Pseudoviridae
Pseudoviridae er en familie af vira [2] , der omfatter tre slægter [3] .
Virus af familien er faktisk LTR retrotransposoner af Ty1-copia familien. De replikerer ved hjælp af strukturer kaldet viruslignende partikler (VLP'er). VLP'er er ikke infektiøse som normale virioner, men ikke desto mindre udgør de en vigtig del af pseudoviruss livscyklus [4] .
Taksonomi
Pseudoviridae er uformelt klassificeret i gruppen af RNA VI revers transkriptionsvira og inficerer svampe og hvirvelløse dyr .
Pseudoviridae inkluderer meget forskellige medlemmer, og de fleste Pseudoviridae koder for Gag og Pol i den samme åbne læseramme .
Pseudoviridae indgår i ordenen Ortervirales sammen med familierne Belpaoviridae , Metaviridae , Retroviridae og Caulimoviridae [5] .
Familien omfatter følgende slægter: [3]
- hemivirus
- Pseudovirus
- Sirevirus
Andre Pseudoviridae- arter, der ikke er tildelt slægten, omfatter:
- Penicillium camemberti virus - GP1 [6]
- Phaseolus vulgaris Tpv2-6 virus
Genom
Genomet af denne familie af vira er et usegmenteret, -RT, positiv-sense enkeltstrenget RNA og er 4200-9700 nukleotider langt . Genomet koder for strukturelle proteiner og ikke -strukturelle proteiner , der koder for RNA-afhængig DNA-polymerase , replikase og revers transkriptase for det omvendte transkriptionstrin under replikation .
Virologi
Virussens kapside har ikke en skal og ser nogenlunde kugleformet ud. Kapsiden er rund med icosaedrisk symmetri med trianguleringstal (T) = 3 og 4. Den er også isometrisk til kvasi-isometrisk og har en diameter på 30-50 nm. LTR retrotransposoner er dårligt karakteriseret, og deres lipider er ikke blevet rapporteret.
Genomet integreres i værtsgenomet og transskriberes af værtscelleenzymer såsom den eukaryote nukleare RNA-polymerase II . Genomreplikation forekommer i værtscytoplasmaet , eller kernen og samlingen kan forekomme i cytoplasmaet eller i kernen.
Noter
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ Llorens, C (2. februar 2021). "ICTV Virus Taksonomi Profile: Pseudoviridae ". Journal of General Virology . 102 (3). doi : 10.1099/ jgv.0.001563 . PMID 33528349 .
- ↑ 1 2 ICTV-rapport Pseudoviridae . (ubestemt)
- ↑ Familie: Pseudoviridae | ICTV (engelsk) . www.ictv.global . Hentet: 19. august 2022.
- ↑ "Ortervirales: Ny virusorden, der forener fem familier af omvendt transskriptionsvirus". Journal of Virology . 92 (12). juni 2018. DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642 . _
- ↑ NCBI: Penicillium camemberti virus - GP1 (art)
Links
Klassificering af vira ifølge Baltimore |
---|
DNA | I: vira |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Præplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Uklassificeret | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
---|
Uklassificeret |
- familie : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Slægter : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-vira |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-vira |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
- Familier : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRA | |
---|
Retrovirus |
---|
ssRNA-RT-vira | Retrovirus | Alfaretrovirus |
- Aviær erythroleukæmivirus
- Rous sarkom virus
- …
|
---|
Betaretrovirus |
- Jaagsiekte får retrovirus
- muse brysttumorvirus
- …
|
---|
Gammaretrovira |
- Feline leukæmivirus
- Murin leukæmivirus
- Abelson murine leukæmivirus
- ven virus
- Xenotropisk murin leukæmivirus-relateret virus
- Koala retrovirus
- …
|
---|
Deltaretrovirus |
- Bovin leukæmivirus
- Primat T-lymfotropisk virus 1
- Primat T-lymfotropisk virus 2
- Primat T-lymfotropisk virus 3
|
---|
Epsilonretrovira |
- Walleye epidermal hyperplasivirus
- …
|
---|
Lentivira |
- Humant immundefektvirus 1
- Humant immundefektvirus 2
- Arthritis encephalitis virus hos geder og får
- Simian immundefekt virus (SIV)
- Heste infektiøs anæmi virus
- Får Madi-wisna virus
- Bovint immundefekt virus (BIV)
- Feline immundefektvirus (FIV)
- Jembrana sygdom virus
- puma lentivirus
|
---|
Spumaretrovirinae |
- Bovispumavirus
- Equipumavirus
- Felispumavirus
- Prosimiiispumavirus
- Simiispumavirus
|
---|
|
---|
Andet |
|
---|
|
---|
dsDNA-RT-vira |
|
---|
Endogen |
- ERVWE1
- HCP5
- Human teratocarcinom-afledt virus
|
---|