X-kromosominaktivering

X-kromosominaktivering ( eng.  X-inaktivering, lyonisering ) er en epigenetisk proces, som følge af , at den ene af de to kopier af X-kromosomerne, der findes i hunpattedyrs celler, bliver transkriptionelt tavs under tidlig embryonal udvikling . I dette tilfælde danner DNA'et fra det inaktive X-kromosom fakultativt heterochromatin .

Inaktivering af X-kromosomet sker i cellerne hos hunpattedyr, således at to kopier af X-kromosomet ikke danner dobbelt så mange produkter af de tilsvarende gener som hos hanpattedyr. Denne proces kaldes dosiskompensation af gener . I placenta er valget af X-kromosomet, der skal inaktiveres, tilfældigt (som vist for muse- og menneskeceller). Et inaktiveret X-kromosom vil forblive inaktivt i alle efterfølgende datterceller som følge af deling.

Historie

I 1959 viste Susumu Ohno , at det ene af de to X-kromosomer hos kvinder opførte sig som et autosom, mens det andet var i en heterochromatin-tilstand. [2] To grupper af forskere foreslog uafhængigt, at et af de to X-kromosomer undergår inaktivering. I 1961 foreslog Mary Lyon , at inaktivering af et af X-kromosomerne hos hunner forårsager plettet pelsfarve hos mus, der er heterozygote for farvegener. [3] Lyons hypotese om enkelt X-inaktivering i pattedyrs hunceller forklarede også det faktum, at mus med kun ét X-kromosom har en hun - fænotype . Ernest Beutler ,  der studerede heterozygote hunner med mangel på enzymet glucose-6-phosphatase dehydrogenase, uafhængigt af Lyon, foreslog eksistensen af ​​to typer erytrocytter i heterozygote organismer - mangelfulde på enzymet og normale. [fire]

Mekanisme

På stadiet af et to- eller firecellet museembryo inaktiveres det faderlige X-kromosom af prægningsmekanismen . [5] [6] [7] På det tidlige blastocyststadium bliver begge X-kromosomer aktive i cellerne i den indre cellemasse . Derefter, i alle celler i blastocystens indre cellemasse, inaktiveres et af X-kromosomerne irreversibelt og uafhængigt af hinanden. Inaktiveret på dette tidlige stadie af embryonal udvikling, vil X-kromosomet derefter blive inaktiveret i alle somatiske afkomsceller i denne celle. Inaktivering af X-kromosomet vendes i cellerne i den kvindelige kimlinje, og derfor indeholder alle oocytter begge aktive X-kromosomer.

Det har vist sig, at normaltilstanden for X-kromosomet i pattedyrsceller er en inaktiveret tilstand, da i organismer eller celler, der indeholder mere end to X-kromosomer, er kun den ene aktiv, mens resten af ​​X-kromosomerne er inaktive. Tilstedeværelsen på X-kromosomerne af stedet for X-kromosominaktiveringscentret - XIC (fra engelsk.  X-inaktiveringscenter ) er vist. Tilstedeværelsen af ​​et inaktiveringscenter er nødvendigt og tilstrækkeligt til inaktivering af X-kromosomet. Translokation af et kromosomområde indeholdende XIC til et autosom fører til inaktivering af det tilsvarende autosom, mens X-kromosomer, der mangler XIC, forbliver aktive.

XIC-regionen indeholder to ikke-kodende RNA-gener , der ikke er oversat til protein - Xist og Tsix , som er involveret i inaktiveringen af ​​X-kromosomet. XIC indeholder også bindingssteder for de tilsvarende regulatoriske proteiner.

Ikke-kodende RNA'er Xist og Tsix

Xist er et gen, der koder for et langt ikke-kodende RNA- molekyle , der medierer specifik inaktivering af X-kromosomet, hvorfra det blev transskriberet. [8] Det inaktive X-kromosom er dækket af RNA transskriberet fra Xist-genet, [9] det aktive X-kromosom er ikke dækket af et sådant RNA. Xist-genet udtrykkes kun fra det inaktive X-kromosom; kromosomer, der ikke indeholder Xist-genet, kan ikke inaktiveres. [10] Kunstig overførsel af Xist-genet til andre kromosomer og dets ekspression fører til inaktivering af andre kromosomer. [11] [12]

Indtil inaktiveringsøjeblikket udtrykker begge X-kromosomer svagt RNA-produktet af Xist-genet; under inaktiveringsprocessen falder Xist-ekspression på det aktive kromosom, mens det på det inaktiverede kromosom stiger. Xist-genproduktet dækker gradvist det inaktiverede kromosom startende fra XIC-regionen; [11] Gendæmpning af et inaktiveret kromosom begynder kort efter, at kromosomet bliver dækket af Xist- gentranskriptet .

Tsix er et langt RNA-molekyle, der ikke koder for et protein. Tsix-transkriptet er antisense til Xist-gentranskriptet, det vil sige, det transskriberes fra den modsatte DNA-streng af det samme gen. [13] Tsix er Xists negative regulator; X-kromosomer, der ikke udtrykker Tsix og derfor har et øget niveau af Xist-ekspression, inaktiveres meget oftere end normale kromosomer.

Som i tilfældet med Xist-genet, før inaktivering, udtrykker begge X-kromosomer svagt Tsix-genets RNA fra det tilsvarende gen. Efter at inaktiveringen af ​​X-kromosomet begynder, stopper det fremtidige inaktiverede kromosom med at udtrykke Tsix RNA, mens det aktive kromosom fortsætter med at udtrykke Tsix i flere dage.

Barrs krop

Barr-legemet kaldes X-kromosomet, hvis DNA er i en tilstand af heterochromatin . [14] Barr-kroppen indeholder produktet af Xist -genet , er normalt placeret i periferien af ​​kernen, DNA'et fra Barr-kroppen replikeres sent .

Noter

  1. Gartler SM, Varadarajan KR, Luo P., Canfield TK, Traynor J., Francke U., Hansen RS Normale histonmodifikationer på det inaktive X-kromosom i ICF- og Rett-syndromceller: implikationer for methyl-CpG-bindende  proteiner  // BMC Biology : journal. - 2004. - Bd. 2 . — S. 21 . - doi : 10.1186/1741-7007-2-21 .  — Figur 1 Arkiveret 8. august 2010 på Wayback Machine
  2. Ohno S., Kaplan WD, Kinosita R. Dannelse af kønskromatin af et enkelt X-kromosom i leverceller fra rattus norvegicus  //  Exp Cell Res : journal. - 1959. - Bd. 18 . - S. 415-419 . - doi : 10.1016/0014-4827(59)90031-X . — PMID 14428474 .
  3. Lyon MF -genvirkning i musens X -kromosom ( Mus musculus L.  )  // Natur  : journal. - 1961. - Bd. 190 , nr. 4773 . - s. 372-373 . - doi : 10.1038/190372a0 . — PMID 13764598 .
  4. Beutler E., Yeh M., Fairbanks VF Den normale menneskelige kvinde som en mosaik af X-kromosomaktivitet: Undersøgelser med genet for G-6-PD-mangel som markør  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the National Academy of Sciences Amerikas Forenede Stater  : tidsskrift. - 1962. - Januar ( bind 48 ). - S. 9-16 . — PMID 13868717 .
  5. Takagi N., Sasaki M. Foretrukken inaktivering af det paternalt afledte X-kromosom i musens ekstraembryonale membraner  //  Nature : journal. - 1975. - Bd. 256 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/256640a0 . — PMID 1152998 .
  6. Cheng MK, Disteche CM Silence of the fathers: tidlig X -  inaktivering  // BioEssays : journal. - 2004. - Bd. 26 , nr. 8 . - s. 821-824 . - doi : 10.1002/bies.20082 . — PMID 15273983 .  (utilgængeligt link)
  7. Okamoto I., Otte A., Allis C., Reinberg D., Heard E. Epigenetic dynamics of imprinted X-inactivation during early muse development  //  Science : journal. - 2004. - Bd. 303 , nr. 5658 . - S. 644-649 . - doi : 10.1126/science.1092727 . — PMID 14671313 .
  8. Hoki Y., Kimura N., Kanbayashi M., Amakawa Y., Ohhata T., Sasaki H., Sado T. En proksimal konserveret gentagelse i Xist-genet er essentiel som et genomisk element for X-inaktivering hos mus   // Udvikling : tidsskrift. - 2009. - Bd. 136 . - S. 139-146 . - doi : 10.1242/dev.026427 . — PMID 19036803 .
  9. Ng K., Pullirsch D., Leeb M., Wutz A. Xist and the order of silencing  //  EMBO Rep : journal. - 2007. - Bd. 8 . - S. 34-9 . - doi : 10.1038/sj.embor.7400871 . — PMID 17203100 . . — « Figur 1 Xist RNA omfatter det X, hvorfra det er transskriberet. ".
  10. Penny GD, Kay GF, Sheardown SA, Rastan S., Brockdorff N. Requirement for Xist in X-kromosominactivation   // Nature . - 1996. - Bd. 379 . - S. 116-117 . - doi : 10.1038/379131a0 . — PMID 8538762 .
  11. 1 2 Herzing LB, Romer JT, Horn JM, Ashworth A. Xist har egenskaber fra X-kromosominaktiveringscentret  //  Nature : journal. - 1997. - Bd. 386 . - S. 272-275 . - doi : 10.1038/386272a0 . — PMID 9069284 .
  12. Lee JT, Jaenisch R. Langrækkende cis-effekter af ektopisk X-inaktiveringscentre på et museautosom  //  Nature: journal. - 1997. - Bd. 386 . - S. 275-279 . - doi : 10.1038/386275a0 . — PMID 9069285 .
  13. Lee JT, Davidow LS, Warshawsky D. Tisx , et gen-antisense til Xist ved X-inaktiveringscentret  // Nat Genet  : journal  . - 1999. - Bd. 21 . - S. 400-404 . - doi : 10.1038/7734 .
  14. Barr ML, Bertram EG En morfologisk skelnen mellem mænds og kvindens neuroner og den nukleolære satellits opførsel under accelereret nukleoproteinsyntese  // Nature  :  journal. - 1949. - Bd. 163 , nr. 4148 . - s. 676-677 . - doi : 10.1038/163676a0 .

Litteratur