Colimovirus

Colimovirus
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [1]Rige:RiboviriaKongerige:PararnaviraeType:ArtverviricotaKlasse:RevtraviricetesBestille:OrterviralesFamilie:Colimovirus
Internationalt videnskabeligt navn
Caulimoviridae
Baltimore-gruppen
VII: dsDNA-RT-vira

Colimovira [2] ( lat.  Caulimoviridae ) er en familie af DNA-holdige plantevira med en omvendt transkriptionsmekanisme og dobbeltstrenget DNA , det vil sige vira, der indeholder et omvendt transkriptionsstadium i deres replikationscyklus.

Struktur af virioner

Virionen er enkel, uden en lipidkonvolut. Nukleokapsidens morfologi er repræsenteret af 2 hovedformer: stavformet og icosahedral. Formen af ​​nukleocapsidet afhænger af virusets størrelse. De stavformede virioner er cirka 35-50 nm i diameter og kan være op til 900 nm lange. Det icosaedriske kapsid er 45-50 nm i diameter og omtrent samme længde.

Genomstruktur og replikation

Genomet af denne virus er et usegmenteret lineært eller cyklisk dobbeltstrenget DNA . Genomstørrelsen er cirka 6-8 kbs. Afhængigt af virus kan genomet enten have én åben læseramme (ORF), som i Petuvirus , eller mere end otte, som i Soymovirus . Genomet af denne virale familie koder for følgende proteiner: revers transkriptase , protease , strukturelle proteiner, såvel som andre proteiner med ukendte funktioner, men på en eller anden måde nødvendige for virusreplikation .

Replikation forekommer både i cytoplasmaet og i værtscellens kerne. Først kommer det virale genom ind i cytoplasmaet. Der danner det et supersnoet minkromosom. Det transskriberer virussens mRNA , som er redundant (fordi det udtrykkes to gange i nogle dele af genomet). Dette transskriberede RNA kommer ind i cytoplasmaet, hvor det spiller to roller. Det kan enten bruges som en skabelon til translation af virale proteiner eller revers-transkriberes til dsDNA ved hjælp af viral reversetase . Da disse vira har meget til fælles med retrovira , er de ofte grupperet sammen som pararetrovira. Der er dog en vigtig forskel her mellem retrovira og vira i Caulimoviridae- familien . I modsætning til retrovira integrerer de ikke deres genom i kromosomer , da deres genom ikke koder for integraseenzymet .

Der er dog arter af Colimovirus-familien, såsom Petunia vene clearing virus , som lejlighedsvis (hovedsageligt under stressende forhold) kan integrere deres genom i det økonomiske genom [3] . Typisk omtales sådanne provirus ofte som endogene pararetrovira (EPRV'er).

Klassifikation

Ifølge International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) omfatter familien i marts 2016 8 slægter [4] :

Den rosegule venevirusart har en usædvanlig genomorganisation, der gør den til en unik art [5] .

Noter

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ Pinevich A.V. , Sirotkin A.K. , Gavrilova O.V. , Potekhin A.A. Virologi: lærebog. - Sankt Petersborg.  : St. Petersburg University Press, 2012. - S. 275. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
  3. ↑ Harper G., Hull R., Lockhart B. og Olszewski N. (2002). Virale sekvenser integreret i plantegenomer. Annual Review of Phytopathology 40 : 119-136. doi : 10.1146/annurev.phyto.40.120301.105642 . PMID 12147756 .
  4. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 26. marts 2017) .
  5. ↑ Mollov D., Lockhart B., Zlesak DC, Olszewski N. (2012). Komplet nukleotidsekvens af rosegul venevirus, et medlem af familien Caulimoviridae med en ny genomorganisation. Arch Virol .

Links