Coronavirusser

Coronavirusser

3D-model af SARS-CoV-2
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [1]Rige:RiboviriaKongerige:OrthornaviraeType:PisuviricotaKlasse:PisoniviricetesBestille:NidoviralesUnderrækkefølge:CornidovirineaeFamilie:Coronavirusser
Internationalt videnskabeligt navn
Coronaviridae
Underfamilier
Baltimore-gruppen
IV: (+)ssRNA-vira

Coronaviruss [2] ( lat.  Coronaviridae ) er en familie af RNA - holdige vira , inklusive 45 arter fra maj 2020, kombineret i to underfamilier [3] [4] . De påvirker pattedyr (inklusive mennesker), fugle og padder. Navnet er forbundet med virussens struktur, hvis spidslignende processer ligner solkoronaen [2] . Der er 7 kendte coronavirus, der inficerer mennesker [5] [6] [7] :

Etymologi

Navnet "coronavirus" kommer fra det latinske corona , som betyder "krans", som igen er lånt fra andet græsk. κορώνη korṓnē, "guirlande, krans" [8] [9] . Navnet blev opfundet af Juna Almeida og David Tyrrell, som var de første til at opdage og studere menneskelige coronavirus [10] . Ordet blev første gang brugt på tryk i 1968 af en uformel gruppe virologer i tidsskriftet Nature for at henvise til en ny familie af vira [11] . Navnet henviser til det karakteristiske udseende af virioner (den infektiøse form af virussen) på elektronmikroskopi, som er omkranset med store hævede fremspring på deres overflade, hvilket skaber et billede, der ligner en solkorona eller glorie [11] [10] . Denne morfologi er skabt af virale spike peplomers, som er proteiner på overfladen af ​​virussen [12] .

Det videnskabelige navn Coronavirus blev vedtaget som slægtsnavnet af International Committee on Virus Nomenclature (senere omdøbt til International Committee on Virus Taxonomy ) i 1971 [13] . Efterhånden som antallet af nye arter steg, blev slægten opdelt i fire slægter, nemlig Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Deltacoronavirus og Gammacoronavirus i 2009 [14] . Det almindelige navn coronavirus bruges til at henvise til ethvert medlem af underfamilien Orthocoronavirinae [15] . Fra 2020 er 45 arter officielt anerkendt [16] .

Epidemiologi

Coronaviruss forårsager sygdom hos pattedyr ( mennesker , flagermus , katte , hunde , grise , kvæg ) og fugle . Nogle  ___fuglehosAvCoVs( coronavirusFugle  :eksempler TGEV  — porcine transmissible gastroenteritis coronavirus og dens patotype PRCV  — porcin respiratory coronavirus), hos hunde med hunde - coronavirus ( CCoV-1 og CCoV-2 /PanCCoV ), hos katte med feline coronavirus ( FECV  — enteritis coronavirus cats, FIPV  — feline infectious peritonitis coronavirus), hos mus , murin coronavirus ( MCoV , forårsager viral hepatitis hos mus, hos rotter RtCoV  — rottecoronavirus, PCoV  — petrel puffinosis coronavirus), osv., er der mange coronavirus i forskellige arter af flagermus [3 ] [17] .

Kilder til coronavirus-infektioner kan være en syg person, dyr. Mulige transmissionsmekanismer: luftbåren, luftbåren, fækal-oral, kontakt. Forekomsten stiger om vinteren og det tidlige forår. I strukturen af ​​ARVI hos indlagte patienter er coronavirusinfektion i gennemsnit 12 %. Den udbredte forekomst af coronavirus fremgår af specifikke antistoffer påvist hos 80 % af mennesker [18] [19] .

Humant coronavirus blev først isoleret i 1965 fra ARVI- patienter af D. Tyrrel fra nasopharynx med akut rhinitis , senere i 1975 isolerede E. Kaul og S. Clark coronavirus fra fæces i barndoms enterocolitis . Efterfølgende tiltrak coronavirus næsten ikke forskernes opmærksomhed, indtil et udbrud af SARS eller alvorligt akut respiratorisk syndrom (SARS, SARS) blev registreret i Kina i 2002-2003 . Sygdommen var forårsaget af SARS-CoV-virus. Som et resultat spredte sygdommen sig til andre lande, i alt 8273 mennesker blev syge, 775 døde (dødelighed 9,6%).

MERS-CoV-viruset er årsagen til Mellemøstens respiratoriske syndrom (MERS), hvoraf de første tilfælde blev rapporteret i 2012 [20] . I 2015 opstod et udbrud af Mellemøstens respiratoriske syndrom i Sydkorea , hvor 183 mennesker blev syge og 33 døde.

I december 2019 begyndte et udbrud af lungebetændelse i Kina , forårsaget af det nyopdagede SARS-CoV-2- virus . Det spredte sig hurtigt til andre lande.

Struktur og livscyklus

Genomet er repræsenteret af enkeltstrenget (+)RNA. Nukleokapsiden er omgivet af en proteinmembran og en lipo-holdig ydre skal, hvorfra kølleformede tornede processer strækker sig, der ligner en krone, som familien har fået sit navn til.

SARS-CoV-2 bruger S-proteinet på kronen til at binde sig til dets receptor  , angiotensin-konverterende enzym 2 (ACE2), såvel som til serinproteasen TMPRSS2 [21] , ligesom SARS-CoV (SARS) viruset gør. [22] . Cellen omslutter virussen med sin membran, og den resulterende membranvesikel er i cellens cytoplasma. De to ovennævnte cellereceptorproteiner transformerer det virale S-protein på en sådan måde, at virus- og cellemembranen smelter sammen [23] .

Efter at være kommet ind i cellen danner virussen membranvesikler ved hjælp af intracellulære membraner, hvortil der er knyttet specielle proteinkomplekser. Disse komplekser syntetiserer en kopi af det virale genomiske RNA og korte mRNA'er til syntese af virale proteiner [24] .

Virussens RNA har en 5'-methyleret begyndelse og en 3'- polyadenyleret slutning. Dette gør det muligt for virussen at påbegynde samling af sine proteiner på sit RNA af cellens ribosomer , som ikke er i stand til at afgøre, om det er virusets RNA eller RNA for selve cellens proteiner.

Coronaviruss har et RNA på omkring 26-30 tusinde basepar , hvilket betyder, at coronavirus har det største ikke-segmenterede RNA af alle kendte vira, det vil sige, at de er de mest komplekse i struktur blandt kendte vira. Virusgenomet består af mere end 20.000 nukleotider og koder for to replikative polyproteiner pp1a og pp1ab [25] [26] , hvorfra der dannes en kopi af virus-RNA'et i næste replikations-/translationspas, samt 8 separate mRNA - skabeloner for virale proteiner, som er uendeligt de er genereret. Genereringen af ​​M-, S-, HE- og E-proteiner, der kommer ind i virusets membranlipidkappe, sker på de tilsvarende mRNA'er i cellens endoplasmatiske retikulum ; N-proteinet, som vil omgive det virale genomiske RNA, syntetiseres på mRNA, der flyder i cellens cytoplasma [24] .

Efter at have modtaget virussens genomiske RNA og dets nødvendige proteiner, nærmer dette RNA, pakket ind i N-proteinet, sig proteinerne, der sidder på det endoplasmatiske retikulum og interagerer med dem. Som et resultat dækker membranen af ​​det endoplasmatiske retikulum med de virale proteiner i det dette RNA og danner et virion [24] . Virionerne frigives derefter fra den inficerede celle via exocytose . Efter frigivelsen af ​​virioner fra cellen dør den.

Taksonomi

Familien af ​​coronavirus ( lat.  Coronaviridae ) omfatter 2 underfamilier og omkring 46 arter [27] :

Underfamilien Letovirinae , isoleret i 2018, omfatter kun én accepteret art, underslægt og slægt (der er dog blevet identificeret yderligere to arter, som endnu ikke er blevet officielt godkendt):

Underfamilie Orthocoronavirinae


Se også

Noter

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ 1 2 Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lærebog for medicinstuderende / red. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Lægeinformationsstyrelsen, 2003. - S. 121. - 236 s. — ISBN 5-89481-136-8 .
  3. ↑ 1 2 Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Studiehistorie og moderne klassificering af coronavirus (Nidovirales: Coronaviridae)  // Infektion og immunitet . - 2020. - T. 10 , nr. 2 . - S. 221-246 . - doi : 10.15789/2220-7619-H0I-1412 . Arkiveret fra originalen den 25. juni 2020.
  4. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 19. juli 2019)
  5. ↑ M. Yu. Shchelkanov, LV Kolobukhina, OA Burgasova, IS Kruzhkova, VV Maleev. COVID-19: ætiologi, klinisk billede, behandling  // Russian Journal of Infection and Immunity. - 06-05-2020. - T. 10 , nej. 3 . — S. 421–445 . — ISSN 2220-7619 2313-7398, 2220-7619 . - doi : 10.15789/2220-7619-CEC-1473 . Arkiveret fra originalen den 3. april 2022.
  6. ↑ Supotnitsky M. V. Den nye coronavirus SARS-CoV-2 i aspektet af den globale epidemiologi af coronavirusinfektioner  // Bulletin of the RCB Protection Troops. - 2020. - Vol. 4 , nr. 1 . - S. 32-65 .
  7. ↑ Hemmelig historie om de første coronavirusser Arkiveret 22. april 2020 på Wayback Machine // Forbes.
  8. ↑ Definition af Coronavirus af Merriam-Webster . Merriam Webster. Hentet 24. marts 2020. Arkiveret fra originalen 23. marts 2020.
  9. ↑ Definition af Corona af Merriam-Webster . Merriam Webster. Hentet 24. marts 2020. Arkiveret fra originalen 24. marts 2020.
  10. ↑ 1 2 Tyrrell, David Arthur John. Cold Wars: The Fight Against  the Common Cold ]  / David Arthur John Tyrrell, Michael Fielder. - Oxford University Press, 2002. - S. 96. - "Vi så nærmere på udseendet af de nye vira og bemærkede, at de havde en slags glorie omkring dem. Anvendelse af en ordbog gav den latinske ækvivalent, corona, og derfor blev navnet coronavirus født." - ISBN 978-0-19-263285-2 . Arkiveret 18. november 2020 på Wayback Machine
  11. ↑ 1 2 Almeida JD, Berry DM, Cunningham CH, Hamre D, Hofstad MS, Mallucci L, McIntosh K, Tyrrell DA (november 1968). Virologi: Coronaviruss. natur . 220 (5168): 650. Bibcode : 1968Natur.220..650. . DOI : 10.1038/220650b0 . [T]her er også en karakteristisk "kant" af fremspring 200 A lange, som er afrundede eller kronbladsformede ... Dette udseende, der minder om solcoronaen, deles af musehepatitisvirus og adskillige vira, der for nylig er blevet genvundet fra mennesket, nemlig stamme B814, 229E og flere andre.
  12. ↑ Sturman LS, Holmes KV (1983-01-01). Lauffer MA, Maramorosch K, red. "Den molekylære biologi af coronavirus" . Fremskridt inden for virusforskning . 28 :35-112. DOI : 10.1016/s0065-3527(08)60721-6 . ISBN  9780120398287 . PMC  7131312 . PMID  6362367 . [D]disse vira udviste en karakteristisk udkant af store, karakteristiske, kronbladsformede peplomere eller pigge, der lignede en krone, som corona spinarum i religiøs kunst; deraf navnet coronavirus.
  13. ↑ Lalchhandama, Kholhring (2020). "Kronikerne om coronavirus: bronkitis, hepatitis og forkølelse". Videnskabsvision _ _ ]. 20 (1):43-53. DOI : 10.33493/scivis.20.01.04 .
  14. ↑ Carstens EB (2010). "Ratifikationsafstemning om taksonomiske forslag til den internationale komité for taksonomi af virus (2009)" . Arkiv for virologi . 155 (1): 133-46. DOI : 10.1007/s00705-009-0547-x . PMC  7086975 . PMID  19960211 .
  15. ↑ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (marts 2019). Flagermus-coronavirus i Kina . Virus . 11 (3):210 . doi : 10.3390/ v11030210 . PMC 6466186 . PMID 30832341 .  
  16. ↑ International Committee on Taksonomy of Viruses (ICTV  ) . talk.ictvonline.org . Hentet 14. september 2020. Arkiveret fra originalen 20. marts 2020.
  17. ↑ Gilmutdinov R. Ya., Galiullin A. K., Spiridonov G. N. Coronavirus-infektioner hos vilde fugle  // Dyrlæge. - 2020. - Udgave. 6 . - S. 57-67 . - doi : 10.33632/1998-698X.2020-6-57-67 .
  18. ↑ Pulmonologi: en national retningslinje . - M.  : GEOTAR-Media, 2009.
  19. ↑ Shirobokov V.P. Medicinsk mikrobiologi, virologi og immunologi . - Vinnitsa: Ny bog, 2015. - S. 504-505.
  20. ↑ Korotyaev A.I. , Babichev S.A. Medicinsk mikrobiologi, immunologi og virologi . - Skt. Petersborg: SpecLit, 2008.
  21. ↑ Stasevich, 2020 , s. 11-12.
  22. ↑ Xintian Xu, Ping Chen, Jingfang Wang, Jiannan Feng, Hui Zhou. Udviklingen af ​​den nye coronavirus fra det igangværende Wuhan-udbrud og modellering af dets spidsprotein for risiko for menneskelig overførsel  //  SCIENCE CHINA Life Sciences. - 2020. - Bd. 63 . — S. 457–460 . - doi : 10.1007/s11427-020-1637-5 . Arkiveret fra originalen den 28. juni 2021.
  23. ↑ Stasevich, 2020 , s. 10-12.
  24. ↑ 1 2 3 Stasevich, 2020 , s. 12.
  25. ↑ Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology  (engelsk) / V. Thiel (redaktør). — 1. udg. – Caister Academic Press, 2007. - ISBN 978-1-904455-16-5 .
  26. ↑ Familie - Coronaviridae // Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses  / Andrew MQ King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, Elliot J. Lefkowitz (red.). - Elsevier Inc., 2012. - S.  806 -828. — ISBN 978-0-12-384684-6 . - doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00068-9 .
  27. ↑ Virus Metadata Repository: version 1. maj 2020; MSL35  // International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). - 2020. - 1. maj.

Litteratur

Links

  Gå til Wikidata-elementet  Ordbøger og encyklopædier
Taksonomi
I bibliografiske kataloger