TRNA

Transfer RNA, tRNA [1]  er en ribonukleinsyre, der sikrer interaktionen mellem aminosyren , ribosomet og messenger RNA (mRNA) under translation . Den har en typisk længde på 73 til 93 nukleotider og en størrelse på omkring 5 nm. tRNA, der er kovalent bundet til aminosyreresten, er direkte involveret i væksten af ​​polypeptidkæden , binder sig specifikt til mRNA - kodonet og tilvejebringer konformationen af ​​komplekset, der er nødvendigt for dannelsen af ​​en ny peptidbinding .

Hver proteinogen aminosyre i en celle har sit eget tRNA (en eller flere).

Struktur af tRNA

Den sekundære struktur af tRNA er normalt visualiseret som et kløverblad med fire arme. Længere tRNA'er har en kort yderligere femte arm kaldet den variable hårnål. I tredimensionelt rum er tRNA-molekylet foldet til en L-formet struktur på grund af den koaksiale pålægning af helixer, som tillader tRNA at passe ind i P-stedet og A-stedet af ribosomer [2] . Længden af ​​armene og diameteren af ​​løkkerne i den sekundære fold af tRNA-molekylet varierer fra art til art [2] [3] . Hovedkomponenterne i tRNA-molekylet er følgende strukturer og funktionelle grupper:

• 5'-ende-phosphatgruppe. De fleste tRNA'er bærer en guanylat (fG) rest i 5'-enden.
• Acceptorarm med acceptorstamme og CCA-hale. Acceptorstammen er dannet af to komplementært forbundne terminale dele af tRNA-molekylet, den består af 7-9 basepar. Acceptorstammen kan indeholde andre basepar end kanoniske Watson-Crick basepar, såsom et AG-par. 3'-enden af ​​acceptorarmen er noget længere, den danner en enkeltstrenget region, som ender med en CCA-sekvens med en fri OH-gruppe . Aminoacyl-tRNA-syntetase binder den transporterede aminosyre til dette formål . Aminosyren indlæst på tRNA'et af aminoacyl-tRNA-syntetase er kovalent bundet til 3'-hydroxylgruppen i den sidste adenosin. Den terminale CCA-sekvens er vigtig for tRNA-genkendelse af enzymer og translation [2] [4] [5] [6] [7] [8] . I nogle prokaryoter er CCA-sekvensen til stede i gensekvensen, men i langt de fleste tilfælde tilføjes den terminale CCA-sekvens under tRNA-behandling og er derfor fraværende i tRNA-genet [9] .
• D-armen har en stilk 4 til 6 basepar lang, der ender i en løkke, der ofte indeholder dihydrouridin [2]
• Antikodonarmen har en stilk på 5 bp lang, for enden af ​​hvilken er en løkke med et antikodon [2] .
• TΨC-armen har en stilk 4-5 bp lang, og en løkke for enden af ​​armen indeholder typisk ribothymidin T og   pseudouridin Ψ [2] .

D- og TΨC-armene giver vigtige interaktioner i foldningen af ​​tRNA-molekyler; TΨC-armen er involveret i interaktionen med rRNA'et fra den store ribosom-underenhed.

tRNA-behandling

tRNA'er syntetiseres af konventionel RNA-polymerase i tilfælde af prokaryoter og af RNA-polymerase III i tilfælde af eukaryoter . Transkriptioner af tRNA - gener gennemgår flertrinsbehandling , hvilket i sidste ende fører til dannelsen af ​​en rumlig struktur, der er typisk for tRNA . tRNA-behandling omfatter 5 nøgletrin [10] :

• fjernelse af 5'-ledernukleotidsekvensen;
• fjernelse af den 3'-terminale sekvens;
• tilføjelse af en CCA-sekvens ved 3'-enden;
• excision af introner (i eukaryoter og archaea );
• modifikationer af individuelle nukleotider.

Efter afslutning af modning skal eukaryote tRNA'er overføres til cytoplasmaet , hvor de deltager i proteinbiosyntesen. Transport af tRNA udføres langs en Ran - afhængig vej med deltagelse af transportfaktoren eksportin t ( Los1 i gær ), som genkender den karakteristiske sekundære og tertiære struktur af modent tRNA: korte dobbeltstrengede sektioner og korrekt behandlet 5'- og 3'-ender. Denne mekanisme sikrer, at kun modne tRNA'er eksporteres fra kernen. Formentlig kan eksportin 5 være et hjælpeprotein, der er i stand til at transportere tRNA gennem nukleare porer sammen med eksportin t [11] .

Se også

• Protein biosyntese

Noter

1. ↑ Ribosomet kunne være en bro mellem præcellulært og cellulært liv . Hentet 1. marts 2015. Arkiveret fra originalen 1. marts 2015. (ubestemt)
2. ↑ 1 2 3 4 5 6 Itoh Y, Sekine S, Suetsugu S, Yokoyama S (juli 2013). "Tertiær struktur af bakteriel selenocystein tRNA" . Nukleinsyreforskning . 41 (13): 6729-6738. doi : 10.1093/nar/ gkt321 . PMC 3711452 . PMID 23649835 .  
3. ↑ Goodenbour JM, Pan T (29. oktober 2006). "Mangfoldighed af tRNA-gener i eukaryoter" . Nukleinsyreforskning . 34 (21): 6137-6146. doi : 10.1093/nar/ gkl725 . PMC 1693877 . PMID 17088292 .  
4. ↑ Jahn M, Rogers MJ, Söll D (juli 1991). "Antikodon- og acceptorstammenukleotider i tRNA(Gln) er vigtige genkendelseselementer for E. coli glutaminyl-tRNA-syntetase." natur . 352 (6332): 258-260. Bibcode : 1991Natur.352..258J . DOI : 10.1038/352258a0 . PMID  1857423 .
5. ↑ O.-Ya. L. Beish. Medicinsk biologi. - Vitebsk: Urajay, 2000. - S. 22.
6. ↑ Ibba M, Soll D (juni 2000). "Aminoacyl-tRNA syntese". Årlig gennemgang af biokemi . 69 (1): 617-650. DOI : 10.1146/annurev.biochem.69.1.617 . PMID  10966471 .
7. ↑ Sprinzl M, Cramer F (1979). "CCA-enden af ​​tRNA og dens rolle i proteinbiosyntese". Fremskridt inden for nukleinsyreforskning og molekylærbiologi . 22 :1-69. DOI : 10.1016/s0079-6603(08)60798-9 . ISBN  978-0-12-540022-0 . PMID  392600 .
8. ↑ Green R, Noller HF (1997). Ribosomer og oversættelse . Årlig gennemgang af biokemi . 66 : 679-716. DOI : 10.1146/annurev.biochem.66.1.679 . PMID  9242921 .
9. ↑ Aebi M, Kirchner G, Chen JY, Vijayraghavan U, Jacobson A, Martin NC, Abelson J, et al. (september 1990). "Isolering af en temperaturfølsom mutant med en ændret tRNA-nukleotidyltransferase og kloning af genet, der koder for tRNA-nukleotidyltransferase i gæren Saccharomyces cerevisiae." Journal of Biological Chemistry . 265 (27): 16216-16220. DOI : 10.1016/S0021-9258(17)46210-7 . PMID2204621  . _
10. ↑ Hopper AK, Phizicky EM tRNA overføres til rampelyset  // Genes Dev.. - 2003. - Vol. 17 , no. 2 . - S. 162-180 . - doi : 10.1101/gad.1049103 . — PMID 12533506 . Arkiveret fra originalen den 19. september 2017.
11. ↑ Köhler A., ​​​​Hurt E. Eksport af RNA fra kernen til cytoplasmaet // Nat. Rev. Mol. Cell Biol .. - 2007. - T. 8 , no. 10 . - S. 761-773 . - doi : 10.1038/nrm2255 . — PMID 17786152 .

Links

• Database over tRNA'er fra genomerne af forskellige organismer  (engelsk)

Ordbøger og encyklopædier	Flot dansk Stor russer Britannica (online) Brockhaus
I bibliografiske kataloger	NKC : ph116389