SARS-CoV-2-stammer

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 5. juni 2022; checks kræver 3 redigeringer .

SARS-CoV-2-stammer  er varianter af SARS-CoV-2- coronaviruset , der anses for at være af særlig betydning [1] . Den genetiske sekvens WIV04/2019 er sandsynligvis den oprindelige stamme , der inficerer mennesker, kendt som "genetisk sekvens nul" [2] .

De er angivet med bogstaverne i det græske alfabet .

Navngivningssystem

Verdenssundhedsorganisationen forsøgte ikke at bruge georeferencing i navnene på stammerne af den nye coronavirus [3] , og besluttede i maj 2021 at udpege dem med bogstaverne i det græske alfabet. Dette udelukker navnene "britiske", "brasilianske" osv., der er forbundet med navnene på de lande, hvor de tilsvarende stammer først blev opdaget [4] . Især blev en ny SARS-CoV-2-stamme opdaget i november 2021 navngivet "omicron" [5] .

Samtidig blev brugen af ​​bogstaverne " nu " og " xi " opgivet [6] : det første ligner det engelske ord new (nyt), og det andet - det kinesiske efternavn Xi, som især er Xi Jinping [7] [8] .

Pivottabel

Risiko:   meget høj   høj   gennemsnit   kort

Navn Første opdagelse Betydelige mutationer Kliniske ændringer
HVEM pangolin Placere datoen Overførbarhed Dødelighed
Beta B.1.351
Sydafrika 		maj 2020 N501Y, K417N, E484K +25 % (20-30 %) [9] Muligvis stigende
Epsilon B.1.427,
B.1.429
USA 		juli 2020 +20 % (19-24 %)
lambda C.37
Peru 		august 2020
Alfa B.1.1.7
Storbritanien 		20. september 2020 [10] N501Y, 69-70del, P681H +29 % (24-33 %) [9] +59 % (44-74 %)
Delta B.1.617.2
Indien 		oktober 2020 L452R, T478K, P681R +97 % (76-117 %) [9] [11] +137 % (50-230 %) [12]
Gamma B.1.1.28
(P.1)
Brasilien 		november 2020 K417T, E484K, N501Y +38 % (29-48 %) [9] +50 % (20-90 %)
Zeta B.1.1.28
(P.2)
Brasilien 		november 2020
Iota B.1.526
USA 		november 2020
Dette B.1.525
Storbritannien Nigeria

december 2020
Kappa B.1.617.1
Indien 		december 2020
Mu B.1.621
Colombia 		januar 2021
Theta B.1.1.28
(P.3)
Filippinerne 		februar 2021
Omicron B.1.1.529
Sydafrika Botswana

8. november 2021 [13] Øget [14] [15] −75 % [16] [Komm. en]

Hoards

Korrespondancetabel for forskellige navne på sorter af SARS-CoV-2
Linjer ifølge Rambaut og andre. Bemærkninger om Rambaut et al. Nextstrain clades GISAID clades Betydelige stammer eller mutationer
A.1-A.6 19B S
B.3–B.7 , B.9 , B.10 , B.13 –B.16 19A L
O
B.2 V
B.1 B.1.5–B.1.72 20A G Lineage B.1 af Rambaut et al. inkluderer stammer med mutation D614G
B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37 GH
B.1.3–B.1.66 20C Indeholder stamme 501.V2
B.1.1 20B GR Inkluderer stamme 202012/01 , stamme B.1.1.207 og B.1.1.284
B.1.177 20A.EU1 [17] GV

Der er flere tusinde stammer af SARS-CoV-2 virus i naturen. De er normalt grupperet i store grupper kaldet clades . Flere forskellige kladenomenklaturer for SARS-CoV-2 er blevet foreslået.

Væsentlige virusstammer

Strains of Concern (VOC)

Nedenfor er de stammer, der er opført af WHO som bekymrende (Variants of Concern) [18] .

Alfa (linje B.1.1.7)

Stamme 202012/01 (VOC-202012/01), tidligere kendt som den første stamme under revision i december 2020 (VUI - 202012/01) og også som afstamning B.1.1.7 eller 20B/501Y.V1, blev først opdaget i oktober 2020 under den britiske COVID-19-pandemi fra en prøve taget den foregående måned. Siden da er dens chancer for at blive dominerende fordoblet hver 6,5 dag (estimeret generationsinterval). Dette korrelerer med en betydelig stigning i forekomsten af ​​COVID-19 i Storbritannien. Denne stigning menes i det mindste delvist at skyldes en ændring i N501Y inden for det receptorbindende domæne af spike-glycoproteinet, som er påkrævet for at binde til ACE2 i humane celler.

Der er nogle beviser på, at denne variant har en 30-70% øget overførselsevne, og foreløbige undersøgelser tyder på en øget dødelighed [19] .

Den 2. februar 2021 rapporterede britiske embedsmænd, at blandt 214.000 genetisk sekventerede prøver af denne stamme havde 11 også E484K-mutationen [20] [21] . En af mutationerne (N501Y) er også til stede i beta- og gamma-stammerne.

Den 31. maj 2021 annoncerede Verdenssundhedsorganisationen, at den britiske stamme til brug i offentlig kommunikation ville blive omtalt som "alpha" [22] [23] .

Beta (linje B.1.351)

501.V2-stammen, også kendt som 501.V2-, 20C/501Y.V2- eller B.1.351-linjen, blev først identificeret i Sydafrika som rapporteret af det sydafrikanske sundhedsministerium den 18. december 2020. Forskere og embedsmænd rapporterede, at forekomsten af ​​denne stamme var højere blandt unge voksne uden nogen underliggende sygdom, og sammenlignet med andre stammer er det mere sandsynligt, at den forårsager alvorlig sygdom i disse tilfælde. Det sydafrikanske sundhedsministerium har også indikeret, at denne stamme muligvis driver den anden bølge af COVID-19-pandemien i landet på grund af det faktum, at stammen spreder sig hurtigere end andre tidligere stammer af virussen.

Forskerne bemærkede, at denne stamme indeholder flere mutationer, der gør det muligt for den lettere at binde sig til menneskeceller. Disse er tre mutationer i det receptor-bindende domæne (RBD) i spike glycoprotein af virus: N501Y [24] [25] (i stedet for aminosyren asparagin (N) aminosyren tyrosin (Y) [26] i position 501), K417N og E484K [27] [28] . To af disse mutationer (E484K og N501Y) er i receptorbindingsmotivet (RBM) af receptorbindingsdomænet (RBD) [29] .

Den nye stamme blev opdaget ved genomsekventering . Adskillige genomiske sekvenser fra denne afstamning er blevet indsendt til GISAID ( Global I nitiative on S haring A vian Influenza D ata) sekvensdatabase, for eksempel sekvensen EPI_ISL_678597 [ 30] .

Den 4. januar 2021 rapporterede The Telegraph , at Oxford-immunolog Sir John Bell mener, at den nye sydafrikanske stamme rejser et "stort spørgsmål", da den kunne være resistent over for vacciner og dermed knuse håb og erstatte dem med frygt [31] . Samme dag sagde vaccinologiprofessor Shabir Madhi til CBS News, at det ikke er sikkert, at den nye 501.V2-stamme vil være i stand til at "omgå" beskyttelsen af ​​vaccinen, men han mener, at den "kan være mindre effektiv" [32 ] . Yderligere mutationer i spidsproteinet i 501.V2-stammen blev citeret af University of Reading Associate Professor of Cellular Microbiology Simon Clarke som en bekymring, fordi de "kan gøre virussen mindre modtagelig over for immunresponset fremkaldt af vaccinen." Lawrence Young, en virolog ved University of Warwick, bemærkede også, at flere spidsmutationer i denne stamme "kan resultere i en vis flugt fra immunforsvaret" [33] .

Ugur Sahin, administrerende direktør for BioNTech , udtalte, at der er behov for yderligere forskning for at sikre, at virksomhedens nuværende vaccine virker mod 501.V2-stammen, men hvis vaccinen skal justeres, kan virksomheden gøre det om cirka 6 uger [ 34] . Den 8. januar 2021 rapporterede The Guardian, at Pfizer og BioNTechs COVID-19-vaccine har vist i test, der involverer 20 blodprøver, at den er i stand til at yde beskyttelse mod 501.V2-stammen. Yderligere forskning er nødvendig for at fastslå den nøjagtige grad af beskyttelse [35] .

Gamma (linje B.1.1.248)

B.1.1.248-slægten blev opdaget i Tokyo den 6. januar 2021 af National Institute of Infectious Diseases (NIID). Den nye stamme blev fundet hos fire personer, der ankom til Tokyo fra Amazonas den 2. januar 2021. Den brasilianske statsfond Oswaldo Cruz bekræftede deres antagelse om, at denne stamme var almindelig i Amazonas regnskov. Denne stamme af SARS-CoV-2 har 12 mutationer i spikeproteinet, inklusive N501Y og E484K.

Et fortrykt papir af Caroline M. Voloch et al. identificerede en ny afstamning af SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', distribueret i Brasilien, afledt af stamme B.1.1.28. Den beskriver, at den nye stamme først dukkede op i juli og først blev opdaget i oktober, men på tidspunktet for offentliggørelsen (december 2020), selvom dens hyppighed er steget betydeligt, var dens distribution stadig for det meste begrænset til delstatshovedstaden Rio de Janeiro.

Denne stamme forårsagede et udbrud i byen Manaus , på trods af at byen allerede havde oplevet en massiv infektion i maj [36] og en undersøgelse viste [37] en høj forekomst af SARS-CoV-2 antistof serotyper [38] .

Den 11. februar 2021 annoncerede lederen af ​​det brasilianske sundhedsministerium, Eduardo Pazuello, at denne stamme er tre gange mere smitsom end den "originale" SARS-CoV-2 [39] .

Delta (linje B.1.617.2)

I oktober 2020 blev B.1.617.2-slægten først opdaget i Indien [40] [41] [42] . I anden halvdel af april 2021 kom den indiske deltastamme til Rusland [43] .

Den 14. juni 2021 blev en muteret variant B.1.617.2 opdaget i Indien, som er kendt som AY.1 eller delta plus varianten [44] . "Delta plus" er kendetegnet ved tilstedeværelsen af ​​K417N-mutationen i spikeproteinet, som kan reducere aktiviteten af ​​antistoffer i restituerede og vaccinerede mennesker [45] . Indiens sundhedsministerium har navngivet tre kendetegn ved "delta plus": øget smitsomhed, øget evne til at binde til lungecellereceptorer og potentiel resistens over for monoklonal antistofterapi [46] .

I oktober 2021, mens de sporede udviklingen af ​​delta-stammen, opdagede britiske virologer en ny stamme, AY.4.2, som er mere smitsom end tidligere stammer. AY.4.2 er 10-15 % mere smitsom end delta-stammen. I Storbritannien tegner det sig for et ud af ti tilfælde af coronavirusinfektion i landet [47] [48] .

Omicron (linje B.1.1.529)

I november 2021 blev B.1.1.529 afstamning opdaget for første gang i Botswana og Sydafrika. Adskiller sig i et stort antal mutationer i askemålere [49] . Ifølge den britiske sundhedssikkerhedsmyndighed har denne variant et spidsprotein, der er væsentligt forskelligt fra det oprindelige coronavirus (varianten, som vaccinerne er baseret på), hvilket giver anledning til bekymring om effektiviteten af ​​eksisterende vacciner. Opdagelsen af ​​en ny stamme forårsagede global panik den 26. november 2021. Mange lande har suspenderet rejser fra Sydafrika, og aktiemarkederne på begge sider af Atlanten har oplevet deres værste fald i mere end et år [50] . Den britiske premierminister Boris Johnson meddelte, at landet indfører en obligatorisk PCR-test for alle, der kommer ind i landet og selvisolering, indtil et negativt resultat er opnået. Obligatorisk ti-dages isolation indføres også for dem, der er mistænkt for at være inficeret med omicron-stammen [51] .

Strains of Interest (VOI)

Nedenfor er de stammer opført af WHO som varianter af interesse [18] .

Lambda (linje C.37)

I august 2020 blev C.37 slægten først opdaget i Peru [52] . I juni 2021, i Peru, tegnede lambda-stammen sig for 81 % af alle rapporterede tilfælde i landet. I Argentina og Chile er andelen af ​​"lambda" omkring en tredjedel [53] .

Andre

Denne (linje B.1.525)

Linje B.1.525, også kendt som VUI-202102/03 eller UK1188, ligner delvist stamme 501.V2, men adskiller sig ved tilstedeværelsen af ​​både E484K-mutationen og den nye F888L-mutation (substitution af phenylalanin (F) til leucin ( L) i domænet S2 spike protein). Fra den 16. februar er stammen blevet opdaget i 15 lande, herunder Storbritannien, Danmark, Finland, Holland, Belgien, Frankrig, Spanien, Nigeria, Ghana, Jordan, Japan, Singapore, Australien, Canada og USA. De første tilfælde blev identificeret i december 2020 i Storbritannien og Nigeria, og fra den 15. februar er dette den hyppigst isolerede stamme i Nigeria. Fra den 15. februar er 38 tilfælde af infektion med det blevet identificeret i Storbritannien. Danmark identificerede 55 tilfælde af infektion med denne stamme fra 14. januar til 9. februar, syv af dem var direkte relateret til udenlandsrejser.

Britiske eksperter studerer de risici, der er forbundet med denne stamme. Det betragtes i øjeblikket som en "stamme under undersøgelse", men efterhånden som flere data bliver tilgængelige, kan det blive en "bekymringsstamme". Professor Ravi Gupta fra University of Cambridge fortalte BBC, at B.1.525 ser ud til at have "betydelige mutationer", der allerede er set i nogle andre nye stammer, hvilket er noget betryggende, da deres sandsynlige effekt til en vis grad er mere forudsigelig.

Mutationer i denne stamme omfatter E484K, en deletion i position 69-70, nye mutationer Q677H (glutamin til histidin i position 677) og F888L (phenylalanin til leucin i position 888) [54] .

Klynge 5

Klynge 5, også kaldet ΔFVI-spike af Danish Serum State Institute (SSI) , blev fundet i Nordjylland , Danmark . Det menes at være gået i arv fra mink til folk på minkfarme. Den 4. november 2020 blev det bekendtgjort, at minkbestanden i Danmark ville blive udslettet for at forhindre eventuel spredning af denne mutation og mindske risikoen for, at der opstår nye mutationer. Der er indført lockdowns og rejserestriktioner i syv kommuner i Nordjylland for at forhindre spredning af en mutation, der kan bringe effektiviteten af ​​nationale eller internationale reaktioner på COVID-19-pandemien i fare.

Verdenssundhedsorganisationen (WHO) har udtalt, at klynge 5 har "moderat reduceret følsomhed over for neutraliserende antistoffer". SSI advarede om, at mutationen kunne reducere effekten af ​​COVID-19-vacciner under udvikling, selvom det næppe vil gøre dem ubrugelige.

Efter karantæne- og massetests meddelte SSI den 19. november 2020, at klynge 5 efter al sandsynlighed er uddød [55] .

Væsentlige mutationer

D614G

D614G er en mutation, der påvirker SARS-CoV-2 spike-proteinet. Stamme G ( glycin i position 614) steg under pandemien, sandsynligvis efter at have oprindeligt opstået i Kina og derefter spredt sig til Italien i januar og derfra over hele verden. G har erstattet D ( asparaginsyre ) i mange lande, især i Europa, og noget langsommere i Kina og resten af ​​Østasien, hvilket understøtter hypotesen om, at G øger transmissionshastigheden, i overensstemmelse med højere virale titere og in vitro smitteevne [ 56] .

I juli 2020 blev den mere smitsomme D614G-stamme af SARS-CoV-2 rapporteret at være blevet den dominerende form for pandemien [57] [58] [59] .

Den globale forekomst af D614G korrelerer med forekomsten af ​​tab af lugt ( anosmi ) som et symptom på COVID-19, muligvis medieret af højere binding af denne stamme til ACE2-receptoren eller højere stabilitet af det tilsvarende protein og dermed højere infektivitet til lugten epitel [60] .

Virus indeholdende G-mutationen betragtes af GISAID som en del af G-kladen [56] , og ved hjælp af[ afklar ] PANGOLIN ( Phylogenetic A signment of N amed G lobal O utbreak LIN eages)  — tilhører klasse B1 [61] .

E484K

E484K er rapporteret at være en mutation, der giver resistens over for mindst én form for anti-SARS-CoV-2 monoklonale antistoffer, hvilket indikerer en "mulig ændring i antigenicitet". Stammer B.1.1.248 (Brasilien/Japan) og 501.V2 (Sydafrika) indeholder denne mutation. Navnet på mutationen, E484K, angiver erstatningen af ​​glutaminsyre (E) med lysin (K) i aminosyreposition 484. Monoklonale antistoffer og serumantistoffer rapporteres at være 10-60 gange mindre effektive til at neutralisere viruset, der bærer E484K-mutationen [62] [63] .

N501Y

N501Y repræsenterer en ændring fra asparagin (N) til tyrosin (Y) i aminosyreposition 501. Public Health England anser denne ændring for at øge receptorbindingsaffiniteten på grund af dens position inden for det receptorbindende domæne af spike-glycoproteinet, som binder til ACE2-receptor ved humane celler; dataene understøtter også hypotesen om øget bindingsaffinitet som følge af denne ændring. Stammer med N501Y omfatter B.1.1.248 (Brasilien/Japan), "bekymringsstamme" 202012/01 (UK), 501.V2 (Sydafrika) og Columbus, Ohio-stammen, der blev den dominerende form for virussen i Columbus i slutningen af ​​december 2020 og i januar. Sidstnævnte fik navnet COH.20G/501Y og ser ud til at have udviklet sig uafhængigt af andre stammer.

Ny stammeevalueringsplatform

Den 26. januar 2021 sagde den britiske regering, at den ville dele sine genomsekventeringsevner med andre lande for at øge sekventeringshastigheden og spore nye stammer [64] . Fra januar 2021 blev mere end halvdelen af ​​al COVID-19-genomsekventering udført i Storbritannien [65] .

Vaccineeffektivitet

En foreløbig undersøgelse fra Pfizer, Inc. viste, at der kun var et lille fald i effektiviteten af ​​deres mRNA-vaccine mod nye stammer af SARS-CoV-2 [66] . Ifølge en artikel offentliggjort den 28. januar 2021 på US Centers for Disease Controls hjemmeside, anses fremkomsten af ​​mutantstammer, der fuldstændigt unddrager sig immunresponset, for usandsynlig på grund af virussens natur [67] .

T-celleimmunitet kan muligvis være en løsning på problemet med reduceret effektivitet af vacciner mod nye stammer. Biotekfirmaet Gritstone Oncology i Emeryville, Californien, USA er ved at udvikle en vaccine, der er specielt designet til at inducere T-celle-immunitet [68] . Peptidvaccinen, der udvikles af universitetet i Tübingen i Tyskland, forsøger at inducere T-celle-immunitet snarere end antistoffer [69] .

Den 29. januar 2021 henvendte Moskvas byduma Daria Besedina sig til Den Russiske Føderations sundhedsminister med en anmodning om at finansiere undersøgelsen af ​​nye stammer og udføre undersøgelser af effektiviteten af ​​russiske vacciner mod disse stammer [70][ betydningen af ​​det faktum? ] . Den 10. februar 2021 udsendte Det Europæiske Lægemiddelagentur en lignende appel til vaccineproducenter [71] . Den 15. februar instruerede den russiske præsident Vladimir Putin regeringen om at implementere genomsekventering af russiske stammer af SARS-CoV-2 inden for en måned, allokere midler til disse undersøgelser og også kontrollere, om russiske vacciner mod nye stammer er effektive [72] .

Den 19. februar 2021 annoncerede Pfizer, at deres vaccine producerer cirka 66 % færre antistoffer, der er aktive mod den sydafrikanske stamme 501.V2 sammenlignet med den "klassiske" stamme, mens immunsystemet stadig er i stand til at neutralisere virussen [73] .

Data fra det israelske sundhedsministerium for juli 2021 indikerer et fald i effektiviteten af ​​vaccinen fra det amerikanske firma Pfizer til 39% i løbet af måneden for at forhindre infektion med delta-stammen af ​​coronavirus, men vaccinen beskytter fortsat 88% mod hospitalsindlæggelse og 91,4 % fra alvorlige tilfælde af sygdommen. [74]

Kommentarer

  1. ↑ Data opnået ved at overvåge patienter på et hospital i bydistriktet Tswane ( Gauteng-provinsen , Sydafrika) af National Institute of Infectious Diseases og University of Pretoria . Se: Forskere fra Sydafrika afslører data om dødelighed fra omicron-stammen Arkivkopi dateret 2. januar 2022 på Wayback Machine // RBC , 30/12/2021.

Noter

  1. ↑ HVEM | SARS-CoV-2-varianter (utilgængeligt link) . HVEM . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 5. januar 2021. 
  2. ↑ Anna Zhukova, Luc Blassel, Frederic Lemoine, Marie Morel, Jakub Voznica. Oprindelse, udvikling og global spredning af SARS-CoV-2  // Comptes Rendus. Biologier. - 0. - T. 0 , nej. 0 . - doi : 10.5802/crbiol.29 . Arkiveret fra originalen den 21. februar 2021.
  3. ↑ Redegørelse for arbejdet på det sjette møde i Udvalget for Internationale Sundhedsregulativer (2005) om nødsituationen i forbindelse med den pandemiske ‎coronavirusinfektion ( COVID 4. december 2021 på Wayback Machine // Artikel dateret 15/01/2021 // Verdenssundhedsorganisationen, officiel hjemmeside, 15/01/2021.
  4. ↑ Coronavirus- stammer vil modtage græske bogstaver _
  5. ↑ Ny stamme af coronavirus med navnet "Omicron" Arkivkopi dateret 27. februar 2022 på Wayback Machine // United Nations, officiel hjemmeside, 26/11/2021
  6. ↑ “Nu” faldt, “Xi” forsvandt Arkivkopi dateret 1. december 2021 på Wayback Machine // “ Moscow 24 ”, 29/11/2021.
  7. ↑ WHO forklarede navnet på stammen " omicron " og udeladelsen af ​​to bogstaver i alfabetet
  8. ↑ Manglende bogstaver: hvorfor WHO navngav den nye stamme " omicron "
  9. ↑ 1 2 3 4 Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (juni 2021). "Øget overførbarhed og global spredning af SARS-CoV-2-varianter af bekymring i juni 2021". Euroovervågning . 26 (24): 2100509. DOI : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  10. ↑ Foreløbig genomisk karakterisering af en ny SARS-CoV-2-linje i Storbritannien defineret af et nyt sæt spidsmutationer . Virologisk (18. december 2020). Hentet 14. juni 2021. Arkiveret fra originalen 21. december 2020.
  11. ↑ Finlay Campbell, Brett Archer, Henry Laurenson-Schafer, Yuka Jinnai, Franck Konings. Øget overførbarhed og global spredning af SARS-CoV-2-varianter af bekymring pr. juni 2021  // Eurosurveillance. — 2021-06-17. - T. 26 , nr. 24 . — ISSN 1025-496X . - doi : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  12. ↑ David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite. Progressiv stigning i virulens af nye SARS-CoV-2-varianter i Ontario, Canada   // medRxiv . - 04-08-2021. — S. 2021.07.05.21260050 . - doi : 10.1101/2021.07.05.21260050 . Arkiveret fra originalen den 2. september 2021.
  13. ↑ Omicron bliver dominerende variant i Sydafrika  (2. december 2021). Arkiveret fra originalen den 2. december 2021. Hentet 21. december 2021.
  14. ↑ "Omicron" identificeret i 110 lande rundt om i verden . " Kommersant " (24. december 2021). Hentet 24. december 2021. Arkiveret fra originalen 24. december 2021.
  15. ↑ Murashko talte om resultaterne af russiske specialisters rejse til Sydafrika Arkivkopi dateret 29. december 2021 på Wayback Machine // TASS , 25.12.2021.
  16. ↑ Forskere fra Sydafrika afslørede data om dødelighed fra omicron-stammen Arkiv kopi dateret 2. januar 2022 på Wayback Machine // RBC , 30/12/2021.
  17. ↑ COG-UK opdatering om SARS-CoV-2 Spike mutationer af særlig interesse: Rapport 1, COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), 20. december 2020, s. 2 , < https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2 -Mutations_final_updated2.pdf > . Hentet 18. januar 2021. . 
  18. ↑ 1 2 Sporing af SARS-CoV-2-varianter . Hentet 29. november 2021. Arkiveret fra originalen 6. juni 2021.
  19. ↑ Coronavirus: Storbritanniens variant 'kan være mere dødbringende' , BBC News  (22. januar 2021). Arkiveret 23. maj 2021. Hentet 3. februar 2021.
  20. ↑ Rachael Rettner-Senior Writer 2. februar 2021. UK coronavirus-variant udvikler vaccineundgående mutation  . livescience.com . Hentet 3. februar 2021. Arkiveret fra originalen 2. februar 2021.
  21. ↑ Achenbach, Joel . Bekymrende coronavirus mutation set i UK variant og i nogle amerikanske prøver , Washington Post . Arkiveret fra originalen den 2. februar 2021. Hentet 3. februar 2021.
  22. ↑ Forklaret: Hvorfor WHO navngav Covid-19-varianter først fundet i Indien som 'Kappa' og 'Delta' | India News - Times of India  (engelsk) . The Times of India . Hentet 2. juni 2021. Arkiveret fra originalen 25. november 2021.
  23. ↑ WHO annoncerer enkle, nemme at sige etiketter for SARS-CoV-2-varianter af interesse og  bekymring . www.who.int . Hentet 6. juni 2021. Arkiveret fra originalen 6. december 2021.
  24. ↑ Fink, Sheri . Sydafrika annoncerer en ny variant af coronavirus. , The New York Times  (18. december 2020). Arkiveret fra originalen den 21. december 2020. Hentet 5. januar 2021.
  25. ↑ Fuld præsentation af SSAK - 18. december | virus | Mutation . Scribd . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 6. januar 2021.
  26. ↑ 3AA-1 og 3AA-2 . web.archive.org (9. oktober 2008). Hentet: 5. januar 2021.
  27. ↑ Erklæring fra WHO's arbejdsgruppe om COVID-19 dyremodeller (WHO-COM) om de britiske og sydafrikanske SARS-CoV-2 nye varianter (PDF), Verdenssundhedsorganisationen . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 7. oktober 2021.
  28. ↑ Derek Lowe 22.  december 2020. De nye mutationer  ? . I pipeline (22. december 2020). Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 29. januar 2021.
  29. ↑ ekspertreaktion på sydafrikansk variant af SARS-CoV-2, som nævnt af Matt Hancock på Downing Street pressebriefing | Science Media   Center ? . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 8. oktober 2021.
  30. ↑ "COVID-19 GISAID Acknowledgement Threat Assessment UK variant" (PDF) . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 28. oktober 2021.
  31. ↑ Knapton, Sarah . Sydafrikansk variant kan unddrage sig vacciner og test, advarer videnskabsmænd , The Telegraph  (4. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 15. december 2021. Hentet 5. januar 2021.
  32. ↑ COVID-vacciner virker "måske ikke" så godt på sydafrikansk stamme,   advarer videnskabsmænd ? . www.cbsnews.com . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 3. december 2021.
  33. ↑ Britiske forskere bekymrer sig om, at vacciner muligvis ikke beskytter mod coronavirus-variant fundet i Sydafrika | CBC News , CBC . Arkiveret fra originalen den 5. januar 2021. Hentet 5. januar 2021.
  34. ↑ BioNTech-vaccine til ny COVID-19-variant kan være klar om 6  uger . euronews (22. december 2020). Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 8. januar 2021.
  35. ↑ Geddes, Linda . Pfizer-vaccine beskytter mod nye Covid-varianter, antyder undersøgelse , The Guardian  (8. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 8. januar 2021. Hentet 9. januar 2021.
  36. ↑ Matt Rivers CNN. Er en ny variant af coronavirus skyld i denne brasilianske bys kollaps? . CNN . Hentet 2. februar 2021. Arkiveret fra originalen 6. november 2021.
  37. ↑ Lewis F. Buss, Carlos A. Prete, Claudia MM Abrahim, Alfredo Mendrone, Tassila Salomon. Tre fjerdedeles angrebsrate af SARS-CoV-2 i det brasilianske Amazonas under en stort set ubehersket epidemi   // Videnskab . — 2021-01-15. — Bd. 371 , udg. 6526 . — S. 288–292 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.abe9728 . Arkiveret fra originalen den 2. februar 2021.
  38. ↑ Ester C. Sabino, Lewis F. Buss, Maria PS Carvalho, Carlos A. Prete, Myuki AE Crispim. Genopblomstring af COVID-19 i Manaus, Brasilien, på trods af høj seroprevalens  //  The Lancet. — 2021-01-27. - T. 0 , nej. 0 . — ISSN 1474-547X 0140-6736, 1474-547X . - doi : 10.1016/S0140-6736(21)00183-5 .
  39. ↑ Den "brasilianske" stamme af coronavirus er tre gange mere smitsom end den allerførste version af COVID-19 - landets sundhedsministerium . nv.ua. _ Dato for adgang: 12. februar 2021.
  40. ↑ PANGO slægter . cov-lineages.org . Hentet 18. april 2021. Arkiveret fra originalen 3. juni 2021.
  41. ↑ Coronavirus | Indisk 'dobbeltmutant'-stamme ved navn B.1.617 (en-IN), The Hindu  (8. april 2021). Arkiveret 26. maj 2021. Hentet 18. juni 2021.
  42. ↑ Indiens anden bølge med variantbrændstof faldt sammen med en stigning i inficerede fly, der landede i Canada , Toronto Sun (10. april 2021). Arkiveret fra originalen den 2. juni 2021. Hentet 18. juni 2021.
  43. ↑ Skaberen af ​​Sputnik V talte om den modificerede indiske stamme i Moskva. Den tredje bølge af COVID-19 bliver forklaret for dem Arkiveret 16. juni 2021 på Wayback Machine , 16/06/2021
  44. ↑ Sharma, Milano Ny 'Delta Plus'-variant af SARS-CoV-2 identificeret;  her er hvad vi ved indtil videre . Indien i dag . Hentet 16. juni 2021. Arkiveret fra originalen 17. juni 2021.
  45. ↑ En ny stamme af delta plus coronavirus er blevet identificeret i Indien Arkiveret 23. juni 2021 på Wayback Machine 21. juni 2021
  46. ↑ Ny supersmitsom stamme af Covid opdaget i Indien Arkivkopi af 25. juni 2021 på Wayback Machine
  47. ↑ Ny Delta-efterkommer kan være mere smitsom end sin forfader . Hentet 23. oktober 2021. Arkiveret fra originalen 23. oktober 2021.
  48. ↑ UK afslører detaljer om ny coronavirus-stamme Arkiveret 23. oktober 2021 på Wayback Machine 20. oktober 2021
  49. ↑ [Ny Botswana-variant med 32 'rædselsvækkende' mutationer er den mest udviklede Covid-stamme NOGENSINDE og kan være 'værre end Delta' - som ekspert siger, at den muligvis er dukket op hos en HIV-patient], 25. november 2021
  50. ↑ Ny COVID-variant Omicron forårsager global panik Arkiveret 28. november 2021 på Wayback Machine , 28.11.2021
  51. ↑ I Storbritannien vil karantæne blive indført for dem, der er i kontakt med bærere af omicron-stammen Arkivkopi dateret 28. november 2021 på Wayback Machine // RIA Novosti, 27.11.2021
  52. ↑ Sporing af SARS-CoV-2-  varianter . Verdenssundhedsorganisationen . Hentet 17. juni 2021. Arkiveret fra originalen 9. juni 2021.
  53. ↑ I Latinamerika raser en farlig ny stamme af coronavirus - "lambda" . Hentet 24. juni 2021. Arkiveret fra originalen 24. juni 2021.
  54. ↑ Endnu en mutant: en ny, potentielt farlig stamme af Covid-19 er begyndt at sprede sig i verden . Insideren . Hentet 17. februar 2021. Arkiveret fra originalen 16. februar 2021.
  55. ↑ De fleste restriktioner lempes i Nordjylland . Sundheds- og Ældreministeriet (19. november 2020). — “Sekventeringen af ​​de positive prøver viser samtidig, at der ikke er påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 siden den 15. september, hvorfor Statens Serums Institut vurderer, at denne variant med stor sandsynlighed er døet ud. ("Med høj sandsynligvis [...] uddøde")". Hentet 16. januar 2021. Arkiveret fra originalen 20. januar 2021.
  56. ↑ 1 2 Oprindelse, udvikling og global spredning af SARS-CoV-2 (utilgængeligt link) . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 21. februar 2021. 
  57. ↑ Coronavirus: Gør mutationer det mere smitsomt? , BBC News  (18. juli 2020). Arkiveret fra originalen den 30. december 2020. Hentet 5. januar 2021.
  58. ↑ Ny, mere infektiøs stamme af COVID-19 dominerer nu globale tilfælde af virus:  undersøgelse . medicalxpress.com . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 17. november 2020.
  59. ↑ Bette Korber, Will M. Fischer, Sandrasegaram Gnanakaran, Hyejin Yoon, James Theiler. Sporing af ændringer i SARS-CoV-2-spids: Bevis på, at D614G øger COVID-19-virusets smitteevne  // Celle. - 20-08-2020. - T. 182 , no. 4 . — s. 812–827.e19 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . Arkiveret 1. november 2020.
  60. ↑ Rafal Butowt, Katarzyna Bilinska, Christopher S. Von Bartheld. [ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7581292/ Chemosensory Dysfunction in COVID-19: Integration of Genetic and Epidemiological Data Points to D614G Spike Protein Variant as a Contributing Factor] // ACS Chemical Neuroscience . - 30-09-2020. - T. 11 , nej. 20 . — S. 3180–3184 . — ISSN 1948-7193 . - doi : 10.1021/acschemneuro.0c00596 . Arkiveret fra originalen den 12. januar 2021.
  61. ↑ cov-lineages/pangolin . - 05-01-2021. Arkiveret fra originalen den 15. februar 2021.
  62. ↑ Allison J. Greaney, Andrea N. Loes, Katharine H. D. Crawford, Tyler N. Starr, Keara D. Malone. Omfattende kortlægning af mutationer til det SARS-CoV-2-receptorbindende domæne, der påvirker genkendelse af polyklonale humane serumantistoffer   // bioRxiv . - 04-01-2021. — S. 2020.12.31.425021 . - doi : 10.1101/2020.12.31.425021 . Arkiveret fra originalen den 26. januar 2021.
  63. ↑ Kai Kupferschmidt. Nye mutationer rejser spøgelse for 'immunflugt'   // Videnskab . — 2021-01-22. — Bd. 371 , udg. 6527 . — S. 329–330 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.371.6527.329 . Arkiveret 13. maj 2021.
  64. ↑ Smout, Alistair . Storbritannien for at hjælpe andre lande med at spore coronavirus-varianter , Reuters  (26. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 26. januar 2021. Hentet 29. januar 2021.
  65. ↑ Donnelly, Laura . Storbritannien for at hjælpe med at sekvensere mutationer af Covid rundt om i verden for at finde farlige nye varianter , The Telegraph  (26. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 27. januar 2021. Hentet 29. januar 2021.
  66. ↑ Collier DA, Meng B, Ferreira, Gupta RK (2021). "Neutralisering af spike 69/70 deletion, E484K og N501Y SARS-CoV-2 af BNT162b2 vaccine-fremkaldte sera" . Hentet 29. januar 2021. Arkiveret fra originalen 26. januar 2021.
  67. ↑ Nye SARS-CoV-2-varianter - CDC . Hentet 4. februar 2021. Arkiveret fra originalen 15. maj 2021.
  68. ↑ Hvordan 'dræber' T-celler kunne booste COVID-immunitet over for nye varianter Arkiveret 15. februar 2021 på Wayback Machine , 12. februar 2021
  69. ↑ Biotech forklarer, hvad der er galt med EpiVacCorona: "Det er en dummy. Fly med en komfortabel kabine, billig og nem at bygge. Men han flyver ikke! . Til stede (23. juni 2021). Hentet 24. juni 2021. Arkiveret fra originalen 24. juni 2021.
  70. ↑ Korrespondance Journal of Deputy Besedina . besedina.moscow . Hentet 19. februar 2021. Arkiveret fra originalen 17. februar 2021.
  71. ↑ EMA forbereder vejledning til at tackle COVID-19-varianter . Hentet 19. februar 2021. Arkiveret fra originalen 15. februar 2021.
  72. ↑ Liste over instruktioner efter et møde med medlemmer af regeringen • Ruslands præsident . Ruslands præsident . Hentet 19. februar 2021. Arkiveret fra originalen 17. februar 2021.
  73. ↑ Sydafrikansk SARS-CoV-2-stamme mistænkt for at reducere immunrespons på Pfizer-vaccine . TASS . Hentet 24. februar 2021. Arkiveret fra originalen 18. februar 2021.
  74. ↑ Pfizer anslås at være 39 % effektiv mod delta-infektion i Israel . TASS . Hentet 25. juli 2021. Arkiveret fra originalen 25. juli 2021.