Picornavirus

picornavirus
Polio virus
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [1]Rige:RiboviriaKongerige:OrthornaviraeType:PisuviricotaKlasse:PisoniviricetesBestille:PicornaviralesFamilie:picornavirus
Internationalt videnskabeligt navn
Picornaviridae
fødsel
se tekst
Baltimore-gruppen
IV: (+)ssRNA-vira
Systematik hos Wikispecies Billeder på Wikimedia Commons NCBI   12058 EOL   8043

Picornaviridae [2] ( lat.  Picornaviridae , fra pico  -small og rna  - RNA ) er en familie, der forener små icosaedriske vira af højere hvirveldyr indeholdende enkeltstrenget genomisk RNA med positiv polaritet (det vil sige samme polaritet som mRNA ). Størrelsen af ​​kapsiden er omkring 27-30 nm , størrelsen af ​​genomet er omkring 7-8 tusinde baser. Reproduktion af picornavira sker i cytoplasmaet af en inficeret celle. Picornavirus indbefatter forårsagende agenser af sådanne sygdomme som poliomyelitis , rhinitis , mund- og klovsyge , hepatitis A osv. I vira-verdenen er picornavirus kendetegnet ved en meget høj mutationsrate, hvilket fører til en høj sandsynlighed for, at deres varianter er skadelige for mennesker [3] .

Strukturen af ​​genomet

Det genomiske RNA fra picornavira indeholder i de fleste tilfælde én åben læseramme under kontrol af IRES  , det interne ribosomindgangssted . Translation af viralt RNA fører til dannelsen af ​​et gigantisk precursorprotein, som, selv før færdiggørelsen af ​​syntesen, skæres af virale proteaser , med dannelsen af ​​modne virale proteiner. Et lille protein er kovalent knyttet til 5'-enden af ​​det virale RNA - VPg (fra det engelske  virale protein genom linked , viralt protein forbundet med genomet). 3'-enden er polyadenyleret (indeholder adskillige tiere adeninrester , svarende til cellulære mRNA'er). I 5'- og 3'-enderne af det virale RNA er de såkaldte cis - replikative elementer (henholdsvis OriL og OriR - fra den engelske  oprindelse  - "begyndelse", venstre  - "venstre", højre  - "højre" ) - de sekvenser, der er nødvendige for genomreplikation.

Proteiner fra picornavirus

Picornavirusgenomet koder for omkring et dusin proteiner , der sikrer viral RNA-replikation, celleomprogrammering og samling af modne virioner . Den kodende region af genomet er ret betinget opdelt i tre sektioner: P1  - koder for de strukturelle proteiner VP1, VP2, VP3, VP4, hvorfra den virale partikel er bygget. P2 og P3  - koder for proteiner, der er nødvendige for celleomprogrammering og replikation:

• 2A - ikke-homolog i repræsentanter for forskellige slægter af picornavirus. For eksempel er det i aphtho- og cardiovirus et peptid , der forårsager et co-translationelt brud i polyproteinets syntetiserede proteinkæde , og i entero- og rhinovira er det serinprotease .
• 2B og 3A er små hydrofobe proteiner involveret i ændringen i cellemembraner forårsaget af picornavirus.
• 2C - dette protein har homologi med helicaser , er en del af picornavirus-replikationskomplekset.
• 3B er VPg, et protein, der binder til 5'-enden af ​​det virale RNA.
• 3C - cysteinprotease , der skærer polyproteinet [4] .
• 3D - RNA-polymerase, et protein, der syntetiserer viralt RNA.
• L - lederprotein er også ikke-homologt i repræsentanter for forskellige slægter; det er fraværende i en række picornavira. I aphthovirus er det en protease, der spalter sig selv fra et polyprotein; i cardiovirus og Teschovirus mangler den enzymatisk aktivitet.

Klassifikation

Ifølge International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) omfatter familien i marts 2017 35 slægter [5] :

• Ampivirus (1 art)
• Aphthovirus - Aphthoviruses (4 arter)
• Aquamavirus (1 art)
• Avihepatovirus (1 art)
• Avisivirus (3 arter)
• Cardiovirus - Cardiovirus [6] (3 arter)
• Cosavirus (5 arter)
• Dicipivirus (1 art)
• Enterovirus - Enterovirus (13 arter)
• Erbovirus (1 art)
• Gallivirus (1 art)
• Harkavirus (1 art)
• Hepatovirus — Hepatovirus [7] (9 arter)
• Hunnivirus (1 art)
• Kobuvirus (6 arter)
• Kunsagivirus (1 art)
• Limnipivirus (3 arter)
• Megrivirus (1 art)
• Mischivirus (3 arter)
• Mosavirus (1 art)
• Oscivirus (1 art)
• Parechovirus - Parechovirus (4 arter)
• Pasivirus (1 art)
• Passerivirus (1 art)
• Potamipivirus (1 art)
• Rabovirus (1 art)
• Rosavirus (1 art)
• Sakobuvirus (1 art)
• Salivirus (1 art)
• Sapelovirus (3 arter)
• Senecavirus (1 art)
• Sicinivirus (1 art)
• Techovirus (1 art)
• Torchivirus (1 art)
• Tremovirus (2 arter)

Se også

• Aviær encephalomyelitis virus

Noter

1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
2. ↑ Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lærebog for medicinstuderende / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Medical Information Agency, 2003. - S. 117. - ISBN 5-89481-136-8 .
3. ↑ S. Dmitriev. En virus er en hacker, der bryder celleprogrammet // Science and Life . - 2022. - Nr. 5 . - S. 8 .
4. ↑ Malcolm BA De picornavirale 3C-proteinaser: cysteinnukleofiler i serinproteinasefolder. : [ engelsk ] ] // Protein Sci. - 1995. - Bd. 4, nr. 8 (august). - S. 1439-1445.
5. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 23. marts 2017) .
6. ↑ Sergeev, Nepoklonov, Aliper, 2007 , s. 461.
7. ↑ Sergeev, Nepoklonov, Aliper, 2007 , s. 448.

Litteratur

• Sergeev V. A. , Nepoklonov E. A. , Aliper T. I. 10.23 Picornavirus // Vira og virale vacciner. - M .  : Biblionics, 2007. - S. 448-462. — ISBN 5-98685-012-2 .
• Semler BL og Wimmer E. 2002. Molecular Biology of Picornaviruses. American Society for Microbiology, Washington, DC

Ordbøger og encyklopædier	Flot dansk Fantastisk catalansk Britannica (online)
Taksonomi	EOL GBIF iNaturalist NCBI IRMNG WorMS
I bibliografiske kataloger	NKC : ph254777