Caudovirales
Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den
version , der blev gennemgået den 9. juli 2019; checks kræver
5 redigeringer .
Caudovirales ( lat. , fra cauda - hale ) - rækkefølgen af DNA-holdige vira - bakteriofager , hvis virioner har en icosaedrisk hovedform og en spiralhale.
Genomet er repræsenteret af et enkelt ikke-segmenteret lineært dobbeltstrenget DNA -molekyle . Et lineært molekyle kan nogle gange antage en ringform; enkeltstrengede huller kan også forekomme i en dobbeltstrenget struktur. Enderne af molekylet er kovalent bundet til terminale proteiner. Genomet kan indeholde fra 18 til 500 tusinde basepar og koder for både strukturelle og ikke-strukturelle proteiner [2] .
Rækkefølgen omfatter et stort antal vira [3] , hvoraf mange har lignende gener, men deres sekvens kan variere betydeligt selv inden for samme slægt. Den fælles oprindelse bedømmes ud fra den karakteristiske struktur af de virale partikler.
I 2016 blev de videnskabelige navne på repræsentanter for ordenen og andre bakteriofager ændret
efter forslag fra underudvalget for bakterielle og arkæiske vira i International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) :
- kombinationer som og phi blev fjernet fra navnene på slægter [4] ;
- i artsnavne blev ordet fag erstattet med virus i erkendelse af, at bakteriofager er almindelige vira; afklarede inficerede organismer til navnet på slægten, fjernede de specifikke navne på prokaryoter og bindestreger; fjernede kombinationen phi , hvor der ikke er nogen historisk grund til dens tilstedeværelse [5] .
Klassifikation
Fra april 2018 er følgende familier og underfamilier inkluderet i rækkefølgen [3] :
- Ackermanviridae
- Autographiviridae
- Chaseviridae
- Demerecviridae
- Drexlerviridae
- Guelinviridae
- Herelleviridae
- Myoviridae
- Podoviridae
- Rountreeviridae
- Salasmaviridae
- Schitoviridae
- Siphoviridae
- Zobellviridae
- Incertae sedis
Noter
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ ICTVdB Management (2006). 02. Caudovirales. Arkiveret 15. juni 2010 på Wayback Machine i: ICTVdB - The Universal Virus Database, version 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
- ↑ 1 2 Taxonomy of Viruses (engelsk) på webstedet for International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 10. maj 2018) .
- ↑ Omdøbning af alle fagslægter : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2015.006aB. - 2015. - 5 s.
- ↑ For at omdøbe alle (522) eksisterende bakterievirus og 2 arkæiske virusarter : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2015.025aB. - 2015. - 18 s.
Klassificering af vira ifølge Baltimore |
---|
DNA | I: vira |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Præplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Uklassificeret | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
---|
Uklassificeret |
- familie : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Slægter : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-vira |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-vira |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
- Familier : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRA | |
---|