SARS-CoV-2 beta-stamme

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 9. juni 2022; checks kræver 2 redigeringer .

SARS-CoV-2 beta-stammen af ​​coronavirus [1] , også kendt som 501.V2, 20C/501Y.V2 eller B.1.351 slægten [ ]2 [4] ) er en stamme af SARS-CoV- 2-virus , der forårsager COVID-19 . Denne stamme blev først opdaget i Nelson Mandela Bay District [5] i Eastern Cape i Sydafrika [6] , som rapporteret af det sydafrikanske sundhedsministerium den 18. december 2020 [7] .

Strain

Forskere og embedsmænd rapporterede, at forekomsten af ​​denne stamme var højere blandt unge mennesker uden nogen underliggende medicinske tilstande, og sammenlignet med andre stammer er det mere sandsynligt, at det fører til alvorlig sygdom i sådanne tilfælde. Det sydafrikanske sundhedsministerium har også indikeret, at denne stamme muligvis driver den anden bølge af COVID-19-pandemien i landet på grund af, at stammen spredes hurtigere end andre tidligere stammer af virussen.

Forskere bemærkede, at denne stamme indeholder adskillige mutationer, der gør det muligt for den lettere at binde sig til humane celler på grund af tre mutationer i det receptorbindende domæne (RBD) i virussens spike-glykoprotein: N501Y (aminosyren asparagin (N) er erstattet af aminosyren tyrosin (Y) i position 501), K417N og E484K. To af disse mutationer (E484K og N501Y) er i receptorbindingsmotivet (RBM) af receptorbindingsdomænet (RBD).

N501Y-mutationen blev også fundet i 202012/01-stammen , som er vidt udbredt i Storbritannien. To andre mutationer fundet i 501.V2, E484K og K417N, er fraværende i den britiske stamme. Derudover har 501.V2 ikke 69-70del-mutationen fundet i en anden stamme.

Discovery

Den nye stamme blev opdaget ved helgenomsekventering. Adskillige genomiske sekvenser fra denne afstamning er blevet indsendt til GISAIDs genetiske sekvensdatabase, for eksempel sekvensen EPI_ISL_678597.

International distribution

Den 23. december meddelte Matt Hancock, at to personer, der var rejst fra Sydafrika til Storbritannien, var blevet inficeret med 501.V2. Den 28. december blev denne stamme fundet hos to personer i Schweiz og en person i Finland. Den 29. december blev stammen opdaget hos en rejsende fra Sydafrika til Japan og hos en international rejsende i Queensland, Australien. Den 30. december blev stammen påvist i Zambia. Den 31. december blev den også fundet i Frankrig på en passager på vej tilbage fra Sydafrika. Den 2. januar 2021 blev det første tilfælde af infektion med denne stamme opdaget i Sydkorea. Østrig rapporterede sit første tilfælde af infektion med stammen, samt fire tilfælde af infektion med den britiske stamme den 4. januar. Den 8. januar 2021 rapporterede Irland om opdagelsen af ​​3 tilfælde af denne stamme, som alle var forbundet med rejser fra Sydafrika.

I Rusland blev denne stamme først identificeret i marts 2021 [8] .

Vaccine ufølsomhed

Den 4. januar 2021 rapporterede The Telegraph , at Oxford-immunolog Sir John Bell mener, at den nye sydafrikanske stamme rejser et "stort spørgsmål", da den kunne være resistent over for vacciner og dermed knuse håb og erstatte dem med frygt [9] . Samme dag sagde vaccinologiprofessor Shabir Madhi til CBS News, at der ikke er sikkerhed for, at den nye 501.V2-stamme vil være i stand til at "omgå" beskyttelsen af ​​vaccinen, men han mener, at den "kan være mindre effektiv" [10 ] . Yderligere mutationer i spidsproteinet i 501.V2-stammen blev citeret af University of Reading Associate Professor of Cellular Microbiology Simon Clarke som en bekymring, fordi de "kan gøre virussen mindre modtagelig over for immunresponset fremkaldt af vaccinen." Lawrence Young, en virolog ved University of Warwick, bemærkede også, at flere spidsmutationer i denne stamme "kan føre til en vis flugt fra immunforsvaret" [11] .

Nogle undersøgelser viser, at denne stamme undslipper fra et neutraliserende multiklonalt antistof rettet mod SARS-CoV-2 spike-proteinet [12] [13] .

Ugur Sahin, administrerende direktør for BioNTech , udtalte, at der er behov for yderligere forskning for at sikre, at virksomhedens nuværende vaccine virker mod 501.V2-stammen, men hvis vaccinen skal justeres, kan virksomheden gøre det om cirka 6 uger [ 14] .

Den 8. januar rapporterede The Guardian, at Pfizer og BioNTechs COVID-19-vaccine har vist i test, der involverer 20 blodprøver, at den er i stand til at yde beskyttelse mod 501.V2-stammen. Yderligere forskning er nødvendig for at fastslå den nøjagtige grad af beskyttelse [15] .

Moderna planlægger at teste en ny version af sin vaccine , specielt modificeret til at beskytte mod 501.V2-stammen [16] , Novavax tager lignende foranstaltninger [17] . Ifølge en klinisk undersøgelse af Ad26.COV2.S- vaccinen af ​​Johnson & Johnson er dens effektivitet i det sydlige Afrika 15 % lavere end i USA (henholdsvis 57 % og 72 %); forskellen er sandsynligvis relateret til udbredelsen af ​​501.V2-stammen i Sydafrika [18] . Et andet vaccinestudie ( NVX-CoV2373 af Novavax) viste [17] [19] 60 % effekt (hos HIV-negative deltagere) i Sydafrika sammenlignet med 90 % effekt i Storbritannien. Ifølge Reuters er Pfizer-vaccinen kun lidt mindre effektiv mod 501.V2 [20] . AstraZeneca planlægger at tilpasse sin vaccine til denne stamme, og den nye vaccine skulle være klar i efteråret 2021 [21] .

Den 24. februar 2021 annoncerede Moderna starten på kliniske forsøg med en ny version af sin vaccine. Den nye version er designet specifikt til at bekæmpe 501.V2 [22] [23] .

Mutation E484K

En ændring i E484K-aminosyren, en receptorbindende domæne (RBD) mutation, er blevet rapporteret at være "associeret med undslippende neutraliserende antistoffer", hvilket kan have en negativ indvirkning på effektiviteten af ​​COVID-vacciner, der målretter mod spikeproteinet [24] [25 ] . Spike-mutationen E484K er blevet forbundet med et tilfælde af geninfektion med 501.V2 SARS-CoV-2-stammen i Brasilien, som ifølge forskerne var det første tilfælde af geninfektion med en stamme, der indeholdt denne mutation [26] .

Statistik

Sager efter land (pr. 9. januar 2021)
Land Bekræftede tilfælde datoen Kilder
Storbritanien 2 23. december 2020 [27]
Schweiz 2 28. december 2020 [28]
Finland en 28. december 2020 [29]
Japan en 29. december 2020 [tredive]
Australien en 29. december 2020 [31]
Zambia en 30. december 2020 [32]
Frankrig en 31. december 2020 [33]
Sydkorea en 2. januar 2021 [34]
Østrig en 4. januar 2021 [35]
Irland 3 8. januar 2021 [36]
Canada en 8. januar 2021 [37]
På verdensplan (11 andre lande) femten

Se også

Noter

  1. ↑ WHO besluttede at navngive stammer af coronavirus med bogstaverne i det græske alfabet . "Varianter af coronavirus COVID-19 vil blive betegnet med bogstaverne i det græske alfabet, for ikke at skelne mellem de lande, hvor disse stammer først blev opdaget, og for at lette udtalen i ikke-videnskabelig samtale, Verdenssundhedsorganisationen ( Hvem sagde. Under det nye system vil den "britiske" stamme af coronavirus B.1.1.7 blive navngivet "Alpha", varianten B.1.351, der først blev opdaget i Sydafrika, bliver "Beta", og den brasilianske P.1 - " Gamma". De to underarter af den "indiske" stamme af coronavirus - B.1.617.2 og B.1.617.1 - vil blive kaldt henholdsvis "Delta" og "Kappa". Hentet 28. juni 2021. Arkiveret fra originalen 28. juni 2021.
  2. ↑ CDC. Coronavirus sygdom 2019 (COVID-19  )  ? . Centre for Disease Control and Prevention (11. februar 2020). Hentet 9. januar 2021. Arkiveret fra originalen 15. maj 2021.
  3. ↑ Afrikansk stamme af coronavirus satte spørgsmålstegn ved vaccinernes effektivitet . www.mk.ru _ Hentet 9. januar 2021. Arkiveret fra originalen 11. januar 2021.
  4. ↑ Ny 'sydafrikansk' stamme af coronavirus når Frankrig . lenta.ru . Hentet 9. januar 2021. Arkiveret fra originalen 4. januar 2021.
  5. ↑ SA når en dyster milepæl på 1 million Covid-19-tilfælde  . www.iol.co.za. _ Hentet 9. januar 2021. Arkiveret fra originalen 26. maj 2021.
  6. ↑ Covid: Sydafrika passerer en million infektioner, efterhånden som tilfældene stiger , BBC News  (28. december 2020). Arkiveret fra originalen den 11. februar 2021. Hentet 9. januar 2021.
  7. ↑ Fink, Sheri . Sydafrika annoncerer en ny variant af coronavirus. , The New York Times  (18. december 2020). Arkiveret fra originalen den 21. december 2020. Hentet 9. januar 2021.
  8. ↑ Stammer af coronavirus COVID-19 identificeret i Rusland - RIA Novosti, 21/10/2021
  9. ↑ Knapton, Sarah . Sydafrikansk variant kan unddrage sig vacciner og test, advarer videnskabsmænd , The Telegraph  (4. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 15. december 2021. Hentet 5. januar 2021.
  10. ↑ COVID-vacciner virker "måske ikke" så godt på sydafrikansk stamme,   advarer videnskabsmænd ? . www.cbsnews.com . Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 3. december 2021.
  11. ↑ Britiske forskere bekymrer sig om, at vacciner muligvis ikke beskytter mod coronavirus-variant fundet i Sydafrika | CBC News , CBC . Arkiveret fra originalen den 5. januar 2021. Hentet 5. januar 2021.
  12. ↑ Yiska Weisblum, Fabian Schmidt, Fengwen Zhang, Justin DaSilva, Daniel Poston. Undslip fra neutraliserende antistoffer med SARS-CoV-2 spike proteinvarianter  // eLife. - T. 9 . — ISSN 2050-084X . - doi : 10.7554/eLife.61312 . Arkiveret fra originalen den 3. januar 2021.
  13. ↑ Kort rapport: Ny variantstamme af SARS-CoV-2 identificeret hos rejsende fra Brasilien . Hentet 24. januar 2021. Arkiveret fra originalen 15. januar 2021.
  14. ↑ BioNTech-vaccine til ny COVID-19-variant kan være klar om 6  uger . euronews (22. december 2020). Hentet 5. januar 2021. Arkiveret fra originalen 8. januar 2021.
  15. ↑ Geddes, Linda . Pfizer-vaccine beskytter mod nye Covid-varianter, antyder undersøgelse , The Guardian  (8. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 8. januar 2021. Hentet 9. januar 2021.
  16. ↑ Grady, Denise . Moderna siger, at vaccinen stadig beskytter mod virusvarianter , The New York Times  (25. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 25. januar 2021. Hentet 25. januar 2021.
  17. ↑ 1 2 Novavax COVID-19-vaccine demonstrerer 89,3 % effektivitet i fase 3-forsøg i Storbritannien | Novavax Inc. - IR-websted  (engelsk) . www.novavax.com . Hentet 30. januar 2021. Arkiveret fra originalen 6. juni 2021.
  18. ↑ Johnson & Johnson rapporterer om effektiviteten af ​​deres COVID-19-vaccine . RBC . Hentet 29. januar 2021. Arkiveret fra originalen 29. januar 2021.
  19. ↑ Novavax stiger i vejret efter positive resultater fra Covid-vaccineforsøg , Bloomberg.com  (28. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 29. januar 2021. Hentet 29. januar 2021.
  20. ↑ Geddes, Linda . Pfizer-vaccine beskytter mod nye Covid-varianter, antyder undersøgelse , The Guardian  (8. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 8. januar 2021. Hentet 1. februar 2021.
  21. ↑ AstraZeneca tilpasser vaccinen til at bekæmpe den sydafrikanske stamme af COVID-19 . RBC . Hentet 12. februar 2021. Arkiveret fra originalen 13. februar 2021.
  22. ↑ Moderna annoncerede udviklingen af ​​en vaccine mod den sydafrikanske stamme af COVID-19 - Interfax . Hentet 26. februar 2021. Arkiveret fra originalen 27. februar 2021.
  23. ↑ Berkeley Lovelace Jr. Moderna for at påbegynde kliniske forsøg med Covid booster-skud for variant fra Sydafrika, sender til NIH til undersøgelse  . CNBC (24. februar 2021). Hentet 26. februar 2021. Arkiveret fra originalen 25. februar 2021.
  24. ↑ Ny virusmutation rejser  vaccinespørgsmål . Frankrig 24 (13. januar 2021). Hentet 24. januar 2021. Arkiveret fra originalen 31. august 2021.
  25. ↑ Ewen Callaway. Kunne nye COVID-varianter underminere vacciner? Labs kæmper for at finde ud af   // Nature . — 2021-01-07. — Bd. 589 , udg. 7841 . — S. 177–178 . - doi : 10.1038/d41586-021-00031-0 . Arkiveret fra originalen den 20. december 2021.
  26. ↑ Brito, Ricardo . Sydafrikansk coronavirus-variant opdaget i tilfælde af geninfektion i Brasilien , Reuters  (9. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 28. januar 2021. Hentet 24. januar 2021.
  27. ↑ Bekræftede tilfælde af COVID-19-variant fra Sydafrika identificeret i Storbritannien . Det Forenede Kongeriges regering . Hentet 23. december 2020. Arkiveret fra originalen 23. december 2020.
  28. ↑ Sydafrikansk Covid-variant opdaget i Schweiz . business insider . Hentet 29. december 2020. Arkiveret fra originalen 19. november 2021.
  29. ↑ Opdatering: Nye britiske, sydafrikanske varianter af Covid-stammer fundet i Finland . Yle Nyheder . Hentet 29. december 2020. Arkiveret fra originalen 31. oktober 2021.
  30. ↑ Sydafrikansk coronavirus-variant fundet i   Japan ? . Nyheder24 . Hentet 29. december 2020. Arkiveret fra originalen 19. november 2021.
  31. ↑ Første tilfælde af 'mere smitsom' coronavirus-stamme opdaget i Australien . 9 Nyheder (29. december 2020). Hentet 9. januar 2021. Arkiveret fra originalen 19. november 2021.
  32. ↑ Zambia oplever anden bølge af Covid-19 som variant knyttet til ny stamme i Sydafrika isoleret  , Luksaka Times (  30. december 2020). Arkiveret fra originalen den 7. januar 2021. Hentet 9. januar 2021.
  33. ↑ Frankrig har opdaget sit første tilfælde af den sydafrikanske variant af coronavirus, sagde sundhedsministeriet torsdag 24. Frankrig  (31. december 2020). Arkiveret 19. november 2021. Hentet 9. januar 2021.
  34. ↑ 남아공 '변이 코로나' 첫 국내 확인…영국발 변이도 4건 추가  (koreansk) , Donga Ilbo (20212 januar). Arkiveret 19. november 2021. Hentet 13. juni 2021.
  35. ↑ Ellyatt, Holly . Covid-variant fundet i Sydafrika bekymrer eksperter: Her er, hvad vi ved indtil videre , CNBC  (6. januar 2021). Arkiveret fra originalen den 7. januar 2021. Hentet 9. januar 2021.
  36. ↑ Udtalelse fra det nationale folkesundhedsberedskab - fredag ​​den 8. januar . Irlands regering . Sundhedsstyrelsen (8. januar 2021). Hentet 8. januar 2021. Arkiveret fra originalen 7. december 2021.
  37. ↑ Alberta rapporterer Canadas 1. tilfælde af coronavirus-variant fundet i Sydafrika . CBC News (8. januar 2021). Hentet 9. januar 2021. Arkiveret fra originalen 9. januar 2021.

Links