Ikke-kodende RNA

Ikke-kodende RNA (ikke-kodende RNA, ncRNA) - RNA- molekyler , der ikke oversættes til proteiner . Det tidligere brugte synonym  - "lille RNA" (smRNA, lille RNA) - er gået ud af brug, da nogle ikke-kodende RNA'er kan være meget store, for eksempel Xist .

Den DNA-sekvens , hvorpå ikke-kodende RNA'er transskriberes, omtales ofte som RNA -genet .

Ikke-kodende RNA'er inkluderer [1] :

• overføre RNA (tRNA),
• ribosomalt RNA (rRNA),
• lille nuklear RNA (snRNA, snRNA),
• lille nukleolært RNA (snoRNA, snoRNA),
• antisense RNA (aRNA),
• mikroRNA (miRNA),
• lille interfererende RNA (siRNA),
• piRNA (piwiRNA, piRNA),
• langt ikke-kodende RNA  (lncRNA) - Xist , Evf , Air , CTN , PINK , TUG1 .

Nylige transkriptomiske teknologier ( RNA-sekventering ) og DNA-mikroarray -teknikker har identificeret mere end 30.000 lange ikke-kodende RNA'er ( langt ncRNA  ) . Det antages, at de "styrer" den selektive landing af polycomb-repressorkomplekser på visse kromatinregioner såvel som direkte DNA-methyltransferaser og muligvis regulerer selektiv DNA-methylering [2] [3] [4] [5] . Desuden, som det viste sig, udgør de en betydelig del (~20% af det samlede antal lange ikke-kodende RNA'er i pattedyrs genomer ), de såkaldte divergerende dsnRNA'er, som transskriberes i den modsatte retning til naboproteinkodende gener , regulerer transkriptionen af ​​disse tilstødende nabogener [6] .

Noter

1. ↑ Lee T.I. , Young RA Transkriptionel regulering og dens fejlregulering ved sygdom.  (engelsk)  // Cell. - 2013. - Bd. 152, nr. 6 . - P. 1237-1251. - doi : 10.1016/j.cell.2013.02.014 . — PMID 23498934 .
2. ↑ Merry, CR, Forrest, ME, Sabres, JN, Beard, L., Gao, XH, Hatzoglou, M., ... & Khalil, AM DNMT1-associerede lange ikke-kodende RNA'er regulerer global genekspression og DNA-methylering i tyktarmskræft // Human molekylær genetik. - 2015. - T. 24 , nr. 21 . - S. 6240-6253 . doi : 10.1093 / hmg/ddv343 .
3. ↑ Håndtering af methylering . Hentet 19. juli 2022. Arkiveret fra originalen 28. november 2016. (ubestemt)
4. ↑ Daniel Holoch & Danesh Moazed. RNA-medieret epigenetisk regulering af genekspression // Naturanmeldelser. genetik. - 2015. - T. 16 , nr. 2 . — s. 71–84 . - doi : 10.1038/nrg3863 . — PMID 25554358 .
5. ↑ Jeffrey J. Quinn & Howard Y. Chang. Unikke træk ved lang ikke-kodende RNA-biogenese og funktion // Naturanmeldelser. genetik. - 2015. - T. 17 , nr. 1 . — s. 47–62 . - doi : 10.1038/nrg.2015.10 . — PMID 26666209 .
6. ↑ Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu, et al., & Xiaohua Shen. Divergente lncRNA'er regulerer genekspression og afstamningsdifferentiering i pluripotente celler // Cellestamcelle. - 2016. - doi : 10.1016/j.stem.2016.01.024 .

Links

• Ishitani R, Yokoyama S, Nureki O. Struktur, dynamik og funktion af RNA-modifikationsenzymer // Curr Opin Struct Biol. - 2008. - T. 18 , nr. 3 . - S. 330-339 .
• Yeung ML, Benkirane M, Jang KT. Små ikke-kodende RNA'er, pattedyrceller og vira: regulatoriske interaktioner?  // Retrovirologi. - 2007. - T. 4 . - S. 74 .

Se også

• RNA-sekventering
• Ultrakonservative elementer af DNA
• Lange og korte ikke-kodende RNA'er (lncRNA og miRNA), der interagerer med polycomb-repressorkomplekser.