Carnitin palmitoyltransferase I

Carnitin palmitoyltransferase I
Tilgængelige strukturer
FBFOrtholog søgning: PDBe RCSB
Identifikatorer
Symboler CPT1A , carnitin palmitoyltransferase 1A (lever), CPT1, CPT1-L, L-CPT1, carnitin palmitoyltransferase 1A
Eksterne ID'er OMIM: 600528 MGI: 1098296 HomoloGene: 1413 GeneCards: 1374
Beslægtede arvelige sygdomme
Sygdommens navn Links
fedme
dyslipidæmi
carnitin palmitoyltransferase I mangel
ortologer
Slags Human Mus
Entrez
Ensemble
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001031847
NM_001876

NM_013495

RefSeq (protein)

NP_001027017
NP_001867

NP_038523

Locus (UCSC) Chr 11: 68,75 – 68,84 Mb Chr 19: 3,37 – 3,44 Mb
PubMed- søgning [5] [6]
Rediger (menneske)Rediger (mus)

Carnitin palmitoyltransferase I , også carnitin acyltransferase I , carnitin acyl-CoA transferase I eller palmitoyl-CoA transferase I ( Carnitine palmitoyltransferase I , forkortelse CPT1  ) er et mitokondrielt enzym, en af ​​formerne for carnitin-O-palmitoyltransferase ( EC.1EC.2.2.1EC . Arkiveret 5. maj 2016 på Wayback Machine ), tilhører acyltransferase- familien [1] . Katalyserer overførslen af ​​en acylgruppe (-COR) fra et acyl-CoA-fedtsyremolekyle med en lang carbonhydridkæde til et carnitinmolekyle med dannelse af acylcarnitin og et frit coenzym A- molekyle . Ofte er reaktionsproduktet palmitoylcarnitin (deraf navnet på enzymet), dog kan andre fedtsyrerester (acylgrupper-COR) også fungere som et substrat [2] [3] . Et af flere enzymer i carnitintransportsystemet . Genet, der koder for dette enzym, er placeret på det 11. kromosom - CPT1A Arkiveret 10. september 2016 på Wayback Machine .

Der er 3 isoformer af enzymet: CPT1A, CPT1B og CPT1C. CPT1 er forbundet med den ydre mitokondriemembran. Aktiviteten af ​​dette enzym kan reduceres af malonyl-CoA (som er en inhibitor), en mellemmetabolit involveret i fedtsyrebiosyntese. Carnitin palmitoyltransferase I spiller en vigtig rolle i forskellige stofskiftesygdomme, såsom for eksempel diabetes . Imidlertid er krystalstrukturen stadig ukendt, som et resultat af hvilken dens nøjagtige virkningsmekanisme forbliver ukendt.

Struktur

CPT1 refererer til et integreret membranprotein, der er forbundet med den ydre mitokondrielle membran via transmembrane regioner i peptidkæden. Både terminale N- og C-domæner er placeret på den cytoplasmatiske side af membranen [4] .

Alle tre isoformer af enzymet findes i pattedyrsvæv. Leverisoformen (CPT1A eller CPTI-L) er lokaliseret i mitokondrierne i alle kropsceller, med undtagelse af skeletmuskelceller og brune fedtvævsceller [5] [6] . Muskelisoformen (CPT1B eller CPTI-M) er et højt udtrykt protein produceret i hjertemyokardiet, skeletmuskelceller (myocytter) og brune fedtvævsceller [4] [5] [6] . Den tredje isoform, cerebral (CPT1C), blev isoleret i 2002 og er overvejende placeret i hjernen og testiklerne . Lidt er kendt om denne form [7] [8] .

Den nøjagtige struktur af alle CPT1-isoformer er endnu ikke fastlagt, selvom der i silico -modeller er blevet skabt baseret på nært beslægtede CPT1-enzymer - acylcarnitin-transferaser, såsom carnitin-acetyltransferase (CRAT) [9] .

En vigtig strukturel forskel mellem CPT1 og CPT2, CRAT og carnitinoktanoyltransferase (COT) er, at CPT1 indeholder et yderligere domæne ved N-terminalen på ca. 160 aminosyrer . Det blev fundet, at dette yderligere N-terminale domæne er vigtigt for nøgleenzyminhibitormolekylet malonyl-CoA [10] .

To forskellige bindingssteder er blevet foreslået, som findes i CPT1A og CPT1B. A-stedet, eller CoA-stedet , ser ud til at binde både malonyl-CoA og palmitoyl-CoA, såvel som andre coenzym A-holdige molekyler. Enzymet menes at binde disse molekyler gennem interaktion med en coenzymdel. Det er blevet foreslået, at malonyl-CoA kan opføre sig som en kompetitiv inhibitor af CPT1A på dette sted. I det andet, O-stedet , menes det, at malonyl-CoA binder meget tættere end i A-stedet . I modsætning til A -stedet binder O -stedet til malonyl-CoA gennem malonat-dicarbonylgruppen [11] . Binding af malonyl-CoA til enzymet af A- og O- stederne hæmmer virkningen af ​​CPT1A ved at eliminere bindingen af ​​carnitin af enzymet.

Reaktionsmekanisme

På grund af manglen på data om enzymets krystalstruktur er den nøjagtige mekanisme for CPT1-katalyse stadig ukendt. Et par forskellige mulige mekanismer for CPT1 er blevet postuleret, som begge involverer en histidinrest , His473 , der tjener som et nøglekatalytisk sted. En sådan mekanisme er baseret på carnitin-acetyltransferase-modellen vist nedenfor, hvor His473-resten deprotonerer carnitin, mens den tilstødende serin -rest stabiliserer det tetraedriske mellemprodukt af oxyanionen.


En anden mekanisme er baseret på antagelsen om, at der er en såkaldt katalytisk triade, bestående af aminosyrerester Cys-305 , His-473 og Asp-454 , som udfører katalytisk acyloverførsel [12] . Denne katalytiske mekanisme involverer dannelsen af ​​et kovalent thioacylenzymmellemprodukt med Cys-305.

Biologiske funktioner

Carnitin palmitoyl transferase systemet er et vigtigt skridt i beta-oxidationen af ​​langkædede fedtsyrer. Langkædede fedtsyrer, såsom palmitoyl-CoA, kan i modsætning til kort- og mellemkædede fedtsyrer ikke frit diffundere gennem den indre mitokondriemembran (den er uigennemtrængelig), for denne overgang er der en carnitin-shuttle , der transporterer dem til matrixen [13] .

Carnitin palmitoyltransferase I er den første komponent i systemet og den hastighedsbegrænsende kemiske reaktion i carnitintransportsystemet , der katalyserer overførslen af ​​acylgruppen fra coenzym A til carnitin med dannelsen af ​​palmitoylcarnitin. Ved hjælp af en translokase ( carnitin-acylcarnitin translocase , CACT) overføres palmitoylcarnitin gennem faciliteret diffusion ( antiport ) gennem den indre mitokondriemembran ind i matrixen.

Carnitin fungerer som en acylgruppeacceptor og kan også spille en rolle i reguleringen af ​​det intracellulære coenzym A-pool: acyl-CoA/CoA-forhold [14] .

Forordning

CPT1 hæmmes af malonyl-CoA, selvom den nøjagtige mekanisme for inhibering forbliver ukendt. Skeletmuskulaturen og myokardieisoformen CPT1 (CPT1B) har vist sig at være 30-100 gange mere følsom over for malonyl-CoA-hæmning end den analoge CPT1A-isoform. Denne hæmning er et godt mål for fremtidige forsøg på at regulere CPT1 i behandlingen af ​​metaboliske lidelser [15] .

Acetyl-CoA-carboxylase (ACC), et enzym, der katalyserer dannelsen af ​​malonyl-CoA fra acetyl-CoA, spiller en vigtig rolle i reguleringen af ​​fedtsyremetabolismen . Forskerne påviste, at ACC2 knockout-mus resulterede i en reduktion i fedt og vægt sammenlignet med vildtype-mus. Dette er resultatet af reduceret ACC-aktivitet, som forårsager et efterfølgende fald i malonyl-CoA-koncentrationer. Disse reducerede niveauer af malonyl-CoA forhindrer igen hæmning af CPT1, hvilket resulterer i en marginal stigning i fedtsyreoxidation [16] . Da hjerte- og skeletmuskelcellerne har en lav evne til at syntetisere fedtsyrer, kan ACC udelukkende fungere som et regulerende enzym i disse celler.

Medicinsk betydning

Hos mennesker er kun "CPT1A"-mangel (carnitin palmitoyltransferase I-mangel) blevet beskrevet [17] . Dette er en sjælden sygdom karakteriseret ved høj risiko for udvikling af hypoketonymisk hypoglykæmi, kramper, hepatisk encefalopati og pludselig spædbarnsdød hos nyfødte [18] .

CPT1 er også forbundet med type 2 diabetes mellitus og insulinresistens .

Ny forskning præsenteret på 2015-kongressen for den europæiske komité for behandling og forskning af multipel sklerose (ECTRIMS) tyder på, at CPT1 også kan spille en rolle i patologien af ​​multipel sklerose (MS) [19] . Forskerne fandt ud af, at mutationer i CPT1-genet ser ud til at beskytte mod multipel sklerose i visse populationer. Denne hypotese er, at en stigning i lipidmetabolismen kan føre til demyelinisering af nerveceller (destruktion af myelin ), og derved tillade et autoimmunt angreb på nerveceller. John Dirk Nyland PhD og kolleger ved Aalborg Universitet i Danmark har leveret data, der viser, at i dyremodeller af MS er CPT1 blokeret af et molekyle kaldet etomoxir, som højst sandsynligt kan lindre symptomerne på sygdommen [20] . Forskerne søger i øjeblikket støtte til et klinisk studie i syge mennesker.

Interaktioner med andre proteiner

CPT1 er kendt for at interagere med en række proteiner, herunder dem fra NDUF- familien , PKC1 og ENO1 [21] .

Knockout CPT1A ved shRNA - biblioteksscreening hæmmer HIV-1- replikation i dyrkede Jurkat T-celler [22] .

Noter

  1. Jogl G., Tong L. Krystalstruktur af carnitine acetyltransferase og implikationer for den katalytiske mekanisme og fedtsyretransport  // Celle  :  journal. - Cell Press , 2003. - Januar ( vol. 112 , nr. 1 ). - S. 113-122 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)01228-X . — PMID 12526798 .
  2. van der Leij FR, Huijkman NC, Boomsma C., Kuipers JR, Bartelds B.  Genomics of the human carnitine acyltransferase geners  // Molecular Genetics and Metabolism : journal. - 2000. - Vol. 71 , nr. 1-2 . - S. 139-153 . - doi : 10.1006/mgme.2000.3055 . — PMID 11001805 .
  3. Bonnefont JP, Djouadi F., Prip-Buus C., Gobin S., Munnich A., Bastin J. Carnitine palmitoyltransferaser 1 og 2: biokemiske, molekylære og medicinske aspekter   // Molecular Aspects of Medicine : journal. - 2004. - Bd. 25 , nr. 5-6 . - S. 495-520 . - doi : 10.1016/j.mam.2004.06.004 . — PMID 15363638 .
  4. 1 2 Yamazaki N., Yamanaka Y., Hashimoto Y., Shinohara Y., Shima A., Terada H. Strukturelle træk ved genet, der koder for human muskeltype carnitin palmitoyltransferase I  //  FEBS Letters : journal. - 1997. - Juni ( bd. 409 , nr. 3 ). - S. 401-406 . - doi : 10.1016/S0014-5793(97)00561-9 . — PMID 9224698 .
  5. 1 2 Brown NF, Hill JK, Esser V., Kirkland JL, Corkey BE, Foster DW, McGarry JD Hvide museadipocytter og 3T3-L1-celler viser et unormalt mønster af carnitin palmitoyltransferase (CPT) I isoform ekspression under differentiering. Inter-tissue og inter-species ekspression af CPT I og CPT II enzymer  //  The Biochemical Journal : journal. - 1997. - Oktober ( bind 327 (Pt 1) ). - S. 225-231 . — PMID 9355756 .
  6. 1 2 Lee J., Ellis JM, Wolfgang MJ Fedtfedtsyreoxidation er nødvendig for termogenese og forstærker oxidativ stress-induceret  inflammation //  Cellerapporter : journal. - 2015. - Januar ( bind 10 , nr. 2 ). - S. 266-279 . - doi : 10.1016/j.celrep.2014.12.023 . — PMID 25578732 .
  7. Price N., van der Leij F., Jackson V., Corstorphine C., Thomson R., Sorensen A., Zammit V. Et nyt hjerneudtrykt protein relateret til carnitin palmitoyltransferase I  // Genomics  :  journal . - Academic Press , 2002. - Oktober ( bind 80 , nr. 4 ). - S. 433-442 . - doi : 10.1006/geno.2002.6845 . — PMID 12376098 .
  8. Lavrentyev EN, Matta SG, Cook GA Ekspression af tre carnitin palmitoyltransferase-I isoformer i 10 regioner af rottehjernen under fodring, faste og diabetes  //  Biokemisk og biofysisk forskningskommunikation : journal. - 2004. - Februar ( bind 315 , nr. 1 ). - S. 174-178 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.040 . — PMID 15013442 .
  9. Morillas M., López-Viñas E., Valencia A., Serra D., Gómez-Puertas P., Hegardt FG, Asins G. Strukturel model af carnitin palmitoyltransferase I baseret på carnitine acetyltransferase krystal   The// : journal. - 2004. - Maj ( vol. 379 , nr. Pt 3 ). - s. 777-784 . - doi : 10.1042/BJ20031373 . — PMID 14711372 .
  10. Woldegiorgis G., Dai J., Arvidson D. Structure-Function Studies with the Mitochondrial Carnitine Palmitoyltransferases I and II  //  Monatshefte fur Chemie : journal. - 2005. - Bd. 136 , nr. 8 . - S. 1325-1340 . - doi : 10.1007/s00706-005-0334-7 .
  11. López-Viñas E., Bentebibel A., Gurunathan C., Morillas M., de Arriaga D., Serra D., Asins G., Hegardt FG, Gómez-Puertas P. Definition ved funktionel og strukturel analyse af to malonyl- CoA-steder i carnitin palmitoyltransferase 1A  (engelsk)  // The Journal of Biological Chemistry  : tidsskrift. - 2007. - Juni ( bind 282 , nr. 25 ). - P. 18212-18224 . - doi : 10.1074/jbc.M700885200 . — PMID 17452323 .
  12. Liu H., Zheng G., Treber M., Dai J., Woldegiorgis G. Cystein-scanning mutagenese af muskel carnitin palmitoyltransferase I afslører en enkelt cysteinrest (Cys-305) er vigtig for  katalyse  The//  : tidsskrift. - 2005. - Februar ( bind 280 , nr. 6 ). - P. 4524-4531 . - doi : 10.1074/jbc.M400893200 . — PMID 15579906 .
  13. Berg JM, Tymoczo JL, Stryer L, "Biochemistry", 6. udgave 2007
  14. Jogl G., Hsiao YS, Tong L. Structure and function of carnitine acyltransferases  //  Annals of the New York Academy of Sciences : journal. - 2004. - November ( bind 1033 , nr. 1 ). - S. 17-29 . - doi : 10.1196/annals.1320.002 . — PMID 15591000 .
  15. Shi J., Zhu H., Arvidson DN, Woldegiorgis G. De første 28 N-terminale aminosyrerester af human hjertemuskel carnitin palmitoyltransferase I er essentielle for malonyl CoA-følsomhed og højaffinitetsbinding  //  Biochemistry : journal. - 2000. - Februar ( bind 39 , nr. 4 ). - s. 712-717 . doi : 10.1021 / bi9918700 . — PMID 10651636 .
  16. Abu-Elheiga L., Oh W., Kordari P., Wakil SJ Acetyl-CoA carboxylase 2 mutant mus er beskyttet mod fedme og diabetes induceret af diæter med højt fedtindhold/højt kulhydratindhold   // Proceedings of the National Academy of Sciences of Amerikas Forenede Stater  : tidsskrift. - 2003. - September ( bind 100 , nr. 18 ). - S. 10207-10212 . - doi : 10.1073/pnas.1733877100 . — PMID 12920182 .
  17. Ogawa E., Kanazawa M., Yamamoto S., Ohtsuka S., Ogawa A., Ohtake A., Takayanagi M., Kohno Y. Ekspressionsanalyse af to mutationer i carnitin palmitoyltransferase IA-mangel  //  Journal of Human Genetics : journal. - 2002. - Bd. 47 , nr. 7 . - s. 342-347 . - doi : 10.1007/s100380200047 . — PMID 12111367 .
  18. Collins SA, Sinclair G., McIntosh S., Bamforth F., Thompson R., Sobol I., Osborne G., Corriveau A., Santos M., Hanley B., Greenberg CR, Vallance H., Arbor L. Carnitin palmitoyltransferase 1A (CPT1A) P479L prævalens hos levende nyfødte i Yukon, Northwest Territories og Nunavut  //  Molekylær genetik og metabolisme : journal. - 2010. - Bd. 101 , nr. 2-3 . - S. 200-204 . - doi : 10.1016/j.ymgme.2010.07.013 . — PMID 20696606 .
  19. Wilner, AN (1. december 2015), Exploring a New Mechanism of Action for MS Drugs, An Expert Interview With John Dirk Nieland, PhD , Medscape , < http://www.medscape.com/viewarticle/854957 > . Hentet 3. december 2015. Arkiveret 25. maj 2016 på Wayback Machine 
  20. Nieland JD Nieland JG Mørkholt AS Bolther L Nielsen S (7.–10. oktober 2015), Abstrakt P1497. CPT1a-mutation viser vejen for ny medicin til behandling af multipel sklerose, 31. kongres i European Committee for the Treatment and Research in Multiple Sclerosis (ECTRIMS), Barcelona, ​​​​Spanien, Final Program 
  21. Havugimana PC, Hart GT, Nepusz T., Yang H., Turinsky AL, Li Z., Wang PI, Boutz DR, Fong V., Phanse S., Babu M., Craig SA, Hu P., Wan C. , Vlasblom J., Dar VU, Bezginov A., Clark GW, Wu GC, Wodak SJ, Tillier ER, Paccanaro A., Marcotte EM, Emili A. Acensus af humane opløselige proteinkomplekser  (engelsk)  // Cell . - Cell Press , 2012. - August ( vol. 150 , nr. 5 ). - S. 1068-1081 . - doi : 10.1016/j.cell.2012.08.011 . — PMID 22939629 .
  22. Yeung ML, Houzet L., Yedavalli VS, Jang KT En genomomfattende kort hårnåle-RNA-screening af jurkat-T-celler for humane proteiner, der bidrager til produktiv HIV-1-replikation  // The  Journal of Biological Chemistry  : tidsskrift. - 2009. - Juli ( bd. 284 , nr. 29 ). - P. 19463-19473 . - doi : 10.1074/jbc.M109.010033 . — PMID 19460752 .

Se også