RBBP4

Retinoblastom bindende protein 4

Indført baseret på FBF 2XU7 .
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolRBBP4  ; NURF55; RBAP48; lin-53
Eksterne ID'erOMIM:  602923 MGI :  1194912 HomoloGene :  21153 GeneCards : RBBP4-gen
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez592819646
EnsembleENSG00000162521ENSMUSG00000057236
UniProtQ09028Q60972
RefSeq (mRNA)NM_001135255NM_009030
RefSeq (protein)NP_001128727NP_033056
Locus (UCSC)Chr 1:
33,12 – 33,15 Mb		Chr 4:
129,31 – 129,34 Mb
Søg i PubMed[en][2]

Det histonbindende protein RBBP4 (også kendt som RbAp48 eller NURF55 ) er et protein kodet i mennesker af RBBP4 -genet . [1] [2]

Funktion

Dette gen koder for et allestedsnærværende udtrykt nuklear protein, der tilhører en meget konserveret underfamilie af WD-gentagelsesproteiner. Det er til stede i proteinkomplekser involveret i histonacetylering og kromatinsamling . Dette er en del af Mi-2/NuRD-komplekset, der er blevet impliceret i kromatin-ombygning og transkriptionel undertrykkelse forbundet med histon-deacetylering. Dette kodede protein er også en del af corepressorkomplekser , der er integreret i transkriptionel silencing . Dette findes blandt flere cellulære proteiner, der binder direkte til retinoblastomproteinet for at regulere celleproliferation. Dette protein ser også ud til at være involveret i transkriptionel undertrykkelse af E2F-responsive gener. [3]

Klinisk betydning

Faldet i RbAp48 i dentate gyrus i hjernens hippocampus er mistænkt for at være hovedårsagen til hukommelsestab ved normal aldring . [4] Et aldersrelateret fald i RbAp48 er observeret i dentate gyrus under vævsobduktion efter menneskelig død, såvel som i mus. Derudover forårsager knocking -genet i den dominerende negative form af RbAp48 hukommelsesmangel hos unge mus, svarende til hvad der observeres hos ældre mus. Endelig reverserer lentivirus -genoverførsel for at øge RbAp48-ekspression i hjernen hukommelsessvækkelse hos gamle mus. [fire]

RBBP4 bruger en del af PKA - CREB1-CPB pathwayen. [4] Således er en af ​​de mulige terapeutiske tilgange til at genoprette aldersrelateret hukommelsestab brugen af ​​PKA-CREB1-CPB metabolismeveje for stimulerende lægemidler. Dopamin D1/D5-agonister såsom 6-Br-APB og SKF-38393, som er positivt koblet til adenylatcyclase og cAMP - phosphodiesterasehæmmeren rolipram , har tidligere vist sig at reducere hukommelsesdefekter hos gamle mus. [5]

Interaktioner

RBBP4 har vist sig at interagere med:

Noter

  1. ↑ Qian YW, Wang YC, Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee EY Et retinoblastom-bindende protein relateret til en negativ regulator af Ras i gær  //  Nature: journal. - 1993. - September ( vol. 364 , nr. 6438 ). - S. 648-652 . - doi : 10.1038/364648a0 . — PMID 8350924 .
  2. ↑ Barak O., Lazzaro MA, Lane WS, Speicher DW, Picketts DJ, Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression   // EMBO J : journal. - 2003. - November ( bind 22 , nr. 22 ). - P. 6089-6100 . - doi : 10.1093/emboj/cdg582 . — PMID 14609955 .
  3. ↑ Entrez-gen: RBBP4 retinoblastom-bindende protein 4 .
  4. ↑ 1 2 3 Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small SA, Kandel ER Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histon-Binding Protein  RbAp48 .)  // Sci Transl Med : journal. - 2013. - August ( bind 5 , nr. 200 ). — S. 200ra115 . - doi : 10.1126/scitranslmed.3006373 . — PMID 23986399 .
  5. ↑ Bach ME, Barad M., Son H., Zhuo M., Lu YF, Shih R., Mansuy I., Hawkins RD, Kandel ER Aldersrelaterede defekter i rumlig hukommelse er korreleret med defekter i den sene fase af hippocampus lang. -term potensering in vitro og svækkes af lægemidler, der forbedrer cAMP-signalvejen  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1999. - April ( bd. 96 , nr. 9 ). - P. 5280-5285 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.5280 . — PMID 10220457 .
  6. ↑ Yarden RI, Brody LC BRCA1 interagerer med komponenter i histon-deacetylasekomplekset  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Bd. 96 , nr. 9 . - S. 4983-4988 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 . — PMID 10220405 .
  7. ↑ Zhang Q., Vo N., Goodman RH Histonbindende protein RbAp48 interagerer med et kompleks af CREB-bindende protein og phosphoryleret CREB   // Mol . celle. Biol. : journal. - 2000. - Vol. 20 , nej. 14 . - S. 4970-4978 . - doi : 10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000 . — PMID 10866654 .
  8. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identifikation og funktionel karakterisering af p66/p68-komponenterne i MeCP1-komplekset   // Mol . celle. Biol. : journal. - 2002. - Bd. 22 , nr. 2 . - S. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
  9. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Dobbelte mekanismer til regulering af transkription af luteiniserende hormonreceptorgen af ​​nukleære forældreløse receptorer og histon-deacetylasekomplekser  (engelsk)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : journal. - 2003. - Bd. 85 , nr. 2-5 . - S. 401-414 . - doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  10. ↑ 1 2 Yao YL, Yang WM De metastase-associerede proteiner 1 og 2 danner distinkte proteinkomplekser med histon-deacetylase-aktivitet  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2003. - Bd. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  11. ↑ 1 2 3 Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouché D. Histon-deacetylase HDAC3 målretter RbAp48 til retinoblastomproteinet  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2001. - Bd. 29 , nr. 15 . - s. 3131-3136 . doi : 10.1093 / nar/29.15.3131 . — PMID 11470869 .
  12. ↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tre proteiner definerer en klasse af humane histon-deacetylaser relateret til gær Hda1p  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Bd. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
  13. ↑ You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST er en integreret komponent af CoREST-human histondeacetylase-komplekset  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2001. - Bd. 98 , nr. 4 . - S. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  14. ↑ 1 2 Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE Histon-deacetylase-aktivitet er nødvendig for fuld transkriptionel undertrykkelse af mSin3A  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - s. 341-347 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80214-7 . — PMID 9150133 .
  15. ↑ Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 er en transkriptionel repressor, der tilhører MeCP1-histondeacetylase-komplekset  . )  / / Nat. Genet.  : journal. - 1999. - Bd. 23 , nr. 1 . - S. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  16. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analyse af NuRD-underenhederne afslører et histon-deacetylase-kernekompleks  og /en forbindelse med DNA-methylering  Genes Dev.  : journal. - 1999. - Bd. 13 , nr. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  17. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Silencing af transkription af det humane luteiniserende hormon-receptorgen med histon-deacetylase-mSin3A-kompleks  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2002. - Bd. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  18. ↑ Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL En rolle for histon-deacetylase-aktivitet i HDAC1-medieret transkriptionel undertrykkelse  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidsskrift. - 1998. - Bd. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  19. ↑ Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histon-deacetylaser og SAP18, et nyt polypeptid, er komponenter i et humant Sin3-kompleks  (engelsk)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - s. 357-364 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  20. ↑ Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Et kandidat X-linket mental retarderingsgen er en komponent i en ny familie af histon-deacetylase-holdige komplekser  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 2003. - Bd. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  21. ↑ Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Chromatindeacetylering af et ATP-afhængigt nukleosomomdannelseskompleks  //  Nature: journal. - 1998. - Bd. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  22. ↑ Qian YW, Lee EY Dobbelt retinoblastom-bindende proteiner med egenskaber relateret til en negativ regulator af ras i gær  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1995. - Bd. 270 , nr. 43 . - P. 25507-25513 . doi : 10.1074/ jbc.270.43.25507 . — PMID 7503932 .
  23. ↑ Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D.  RbAp48 tilhører histon-deacetylase-komplekset, der associeres med retinoblastomproteinet  // J Biol. Chem.  : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 13 . - P. 9797-9804 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9797 . — PMID 10734134 .
  24. ↑ 1 2 Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, et nyt protein, der er konserveret mellem menneske og gær, er en bestanddel af et histon-deacetylase-kompleks  (engelsk)  // Mol. celle : journal. - 1998. - Bd. 1 , nr. 7 . - S. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  25. ↑ Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Rolle af Sin3-histondeacetylasekomplekset i vækstregulering af kandidattumorundertrykkeren p33(ING1  )  // Mol. celle. Biol. : journal. - 2002. - Bd. 22 , nr. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .

Litteratur