaktorer baseret på zinkfingre og TAL-effektoren , kræver DNA-genkendelse af CRISPR-Cas-systemet kun skabelsen af ​​en passende RNA "guide"-sekvens og ikke skabelsen af ​​nye proteindomæner af enzymet, hvilket gør den er meget mere tilgængelig på grund af billighed og enkelhed (op til det faktum, at der blev udviklet et sæt regler - "grammatik" - der beskriver, hvordan man designer en syntetisk transskriptionsfaktor (STFS) og et program til dets automatiserede design [48] ).

Se også

• NPAS3
• Proteiner af polycomb-gruppen
• Regulerende funktion af proteiner
• laktoseoperon
• okt-4

Noter

1. ↑ Koordinerede fald i rRNA-gentransskriptionsfaktorer og rRNA-syntese under muskelcelledifferentiering - PubMed . Hentet 1. juli 2020. Arkiveret fra originalen 4. juli 2020. (ubestemt)
2. ↑ 1 2 Latchman DS Transskriptionsfaktorer: en oversigt   // Int . J Biochem. Celle biol. : journal. - 1997. - Bd. 29 , nr. 12 . - S. 1305-1312 . - doi : 10.1016/S1357-2725(97)00085-X . — PMID 9570129 .
3. ↑ Karin M. For mange transkriptionsfaktorer: positive og negative interaktioner  //  New Biol. : journal. - 1990. - Bd. 2 , nr. 2 . - S. 126-131 . — PMID 2128034 .
4. ↑ Roeder RG Rollen af ​​generelle initieringsfaktorer i transkription af RNA-polymerase II  // Trends Biochem  . sci. : journal. - 1996. - Bd. 21 , nr. 9 . - s. 327-335 . - doi : 10.1016/0968-0004(96)10050-5 . — PMID 8870495 .
5. ↑ Nikolov DB, Burley SK RNA-polymerase II-transkriptionsinitiering: et strukturelt synspunkt  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1997. - Bd. 94 , nr. 1 . - S. 15-22 . - doi : 10.1073/pnas.94.1.15 . — PMID 8990153 .
6. ↑ Lee TI, Young RA Transskription af eukaryote proteinkodende gener   // Annu . Rev. Genet.  : journal. - 2000. - Vol. 34 . - S. 77-137 . - doi : 10.1146/annurev.genet.34.1.77 . — PMID 11092823 .
7. ↑ Mitchell PJ, Tjian R. Transkriptionel regulering i pattedyrsceller ved sekvensspecifikke DNA-bindingsproteiner  //  Science : journal. - 1989. - Bd. 245 , nr. 4916 . - s. 371-378 . - doi : 10.1126/science.2667136 . — PMID 2667136 .
8. ↑ Ptashne M., Gann A. Transskriptionel aktivering ved rekruttering   // Nature . - 1997. - Bd. 386 , nr. 6625 . - S. 569-577 . - doi : 10.1038/386569a0 . — PMID 9121580 .
9. ↑ 1 2 Brivanlou AH, Darnell JE Signaltransduktion og kontrol af genekspression  (engelsk)  // Science : journal. - 2002. - Bd. 295 , nr. 5556 . - s. 813-818 . - doi : 10.1126/science.1066355 . — PMID 11823631 .
10. ↑ van Nimwegen E. Skaleringslove i det funktionelle indhold af genomer  // Trends Genet  . : journal. - 2003. - Bd. 19 , nr. 9 . - S. 479-484 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00203-8 . — PMID 12957540 .
11. ↑ Babu MM, Luscombe NM, Aravind L., Gerstein M., Teichmann SA Struktur og udvikling af transkriptionelle regulatoriske netværk   // Curr . Opin. Struktur. Biol. : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 3 . - S. 283-291 . - doi : 10.1016/j.sbi.2004.05.004 . — PMID 15193307 .
12. ↑ Lambert SA , Jolma A. , Campitelli LF , Das PK , Yin Y. , Albu M. , Chen X. , Taipale J. , Hughes TR , Weirauch MT The Human Transcription Factors.  (engelsk)  // Cell. - 2018. - 8. februar ( bd. 172 , nr. 4 ). - S. 650-665 . - doi : 10.1016/j.cell.2018.01.029 . — PMID 29425488 .
13. ↑ Reese JC Basale transkriptionsfaktorer  (ubestemt)  // Aktuel mening inden for genetik og udvikling. - 2003. - April ( bind 13 , nr. 2 ). - S. 114-118 . - doi : 10.1016/S0959-437X(03)00013-3 . — PMID 12672487 .
14. ↑ Shilatifard A., Conaway RC, Conaway JW RNA  - polymerase II forlængelseskomplekset  // Årlig gennemgang af biokemi : journal. - 2003. - Bd. 72 . - S. 693-715 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161551 . — PMID 12676794 .
15. ↑ Thomas MC, Chiang CM Det generelle transkriptionsmaskineri og generelle cofaktorer  //  Kritiske anmeldelser i biokemi og molekylærbiologi: tidsskrift. - 2006. - Bd. 41 , nr. 3 . - S. 105-178 . — PMID 16858867 .
16. ↑ Lobe CG Transkriptionsfaktorer og pattedyrs udvikling  (neopr.)  // Aktuelle emner i udviklingsbiologi. - 1992. - T. 27 . - S. 351-383 . — PMID 1424766 .
17. ↑ Lemons D., McGinnis W. Genomisk udvikling af Hox-genklynger  // Science  :  journal. - 2006. - September ( bind 313 , nr. 5795 ). - P. 1918-1922 . - doi : 10.1126/science.1132040 . — PMID 17008523 .
18. ↑ Moens CB, Selleri L. Hox cofactors in vertebrate development  (neopr.)  // Developmental biology. - 2006. - Marts ( bd. 291 , nr. 2 ). - S. 193-206 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2005.10.032 . — PMID 16515781 .
19. ↑ Ottolenghi C., Uda M., Crisponi L., Omari S., Cao A., Forabosco A., Schlessinger D. Bestemmelse og stabilitet af køn  (neopr.)  // BioEssays : nyheder og anmeldelser inden for molekylær, cellulær og udviklingsmæssig biologi. - 2007. - Januar ( bind 29 , nr. 1 ). - S. 15-25 . - doi : 10.1002/bies.20515 . — PMID 17187356 .
20. ↑ Pawson T. Signaltransduktion - en bevaret vej fra membranen til kernen  //  Developmental genetics : journal. - 1993. - Bd. 14 , nr. 5 . - s. 333-338 . - doi : 10.1002/dvg.1020140502 . — PMID 8293575 .
21. ↑ Osborne CK, Schiff R., Fuqua SA, Shou J. Østrogenreceptor: nuværende forståelse af dens aktivering og modulering   // Clin . Cancer Res. : journal. - 2001. - December ( bind 7 , nr. 12 Suppl ). - S. 4338s-4342s; diskussion 4411s—4412s . — PMID 11916222 .
22. ↑ Shamovsky I., Nudler E. Ny indsigt i mekanismen for varmechokresponsaktivering   // Cell . Mol. livsvidenskab.  : journal. - 2008. - Marts ( bd. 65 , nr. 6 ). - S. 855-861 . - doi : 10.1007/s00018-008-7458-y . — PMID 18239856 .
23. ↑ Benizri E., Ginouvès A., Berra E. Magien ved hypoxi-signaleringskaskaden   // Cell . Mol. livsvidenskab.  : journal. - 2008. - April ( bind 65 , nr. 7-8 ). - S. 1133-1149 . - doi : 10.1007/s00018-008-7472-0 . — PMID 18202826 .
24. ↑ Weber LW, Boll M., Stampfl A. Vedligeholdelse af kolesterolhomeostase: sterolregulerende elementbindende proteiner  // World  J. Gastroenterol. : journal. - 2004. - November ( bind 10 , nr. 21 ). - s. 3081-3087 . — PMID 15457548 . Arkiveret fra originalen den 11. august 2007.
25. ↑ 1 2 Whiteside ST, Goodbourn S. Signaltransduktion og nuklear målretning: regulering af transkriptionsfaktoraktivitet ved subcellulær lokalisering   // Journal of Cell Science : journal. — Selskabet af Biologer, 1993. - April ( vol. 104 (Pt 4) ). - S. 949-955 . — PMID 8314906 .
26. ↑ Bohmann D. Transskriptionsfaktor-phosphorylering: en forbindelse mellem signaltransduktion og reguleringen af ​​genekspression  //  Cancerceller (Cold Spring Harbor, NY: 1989): tidsskrift. - 1990. - November ( bind 2 , nr. 11 ). - S. 337-344 . — PMID 2149275 .
27. ↑ Weigel NL, Moore NL Steroid Receptor Phosphorylation: A Key Modulator of Multiple Receptor Functions   : journal . - 2007. - PMID 17536004 .
28. ↑ Wärnmark A., Treuter E., Wright AP, Gustafsson J-Å. Aktiveringsfunktion 1 og 2 af nukleare receptorer: molekylære strategier for transkriptionel aktivering  (engelsk)  // Mol. Endokrinol. : journal. - 2003. - Bd. 17 , nr. 10 . - S. 1901-1909 . - doi : 10.1210/me.2002-0384 . — PMID 12893880 .
29. ↑ Littlewood TD, Evan GI Transskriptionsfaktorer 2: helix-loop-helix  (neopr.)  // Proteinprofil. - 1995. - V. 2 , nr. 6 . - S. 621-702 . — PMID 7553065 .
30. ↑ Vinson C., Myakishev M., Acharya A., Mir AA, Moll JR, Bonovich M. Klassificering af humane B-ZIP-proteiner baseret på dimeriseringsegenskaber  //  Molekylær og cellulær biologi : journal. - 2002. - September ( bind 22 , nr. 18 ). - P. 6321-6335 . - doi : 10.1128/MCB.22.18.6321-6335.2002 . — PMID 12192032 .
31. ↑ Wintjens R., Rooman M. Strukturel klassifikation af HTH DNA-bindende domæner og protein-DNA interaktionsmåder  //  Journal of molecular biology : journal. - 1996. - September ( bind 262 , nr. 2 ). - S. 294-313 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0514 . — PMID 8831795 .
32. ↑ Gehring WJ, Affolter M., Bürglin T. Homeodomæneproteiner  (engelsk)  // Årlig gennemgang af biokemi : journal. - 1994. - Bd. 63 . - s. 487-526 . doi : 10.1146 / annurev.bi.63.070194.002415 . — PMID 7979246 .
33. ↑ Dahl E., Koseki H., Balling R. Pax-gener og organogenese  (neopr.)  // BioEssays: nyheder og anmeldelser i molekylær-, cellulær- og udviklingsbiologi. - 1997. - September ( bind 19 , nr. 9 ). - S. 755-765 . - doi : 10.1002/bies.950190905 . — PMID 9297966 .
34. ↑ Laity JH, Lee BM, Wright PE Zinkfingerproteiner: ny indsigt i strukturel og funktionel mangfoldighed  //  Aktuel mening i strukturel biologi: tidsskrift. - 2001. - Februar ( bind 11 , nr. 1 ). - S. 39-46 . - doi : 10.1016/S0959-440X(00)00167-6 . — PMID 11179890 .
35. ↑ Wolfe SA, Nekludova L., Pabo CO DNA-genkendelse af Cys2His2 zinkfingerproteiner  (engelsk)  // Årlig gennemgang af biofysik og biomolekylær struktur  : tidsskrift. - 2000. - Vol. 29 . - S. 183-212 . - doi : 10.1146/annurev.biophys.29.1.183 . — PMID 10940247 .
36. ↑ Fichou Y., Nectoux J., Bahi-Buisson N., Rosas-Vargas H., Girard B., Chelly J., Bienvenu T. Den første missense-mutation, der forårsager Rett-syndrom, der specifikt påvirker MeCP2_e1-isoformen. (engelsk)  // Neurogenetics: journal. - 2008. - November. — PMID 19034540 .
37. ↑ Al-Quobaili F., Montenarh M. Pancreatic duodenal homeobox factor-1 og diabetes mellitus type 2 (gennemgang). (engelsk)  // Int J Mol Med. : journal. - 2008. - Bd. 21(4) . - S. 399-404 . — PMID 18360684 .
38. ↑ Lai CS, Fisher SE, Hurst JA, Vargha-Khadem F., Monaco AP. Et forkhead-domæne-gen er muteret i en alvorlig tale- og sprogforstyrrelse. (engelsk)  // Natur: journal. - 2001. - Bd. 413 (6855) . - s. 519-523 . — PMID 11586359 .
39. ↑ 1 2 Banerjee-Basu S., Baxevanis AD Strukturel analyse af sygdomsfremkaldende mutationer i P-underfamilien af ​​forkhead-transskriptionsfaktorer. (engelsk)  // Proteins: journal. - 2004. - Bd. 54(4) . - s. 639-647 . — PMID 14997560 .
40. ↑ Ariffin H., Martel-Planche G., Daud SS, Ibrahim K., Hainaut P. Li-Fraumenis syndrom hos en malaysisk familie. (neopr.)  // Cancer Genet Cytogenet .. - 2008. - T. 186 (1) . - S. 49-53 . — PMID 18786442 .
41. ↑ Stegmaier P., Kel AE, Wingender E. Systematisk DNA-bindende domæneklassifikation af transkriptionsfaktorer  //  Genominformatik. International Conference on Genome Informatics: tidsskrift. - 2004. - Bd. 15 , nr. 2 . - S. 276-286 . — PMID 15706513 . Arkiveret fra originalen den 19. juni 2013.
42. ↑ Matys V., Kel-Margoulis OV, Fricke E., Liebich I., Land S., Barre-Dirrie A., Reuter I., Chekmenev D., Krull M., Hornischer K., Voss N., Stegmaier P. ., Lewicki-Potapov B., Saxel H., Kel AE, Wingender E. TRANSFAC og dets modul TRANSCompel: transkriptionel genregulering i eukaryoter  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2006. - Bd. 34 , nr. Database problem . - P. D108-10 . doi : 10.1093 / nar/gkj143 . — PMID 16381825 .
43. ↑ TRANSFAC®-database . _ _ Hentet 5. august 2007. Arkiveret fra originalen 21. marts 2012. (ubestemt)
44. ↑ Qi Lei S. , Larson Matthew H. , Gilbert Luke A. , Doudna Jennifer A. , ​​Weissman Jonathan S. , Arkin Adam P. , Lim Wendell A. Genanvender CRISPR som en RNA-Guided Platform for Sequence-Specific Control af genekspression   // Celle . - 2013. - Februar ( bind 152 , nr. 5 ). - S. 1173-1183 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2013.02.022 . — PMID 23452860 .
45. ↑ Farzadfard Fahim , Perli Samuel D. , Lu Timothy K. Tunable and Multifunctional Eukaryotic Transcription Factors Based on CRISPR/Cas  //  ACS Synthetic Biology. - 2013. - 11. september ( bind 2 , nr. 10 ). - s. 604-613 . — ISSN 2161-5063 . - doi : 10.1021/sb400081r . — PMID 23977949 .
46. ↑ Gilbert Luke A. , Larson Matthew H. , Morsut Leonardo , Liu Zairan , Brar Gloria A. , Torres Sandra E. , Stern-Ginossar Noam , Brandman Onn , Whitehead Evan H. , Doudna Jennifer A. , Lim Wendell A. , Weissman Jonathan S. , Qi Lei S. CRISPR-medieret modulær RNA-guidet regulering af transkription i eukaryoter  // Cell. - 2013. - Juli ( vol. 154 , nr. 2 ). - S. 442-451 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2013.06.044 . — PMID 23849981 .
47. ↑ Perez-Pinera Pablo , Kocak D Dewran , Vockley Christopher M , Adler Andrew F , Kabadi Ami M , Polstein Lauren R , Thakore Pratiksha I , Glass Katherine A , Ousterout David G , Leong Kam W , Guilak Farshid , Crawford Gregory E , Timothy E , Gersbach Charles A. RNA-guidet genaktivering ved CRISPR-Cas9-baserede transkriptionsfaktorer  //  Nature Methods. - 2013. - 25. juli ( bind 10 , nr. 10 ). - S. 973-976 . — ISSN 1548-7091 . - doi : 10.1038/nmeth.2600 . — PMID 23892895 .
48. ↑ Purcell Oliver , Peccoud Jean , Lu Timothy K. Regelbaseret design af syntetiske transkriptionsfaktorer i eukaryoter  //  ACS Synthetic Biology. - 2014. - 3. januar ( bind 3 , nr. 10 ). - s. 737-744 . — ISSN 2161-5063 . - doi : 10.1021/sb400134k . — PMID 24933274 .

Ordbøger og encyklopædier	Britannica (online) Brockhaus
I bibliografiske kataloger	J9U : 987007537188805171 LCCN : sh92005483