Poliomavira
Poliomavira |
---|
Et mikrofotografi af en celle inficeret med poliomavirus - en stor blå celle til venstre, under midten. urinprøve |
Gruppe:Virus [1]Rige:MonodnaviriaKongerige:ShotokuviraeType:cossaviricotaKlasse:PapovaviricetesBestille:SepolyviralesFamilie:Poliomavira |
Polyomaviridae |
- Alfapolyomavirus
- Betapolyomavirus
- Gammapolyomavirus
- Deltapolyomavirus
|
I: dsDNA-vira |
|
Polyomavira [2] ( lat. Polyomaviridae ) er en familie af vira uden kappe . Det tilhører gruppe I i klassificeringen af vira ifølge Baltimore . I overensstemmelse med revisionen godkendt af International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) i 2016, omfatter den 4 slægter [3] .
Forskningshistorie
Muse polyomavirus blev beskrevet i 1953 af Ludwik Gross [4] . Senere blev mange polyomavira beskrevet for at inficere fugle og pattedyr . Slægten Polyomavirus , som forener dem, blev først tildelt familien Papovaviridae , og siden 1999, efter adskillelsen af sidstnævnte, til familien Polyomaviridae [5] .
Polyomavira er bredt undersøgt som tumorogene vira til mennesker og dyr. p53 -proteinet , en tumorsuppressor, for eksempel, er blevet isoleret som et cellulært protein forbundet med det store T-antigen fra SV40-viruset .
Beskrivelse
Polyomavira er DNA-holdige vira ( genomet er et cirkulært dobbeltstrenget DNA på omkring 5000 basepar langt), virionerne er små, omkring 40-50 nm i diameter, icosaedriske i form, ikke dækket af en lipidmembran . Vira er sædvanligvis onkogene, ofte latente i værtsorganismen og forårsager ikke sygdom, men danner tumorer i organismer af andre arter, eller i tilfælde af værtens immundefekt. Roden "polyom" i virussens navn antyder, at vira kan forårsage flere tumorer.
Store og små T-antigener
Det store T -antigen spiller en vigtig rolle i reguleringen af virussens livscyklus ved at binde sig til det virale DNA og forbedre dets replikation . Til replikation kræver polyomavira enzymer til metabolismen af nukleinsyrer i cellen; derfor er replikation af genomisk viralt DNA kun mulig i S-fasen af cellecyklussen. Det store T-antigen binder til cellecykluskontrolproteiner og stimulerer initieringen af DNA-replikation [6] . Det gør det ved at hæmme p53-tumorsuppressorgenet og generne i retinoblastomfamilien . I dette tilfælde stimuleres celledelinger ved binding til cellulært DNA, helicase , DNA-polymerase α og transkriptions - præinitieringsfaktorer [7] . Sådanne ændringer i cellecyklussen fører til onkogen transformation.
Det lille T-antigen aktiverer også adskillige cellulære veje, der stimulerer celleproliferation , såsom mitogen-aktiveret proteinkinase ( MAPK ) og stress-aktiveret proteinkinase ( SAPK ) veje [8] [ 9] .
Klassifikation
I 2015 omfattede slægten Polyomavirus , den eneste i familien af polyomavirus på det tidspunkt, 13 arter [10] . Som et resultat af 2016-revisionen blev 4 nye slægter dannet i familien og 68 nye arter blev inkluderet [11] , slægten Polyomavirus og 5 gamle arter blev slettet ( afrikansk grøn abe polyomavirus, bavian polyomavirus 2, humant polyomavirus, kaninyre vakuolerende virus, Simian virus 12 ) [12] , og resten af arterne blev opdelt i nye slægter og ændrede deres navne [13] . Ifølge ICTV, fra marts 2017, er klassificeringen af familien som følger [14] :
- Slægten Alphapolyomavirus (37 arter)
- Mesocricetus auratus polyomavirus 1 [ syn. Hamster polyomavirus ]
- Mus musculus polyomavirus 1 [syn. Murint polyomavirus ]
- Slægten Betapolyomavirus (29 arter)
- Human polyomavirus 1 [syn. B.K. polyomavirus ]
- Human polyomavirus 2 [syn. JC polyomavirus ]
- Macaca mulatta polyomavirus 1 [syn. Simian virus 40 ]
- Mus musculus polyomavirus 2 [syn. Murint pneumotropisk virus ]
- Slægten Gammapolyomavirus (7 arter)
- Aves polyomavirus 1 [syn. Undulat spæde sygdom polyomavirus ]
- Slægten Deltapolyomavirus (4 arter)
- Arter incertae sedis (3 arter)
- Bos taurus polyomavirus 1 [syn. bovin polyomavirus ]
Humane polyomavira
Siden 2016 er 13 typer polyomavira blevet rapporteret, der inficerer mennesker:
Udsigt |
Slægt |
Artsnavn før 2016 [15] |
Koden
|
Humant polyomavirus 1 |
Betapolyomavirus |
BK polyomavirus |
BKPyV
|
Humant polyomavirus 2 |
Betapolyomavirus |
JC polyomavirus |
JCPyV
|
Humant polyomavirus 3 |
Betapolyomavirus |
KI polyomavirus |
KIPyV [16]
|
Humant polyomavirus 4 |
Betapolyomavirus |
WU polyomavirus |
WUPyV [16]
|
Humant polyomavirus 5 |
Alfapolyomavirus |
Merkel celle polyomavirus |
MCPyV [17]
|
Humant polyomavirus 6 |
Deltapolyomavirus |
— |
—
|
Humant polyomavirus 7 |
Deltapolyomavirus |
— |
—
|
Humant polyomavirus 8 |
Alfapolyomavirus |
Trichodysplasia spinulosa-associeret polyomavirus |
TSPyV [17]
|
Humant polyomavirus 9 |
Alfapolyomavirus |
— |
—
|
Humant polyomavirus 10 |
Deltapolyomavirus |
MW polyomavirus |
MWPyV [18]
|
Humant polyomavirus 11 |
Deltapolyomavirus |
STL polyomavirus |
StLPyV [18]
|
Humant polyomavirus 12 |
Alfapolyomavirus |
— |
—
|
Humant polyomavirus 13 |
Alfapolyomavirus |
New Jersey polyomavirus |
NJPyV [17]
|
Human polyomavirus 1-4 infektion er svær at skelne fra infektion med Macaca mulatta polyomavirus 1 [19] [20] .
Human polyomavirus 1 forårsager milde luftvejsinfektioner og inficerer nyrerne hos immunsupprimerede patienter, såsom efter organtransplantationer . Human polyomavirus 2 inficerer celler i åndedrætssystemet , nyrerne eller hjernen . Begge disse vira er vidt udbredt i befolkningen, omkring 80% af amerikanske voksne har antistoffer mod disse vira.
Human polyomavirus 5 blev beskrevet i 2008 for at forårsage Merkel hudkræft [21] [22] [23] .
Humant polyomavirus 8 blev i 2010 beskrevet som at forårsage trichodysplasi.
Noter
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lærebog for medicinstuderende / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Medical Information Agency, 2003. - S. 114. - ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. en.
- ↑ GROSS L. Et filtrerbart middel, udvundet fra Ak-leukæmiske ekstrakter, der forårsager spytkirtelcarcinomer i C3H-mus // Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine. Society for Experimental Biology and Medicine: tidsskrift. - 1953. - Juni ( bind 83 , nr. 2 ). - S. 414-421 . — PMID 13064287 .
- ↑ van Regenmortel, MHV, Fauquet, CM, Bishop, DHL, Carstens, EB, Estes, MK, Lemon, SM, Maniloff, J., Mayo, MA, McGeoch, DJ, Pringle, CR og Wickner, RB Virus taksonomi. Syvende rapport fra International Committee on Taxonomy of Viruses : [ eng. ] . — ICTV 7. rapport. - San Diego: Academic Press, 2000. - S. 1.
- ↑ White MK, Gordon J., Reiss K. et al. Humane polyomavira og hjernetumorer (neopr.) // Brain Research. Hjerneforskningsanmeldelser. - 2005. - December ( bind 50 , nr. 1 ). - S. 69-85 . - doi : 10.1016/j.brainresrev.2005.04.007 . — PMID 15982744 .
- ↑ Kelley WL, Georgopoulos C. T/t fælles exon af simian virus 40, JC og BK polyomavirus T antigener kan funktionelt erstatte J-domænet af Escherichia coli DnaJ molekylær chaperon // Proceedings of the National Academy sciences : journal. - United States National Academy of Sciences , 1997. - April ( vol. 94 , nr. 8 ). - P. 3679-3684 . - doi : 10.1073/pnas.94.8.3679 . — PMID 9108037 .
- ↑ Sontag E., Fedorov S., Kamibayashi C., Robbins D., Cobb M., Mumby M. Interaktionen mellem SV40 lille tumorantigen med proteinphosphatase 2A stimulerer kortkinasevejen og inducerer celleproliferation // Celle : journal. - Cell Press , 1993. - December ( vol. 75 , nr. 5 ). - s. 887-897 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90533-V . — PMID 8252625 .
- ↑ Watanabe G., Howe A., Lee RJ et al. Induktion af cyclin D1 af simian virus 40 small tumor antigen (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences : journal. - United States National Academy of Sciences , 1996. - November ( vol. 93 , nr. 23 ). - P. 12861-12866 . - doi : 10.1073/pnas.93.23.12861 . — PMID 8917510 .
- ↑ Virus Taxonomy: 2014-udgivelse arkiveret 27. marts 2017 på Wayback Machine på ICTV-webstedet ( Få adgang til 26. marts 2017) .
- ↑ Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. 1-7.
- ↑ Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. 12-13.
- ↑ Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. 14-19.
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 24. marts 2017) .
- ↑ Arter (undtagen BK polyomavirus og JC polyomavirus ) blev ikke registreret hos ICTV før 2016.
- ↑ 1 2 Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. fire.
- ↑ 1 2 3 Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. 2.
- ↑ 1 2 Revision om familien Polyomaviridae , 2015 , s. 6.
- ↑ Poulin DL, DeCaprio JA Er der en rolle for SV40 i human cancer? (neopr.) // Journal of Clinical Oncology. - 2006. - September ( bind 24 , nr. 26 ). - S. 4356-4365 . - doi : 10.1200/JCO.2005.03.7101 . — PMID 16963733 .
- ↑ zur Hausen H. SV40 i humane kræftformer - en endeløs fortælling? (neopr.) // International Journal of Cancer. - 2003. - December ( bind 107 , nr. 5 ). - S. 687 . - doi : 10.1002/ijc.11517 . — PMID 14566815 .
- ↑ L. Altman . Virus er forbundet med en kraftig hudkræft , New York Times (18. januar 2008). Arkiveret fra originalen den 19. februar 2015. Hentet 18. januar 2008.
- ↑ Feng H., Shuda M., Chang Y., Moore PS Klonal integration af et polyomavirus i humant Merkel-cellekarcinom // Science : journal. - 2008. - Februar ( bd. 319 , nr. 5866 ). - S. 1096-1100 . - doi : 10.1126/science.1152586 . — PMID 18202256 .
- ↑ Shuda M., Arora R., Kwun HJ et al. Human Merkel celle polyomavirusinfektion I. MCV T-antigenekspression i Merkelcellekarcinom, lymfoidt væv og lymfoide tumorer (engelsk) // International Journal of Cancer : journal. - 2009. - September ( bind 125 , nr. 6 ). - S. 1243-1249 . - doi : 10.1002/ijc.24510 . — PMID 19499546 .
Litteratur
Ordbøger og encyklopædier |
|
---|
Taksonomi |
|
---|
I bibliografiske kataloger |
|
---|
Klassificering af vira ifølge Baltimore |
---|
DNA | I: vira |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Præplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Uklassificeret | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
---|
Uklassificeret |
- familie : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Slægter : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-vira |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-vira |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
- Familier : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRA | |
---|