TOP2B

Topoisomerase (DNA) II beta 180 kDa

Human topoisomerase Iibeta i kompleks med DNA (guldkugle). PDB-post 4j3n

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
3QX3 , 4G0U , 4G0V , 4G0W , 4J3N

Identifikatorer

Symbol

TOP2B ; TOPIIB; top2beta

Eksterne ID'er

OMIM: 126431 MGI : 98791 HomoloGene : 134711 ChEMBL : 3396 GeneCards : TOP2B Gen

EF-nummer

5.99.1.3

Gen-ontologi
Fungere	• kromatinbinding • DNA-topoisomerase type II (ATP-hydrolyserende) aktivitet • proteinkinase C-binding • ATP-binding • protein C-terminus-binding • DNA-binding, bøjning • enzymbinding • histondeacetylase-binding • metalionbinding • proteinheterodimeriseringsaktivitet
celle komponent	• heterochromatin • kerne • nukleoplasma • nukleolus • cytoplasma • cytosol • nukleoid • DNA topoisomerase kompleks (ATP-hydrolyserende)
biologisk proces	• opløsning af meiotiske rekombinationsmellemprodukter • søsterkromatidsegregering • neuronmigrering • ATP katabolisk proces • DNA-topologisk ændring • DNA-afvikling involveret i DNA-replikation • mitotisk rekombination • axonogenese • udvikling af forhjernen • mitotisk DNA-integritetskontrolpunkt
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 3:
25,64 – 25,71 Mb

Chr 14:
16,37 – 16,43 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

DNA-topoisomerase 2-beta er et enzym kodet i mennesker af TOP2B -genet [1] [2] .

Dette gen koder for DNA- topoisomerase , et enzym , der kontrollerer og ændrer de topologiske tilstande af DNA under transkription . Dette nukleare enzym er involveret i processer såsom kromosomkondensation , kromatidseparation og torsionsstressreduktion, der opstår under DNA-transkription og replikation . Det katalyserer overgangshacking og genforening af to strenge af dupleks-DNA, hvilket tillader strengene at passere gennem hinanden, hvilket ændrer topologien af DNA'et. To former for dette enzym eksisterer som sandsynlige produkter i tilfælde af genduplikation. Genet, der koder for beta-formen, er placeret på kromosom 3, mens alfa-formen er placeret på kromosom 17. Genet, der koder for dette enzym, fungerer som et mål for flere antitumormidler, såsom mitoxantron , og mange mutationer i dette gen er forbundet med udvikling af lægemiddelresistens. Nedsat aktivitet af dette enzym kan også spille en rolle i ataxia-telangiectasia . Alternativ splejsning af dette gen resulterer i to transkriptvarianter; den anden mulighed er dog endnu ikke fuldstændig beskrevet [3] .

Interaktioner

TOP2B har vist sig at interagere med BAZ1B [4] , HDAC1 [5] [6] , histon deacetylase 2 [5] , CD3E [7] , SUMO1 [8] og P53 [9] .

Noter

↑ Tan KB, Dorman TE, Falls KM, Chung TD, Mirabelli CK, Crooke ST, Mao J. Topoisomerase II alfa og topoisomerase II beta gener: karakterisering og kortlægning til henholdsvis humane kromosomer 17 og 3 // Kræftforskning : journal. - 1992. - Januar ( bind 52 , nr. 1 ). - S. 231-234 . — PMID 1309226 .
↑ Jenkins JR, Ayton P., Jones T., Davies SL, Simmons DL, Harris AL, Sheer D., Hickson ID Isolering af cDNA-kloner, der koder for beta-isozymet af human DNA topoisomerase II og lokalisering af genet til kromosom 3p24 // Nukleinsyreforskning : journal. - 1993. - Januar ( bind 20 , nr. 21 ). - P. 5587-5592 . doi : 10.1093 / nar/20.21.5587 . — PMID 1333583 .
↑ Entrez-gen: TOP2B topoisomerase (DNA) II beta 180kDa . (ubestemt)
↑ Kitagawa, Hirochika; Fujiki Ryoji, Yoshimura Kimihiro, Mezaki Yoshihiro, Uematsu Yoshikatsu, Matsui Daisuke, Ogawa Satoko, Unno Kiyoe, Okubo Mataichi, Tokita Akifumi, Nakagawa Takeya, Ito Takashi, Ishimi Yukio, Nagasumo Kattogiawa, Shinsumo Kattogiawa, Shin,. Chromatin-remodeling-komplekset WINAC retter sig mod en nuklear receptor til promotorer og er svækket i Williams syndrom // Cell : journal. - USA: Cell Press , 2003. - Juni ( vol. 113 , nr. 7 ). - S. 905-917 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00436-7 . — PMID 12837248 .
↑ 1 2 Tsai, SC; Valkov N; Yang W.M.; Gump J; Sullivan D; Seto E. Histon deacetylase interagerer direkte med DNA topoisomerase II // Nature Genetics : tidsskrift . - USA, 2000. - November ( bind 26 , nr. 3 ). - s. 349-353 . — ISSN 1061-4036 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
↑ Johnson, CA; PadgetK; Austin CA; Turner B M. Deacetylase-aktivitet associerer med topoisomerase II og er nødvendig for etoposid-induceret apoptose // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 2001. - Februar ( vol. 276 , nr. 7 ). - P. 4539-4542 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.C000824200 . — PMID 11136718 .
↑ Nakano, H; Yamazaki T; Miyatake S; Nozaki N; Kikuchi A; Saito T. Specifik interaktion mellem topoisomerase II beta og CD3-epsilonkæden af T-cellereceptorkomplekset (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - USA, 1996. - Marts ( vol. 271 , nr. 11 ). - P. 6483-6489 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.271.11.6483 . — PMID 8626450 .
↑ Mao, Y; Desai SD; Liu L F. SUMO-1 konjugation til humant DNA topoisomerase II isozymer (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - USA, 2000. - August ( vol. 275 , nr. 34 ). - P. 26066-26073 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M001831200 . — PMID 10862613 .
↑ Cowell, I.G.; Okorokov A.L.; Cutts SA; PadgetK; Klokke M; Milner J; Austin CA. Human topoisomerase IIalpha og IIbeta interagerer med den C-terminale region af p53 // Eksperimentel celleforskning : journal. - USA, 2000. - Februar ( bind 255 , nr. 1 ). - S. 86-94 . — ISSN 0014-4827 . - doi : 10.1006/excr.1999.4772 . — PMID 10666337 .

Litteratur

Champoux JJ DNA topoisomeraser: struktur, funktion og mekanisme. (engelsk) // Årlig gennemgang af biokemi : journal. - 2002. - Bd. 70 . - s. 369-413 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.369 . — PMID 11395412 .
Austin CA, Fisher LM Isolering og karakterisering af en human cDNA-klon, der koder for en ny DNA-topoisomerase II-homolog fra HeLa-celler. (engelsk) // FEBS Letters : journal. - 1990. - Bd. 266 , nr. 1-2 . - S. 115-117 . - doi : 10.1016/0014-5793(90)81520-X . — PMID 2163884 .
Chung TD, Drake FH, Tan KB, et al. Karakterisering og immunologisk identifikation af cDNA-kloner, der koder for to humane DNA-topoisomerase II-isozymer (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1990. - Bd. 86 , nr. 23 . - P. 9431-9435 . - doi : 10.1073/pnas.86.23.9431 . — PMID 2556712 .
Austin CA, Sng JH, Patel S., Fisher LM Ny HeLa topoisomerase II er II beta isoformen: komplet kodende sekvens og homologi med andre type II topoisomeraser // Biochimica et Biophysica Acta : journal. - 1993. - Bd. 1172 , nr. 3 . - S. 283-291 . - doi : 10.1016/0167-4781(93)90215-Y . — PMID 8383537 .
Davies SL, Jenkins JR, Hickson ID Humane celler udtrykker to differentielt splejsede former for topoisomerase II beta mRNA // Nukleinsyreforskning : journal. - 1993. - Bd. 21 , nr. 16 . - P. 3719-3723 . doi : 10.1093 / nar/21.16.3719 . — PMID 8396237 .
Nakano H., Yamazaki T., Miyatake S., et al. Specifik interaktion mellem topoisomerase II beta og CD3-epsilonkæden af T-cellereceptorkomplekset (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 1996. - Bd. 271 , nr. 11 . - P. 6483-6489 . doi : 10.1074 / jbc.271.11.6483 . — PMID 8626450 .
Biersack H., Jensen S., Gromova I., et al. Aktive heterodimerer dannes fra humant DNA topoisomerase II alfa- og II-beta-isoformer (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Bd. 93 , nr. 16 . - P. 8288-8293 . - doi : 10.1073/pnas.93.16.8288 . — PMID 8710863 .
Meyer KN, Kjeldsen E., Straub T., et al. Cellecykluskoblet flytning af type I og II topoisomeraser og modulering af katalytiske enzymaktiviteter // Journal of Cell Biology : journal. - 1997. - Bd. 136 , nr. 4 . - s. 775-788 . doi : 10.1083/ jcb.136.4.775 . — PMID 9049244 .
Fukunaga R., Hunter T. MNK1, en ny MAP-kinase-aktiveret proteinkinase, isoleret ved en ny ekspressionsscreeningsmetode til identifikation af proteinkinase-substrater // The EMBO Journal : journal. - 1997. - Bd. 16 , nr. 8 . - S. 1921-1933 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.1921 . — PMID 9155018 .
Ng SW, Liu Y., Schnipper LE Kloning og karakterisering af den 5'-flankerende sekvens for det humane DNA topoisomerase II beta-gen (engelsk) // Gene: journal. - 1998. - Bd. 203 , nr. 2 . - S. 113-119 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00500-3 . — PMID 9426241 .
Yamane K., Kawabata M., Tsuruo T. Et DNA-topoisomerase-II-bindende protein med otte gentagne regioner, der ligner DNA-reparationsenzymer og en cellecyklusregulator // FEBS Journal : journal. - 1998. - Bd. 250 , nr. 3 . - S. 794-799 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x . — PMID 9461304 .
Cowell IG, Willmore E., Chalton D., et al. Nuklear distribution af humant DNA topoisomerase IIbeta: et nuklear målretningssignal findes i den 116-rester C-terminale hale // Eksperimentel celleforskning : journal. - 1998. - Bd. 243 , nr. 2 . - S. 232-240 . - doi : 10.1006/excr.1998.4150 . — PMID 9743583 .
Lang AJ, Mirski SE, Cummings HJ, et al. Strukturel organisation af de humane TOP2A- og TOP2B-gener (engelsk) // Gene : journal. - 1998. - Bd. 221 , nr. 2 . - S. 255-266 . - doi : 10.1016/S0378-1119(98)00468-5 . — PMID 9795238 .
Sng JH, Heaton VJ, Bell M., et al. Molekylær kloning og karakterisering af de humane topoisomerase IIalpha- og IIbeta-gener: beviser for isoformudvikling gennem genduplikation // Biochimica et Biophysica Acta : journal. - 1999. - Bd. 1444 , Nr. 3 . - S. 395-406 . - doi : 10.1016/S0167-4781(99)00020-2 . — PMID 10095062 .
Bjergbæk L., Jensen S., Westergaard O., Andersen AH Brug af en biokemisk tilgang til at identificere de primære dimeriseringsregioner i human DNA topoisomerase IIalpha // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1999. - Bd. 274 , nr. 37 . - P. 26529-26536 . doi : 10.1074 / jbc.274.37.26529 . — PMID 10473615 .
Cowell IG, Okorokov AL, Cutts SA, et al. Human topoisomerase IIalpha og IIbeta interagerer med den C-terminale region af p53 // Eksperimentel celleforskning : journal. - 2000. - Vol. 255 , nr. 1 . - S. 86-94 . - doi : 10.1006/excr.1999.4772 . — PMID 10666337 .
Mao Y., Desai SD, Liu LF SUMO-1-konjugation til humant DNA topoisomerase II-isozymer (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2000. - Vol. 275 , nr. 34 . - P. 26066-26073 . - doi : 10.1074/jbc.M001831200 . — PMID 10862613 .
Mirski SE, Voskoglou-Nomikos T., Young LC, et al. Samtidig kvantificering af topoisomerase II alfa- og beta-isoform-mRNA'er i lungetumorceller og normalt og malignt lungevæv // Laboratorieundersøgelse : journal. - 2000. - Vol. 80 , nr. 6 . - s. 787-795 . - doi : 10.1038/labinvest.3780083 . — PMID 10879730 .