Pararnavirae
Pararnavirae er et kongerige af vira skabt af International Committee on Taxonomy of Viruses , som omfatter alle retrotransskriberede vira. Det omfatter gruppe VI og VII i henhold til Baltimore-klassifikationen [2] . de kan indeholde DNA eller RNA , men de replikerer ved hjælp af revers transkriptase , det vil sige gennem en mellemstreng af genetisk materiale , der er forskellig fra den, de er sammensat af. Kongeriget omfatter to ordener og seks familier.
DNA-vira i dette rige er tæt beslægtede med RNA-vira, så de er klassificeret i Ribovirian- riget sammen med sidstnævnte. Oprindelsen af disse vira ser ud til at dateres tilbage til fremkomsten af eukaryoter . Det er blevet foreslået, at retrotranskriptionelle vira stammer fra en begivenhed, hvor en retrotransposon blev integreret i kapsiden af en anden virus, og erstattede genomet og enzymerne fra værtsvirussen, men det er også blevet foreslået, at det også kunne være et RNA-virus. Senere retrotransficerede vira opstod fra LTR retrotransposoner som et resultat af viral infektion. De er klassificeret i familierne Pseudoviridae , Metaviridae og Belpaoviridae [3] [4] .
Human immundefektvirus (HIV) og hepatitis B-virus er blandt de arter, der påvirker mennesker [5] .
Klassifikation
Fylogeni
En fylogenetisk undersøgelse af revers transkriptase gav følgende resultat, og endogeniserede LTR-retrotransposoner tildelt familierne Pseudoviridae, Metaviridae og Belpaviridae blev også inkluderet: [6] [7]
Referencer
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ Virustaksonomi: 2019-udgivelse . talk.ictvonline.org . International Komité for Taksonomi af Virus. Dato for adgang: 25. april 2020. (ubestemt)
- ↑ Arshan, Nasir; Caetano-Anollés, Gustavo (25. september 2015). "En fylogenomisk datadrevet udforskning af viral oprindelse og evolution" . Videnskabens fremskridt . 1 (8): e1500527. Bibcode : 2015SciA....1E0527N . doi : 10.1126/ sciadv.1500527 . PMC 4643759 . PMID26601271 . _
- ↑ Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Virus World som et evolutionært netværk af vira og kapsidløse selviske elementer . Mikrobiologi og molekylærbiologi anmeldelser.
- ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH Forslag: Opret en megataksonomisk ramme, der udfylder alle vigtigste taksonomiske rækker, for rigets Riboviria . International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . Dato for adgang: 21. maj 2020.
- ↑ Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: New Virus Order Unifying Five Families of Reverse-Transcription Viruses // Journal of Virology / Rozanne M. Sandri-Goldin. — 2018-06-15. — Bd. 92 , udg. 12 . — P.e00515–18 . — ISSN 1098-5514 0022-538X, 1098-5514 . - doi : 10.1128/JVI.00515-18 .
- ↑ Carlos Llorens, Beatriz Soriano, Maria Navarrete-Muñoz, Ahmed Hafez, Vicente Arnau. 3 // Omvendt transskriberende vira af familierne Belpaoviridae, Metaviridae og Pseudoviridae (ordenen Ortervirales) . - Elsevier, 2020. - ISBN 978-0-12-809633-8 .
Noter
Klassificering af vira ifølge Baltimore |
---|
DNA | I: vira |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Præplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Uklassificeret | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
---|
Uklassificeret |
- familie : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Slægter : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-vira |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-vira |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
- Familier : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRA | |
---|