Transposoner

Transposoner ( eng.  transposable element, transposon ) er dele af DNA'et fra organismer, der er i stand til bevægelse (transposition) og reproduktion inden for genomet [1] . Transposoner er også kendt som "hoppende gener" og er eksempler på transponerbare genetiske elementer .

Transposoner refererer formelt til den såkaldte ikke-kodende del af genomet - en, der i sekvensen af ​​DNA-basepar ikke bærer information om proteiners aminosyresekvenser, selvom nogle klasser af mobile elementer indeholder information om enzymer i deres sekvens transskriberes og katalyserer bevægelser; for eksempel koder DNA-transposoner og DDP-1 for proteinerne transposase , BORS1 og BORS2 . Hos forskellige arter er transposoner fordelt i varierende grad: for eksempel udgør transposoner hos mennesker op til 45% af hele DNA-sekvensen, hos frugtfluen Drosophila melanogaster udgør delen af ​​transponerbare elementer kun 15-20% af hele genomet [2] . I planter kan transposoner optage hovedparten af ​​genomet, for eksempel i majs ( Zea mays ), med en genomstørrelse på 2,3 milliarder basepar, er mindst 85% forskellige transponerbare elementer [3] .

Opdagelseshistorie

Barbara McClintock studerede variationer i farven på korn og blade af majs, og i 1948 kom hun gennem cytologiske og genetiske undersøgelser til den konklusion, at mobile DNA-fragmenter, Ac/Ds - elementer, fører til somatisk mosaicisme af planter [4] . Hun var den første til at bevise, at det eukaryote genom ikke er statisk, men indeholder områder, der kan bevæge sig. I 1983 modtog Barbara McClintock Nobelprisen for dette arbejde [5] .

Selvom transposoner blev opdaget i 1940'erne , blev det først et halvt århundrede senere klart, hvor stor deres andel i genomet af organismer var. Således viste opnåelse af den første nukleotidsekvens ( sekventering ) af det humane genom, at der er mindst 50% af mobile elementer i DNA-sekvensen. Et nøjagtigt skøn er svært at opnå, fordi nogle transposonregioner har ændret sig så meget over tid, at de ikke kan identificeres med sikkerhed [6] .

Da transposoner har potentiale til at forårsage skadelige mutationer og kromatinnedbrydninger , har man siden opdagelsen af ​​transposerbare elementer ment, at deres virkning er reduceret til genomisk parasitisme. Men i begyndelsen af ​​det 21. århundrede dukker der flere og flere data op om de mulige gavnlige virkninger af transposoner for organismer [7] , om retrotransposoners evolutionære indflydelse på placentapattedyrs genom [8] . Identificerer organismers anvendelse af transposoner. For eksempel er DDP-1 retrotransposon RNA involveret i dannelsen af ​​heterochromatin under X-kromosom inaktivering [9] . Frugtfluen mangler telomerase , men bruger i stedet retrotransposon revers transkriptase til at forlænge telomere regioner, som hos Drosophila melanogaster er transposon-gentagelser [10] [11] .

Typer af transposoner og mekanismer for deres bevægelse

Transponerbare genetiske elementer refererer til gentagne elementer i genomet - dem, der har flere kopier i en celles DNA-sekvens . Gentagne elementer af genomet kan lokaliseres i tandem ( mikrosatellitter , telomerer osv.) og kan spredes gennem genomet (mobile elementer, pseudogener , etc.) [12] .

Mobile genetiske elementer i henhold til typen af ​​transposition kan opdeles i to klasser: DNA-transposoner , som bruger "klip og indsæt"-metoden, og retrotransposoner , hvis bevægelse i sin algoritme har syntesen af ​​RNA fra DNA , efterfulgt af omvendt syntese af DNA fra et RNA-molekyle, det vil sige metoden "kopier og indsæt".

Transposoner kan også opdeles efter graden af ​​autonomi. Både DNA-transposoner og retrotransposoner har autonome og ikke-autonome elementer. Ikke-autonome elementer til transposition kræver enzymer, der er kodet af autonome elementer, som ofte indeholder væsentligt ændrede transposonregioner og yderligere sekvenser. Antallet af ikke-autonome transposoner i genomet kan betydeligt overstige antallet af autonome [13] .

DNA-transposoner

DNA-transposoner bevæger sig rundt i genomet på en cut-and-paste måde takket være et kompleks af enzymer kaldet transposase [1] . Information om aminosyresekvensen af ​​transposaseproteinet er kodet i sekvensen af ​​transposonet. Derudover kan denne DNA-region indeholde andre sekvenser forbundet med transposonet, såsom gener eller dele deraf. De fleste DNA-transposoner har en ufuldstændig sekvens. Sådanne transposoner er ikke autonome og bevæger sig rundt i genomet på grund af en transposase, som er kodet af en anden, komplet, DNA-transposon [1] .

I enderne af DNA-transposonregionerne er omvendte gentagelser, som er specielle transposase-genkendelsessteder, der således adskiller denne del af genomet fra resten. Transposase er i stand til at lave dobbeltstrengede DNA-klip, skære og indsætte en transposon i mål-DNA'et [14] .

Ac/Ds planteelementer tilhører DNA-transposoner , som først blev opdaget af Barbara McClintock i majs. Ac -element ( eng.  Activator ) er autonomt og koder for transposase. Der er flere typer Ds- elementer, der er i stand til at danne kromosombrud , og som bevæger sig gennem genomet på grund af Ac - elementer [15] .

Helitroner er en  type transposon, der findes i planter , dyr og svampe , men som er meget til stede i majsgenomet, hvor den i modsætning til andre organismer findes i genrige dele af DNA [3] . Helitroner transponeres i henhold til den rullende cirkelmekanisme . Processen begynder med brud på en streng af DNA-transposonen. Den frigivne DNA-strækning invaderer målsekvensen, hvor der dannes en heterodupleks . Ved hjælp af DNA-replikation fuldføres introduktionen af ​​transposonet i et nyt sted [16] .  

Helitroner kan fange tilstødende sekvenser under transposition.

Retrotransposoner

Retrotransposoner er mobile genetiske elementer, der bruger "copy and paste"-metoden til at sprede sig i dyrs genom [17] . Mindst 45% af det menneskelige genom består af retrotransposoner og deres derivater. Bevægelsesprocessen involverer det mellemliggende trin af et RNA- molekyle , som aflæses fra retrotransposonområdet, og som igen bruges som skabelon for omvendt transkription til en DNA-sekvens. Det nyligt syntetiserede retrotransposon indsættes i en anden region af genomet.

Pattedyrs aktive retrotransposoner er opdelt i tre hovedfamilier: Alu-gentagelser, DDP-1, SVA.

• DDP-1 retrotransposoner  er lange spredte gentagelser, en type retrotransposoner, der er udbredt i pattedyr og udgør op til 20% af genomet. DDP-1-elementer har en længde på omkring 6 tusinde basepar [7] . De fleste af disse retrotransposoner er ufuldstændigt repræsenteret i genomet, selvom der er ca. 150 komplette og potentielt mobile DDP-1-elementer i den humane DNA-sekvens og ca. 3000 i musen [7] .
  Bevægelsesprocessen begynder med aflæsning af RNA-molekylet fra DDP-1-elementet. RNA transporteres til cytoplasmaet , hvor BORS1 (som er et RNA-bindende protein) og BORS2 (som er et protein med endonuklease- og revers transkriptase-aktiviteter) translateres fra det. BORS1, BORS2 og transposon-RNA danner et ribonukleoprotein og importeres til kernen , hvor omvendt transkription af retrotransposonet forekommer [18] .
  De fleste tilfælde af indsættelse af DDP-1-elementer er ufuldstændige, og sådanne kopier er ikke længere i stand til selvmobilisering [7] .
  Der er information om de ikke-kanoniske funktioner af DDP-1-elementer under inaktiveringen af ​​X-kromosomet [9] .
• LTR  - lange terminale gentagelser  - retrotransposoner med endelige gentagne sekvenser, der spiller en vigtig rolle i transkription og revers transkription af transposon RNA [4] . LTR-elementer koder for pol- og gag- proteiner , som er tæt på retrovirale proteiner, men i modsætning til sidstnævnte mangler LTR proteiner, der kunne danne den ydre skal ( superkapsid ) og forlade cellen [13] .
• CRP  - korte dispergerede gentagelser er ikke-autonome retrotransposoner: de kræver aktiviteten af ​​DDP-1-elementer for bevægelse; i DNA-sekvensen indeholder CRP kun RNA-polymerasebindingsstedet [4] . RTP'erne inkluderer Alu-retrotransposoner.

• Alu-repeat ( Alu fra Arthrobacter luteus ) er vidt udbredte transponerbare elementer i det menneskelige genom [19] . Alu-elementer er omkring 300 basepar lange og er ofte placeret i introner , ikke-translaterede områder af genomet og intergene regioner [12] . Alu - retrotransposoner blev præfikseret, fordi de indeholder restriktionsenzymgenkendelsessekvensen AluI [12 ] . Sekvensanalyse viste, at Alu-elementer opstod i primater for omkring 65 millioner år siden fra 7SL RNA-genet, som er en del af det ribosomale kompleks [12] . Alu-retrotransposoner har ikke deres egen revers transkriptase, så de har brug for DDP-1 enzymer til bevægelse.
  Alu-elementer er de steder, hvor op til 90 % af al A - I RNA-redigering finder sted [18] .
• SVA  er transposerbare elementer af 2-3 tusinde basepar DNA, bestående af flere dele: korte spredte elementer (SRC), variabelt antal tandemgentagelser (VTR), Alu- sekvens1 [20] og CT-gentagelse, med sekvensen CCCTCT , som forekommer oftest og har navnet hexamer (Hex) [21] . SVA-elementer varierer betydeligt i længde på grund af forskelligt antal gentagelser af bestanddele [21] . De er ikke autonome og kræver proteiner kodet i DDP1 retrotransposoner til bevægelse, men de er aktive i det menneskelige genom [4] . SVA-elementer gennemgår høje niveauer af DNA-methylering i de fleste menneskelige væv. En interessant kendsgerning er under-methyleringen af ​​DNA af SVA retrotransposoner i menneskelige mandlige kønsceller , mens i chimpanser er SVA-sekvenserne af spermatozoer stærkt methylerede [22] .

Transposon blokerende mekanismer

Mobile elementer af genomet er ret bredt repræsenteret i plante- og dyregenomer. Deres høje aktivitet er en risiko for stabiliteten af ​​genomet , så deres ekspression er stramt reguleret, især i de væv , der er involveret i dannelsen af ​​kønsceller og overførsel af arvelig information til efterkommere. Hos planter og dyr sker reguleringen af ​​aktiviteten af ​​mobile elementer i genomet ved de novo - methylering af DNA-sekvensen og aktiviteten af ​​ikke-kodende RNA sammen med Argonaut-proteinkomplekser [23] .

Hovedrollen for små ikke-kodende RNA'er, der interagerer med pivi-komplekset eller piRNA , er at undertrykke transponerbare genomiske elementer i kimlinievæv. Denne rolle af piRNA er ret meget konserveret i dyr [24] .

Hos mus er mobile elementer af genomet under ontogenese overvejende i en inaktiv tilstand, hvilket opnås gennem epigenetiske interaktioner og aktiviteten af ​​ikke-kodende RNA'er [25] . Under embryonal udvikling gennemgår det epigenetiske DNA-methyleringsmærke omprogrammering: forældremærker slettes, og nye etableres [26] . I denne periode spiller en del af argonautproteinerne - piwi-proteiner (Mili og Miwi2) - og ikke-kodende RNA'er, der interagerer med dem - piRNA - en nøglerolle i de novo undertrykkelse af muse-retrotransposoner ved DNA-methylering og ping-pong cyklus af piRNA-amplifikation og målsuppression [27] . Hvis mus mangler Mili- og Miwi2-proteiner, fører dette til aktivering af DDP-1 og LTP og standsning af gametogenese og sterilitet hos mænd [24] . Nyligt arbejde har vist, at hos fluen Drosophila melanogaster er SFG-1- proteinet en aktiv cofaktor i suppression .

Mekanismen for piRNA- induceret undertrykkelse af transposoner er ikke blevet fuldstændig belyst, men den kan repræsenteres skematisk af følgende model [28] :

• primær akkumulering af enkeltstrengede RNA-molekyler, piRNA- prækursorer ;
• modning af piRNA'er og deres amplifikation ved hjælp af pewee-proteiner (ping-pong-cyklus);
• undertrykkelse af måltransposonet, som kan forekomme på flere måder: RNA-nedbrydning (via RNase-aktiviteten af ​​det H-lignende domæne af argonautproteiner), translationel undertrykkelse og rekruttering af kromatin - modificerende systemer (såsom SWI/SNF-proteiner [13] ) og yderligere epigenetisk undertrykkelse af transposon.

I modsætning til vira , som bruger værten til at reproducere og er i stand til at forlade den, eksisterer mobile genetiske elementer udelukkende i værten. I et vist omfang er transposoner derfor i stand til at regulere deres aktivitet. Et eksempel på dette er Ac - DNA-transposoner  - autonome mobile elementer af planter, der koder for deres egen transposase. Ac -elementer viser evnen til at reducere aktiviteten af ​​transposase med en stigning i dens kopier [29] .

Også undertrykkelsen af ​​planteautonome DNA-transposoner MuDR kan forekomme ved hjælp af Muk. Muk er en variant af MuDR og har flere palindromiske DNA-regioner i sin sekvens. Når Muk transskriberes, danner dette RNA en hårnål, som derefter skæres af et kompleks af enzymer til små interfererende RNA'er (siRNA'er), som dæmper MuDR-aktiviteten via RNA-interferensprocessen [29] .

Sygdomme

Fra 2012 er 96 forskellige menneskelige sygdomme blevet dokumenteret, der er forårsaget af de novo -introduktion af mobile genetiske elementer [22] . Alu-gentagelser forårsager ofte kromosomafvigelser og er årsag til 50 typer sygdomme [30] . Så i neurofibromatosis type I blev der fundet 18 tilfælde af indlejrede retrotransposoner , hvoraf 6 forekommer på 3 specifikke steder. Aktiviteten af ​​mobile elementer DDP-1 i somatiske væv blev registreret hos patienter med lungekræft [22] .

Hvis transponeringen, der forårsager sygdomme, sker i kønscellerne , så arver de følgende generationer sygdommene. Så hæmofili kan forekomme på grund af indsættelsen af ​​DDP-1-retrotransposonet i DNA-regionen, der koder for koagulationsfaktor VIII -genet . Hos mus blev tilfælde af onkogenese, udviklingsstop og sterilitet registreret på grund af indsættelsen af ​​mobile elementer i genomet [30] .

Transposonernes evolutionære rolle

Nogle stadier af udviklingen af ​​organismer var forårsaget af aktiviteten af ​​mobile elementer i genomet. Allerede den første nukleotidsekvens af det menneskelige genom beviste, at mange gener var derivater af transposoner [6] . Mobile elementer af genomet kan påvirke organisationen af ​​genomet ved at rekombinere genetiske sekvenser og være en del af sådanne fundamentale strukturelle elementer af kromatin som centromerer og telomerer [31] . Transponerbare elementer kan påvirke nabogener ved at ændre mønstre ( mønstre ) af splejsning og polyadenylering eller fungere som forstærkere eller promotorer [13] . Transposoner kan påvirke genernes struktur og funktion ved at slukke og ændre funktioner, ændre strukturen af ​​gener, mobilisere og reorganisere genfragmenter og ændre den epigenetiske kontrol af gener [16] .

Transposonreplikation kan forårsage nogle sygdomme, men på trods af dette blev transposoner ikke fjernet under evolutionen og forblev i DNA -sekvenserne af næsten alle organismer, enten i form af hele kopier, der kunne bevæge sig langs DNA'et, eller i en forkortet form, efter at have mistet evnen til at bevæge sig. Men trunkerede kopier kan også deltage i sådanne processer som post-transkriptionel regulering af gener, rekombination osv. [31] Et andet vigtigt punkt i transposonernes potentielle evne til at påvirke udviklingshastigheden er, at deres regulering afhænger af epigenetiske faktorer. Dette fører til transposoners evne til at reagere på miljøændringer og forårsage genetisk ustabilitet [31] . Ved stress aktiveres transposoner enten direkte eller ved at reducere deres undertrykkelse af argonautproteiner og piRNA'er [13] . I planter er mobile genetiske elementer meget følsomme over for forskellige typer stress; deres aktivitet kan påvirkes af adskillige abiotiske og biotiske faktorer , herunder saltholdighed , skade, kulde, varme, bakterielle og virale infektioner [16] .

En anden mulig mekanisme for udviklingen af ​​organismers genomer er horisontal genoverførsel  - processen med at overføre gener mellem organismer, der ikke er i et "forfader-efterkommer"-forhold. Der er bevis for, at interaktioner mellem parasitære organismer og dyreværter kan føre til horisontal transposon-assisteret genoverførsel, der har fundet sted mellem hvirveldyr og hvirvelløse dyr [32] .

Eksempler på den evolutionære rolle af mobile genetiske elementer

Pattedyrs erhvervet immunitet menes at være opstået i kæbefisk for cirka 500 millioner år siden [33] . Erhvervet immunitet tillader dannelsen af ​​antistoffer mod mange typer patogener , der kommer ind i kroppen af ​​pattedyr, herunder mennesker. For at danne forskellige antistoffer ændrer celler i immunsystemet DNA-sekvensen ved somatisk rekombination ved hjælp af et system, der opstod og udviklede sig på grund af mobile elementer i genomet [33] .

Neuroner , celler i nervesystemet, kan have et mosaikgenom , det vil sige, at deres DNA-sekvens adskiller sig fra DNA-sekvensen af ​​andre celler, selvom de alle er dannet fra en forløbercelle - en zygote . Hos rotter har specielt indsatte humane DDP-1 retrotransposoner vist sig at være aktive selv i voksenalderen. Også en stigning i kopier af DDP-1 retrotransposoner i neuronerne i nogle dele af hjernen , især hypothalamus , blev registreret i sammenligning med andre væv hos voksne [34] . Det har også vist sig, at mobile elementer fører til heterogenitet i neuronerne hos fluen Drosophila melanogaster [2] . Aktiviteten af ​​mobile elementer i neuroner kan føre til synaptisk plasticitet og større variation i adfærdsreaktioner [7] .

DNA-sekvenserne af generne for telomerase og DDP-1 retrotransposoner har en høj homologi, hvilket indikerer muligheden for oprindelsen af ​​telomerase fra retrotransposoner [1] .

Planter har en meget høj grad af genomudvikling, derfor er virkningerne af transponerbare elementer, der opstod som et resultat af domesticering , da det skete for nylig, bedst kendt, og disse ændringer er nemme at identificere, da de egenskaber, som dyrkede planter var udvalgte er kendte [16] . Et eksempel kunne være erhvervelsen af ​​en oval form af den romerske tomat Solanum lycopersicum . Genet, som er placeret på SUN- locuset , blev flyttet ved retrotransposition til en anden DNA-region, hvor det reguleres af forskellige promotorsekvenser i ovale tomater [16] .

Brug af transposoner

Genteknologi

Da transponerbare elementer af genomet er i stand til at integreres i kromatin , bruges de i genteknologi til den specifikke og kontrollerede indsættelse af gener eller dele af DNA, som forskere studerer. Transposoner bruges til mutagenese og til at bestemme de regulatoriske elementer i genomet i laboratorier.

Det bedst kendte system for indført in vivo mutagenese  er det P-mobile element af fluen D. melanogaster , som kan bruges til at studere genfunktioner, etablering af kromosomafvigelser osv. [35]

Hos hvirveldyr var der i lang tid ingen effektiv metode til transposonmodifikation af genomet. Der er nu et Tol2-transponerbart elementsystem afledt af den japanske fisk Oryzias latipes , som bruges i både mus og menneskelige cellelinjer [35] . Minos-transposonsystemet [36] er også vellykket .

Tornerose-transposonsystemet blev skabt baseret på DNA-sekvensen af ​​en fisketransposase .  Succesfuld brug af dette system i mus har gjort det muligt at identificere kandidater til humane tyktarmskræft-onkogener [37] .

Fylogenetik

Udover brugen af ​​transposoner i genteknologi er studiet af transposonaktivitet en metode til fylogenetik . Ved at analysere og sammenligne nukleotidsekvenserne af genomerne fra forskellige arter kan man finde transposoner, der er til stede i nogle arter, men fraværende i andre. Arter, der deler den samme retrotransposon, har højst sandsynligt fået det fra en fælles forfader. Det er således muligt at få information om arternes evolutionære udvikling og bygge fylogenetiske træer [38] .

Noter

1. ↑ 1 2 3 4 Sivolob A. V. Molekylærbiologi . - Kiev: Printing Center "Kyiv University", 2008. - 384 s.
2. ↑ 1 2 Perrat PN, DasGupta S., Wang J. et al. Transpositionsdrevet genomisk heterogenitet i Drosophila-hjernen  (engelsk)  // Science : journal. - 2013. - Bd. 340 , nr. 6128 . - S. 91-95 . — ISSN 0036-8075 . - doi : 10.1126/science.1231965 .
3. ↑ 1 2 Patrick S. Schnable, Doreen Ware, Robert S. Fulton, et al. B73-majsgenomet: kompleksitet, mangfoldighed og dynamik  (engelsk)  // Science : journal. - 2009. - Bd. 326 , nr. 5956 . - S. 1112-1115 . - doi : 10.1126/science.1178534 . — PMID 19965430 .
4. ↑ 1 2 3 4 Levin Henry L., Moran John V. Dynamisk interaktion mellem transponerbare elementer og deres værter  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2011. - Bd. 12 , nr. 9 . - s. 615-627 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg3030 .
5. ↑ Nobelpris til Barbara McClintock   // Nature . - 1983. - Bd. 305 , nr. 5935 . - S. 575-575 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/305575a0 .
6. ↑ 1 2 Lander Eric S., Linton Lauren M., Birren Bruce. Indledende sekventering og analyse af det menneskelige genom  //  Nature : journal. - 2001. - Bd. 409 , nr. 6822 . - S. 860-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/35057062 .
7. ↑ 1 2 3 4 5 Sangerinden Tatjana, McConnell Michael J., Marchetto Maria CN et al. LINE-1 retrotransposoner: mediatorer af somatisk variation i neuronale genomer? (engelsk)  // Trends in Neurosciences : journal. - Cell Press , 2010. - Vol. 33 , nr. 8 . - S. 345-354 . — ISSN 01662236 . - doi : 10.1016/j.tins.2010.04.001 .
8. ↑ Kaneko-Ishino Tomoko, Ishino Fumitoshi. Retrotransposon-dæmpning ved DNA-methylering bidrog til udviklingen af ​​placentation og genomisk prægning hos pattedyr  //  Development, Growth & Differentiation: journal. - 2010. - Bd. 52 , nr. 6 . - S. 533-543 . — ISSN 00121592 . - doi : 10.1111/j.1440-169X.2010.01194.x .
9. ↑ 1 2 Melamed Esther, Arnold Arthur P. Rollen af ​​LINEs og CpG-øer i dosiskompensation på kyllingens Z-kromosom  //  Kromosomforskning: tidsskrift. - 2009. - Bd. 17 , nr. 6 . - s. 727-736 . — ISSN 0967-3849 . - doi : 10.1007/s10577-009-9068-4 .
10. ↑ Abad JP TAHRE, en ny telomerisk retrotransposon fra Drosophila melanogaster, afslører oprindelsen af ​​Drosophila Telomeres   // Molekylær biologi og evolution : journal. - Oxford University Press , 2004. - Vol. 21 , nr. 9 . - S. 1620-1624 . — ISSN 0737-4038 . - doi : 10.1093/molbev/msh180 .
11. ↑ Nick Fulcher, Elisa Derboven, Sona Valuchova & Karel Riha. Hvis hætten passer, skal du bære den: en oversigt over telomere strukturer over evolution  //  Cellular and molecular life sciences : CMLS : journal. - 2013. - doi : 10.1007/s00018-013-1469-z . — PMID 24042202 .
12. ↑ 1 2 3 4 Batzer Mark A., Deininger Prescott L. Alu-gentagelser og menneskelig genomisk mangfoldighed  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2002. - Bd. 3 , nr. 5 . - S. 370-379 . — ISSN 14710056 . doi : 10.1038 / nrg798 .
13. ↑ 1 2 3 4 5 R. Keith Slotkin, Robert Martienssen. Transponerbare elementer og den epigenetiske regulering af genomet  // Naturanmeldelser  . Genetik  : tidsskrift. - 2007. - April ( bind 8 , nr. 4 ). - S. 272-285 . doi : 10.1038 / nrg2072 . — PMID 17363976 .
14. ↑ af Opijnen Tim, Camilli Andrew. Transposon-indsættelsessekvensering: et nyt værktøj til analyse af mikroorganismer på systemniveau  (engelsk)  // Nature Reviews Microbiology  : journal. - 2013. - Bd. 11 , nr. 7 . - S. 435-442 . — ISSN 1740-1526 . - doi : 10.1038/nrmicro3033 .
15. ↑ Chunguang Du, Andrew Hoffman, Limei He, Jason Caronna & Hugo K. Dooner. Den komplette Ac/Ds-transposonfamilie af majs  (neopr.)  // BMC-genomik. - 2011. - T. 12 . - S. 588 . - doi : 10.1186/1471-2164-12-588 . — PMID 22132901 .
16. ↑ 1 2 3 4 5 Damon Lisch. Hvor vigtige er transposoner for planteudvikling? (engelsk)  // Naturanmeldelser. Genetik  : tidsskrift. - 2013. - Bd. 14 , nr. 1 . - S. 49-61 . doi : 10.1038 / nrg3374 . — PMID 23247435 .
17. ↑ Baillie J. Kenneth, Barnett Mark W., Upton Kyle R. Somatisk retrotransposition ændrer det genetiske landskab i den menneskelige hjerne  //  Nature: journal. - 2011. - Bd. 479 , nr. 7374 . - S. 534-537 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature10531 .
18. ↑ 1 2 Cordaux Richard, Batzer Mark A. Indvirkningen af ​​retrotransposoner på menneskets  genomudvikling // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2009. - Bd. 10 , nej. 10 . - S. 691-703 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg2640 .
19. ↑ Hannah Stower. Alternativ splejsning: Regulating Alu element 'exonization'  //  Nature Reviews Genetics  : journal. - 2013. - Bd. 14 , nr. 3 . - S. 152-153 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg3428 .
20. ↑ Varki Ajit, Geschwind Daniel H., Eichler Evan E. Menneskelig unikhed: genominteraktioner med miljø, adfærd og kultur  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2008. - Bd. 9 , nr. 10 . - s. 749-763 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg2428 .
21. ↑ 1 2 Hancks DC, Mandal PK, Cheung LE et al. Den minimale aktive humane SVA-retrotransposon kræver kun 5'-hexamer og alu-lignende domæner   // Molekylær og cellulær biologi : journal. - 2012. - Bd. 32 , nr. 22 . - P. 4718-4726 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.00860-12 .
22. ↑ 1 2 3 Hancks Dustin C., Kazazian Haig H. Aktive humane retrotransposoner: variation og sygdom  //  Current Opinion in Genetics & Development : journal. - 2012. - Bd. 22 , nr. 3 . - S. 191-203 . — ISSN 0959437X . - doi : 10.1016/j.gde.2012.02.006 .
23. ↑ Law Julie A., Jacobsen Steven E. Etablering, opretholdelse og modificering af DNA-methyleringsmønstre i planter og dyr  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2010. - Bd. 11 , nr. 3 . - S. 204-220 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg2719 .
24. ↑ 1 2 Siomi Mikiko C., Sato Kaoru, Pezic Dubravka et al. PIWI-interagerende små RNA'er: avantgarden for genomforsvar  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : tidsskrift  . - 2011. - Bd. 12 , nr. 4 . - S. 246-258 . — ISSN 1471-0072 . - doi : 10.1038/nrm3089 .
25. ↑ De Fazio Serena, Bartonicek Nenad, Di Giacomo Monica. Endonukleaseaktiviteten af ​​Mili giver næring til piRNA-amplifikation, der dæmper LINE1-elementer  (engelsk)  // Nature : journal. - 2011. - Bd. 480 , nr. 7376 . - S. 259-263 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature10547 .
26. ↑ Popp Christian, Dean Wendy, Feng Suhua. Genom-dækkende sletning af DNA-methylering i muse primordiale kønsceller er påvirket af AID-mangel  //  Nature : journal. - 2010. - Bd. 463 , nr. 7284 . - S. 1101-1105 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature08829 .
27. ↑ Castel Stephane E., Martienssen Robert A. RNA-interferens i kernen: roller for små RNA'er i transkription, epigenetik og videre  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2013. - Bd. 14 , nr. 2 . - S. 100-112 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg3355 .
28. ↑ Luteijn Maartje J., Ketting René F.  PIWI- interagerende RNA'er: fra generation til transgenerationel epigenetik  // Nature Reviews Genetics  : journal. - 2013. - Bd. 14 , nr. 8 . - S. 523-534 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg3495 .
29. ↑ 1 2 Damon Lisch. Regulering af transponerbare elementer i majs  (neopr.)  // Aktuel udtalelse i plantebiologi. - 2012. - T. 15 , nr. 5 . - S. 511-516 . - doi : 10.1016/j.pbi.2012.07.001 . — PMID 22824142 .
30. ↑ 1 2 Zamudio N., Bourc'his D. Transponerbare elementer i pattedyrets kimlinje: en behagelig niche eller en dødelig fælde? (engelsk)  // Arvelighed: tidsskrift. - 2010. - Bd. 105 , nr. 1 . - S. 92-104 . — ISSN 0018-067X . - doi : 10.1038/hdy.2010.53 .
31. ↑ 1 2 3 Rebollo Rita, Horard Beatrice, Hubert Benjamin et al.  Springende gener og epigenetik : Mod nye arter  // Gen. — Elsevier , 2010. — Vol. 454 , nr. 1-2 . - S. 1-7 . — ISSN 03781119 . - doi : 10.1016/j.gene.2010.01.003 .
32. ↑ Gilbert Clément, Schaack Sarah, Pace II John K. et al. En rolle for vært-parasit-interaktioner i den horisontale overførsel af transposoner på tværs af phyla  (engelsk)  // Nature: journal. - 2010. - Bd. 464 , nr. 7293 . - S. 1347-1350 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature08939 .
33. ↑ 1 2 Flajnik Martin F., Kasahara Masanori. Oprindelse og udvikling af det adaptive immunsystem: genetiske hændelser og selektive tryk  (engelsk)  // Nature Reviews Genetics  : tidsskrift. - 2009. - Bd. 11 , nr. 1 . - S. 47-59 . — ISSN 1471-0056 . - doi : 10.1038/nrg2703 .
34. ↑ Coufal Nicole G., Garcia-Perez José L., Peng Grace E. L1 retrotransposition i humane neurale progenitorceller  (italiensk)  // Natur: diario. - 2009. - V. 460 , n. 7259 . - S. 1127-1131 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature08248 .
35. ↑ 1 2 Carlson Corey M., Largaespada David A. Insertionel mutagenese hos mus: nye perspektiver og værktøjer  // Nature Reviews Genetics  : journal  . - 2005. - Bd. 6 , nr. 7 . - S. 568-580 . — ISSN 1471-0056 . doi : 10.1038 / nrg1638 .
36. ↑ Venken Koen J T., Schulze Karen L., Haelterman Nele A. MiMIC: a very alsidig transposon insertion resource for engineering Drosophila melanogaster geners  // Nature Methods  : journal  . - 2011. - Bd. 8 , nr. 9 . - s. 737-743 . — ISSN 1548-7091 . - doi : 10.1038/nmeth.1662 .
37. ↑ Marts H Nikki, Rust Alistair G., Wright Nicholas A. Insertionel mutagenese identificerer flere netværk af samvirkende gener, der driver intestinal tumorgenese  // Nature Genetics  : journal  . - 2011. - Bd. 43 , nr. 12 . - S. 1202-1209 . — ISSN 1061-4036 . - doi : 10.1038/ng.990 .
38. ↑ Inferring Phylogenetic Trees from Transposon Data , < http://content.csbs.utah.edu/~rogers/ant1050/trantree.html > 

Ordliste

• Ac/Ds  - activation-dissociation system ( eng.  Activator-dissociation system )
• BORS1  - protein af den første åbne læseramme ( eng.  Åben læseramme 1 protein, ORF1p ); BORS2  - protein i den anden åbne læseramme
• DDP  - lange spredte gentagelser ( eng.  Long Interspersed Elements, LINE, L )
• LTR  - lange terminalgentagelser ( eng.  Long Terminal Repeat, LTR )
• KDP  - korte spredte gentagelser ( eng.  Short INTEspersed Elements, SINE )
• SVA ( eng.  SINE-R-VNTR-Alu ) - elementer af KDP-VChTP-Alu (hvor VChTP - tandemgentagelser  varierer i antal , eng.  Variabelt antal tandemgentagelser, VNTR ).
• SFG-1  - gametocytspecifik faktor 1 ( eng.  gametocytspecifik faktor 1, GTSF1 )

Litteratur

• Golubovsky M. D. Ustabilitet af gener og mobile elementer: om historien om undersøgelse og opdagelse // Historisk og biologisk forskning. 2011. nr. 4. S.60-78.
• Titov I.I., Vorozheykin P.S. miRNA-holdige humane transposoner  // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. - T. 15 , nr. 323-326 .
• Avdeev Yu. I., Avdeev A. Yu. Påvisning af kimcelletransposoner i solanum lycopersicum L. spontane mutanter og planteavl // nr. 2013. nr. 2. S.103-109.
• Danilevskaya O.N. Mobile genetiske elementer i Drosophila: opdagelsens historie og opdagernes skæbne // Istoriko-biologicheskie issledovaniya. 2011. nr. 4. S.79-89.
• Yurchenko N. N., Kovalenko L. V., Zakharov I. K. Mobile genetiske elementer: ustabilitet af gener og genomer  // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. - T. 15 , nr. 2 . - S. 261-270 .

Se også

• Transposon Tn10

Ordbøger og encyklopædier	Flot dansk Fantastisk norsk Britannica (online)
I bibliografiske kataloger	BNF : 12262439n J9U : 987007538808305171 LCCN : sh85135694