Arenavirus
Arenavira [2] ( lat. Arenaviridae , fra andet græsk arenosa -sand) er en familie af RNA- vira . Familiens navn blev givet i henhold til virionets struktur - som så at sige er drysset med sand. Vira i troperne , dødelighed efter infektion - over 20%.
Konventionelt klassificeres arenavirus i New World og Old World virus . Blandt de fire vira i den gamle verden skelnes lymfocytisk choriomeningitis-virus , der findes i gnavere rundt om i verden, såvel som Lassa-febervirus - op til 15.000 tilfælde i Vestafrika , dødelighed op til 30%. New World virus findes i rotter i Sydamerika .
Virion
Virionet er dækket med en membran indeholdende lipider , har store pigge på overfladen. Indeholder to nukleokapsider . Morfologien af virioner er multipel, diameteren er omkring 62-200 nm, i gennemsnit omkring 110 nm.
Genom
Genomisk enkeltstrenget (-)RNA indeholder to åbne læserammer:
- (S) - 3336-3535 nukleotider, koder for to polypeptider, to læserammer - NP - nukleocapsid; GPC - skåret i GP1, GP2 - to glykoproteiner
- (L) - 7200 nukleotider, koder for to proteiner - RNA-polymerase og et Z-protein indeholdende en Zn-bindende finger
Replikering
Genomisk (-)RNA replikerer til (+)antigenomisk mRNA, som translateres.
Diagnostik
- ELISA mod IgG, herunder IgM, og i den akutte fase.
- PCR - under infektion, den mest pålidelige metode.
Klassifikation
I 2014 blev en ny slægt Reptarenavirus inkluderet i familien af arenavirus [3] , og slægten Arenavirus lokaliseret der blev omdøbt til Mammarenavirus sammen med alle dens arter [4] . Ifølge International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) omfatter familien i marts 2017 2 slægter [5] :
- Mammarenavirus (33 arter)
- Reptarenavirus (3 arter)
Noter
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lærebog for medicinstuderende / Red. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Lægeinformationsstyrelsen, 2003. - S. 131-132. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Opret en ny slægt, Reptarenavirus , omfattende tre nye arter i familien Arenaviridae : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2014.011a-dV. - 2014. - 12 s.
- ↑ Omdøb en (1) slægt og femogtyve (25) arter i familien Arenaviridae : [ eng. ] // ICTVonline. — Kode tildelt: 2014.012aV. - 2014. - 6 s.
- ↑ Taxonomy of Viruses på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Få adgang: 26. marts 2017) .
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Liste over mikroorganismer, toksiner, udstyr og teknologier, der er underlagt eksportkontrol : [godkendt. Dekret fra præsidenten for Den Russiske Føderation af 20. august 2007 nr. 1083]: embedsmand. tekst: tilgået 1. juni 2016
Klassificering af vira ifølge Baltimore |
---|
DNA | I: vira |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Præplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Uklassificeret | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
---|
Uklassificeret |
- familie : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Slægter : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-vira |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-vira |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Uklassificeret |
- Familier : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FRA | |
---|