Zobellviridae

Zobellviridae
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [1]Rige:DuplodnaviriaKongerige:HeunggongviraeType:UroviricotaKlasse:CaudoviricetesFamilie:Zobellviridae
Internationalt videnskabeligt navn
Zobellviridae
Baltimore-gruppen
I: dsDNA-vira


Zobellviridae er en familie af marine bakteriofager med subvirusmorfologi.

Historie

I 2019 offentliggjorde Vera Bischoff et al en undersøgelse af to nye bakteriofager, der parasitterer en marin bakterie af slægten Lentibacter og den genetiske mangfoldighed af lignende vira. En gruppe af vira af alfa-proteobakterier Celeribacter , Lentibacter og Sulfitobacter [2] blev skitseret ved metoder til fylogenetisk analyse af komplette genomer . I 2021 blev det beskrevne taxon ratificeret af International Committee on Taxonomy of Viruses som en familie opkaldt efter den amerikanske forsker Claude E. ZoBell ( eng.  Claude Ephraim ZoBell ) [3] .

Karakteristika

I juni 2022 omfattede familien 8 slægter og 11 arter [4] . Størrelsen af ​​genomerne varierer inden for 37-51 kilobaser [5] , genomiske ender er organiseret i form af direkte gentagelser. Naturen af ​​gensammensætningen af ​​fager fra Zobellviridae- familien og tilstedeværelsen af ​​direkte terminale gentagelser indikerer replikationen af ​​genomet og mekanismen for DNA-pakning i capsidet svarende til T7-fagen. Lyseringen af ​​bakterieceller forløber langs den kanoniske cholin-endolysin-vej. Ifølge metagenomiske data findes medlemmer af familien over hele verden i havene i tempererede, tropiske og ækvatoriale zoner . Det er sandsynligt, at Zobellviridae inficerer bakterier i symbiotiske forhold med protister [2] .

Noter

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ 1 2 Bischoff V, Bunk B, Meier-Kolthoff JP, Spröer C, Poehlein A, Dogs M et al. (2019). "Cobavirus - en ny globalt distribueret faggruppe, der inficerer Rhodobacteraceae i marine økosystemer." ISME Journal . 13 (6): 1404-1421. DOI : 10.1038/s41396-019-0362-7 . PMID  30718806 .
  3. ↑ Krupovic M, Turner D, Morozova V, Dyall-Smith M, Oksanen HM, Edwards R et al. (2021). "Bakterielle vira-underudvalg og arkæiske vira-underudvalg for ICTV: opdatering af taksonomiændringer i 2021." Arkiv for virologi . 166 (11): 3239-3244. DOI : 10.1007/s00705-021-05205-9 . PMID  34417873 .
  4. ↑ Virustaksonomi: 2021-udgivelse . International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Hentet: 24. juni 2022.
  5. ↑ [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=txid2842333[Organism:exp] Nukleotiddatabase] . National Library of Medicine. Hentet: 24. juni 2022.