Histon deacetylase 2

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 3. juni 2015; checks kræver 6 redigeringer .
Histon deacetylase 2
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolHDAC2  ; HD2; RPD3; YAF1
Eksterne ID'erOMIM:  605164 MGI :  1097691 HomoloGene :  68187 ChEMBL : 1937 GeneCards : HDAC2-gen
EF-nummer3.5.1.98
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez306615182
EnsembleENSG00000196591ENSMUSG00000019777
UniProtQ92769P70288
RefSeq (mRNA)NM_001527NM_008229
RefSeq (protein)NP_001518NP_032255
Locus (UCSC)Chr 6:
114,25 – 114,33 Mb
Chr 10:
36,97 - 37 Mb
Søg i PubMed[en][2]

Histon deacetylase 2  er et enzym fra histon deacetylase familien kodet i mennesker af HDAC2 genet . [en]

Funktion

HDAC2 - genproduktet tilhører familien af ​​histon - deacetylaser . Histon-deacetylaser virker som en del af store multiproteinkomplekser og er ansvarlige for deacetyleringen af ​​lysinrester ved den N-terminale region af kernehistoner (H2A, H2B, H3 og H4). Dette protein danner også transkriptionelle repressorkomplekser ved at binde til forskellige proteiner, herunder YY1, en af ​​pattedyrs transkriptionsfaktorer . Histon deacetylase 2 spiller en vigtig rolle i reguleringen af ​​transkription , cellecyklus og udvikling. [2]

Interaktioner

Histon deacetylase 2 interagerer med:

Noter

  1. Betz R., Gray SG, Ekström C., Larsson C., Ekström TJ Human histon deacetylase 2, HDAC2 (Human RPD3), er lokaliseret til 6q21 ved radiation hybrid mapping  // Genomics  :  journal. - Academic Press , 1998. - December ( vol. 52 , nr. 2 ). - S. 245-246 . doi : 10.1006/ geno.1998.5435 . — PMID 9782097 .
  2. Entrez-gen: HDAC2-histondeacetylase 2 .
  3. 1 2 Schmidt DR, Schreiber SL Molekylær association mellem ATR og to komponenter i nukleosomomdannelses- og deacetyleringskomplekset, HDAC2 og CHD4  //  Biochemistry: journal. — Bd. 38 , nr. 44 . - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
  4. 1 2 3 4 Yoon YM, Baek KH, Jeong SJ, Shin HJ, Ha GH, Jeon AH, Hwang SG, Chun JS, Lee CW WD-gentagelsesholdige mitotiske checkpoint-proteiner fungerer som transkriptionelle repressorer under   interfase // FEBS Lett. : journal. — Bd. 575 , nr. 1-3 . - S. 23-9 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.07.089 . — PMID 15388328 .
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Et kandidat X-bundet mental retarderingsgen er en komponent i en ny familie af histon-deacetylase-holdige komplekser   // J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  6. 1 2 3 4 5 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Chromatindeacetylering af et ATP-afhængigt nukleosomomdannelseskompleks  //  Nature: journal. — Bd. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  7. 1 2 Hakimi MA, Bochar DA, Schmiesing JA, Dong Y., Barak OG, Speicher DW, Yokomori K., Shiekhattar R. A chromatin remodeling complex that loads cohesin onto human chromosomes  //  Nature : journal. — Bd. 418 , nr. 6901 . - S. 994-998 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
  8. Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB DNMT1 binder HDAC2 og en ny co-repressor, DMAP1, for at danne et kompleks ved replikationsfoci   // Nat . Genet.  : journal. — Bd. 25 , nr. 3 . - S. 269-277 . - doi : 10.1038/77023 . — PMID 10888872 .
  9. 1 2 3 van der Vlag J., Otte AP Transkriptionel repression medieret af det humane polycomb-gruppeprotein EED involverer histon-deacetylering   // Nat . Genet.  : journal. — Bd. 23 , nr. 4 . - S. 474-478 . - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
  10. Yang WM, Yao YL, Seto E. Det FK506-bindende protein 25 associeres funktionelt med histondeacetylaser og med transkriptionsfaktor YY1  // EMBO  J. : journal. — Bd. 20 , nej. 17 . - P. 4814-4825 . - doi : 10.1093/emboj/20.17.4814 . — PMID 11532945 .
  11. Trevejskontrol af føtal hjertecelleproliferation kunne hjælpe med at regenerere hjerteceller  (7. oktober 2010). Arkiveret fra originalen den 3. januar 2012. Hentet 9. april 2015.
  12. Wen YD, Cress WD, Roy AL, Seto E. Histon deacetylase 3 binder til og regulerer den multifunktionelle transkriptionsfaktor TFII-I  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 278 , nr. 3 . - S. 1841-1847 . - doi : 10.1074/jbc.M206528200 . — PMID 12393887 .
  13. 1 2 Fischer DD, Cai R., Bhatia U., Asselbergs FA, Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Isolation and characterization of a novel class II histon deacetylase , HDAC10  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 277 , nr. 8 . - P. 6656-6666 . - doi : 10.1074/jbc.M108055200 . — PMID 11739383 .
  14. 1 2 3 Yao YL, Yang WM De metastase-associerede proteiner 1 og 2 danner distinkte proteinkomplekser med histon-deacetylase-aktivitet  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  15. 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Et kerne-BRAF35-kompleks indeholdende histon-deacetylase medierer undertrykkelse af neuronspecifikke gener  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidsskrift. — Bd. 99 , nr. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
  16. 1 2 Johnson CA, White DA, Lavender JS, O'Neill LP, Turner BM Humane klasse I histondeacetylasekomplekser viser øget katalytisk aktivitet i nærvær af ATP og co-immunpræcipitat med det ATP-afhængige chaperonprotein  Hsp70  // J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 277 , nr. 11 . - P. 9590-9597 . - doi : 10.1074/jbc.M107942200 . — PMID 11777905 .
  17. Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Enzymatisk aktivitet forbundet med klasse II HDAC'er er afhængig af et multiproteinkompleks indeholdende HDAC3 og SMRT/N-  CoR  // Mol. celle : journal. — Bd. 9 , nr. 1 . - S. 45-57 . - doi : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
  18. Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7-histondeacetylaseaktivitet er forbundet med HDAC3 in vivo  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 276 , nr. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
  19. Ashburner BP, Westerheide SD, Baldwin AS p65 (RelA) underenheden af ​​NF-kappaB interagerer med histon deacetylase (HDAC) corepressorerne HDAC1 og HDAC2 for negativt at regulere genekspression   // Mol . celle. Biol. : journal. — Bd. 21 , nr. 20 . - P. 7065-7077 . - doi : 10.1128/MCB.21.20.7065-7077.2001 . — PMID 11564889 .
  20. 1 2 3 4 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analyse af NuRD-underenhederne afslører et histon-deacetylase-kernekompleks og en forbindelse med DNA-methylering   // Genes Dev .  : journal. — Bd. 13 , nr. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  21. Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL En rolle for histon-deacetylase-aktivitet i HDAC1-medieret transkriptionel undertrykkelse  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidsskrift. — Bd. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  22. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histon-deacetylaser og SAP18, et nyt polypeptid, er komponenter i et humant Sin3-kompleks  (engelsk)  // Cell  : journal. — Celle Tryk på . — Bd. 89 , nr. 3 . - s. 357-364 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  23. Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Human Sin3 deacetylase og trithorax-relateret Set1/Ash2 histon H3-K4 methyltransferase er bundet sammen selektivt af celleproliferationsfaktoren HCF-   1 // Genes Dev.  : journal. — Bd. 17 , nr. 7 . - S. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  24. Mazumdar A., ​​Wang RA, Mishra SK, Adam L., Bagheri-Yarmand R., Mandal M., Vadlamudi RK, Kumar R. Transkriptionel undertrykkelse af østrogenreceptor ved metastase-associeret protein 1   corepressor // Nat. Celle biol.  : journal. — Bd. 3 , nr. 1 . - S. 30-7 . - doi : 10.1038/35050532 . — PMID 11146623 .
  25. 1 2 Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN Histon-deacetylaser forbundet med mSin3-corepressoren medierer gal transkriptionel undertrykkelse  (engelsk)  // Cell  : journal. — Celle Tryk på . — Bd. 89 , nr. 3 . - S. 349-356 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  26. Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, Jansen JF, Vermeulen M., Stunnenberg HG, Vuister GW The Mad1-Sin3B interaction involves a novel spiral fold   // Nat . Struktur. Biol.  : journal. — Bd. 7 , nr. 12 . - S. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
  27. Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. To højt beslægtede p66-proteiner omfatter en ny familie af potente transkriptionelle repressorer, der interagerer med MBD2 og MBD3  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 277 , nr. 43 . - P. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
  28. Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 er en transkriptionel repressor, der tilhører MeCP1-histondeacetylase-komplekset  . )  / / Nat. Genet.  : journal. — Bd. 23 , nr. 1 . - S. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  29. Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Karakterisering af BHC80 i BRAF-HDAC-kompleks, involveret i neuronspecifik genrepression   // Biochem . Biofys. Res. commun. : journal. — Bd. 322 , nr. 2 . - S. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
  30. Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. Proteinet phosphatase-1 (PP1) regulator, nuklear inhibitor af PP1 (NIPP1), interagerer med polycomb gruppe protein, embryonal ektoderm udvikling (EED), og fungerer som en transkriptionel repressor  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 278 , nr. 33 . - P. 30677-30685 . - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
  31. 1 2 Zhang Y., Dufau ML Dobbelte mekanismer til regulering af transkription af luteiniserende hormonreceptorgen af ​​nukleære forældreløse receptorer og histon-deacetylasekomplekser  (engelsk)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : journal. — Bd. 85 , nr. 2-5 . - S. 401-414 . - doi : 10.1016/s0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  32. 1 2 3 Zhang Y., Dufau ML Silencing af transkription af det humane luteiniserende hormon-receptorgen af ​​histon-deacetylase-mSin3A-kompleks  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  33. You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST er en integreret komponent af CoREST-human histondeacetylase-komplekset  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . — Bd. 98 , nr. 4 . - S. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  34. Kiernan R., Brès V., Ng RW, Coudart MP, El Messaoudi S., Sardet C., Jin DY, Emiliani S., Benkirane M. Efteraktivering af NF-kappa B-afhængig transkription er reguleret ved acetylering af p65  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 278 , nr. 4 . - P. 2758-2766 . - doi : 10.1074/jbc.M209572200 . — PMID 12419806 .
  35. Yu Z., Zhang W., Kone BC Histon-deacetylaser øger cytokininduktion af iNOS-genet  //  J. Am. soc. Nephrol. : journal. — Bd. 13 , nr. 8 . - S. 2009-2017 . - doi : 10.1097/01.asn.0000024253.59665.f1 . — PMID 12138131 .
  36. Lai A., Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E., Branton PE RBP1 rekrutterer både histon-deacetylase-afhængige og -uafhængige undertrykkelsesaktiviteter til retinoblastomfamilieproteiner   // Mol . celle. Biol. : journal. — Bd. 19 , nr. 10 . - P. 6632-6641 . — PMID 10490602 .
  37. Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, et nyt protein, der er konserveret mellem menneske og gær, er en bestanddel af et histon-deacetylase-kompleks   // Mol. celle : journal. — Bd. 1 , nr. 7 . - S. 1021-1031 . - doi : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  38. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Rolle af Sin3-histondeacetylasekomplekset i vækstregulering af kandidattumorundertrykkeren p33(ING1  )  // Mol. celle. Biol. : journal. — Bd. 22 , nr. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  39. Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Identifikation og karakterisering af tre nye komponenter i mSin3A corepressorkomplekset   // Mol . celle. Biol. : journal. — Bd. 23 , nr. 10 . - P. 3456-3467 . - doi : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  40. Yang L., Mei Q., ​​​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA En ERG (ets-relateret gen)-associeret histonmethyltransferase interagerer med histon deacetylaser 1/2 og transkriptions co-repressorer mSin3A/B  (engelsk)  // Biochem. J. : journal. — Bd. 369 , nr. Pt 3 . - s. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  41. Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Hayward SD En rolle for SKIP i EBNA2-aktivering af CBF1-undertrykte promotorer  //  J. Virol. : journal. — Bd. 74 , nr. 4 . - P. 1939-1947 . doi : 10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000 . — PMID 10644367 .
  42. Vaute O., Nicolas E., Vandel L., Trouche D. Funktionel og fysisk interaktion mellem histonmethyltransferasen Suv39H1 og histondeacetylaser  // Nucleic Acids Res  . : journal. — Bd. 30 , nej. 2 . - S. 475-481 . doi : 10.1093 / nar/30.2.475 . — PMID 11788710 .
  43. 1 2 Won J., Yim J., Kim TK Sp1 og Sp3 rekrutterer histondeacetylase til at undertrykke transkription af human telomerase revers transcriptase (hTERT) promotor i normale humane somatiske celler  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 277 , nr. 41 . - P. 38230-38238 . - doi : 10.1074/jbc.M206064200 . — PMID 12151407 .
  44. 1 2 Sun JM, Chen HY, Moniwa M., Litchfield DW, Seto E., Davie JR Den transkriptionelle repressor Sp3 er forbundet med CK2-phosphoryleret histondeacetylase 2  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 277 , nr. 39 . - P. 35783-35786 . - doi : 10.1074/jbc.C200378200 . — PMID 12176973 .
  45. Tsai SC, Valkov N., Yang WM, Gump J., Sullivan D., Seto E. Histon-deacetylase interagerer direkte med DNA-topoisomerase II   // Nat . Genet.  : journal. — Bd. 26 , nr. 3 . - s. 349-353 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
  46. Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E. Isolering og karakterisering af cDNA'er svarende til et yderligere medlem af den humane histon-deacetylase-genfamilie  //  J. Biol. Chem.  : journal. — Bd. 272 , nr. 44 . - S. 28001-28007 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.28001 . — PMID 9346952 .
  47. Yao YL, Yang WM, Seto E. Regulering af transkriptionsfaktor YY1 ved acetylering og deacetylering   // Mol . celle. Biol. : journal. — Bd. 21 , nr. 17 . - P. 5979-5991 . - doi : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . — PMID 11486036 .
  48. Kalenik JL, Chen D., Bradley ME, Chen SJ, Lee TC Gær to-hybrid kloning af et nyt zinkfingerprotein, der interagerer med den multifunktionelle transkriptionsfaktor YY1  // Nucleic Acids Res  . : journal. — Bd. 25 , nr. 4 . - S. 843-849 . doi : 10.1093 / nar/25.4.843 . — PMID 9016636 .

Litteratur