5S rRNA (5S ribosomal ribonukleinsyre) er en strukturel og funktionel komponent af den store underenhed af ribosomet , som fungerer som et stillads for ribosomale proteiner og er en katalytisk nøglekomponent i peptidyltransferase. Det blev fundet i næsten alle ribosomer ( bakterier , archaea og eukaryoter ), med undtagelse af svampemitokondrier , højere dyr og de fleste protister . Betegnelsen 5S skyldes sedimentationsfaktoren på 5 Swedberg-enheder i ultracentrifugering , refererer til sedimentationshastigheden af et molekyle i en ultracentrifuge, som måles i Svedberg- enheder(S). Den er ca. 120 nukleotider lang og har en molekylvægt på 40 kDa . [1] .
Den sekundære struktur af 5S rRNA består af fem helixer (I-V), to hårnålesløjfer (C og D), to indre løkker (B og E) og et hængselområde (løkke A), der danner en tre-helix-forbindelse [1] .
Oprindeligt mente man, at 5S rRNA kun spillede en strukturel rolle som et stillads for ribosomale proteiner, men for nylig har det også vist sig at være en vigtig katalytisk komponent i peptidyltransferasecentret i ribosomet. I Escherichia coli reducerer deletioner af 5S rRNA-genet proteinsyntesehastigheden. Der er også en række interaktioner mellem 5S rRNA og L5 ribosomale proteiner. I eukaryote celler binder det L5 ribosomale protein og stabiliserer 5S rRNA til dannelse af en præ-ribosomal ribonukleoproteinpartikel (RNP), der findes i både cytosolen og kernen. L5-mangel forhindrer 5S rRNA-transport ind i kernen og fører til reduceret ribosomsamling. Der er kun én direkte interaktion mellem 5S RNA y domænet og den 38 23S ribosomale RNA helix [2] .