Molekylær symmetri er et grundlæggende begreb i kemi, der beskriver og klassificerer et molekyles symmetri , brugt til at forudsige eller forklare molekylers kemiske egenskaber , såsom dipolmoment og tilladte spektroskopiske overgange , for eksempel . Studiet af molekylær symmetri er baseret på gruppeteori , et molekyles tilstand klassificeres ved hjælp af irreducerbare repræsentationer fra tegntabellen for molekylets symmetrigruppe.
Symmetri bruges i studiet af molekylære orbitaler med anvendelser som Hückel-metoden , ligandfeltteori og Woodward-Hoffmann-reglerne . Et andet grundlag i stor skala er brugen af krystalsystemer til at beskrive krystallografisk symmetri.
Der er mange metoder til at etablere symmetrien af et molekyle, herunder røntgendiffraktionsanalyse og forskellige former for spektroskopi . Spektroskopisk notation er baseret på symmetri.
Gruppeteori bruges til at studere molekylær symmetri.
Rotationsakse ( ) | Ukorrekte rotationselementer ( ) | ||
---|---|---|---|
Chiralt nr |
Achiral reflektionsplan |
Achiralt symmetricenter | |
Punktsymmetrigruppen i et molekyle kan beskrives ved fem typer symmetrielementer .
De fem symmetrielementer har fem typer symmetrioperationer forbundet med dem , som gør molekylet uskydeligt fra starttilstanden. De er nogle gange markeret med en " vogn " eller " cirkumfleks " (låg) for at skelne mellem symmetrielementerne. Så er rotationen af molekylet rundt om aksen, og er identitetsoperationen. Et symmetrielement kan have mere end én symmetrioperation tilknyttet. For eksempel er aksen af et kvadratisk xenonfluorid- molekyle ( ) forbundet med to rotationer på 90° i modsatte retninger og en rotation på 180°. Da er ækvivalent med , svarer til , og er ækvivalent med î , kan alle symmetrioperationer opdeles i korrekte og ukorrekte rotationer.
For lineære molekyler er rotation med uret eller mod uret langs molekylets akse gennem enhver vinkel en symmetrioperation.
Symmetrioperationerne af et molekyle (eller et andet objekt) danner en gruppe . I matematik er en gruppe et sæt med en binær operation , der opfylder de fire egenskaber, der er anført nedenfor.
I en symmetrigruppe er gruppens elementer symmetrioperationerne (ikke symmetrielementerne), og binære kombinationer består af at anvende en operation og derefter en anden. Et eksempel er sekvensen af rotation om z - aksen og refleksion om xy -planet , som er betegnet med . Efter konvention udføres operationer fra højre mod venstre.
Symmetrigruppen har alle gruppers egenskaber.
Rækkefølgen af en gruppe er antallet af elementer i gruppen. For grupper af lille orden kan gruppens egenskaber let kontrolleres ved at overveje tabellen over sammensætninger, hvor rækkerne og kolonnerne svarer til gruppens elementer, og cellerne i tabellen svarer til deres produkt.
Den successive påføring (eller sammensætning ) af en eller flere symmetrioperationer af et molekyle har en effekt svarende til anvendelsen af en enkelt symmetrioperation. For eksempel ses rotation efterfulgt af refleksion som en symmetrioperation . (Operation A efterfulgt af operation B for at danne operation C skrives som BA = C ) [3] . Desuden opfylder sættet af alle symmetrioperationer (inklusive sammensatte operationer) alle egenskaberne for gruppen givet ovenfor. Så ( S , * ) er en gruppe, hvor S er mængden af alle symmetrioperationer af det samme molekyle, og betyder sammensætningen (genanvendelse) af symmetrioperationer.
Denne gruppe kaldes molekylets punktgruppe, fordi mange symmetrioperationer efterlader mindst ét punkt fast (selvom for nogle symmetrier forbliver aksen eller planet fast). Med andre ord er en punktgruppe en gruppe, der opsummerer alle de symmetrioperationer, som molekyler i en given kategori har [3] . Symmetrien af en krystal er derimod beskrevet af en krystallografisk gruppe af symmetrioperationer, som inkluderer parallelle oversættelser i rummet.
Det er muligt at bestemme punktgruppesymmetrioperationer for et bestemt molekyle ved at overveje den geometriske symmetri for molekylets molekylære model. Men hvis en punktgruppe bruges til at klassificere et molekyles tilstande, fortolkes operationerne i den ikke på samme måde. I stedet fortolkes operationerne som rotationer og/eller refleksioner af de elektronisk-vibrationskoordinater [4] , og disse operationer pendler med den vibrationelle Hamiltonian. De er "symmetrioperationerne" for denne Hamiltonianer. Punktgruppen bruges til at klassificere vibrationsegentilstande efter symmetri. Klassificering af symmetrien af rotationsniveauer, egentilstande af den komplette (rotations-vibrations-elektroniske) Hamiltonian kræver brugen af en passende permutation-inversion gruppe, som i Longuet-Higgins [5] .
Tildeling af en punktgruppe til hvert molekyle klassificerer kategorier med lignende symmetriegenskaber. For eksempel og har identiske symmetrioperationer [6] . De kan alle gennemgå den samme E -operation , to rotationer og tre forskellige planrefleksioner uden at miste deres identitet, så de har alle den samme punktgruppe af orden 6 [3] . På samme måde deler vand ( ) og hydrogensulfid ( ) identiske symmetrioperationer. Begge stoffer kan gennemgå den identiske operation E , en rotation og to refleksioner uden at miste deres identitet, således at begge stoffer har samme punktgruppe af orden 4 [7] . Dette klassifikationssystem hjælper videnskabsmænd med at studere molekyler mere effektivt, fordi kemiske molekyler med samme punktgruppe har lignende bindingsmønstre, bindingsdiagrammer og spektrale egenskaber [3] .
Følgende tabel indeholder mange af de punktgrupper, der gælder for molekyler. Grupper er mærket med Schoenflies-symboler , der almindeligvis bruges i kemi og molekylær spektroskopi. Beskrivelserne omfatter molekylernes generelle former, som kan forklares ved hjælp af AETR-modellen . I hver linje har beskrivelser og eksempler ikke højere symmetrier, hvilket betyder, at den angivne punktgruppe fanger alle punktsymmetrier.
prikgruppe | Symmetrioperationer [8] | En simpel beskrivelse af typisk geometri | Eksempel 1 | Eksempel 2 | Eksempel 3 |
C1 _ | E | Ingen symmetri, chiral | Bromchlordifluormethan (begge enantiomerer vist ) |
Lyserginsyre |
L-leucin og de fleste andre aminosyrer undtagen glycin |
Cs _ | Refleksionsplan | Thionylchlorid |
Hypoklorsyre |
Chloriodomane | |
Ei _ | Symmetriens centrum | mesovinsyre |
Slimsyre (mesogmælkesyre) |
( S , R ) 1,2-dibrom-1,2-dichlorethan ( anti -konformer ) | |
Lineær | Hydrogenfluorid (og alle andre heteronukleære diatomiske molekyler ) |
Nitrogenoxid (nitrogenoxid) |
Cyanbrinte (hydrogencyanid) | ||
Lineær med inversionscenter | Ilt (og alle andre homonukleære diatomiske molekyler ) |
Carbondioxid |
Acetylen (ethyn) | ||
"Geometri af en åben bog", chiral | Brintoverilte |
Hydrazin |
Tetrahydrofuran (snoet konformation, snoet konformation) | ||
propel, chiral | Triphenylphosphin |
Triethylamin |
Orthophosphorsyre | ||
Flad med symmetricentrum, ingen lodret plan | Trans - 1,2-dichlorethylen |
Trans - difluordiazin |
Trans - azobenzen | ||
Propel | Borsyre |
Phloroglucinol (1,3,5-trihydroxybenzen) |
|||
Vinkel ( ), sving ( ) eller T -formet (ClF 3 ) | Hydrogenmonoxid |
Svovltetrafluorid |
klorfluorid | ||
Trigonal-pyramideformet | Ikke-inverteret ammoniak |
Fosforoxychlorid |
Tetracarbonylkoboltsyre , HCo(CO) 4 | ||
firkantet pyramideformet | xenonoxid tetrafluorid |
Pentaborane , B5H9 _ _ |
Nitroprussid anion [Fe(CN) 5 (NO)] 2− | ||
Malkeafføringskompleks | Cyclopentadienylnikkelnitrosyl |
Korannulen |
|||
Snoet, chiral | Biphenyl (skæv konformation) |
Twistan ( C10H16 ) _ _ |
cyclohexan konformation (twist) | ||
Tredobbelt helix, chiral | Tris(ethylendiamin) cobalt(III) kation | Jern(III) tris-oxalatanion | | |||
Flad med symmetricentrum, lodret plan | Ethylen |
Pyrazin |
Diboran | ||
Trekantet flad eller trekantet bipyramideformet | Bortrifluorid |
Fosfor (V) chlorid |
Cyclopropan | ||
flad firkant | Xenon(IV)fluorid |
Kaliumoctachlordimolybdatanion |
Trans - [Co III (NH 3 ) 4 Cl 2 ] + (eksklusive hydrogenatomer) | ||
Femkantet | Cyclopentadienyl anion |
Rutenocæn |
Fulleren C70 | ||
Sekskantet | Benzen |
Bis(benzen)chrom |
Coronen ( C 24 H 12 ) | ||
halvkantede | Tropilia ion () kation |
||||
Ottekantet | Anion af cyclooctatetraen ( ) |
Ouranocæn |
|||
90° drejning | Allen |
Tetrasvovltetranitrid |
Diborane (ophidset tilstand) | ||
60° rotation | Ethan (zigzag rotationsisomer ) |
Octacarbonyldicobalt ( ikke-broforbundet isomer ) |
Cyclohexan konformation (lænestol) | ||
45° drejning | Svovl (kronebygning) |
Dimanganese decacarbonyl (zigzag roterende isomer) |
Octafluoroxenat(VI) anion (idealiseret geometri) | ||
36° drejning | Ferrocen (zigzag roterende isomer) |
||||
1,2,3,4 - tetrafluorspiropentan [9] > |
|||||
tetraedrisk | Metan |
Fosfor(V)oxid |
Adamantane | ||
Icosahedron med pyrit-hedral symmetri | Nogle C60 fulleren hexaaddukter [10] | ||||
Oktaedral eller kubisk | Svovl(VI)fluorid |
Molybdæn hexacarbonyl |
cubansk | ||
Icosahedral eller dodecahedral | Buckminsterfullerene |
Anion af dodecaborate |
Dodekaeder |
Symmetrioperationer kan repræsenteres på mange måder . Normalt repræsenteret ved matricer . For enhver vektor, der repræsenterer et punkt i et kartesisk koordinatsystem, giver venstre multiplikation med en matrix den nye position for punktet efter symmetrioperationen. Sammensætningen af operationer svarer til matrixmultiplikation. I en punktgruppe fører multiplikation af matricer med to symmetrier til en matrix af en anden symmetrioperation i samme punktgruppe [3] . Et eksempel er
Selvom der er et uendeligt antal af sådanne repræsentationer, bruges irreducible gruppe repræsentationer almindeligvis , da alle andre repræsentationer kan beskrives som en lineær kombination af irreducible repræsentationer.
For hver punktgruppe opsummerer tegntabellen information om symmetrioperationer og om dens irreducerbare repræsentationer. Da antallet af irreducerbare repræsentationer altid er lig med antallet af klasser af symmetrioperationer, er tabellerne kvadratiske.
Selve tabellen består af tegn , der repræsenterer, hvordan en bestemt irreducerbar repræsentation ændres, hvis en bestemt symmetrioperation anvendes. Enhver symmetrioperation i et molekyles punktgruppe, der virker på molekylet, efterlader molekylet uændret. Men når man handler på et generisk objekt, såsom en vektor eller en orbital , er dette ikke nødvendigvis tilfældet. En vektor kan ændre retning og en orbital kan ændre type. For simple punktgrupper er værdierne enten 1 eller -1. 1 betyder, at tegnet eller fasen (af en vektor eller orbital) ikke ændres af symmetrioperationen ( symmetrisk operation ), mens −1 betyder fortegn er omvendt ( asymmetrisk operation ).
Visninger er mærket i henhold til en række konventioner:
Tabellerne indeholder også information om, hvordan de kartesiske koordinatrotationsvektorer omkring dem og kvadratiske funktioner ændres under påvirkning af gruppesymmetrioperationer ved at specificere, hvilken irreducerbar repræsentation, der virker på samme måde. Disse præciseringer er givet i tabellens højre kolonner. Denne yderligere information er nyttig, fordi de kemisk vigtige orbitaler (især p- og d -orbitaler ) har de samme symmetrier som disse strukturer.
Tegntabellen for punktsymmetrigruppen er angivet nedenfor:
en | en | en | en | z | ||
en | en | −1 | −1 | xy | ||
en | −1 | en | −1 | xz | ||
en | −1 | −1 | en | yz |
Overvej eksemplet med vand ( ), som har den ovenfor beskrevne symmetri . Iltkredsløbet har symmetri som i fjerde række i tegntabellen ovenfor, med x i den sjette kolonne). Den er placeret vinkelret på molekylets plan og skifter fortegn under operationerne og , men forbliver uændret under de to andre operationer (naturligvis er karakteren for den identiske operation altid +1). Så er sættet af orbitaltegn {1, −1, 1, −1}, hvilket svarer til en irreducerbar repræsentation af . På samme måde har 2 p z orbitalen symmetrien af den irreducible repræsentation (det vil sige, ingen af symmetrioperationerne ændrer den), orbitalen har symmetrien , og orbitalen har symmetrien .
Hans Bethe brugte karaktererne af punktgruppeoperationer, da han studerede ligandfeltteori i 1929, og Eugene Wigner brugte gruppeteori til at forklare valget af regler for atomspektroskopi [11] . Den første karaktertabel blev skabt af Laszlo Tissa (1933) i forbindelse med vibrationsspektre. Robert Mulliken var den første til at udgive karaktertabeller på engelsk (1933), og E. Bright Wilson brugte dem i 1934 til at forudsige symmetrien af normale vibrationer [12] . Et komplet sæt af 32 krystallografiske punktgrupper blev offentliggjort i 1936 af Rosenthal og Murphy [13] .
Som diskuteret ovenfor i punktgrupper og permutations-inversionsgrupper er punktgrupper nyttige til at klassificere vibrationstilstandene af stive molekyler (nogle gange kaldet semi- rigide molekyler), der kun gennemgår små vibrationer omkring en ligevægtsgeometri. Longuet-Higgins introducerede en mere generel type symmetrigruppe, der ikke kun er egnet til klassificering af rovibroniske tilstande af stive molekyler, men også til klassificering af tilstande af ikke- stive (eller fluktuerende ) molekyler, der passerer til ækvivalente geometrier (kaldet versioner [14 ) ] ), hvilket kan forårsage virkningen af forvrængning af molekylets rotation [5] . Disse grupper er kendt som permutations-inversionsgrupper , fordi deres symmetrioperationer er energetisk mulige permutationer af identiske kerner, inversion i forhold til massecentret ( paritetsoperation ) eller en kombination af disse operationer.
For eksempel har ethan ( ) tre ækvivalente hindrede konformationer [2] . Overgangen mellem konformationer sker ved almindelige temperaturer ved intern rotation af methylgruppen i forhold til de øvrige bestanddele. Dette er ikke en rotation af det komplette molekyle om aksen . Selvom hver konformation har symmetri , som i tabellen ovenfor, kræver beskrivelsen af interne rotationer og tilhørende kvantetilstande og energiniveauer en mere komplet permutations-inversionsgruppe .
På samme måde har ammoniak ( ) to pyramideformede ( ) konformationer, der omdannes til hinanden i en proces kendt som pyramidal inversion . Dette er ikke en punktgruppeinversionsoperation i i stive molekyler med central symmetri, fordi den ikke har noget symmetricenter. Det er snarere en ændring i kernen og de elektroniske koordinater i molekylets massecentrum (nogle gange kaldet paritetsoperationen), som viser sig at være energetisk mulig for dette molekyle. En passende permutations-inversionsgruppe til brug i denne situation er , som er isomorf til punktgruppen .
Derudover har metan ( ) og molekyler som eksempler symmetriske ligevægtsstrukturer med symmetripunktgrupper og hhv. De mangler permanente elektriske dipolmomenter, men de har meget svage rotationsspektre på grund af rotationscentrifugal forvrængning [15] [16] . De permutations-inversionsgrupper, der kræves for en fuldstændig undersøgelse af molekylerne og er hhv .
Den anden og mindre generelle tilgang til symmetrien af ikke-stive molekyler tilhører Altman [17] [18] . I denne tilgang er symmetrigrupper kendt som Schrödinger-supergrupper og består af to typer operationer (og deres kombinationer): (1) geometriske symmetrioperationer (rotation, refleksion i planet, central symmetri) af stive molekyler og (2) isodynamiske operationer der oversætter ikke-stive molekyler til energetisk ækvivalente former ved fysiske processer såsom rotation af en enkeltbinding (som i ethan) eller permutationer i et molekyle (som i ammoniak) [18] .