Guide RNA
Guide-RNA, gRNA , er RNA'er, der medierer indsættelsen af uridinnukleotider i mRNA i trypanosomer under RNA-redigeringsprocessen . [1] [2] [3] gRNA'er kodes af forskellige områder af kinetoplastgenomet . [fire]
Virkningsmekanisme
5'-enden af gRNA'et hybridiserer til en kort region af uredigeret præ-mRNA kaldet ankersekvensen, mens 3'-enden af sådanne RNA'er er redigeringsskabelonen. Mange gRNA'er hybridiserer ikke til ankersekvensen af det primære transkript, men hybridiserer til det delvist redigerede transkript. Derfor begynder trypanosom præ-mRNA-redigering sædvanligvis nær 3'-enden og skrider frem til 5'-enden i en iterativ proces, der kræver flere forskellige gRNA'er, der sekventielt binder til ankersekvensen af de delvist redigerede regioner. Det er stadig ikke helt klart, hvorfor trypanosom-kinetoplaster bruger en så kompliceret mekanisme til mRNA- dannelse . Funktionerne af mange gRNA'er er ikke blevet undersøgt. [5]
Noter
- ↑ Stuart KD, Schnaufer A, Ernst NL, Panigrahi AK. Kompleks håndtering: RNA-redigering i trypanosomer // Trends Biochem Sci. - 2005. - T. 30 , nr. 2 . - S. 97-105 .
- ↑ Madison-Antenucci S, Grams J, Hajduk SL. Redigeringsmaskiner: kompleksiteten af trypanosom-RNA-redigering // Cell. - 2002. - T. 108 , nr. 4 . - S. 435-438 .
- ↑ Stuart K, Allen TE, Kable ML, Lawson S. Kinetoplastid RNA-redigering: komplekser og katalysatorer // Curr Opin Chem Biol. - 1997. - T. 1 , nr. 3 . - S. 340-346 .
- ↑ Uliel S, Liang XH, Unger R, Michaeli S. Små nukleolære RNA'er, der styrer modifikation i trypanosomatider: repertoire, mål, genomorganisation og unikke funktioner // Int J Parasitol. - 2004. - T. 34 , nr. 4 . - S. 445-454 .
- ↑ Stuart K, Panigrahi AK. RNA-redigering: kompleksitet og komplikationer // Mol Microbiol. - 2002. - T. 45 , nr. 3 . - S. 591-596 .
Litteratur
- Gurbachan S. Miglani. RNA'er: deres behandling og funktion // Avanceret genetik . - CRC Press, 2002. - S. 257-259. — 665 s. — ISBN 0849324254 .
- Bruce Alberts. RNA-redigering kan ændre betydningen af RNA-meddelelsen // Molecular Biology of the Cell . - Garland Science, 2007. - S. 483-484. — 1601 s. — ISBN 0815341113 .
- Simpson L, Thiemann OH, Savill NJ, Alfonzo JD, Maslov DA. Udvikling af RNA-redigering i trypanosommitokondrier // Proc Natl Acad Sci US A. - 2000. - V. 97 , nr. 13 . - S. 6986-6993 . — Gennemgangsartikel om udviklingen af RNA-redigering i Trypanos på engelsk, frit tilgængelig
Se også
RNA redigering