Generelle transkriptionsfaktorer [1] ( eng. generelle transkriptionsfaktorer, GTF'er, basale transkriptionsfaktorer ) - en klasse af proteintransskriptionsfaktorer , der hjælper med at placere eukaryotisk RNA-polymerase II korrekt på promotoren , og som også bidrager til adskillelsen af to DNA-strenge til tillade transkription at begynde på dette sted og fremme frigivelsen af RNA-polymerase fra promotoren under overgangen fra transkriptionsinitiering til transkriptionsforlængelse. Navnet "almindelig" skyldes det faktum, at de er nødvendige for driften af næsten alle de promotorer, der anvendes af RNA-polymerase II. Derudover interagerer GTF'er medmediatoren er et af nøgleelementerne i det transkriptionelle apparat, der er nødvendigt for den korrekte interaktion af aktivatorproteiner og GTF'er med RNA-polymerase II [2] . Generelle transkriptionsfaktorer betegnes TFII (fra den engelsk-transkriptionsfaktor RNA polymerase II) [1] . GTF'er omfatter TFIIA , TFIIB , TFIID , TFIIE , TFIIG , TFIIH [3] [4] .
Eukaryote GTF'er udfører funktioner svarende til dem af den bakterielle σ-faktor , desuden har dele af TFIIH den samme tredimensionelle struktur som lignende dele af σ-faktoren [5] .
Generelle faktorer samles på RNA-polymerase II-promotoren til et præinitieringskompleks ( transkriptionsinitieringskompleks ) som følger . RNA-polymerase II-promotoren har normalt en speciel sekvens kaldet TATA-boksen , som er placeret 25 nukleotider fra transkriptionsstartstedet. TFIID-faktoren genkender og binder TATA-boksen gennem dens TBP underenhed , hvorefter TFIIB binder til DNA ved siden af. TFIID forvrænger kraftigt den tredimensionelle struktur af DNA i TATA-boksregionen, og denne forvrængning tjener sandsynligvis som en mekanisk reference til at bestemme positionen af den aktive promotor. Derefter bliver de resterende almindelige transkriptionsfaktorer og selve RNA-polymerase II knyttet til promotoren og danner et fuldgyldigt transkriptionsinitieringskompleks. Dernæst afbryder TFIIH ved hjælp af ATP de to DNA-strenge ved transkriptionsstartpunktet, og udsætter samtidig skabelonstrengen til ydersiden. Den indeholder også en underenhed med proteinkinaseaktivitet , der phosphorylerer RNA-polymerase II, hvilket får dens konformation til at ændre sig, så den frigøres fra GTF'er og fortsætter til forlængelse. Fosforylering af RNA-polymerase II udføres ved det C-terminale domæne, bestående af 52 tandem 7 - aminosyregentagelser ; den 5. serinrest phosphoryleres i hver gentagelse. Efter adskillelse af RNA-polymerase II fra DNA adskilles transkriptionsfaktorer også fra DNA [6] .
Ovenstående bindingssekvens observeres under in vitro -betingelser ; in vivo kan samlingsrækkefølgen af almindelige transkriptionsfaktorer på promotoren variere fra gen til gen [6] .
Tabellen nedenfor viser funktionerne af almindelige transkriptionsfaktorer.
| Navn | Antal underenheder |
Funktioner [7] |
|---|---|---|
| TFIID TBP underenhed TAF underenhed |
1 ~ 11 |
Genkender TATA-boksen. Genkender andre DNA-sekvenser omkring transkriptionsstartstedet, regulerer DNA-binding af TBP |
| TFIIA | 2 [8] [9] | Interagerer med TBP TFIID-underenheden og er involveret i TBP-binding til TATA-boksen [10] |
| TFIIB | en | Genkender BRE -elementet i promotorer, orienterer nøjagtigt RNA-polymerase II ved transkriptionsstartpunktet |
| TFIIF | 3 | Stabiliserer interaktionen af RNA-polymerase med TBP og TFIIB, fremmer binding til TFIIE og TFIIH |
| TFIIE | 2 | Rekrutterer og regulerer TFIIH |
| TFIIH | 9 | Afvikler DNA ved transkriptionsstartstedet, phosphorylerer RNA-polymerase II og frigiver det fra promotoren |