SAP30

Sin3A-associeret protein, 30kDa

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
2KDP

Identifikatorer

Symbol

SAP30

Eksterne ID'er

OMIM: 603378 MGI : 1929129 HomoloGene : 2869 GeneCards : SAP30 Gene

Gen-ontologi
Fungere	• DNA-binding • transkriptions-corepressoraktivitet • proteinbinding • metalionbinding
celle komponent	• histon deacetylase kompleks
biologisk proces	• negativ regulering af transkription fra RNA-polymerase II-promotor • transkription, DNA-templeret • regulering af transkription, DNA-templeret • skeletmuskelcelledifferentiering
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 4:
174,29 - 174,3 Mb

Chr 8:
57,48 – 57,49 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

Det 30 kDa Sin3A-associerede protein , også kendt som SAP30 , er et protein kodet i mennesker af SAP30 -genet [1] .

Funktion

Histonacetylering spiller en nøglerolle i reguleringen af eukaryot genekspression . Acetylering og deacetylering af histoner katalyseres af multisubunit-komplekser. Proteinet kodet af dette gen er en komponent af histon-deacetylasekomplekset , som inkluderer SIN3A , SAP18 , HDAC1 , HDAC2 , RbAp46 , RbAp48 og andre polypeptider. Dette kompleks er aktivt involveret i deacetyleringen af de vigtigste oktamerhistoner, men er inaktivt i deacetyleringen af nukleosomale histoner. Pseudogenet af dette gen er placeret på kromosom 3 [1] .

Pattedyr har en paralog af SAP30, kaldet SAP30-lignende (SAP30L), hvis tilgængelige sekvenser er 70 % identiske med SAP30 [2] . SAP30 og SAP30L udgør tilsammen den velbevarede SAP30-familie af proteiner . SAP30L interagerer også med flere corepressorkomponenter af Sin3A-komplekset og inducerer transkriptionel undertrykkelse via rekruttering af Sin3A og histon-deacetylaser [3] .

Proteiner af SAP30-familien har funktionel nuklear lokalisering af signalet, og de kan transmittere Sin3A-signalet til kernen [3] . SAP30-proteiner har uafhængig sekvenskontakt med DNA , deres N-terminale zinkafhængige modul, og deres sure kerneregion bidrager til histon-nukleosom-interaktioner. DNA-binding af SAP30-proteiner reguleres af lipid nuklear signalering, phosphoinositides (PI) [4] . SAP30-proteinerne giver det første eksempel, hvor DNA og PI ser ud til at være i et gensidigt antagonistisk forhold med hensyn til deres interaktion med zinkfingerproteiner og illustrerer således den molekylære mekanisme for, hvordan disse lipider kan bidrage til genregulering [4] [5] .

Interaktioner

SAP30 har vist sig at interagere med HDAC1 [6] [7] [8] [9] [10] [11] , histon deacetylase 2 [7] [8] [11] , SIN3A [7] [8] [10] [11] [12] [13] , RBBP7 [7] [8] [11] , nuklear receptor corepressor 1 [13] [14] , RBBP4 [7] [8] [11] , ING1 [11] og YY1 [ 6] .

Noter

↑ 1 2 Entrez-gen: SAP30 Sin3A-associeret protein, 30 kDa . (ubestemt)
↑ Lindfors K., Viiri KM, Niittynen M., Heinonen TY, Mäki M., Kainulainen H. TGF-beta inducerer ekspressionen af SAP30L, et nyt nuklear protein // BMC Genomics : journal. - 2003. - December ( bind 4 ). — S. 53 . - doi : 10.1186/1471-2164-4-53 . — PMID 14680513 .
↑ 1 2 Viiri KM, Korkeamäki H., Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K., Peterson P., Mäki M., Kainulainen H., Lohi O. SAP30L interagerer med medlemmer af Sin3A-corepressorkomplekset og målretter Sin3A til nucleolus (eng.) // Nucleic Acids Research : journal. - 2006. - Bd. 34 , nr. 11 . - s. 3288-3298 . - doi : 10.1093/nar/gkl401 . — PMID 16820529 .
↑ 1 2 Viiri KM, Jänis J., Siggers T., Heinonen TY, Valjakka J., Bulyk ML, Mäki M., Lohi O. DNA-binding og -bøjning af SAP30L og SAP30 medieres af et zinkafhængigt modul og monophosphoinositides // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2009. - Januar ( bind 29 , nr. 2 ). - S. 342-356 . - doi : 10.1128/MCB.01213-08 . — PMID 19015240 .
↑ TamPub (downlink) . Hentet 20. april 2015. Arkiveret fra originalen 25. maj 2011. (ubestemt)
↑ 1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y. Modulering af YY1-aktivitet ved SAP30 // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. - USA, 2003. - Juni ( vol. 306 , nr. 1 ). - S. 267-275 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/S0006-291X(03)00966-5 . — PMID 12788099 .
↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; SunZW; Iratni R; Erdjument Bromage H; TempstP; Hampsey M; Reinberg D. SAP30, et nyt protein, der er konserveret mellem menneske og gær, er en komponent i et histon-deacetylasekompleks // Molecular Cell : journal. - USA, 1998. - Juni ( bind 1 , nr. 7 ). - S. 1021-1031 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; NgHH; Erdjument Bromage H; TempstP; Fugl A; Reinberg D. Analyse af NuRD-underenhederne afslører et histon-deacetylase-kernekompleks og en forbindelse med DNA-methylering // Genes & Development : journal . - USA, 1999. - August ( bind 13 , nr. 15 ). - S. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
↑ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar. HBP1- og Mad1-repressorer binder Sin3-corepressor-PAH2-domænet med modsatte heliske orienteringer (engelsk) // Nature Structural & Molecular Biology : journal. - USA, 2004. - August ( vol. 11 , nr. 8 ). - s. 738-746 . — ISSN 1545-9993 . doi : 10.1038 / nsmb798 . — PMID 15235594 .
↑ 12 Yochum , G.S.; Ayer DE. Pf1, et nyt PHD zinkfingerprotein, der forbinder TLE-corepressoren til mSin3A-histondeacetylasekomplekset // Molecular and Cellular Biology : journal. - USA, 2001. - Juli ( vol. 21 , nr. 13 ). - P. 4110-4118 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . — PMID 11390640 .
↑ 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument Bromage H; TempstP; Reinberg D. Sin3-histondeacetylase-kompleksets rolle i vækstregulering af kandidattumorsuppressoren p33(ING1 ) // Molecular and Cellular Biology : journal. - USA, 2002. - Februar ( vol. 22 , nr. 3 ). - s. 835-848 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
↑ Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. Identifikation og karakterisering af tre nye komponenter i mSin3A corepressorkomplekset // Molecular and Cellular Biology : journal. - USA, 2003. - Maj ( vol. 23 , nr. 10 ). - P. 3456-3467 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
↑ 12 Laherty , CD; Billin A N., Lavinsky R M., Yochum G S., Bush A C., Sun J M., Mullen TM, Davie J R., Rose D W., Glass C K., Rosenfeld M G., Ayer DE., Eisenman R N. SAP30, en komponent af mSin3-corepressorkomplekset involveret i N-CoR-medieret undertrykkelse af specifikke transkriptionsfaktorer // Molecular Cell : journal. - USA, 1998. - Juli ( vol. 2 , nr. 1 ). - S. 33-42 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . — PMID 9702189 .
↑ Underbakke, C; Qutob MS; Yee SP; Torchia J. Et nyt nuklear receptor-corepressorkompleks, N-CoR, indeholder komponenter af pattedyrs SWI/SNF-komplekset og corepressoren KAP-1 // Journal of Biological Chemistry : journal. - USA, 2000. - December ( vol. 275 , nr. 51 ). - P. 40463-40470 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M007864200 . — PMID 11013263 .

Litteratur

Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN Mad-Max transkriptionel undertrykkelse medieres af ternær kompleksdannelse med pattedyrshomologer af gærrepressor Sin3. (engelsk) // Cell : journal. - Cell Press , 1995. - Vol. 80 , nr. 5 . - s. 767-776 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . — PMID 7889570 .
Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., et al. Histon-deacetylaser og SAP18, et nyt polypeptid, er komponenter i et humant Sin3-kompleks. (engelsk) // Cell : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - s. 357-364 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., et al. SAP30, et nyt protein, der er konserveret mellem mennesker og gær, er en komponent i et histon-deacetylase-kompleks. (engelsk) // Molecular Cell : journal. - 1998. - Bd. 1 , nr. 7 . - S. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, et al. SAP30, en komponent af mSin3-corepressorkomplekset involveret i N-CoR-medieret undertrykkelse af specifikke transkriptionsfaktorer. (engelsk) // Molecular Cell : journal. - 1998. - Bd. 2 , nr. 1 . - S. 33-42 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . — PMID 9702189 .
Zhang Y., LeRoy G., Seelig HP, et al. Det dermatomyositis-specifikke autoantigen Mi2 er en komponent i et kompleks, der indeholder histon-deacetylase og nukleosomomdannelsesaktiviteter. (engelsk) // Cell : journal. - Cell Press , 1998. - Vol. 95 , nr. 2 . - S. 279-289 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . — PMID 9790534 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, et al. Chromatindeacetylering af et ATP-afhængigt nukleosomomdannelseskompleks. (engelsk) // Natur: journal. - 1998. - Bd. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
Hsieh JJ, Zhou S., Chen L., et al. CIR, en corepressor, der forbinder DNA-bindingsfaktoren CBF1 til histon-deacetylasekomplekset. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1999. - Bd. 96 , nr. 1 . - S. 23-8 . - doi : 10.1073/pnas.96.1.23 . — PMID 9874765 .
Boutell JM, Thomas P., Neal JW, et al. Afvigende interaktioner af transkriptionelle repressorproteiner med genproduktet Huntingtons sygdom, huntingtin. (engelsk) // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 2000. - Vol. 8 , nr. 9 . - P. 1647-1655 . - doi : 10.1093/hmg/8.9.1647 . — PMID 10441327 .
Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., et al. Analyse af NuRD-underenhederne afslører et histon-deacetylase-kernekompleks og en forbindelse med DNA-methylering. (engelsk) // Gener & Development : tidsskrift. - 1999. - Bd. 13 , nr. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
Krithivas A., Young D.B., Liao G., et al. Human herpesvirus 8 LANA interagerer med proteiner i mSin3-corepressorkomplekset og regulerer negativt Epstein-Barr-virusgenekspression i dobbeltinficerede PEL-celler. (engelsk) // Journal of Virology : journal. - 2000. - Vol. 74 , nr. 20 . - P. 9637-9645 . doi : 10.1128 / JVI.74.20.9637-9645.2000 . — PMID 11000236 .
Underhill C., Qutob MS, Yee SP, Torchia J. Et nyt nuklear receptor-corepressorkompleks, N-CoR, indeholder komponenter af pattedyrs SWI/SNF-komplekset og corepressoren KAP-1. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2001. - Bd. 275 , nr. 51 . - P. 40463-40470 . - doi : 10.1074/jbc.M007864200 . — PMID 11013263 .
Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, et al. Stabile histon-deacetylase-komplekser kendetegnet ved tilstedeværelsen af SANT-domæneproteiner CoREST/kiaa0071 og Mta-L1. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2001. - Bd. 276 , nr. 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
Skowyra D., Zeremski M., Neznanov N., et al. Differentiel association af produkter af alternative transkripter af kandidattumorsuppressoren ING1 med mSin3/HDAC1 transkriptionelle corepressorkomplekset. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2001. - Bd. 276 , nr. 12 . - P. 8734-8739 . - doi : 10.1074/jbc.M007664200 . — PMID 11118440 .
Yochum GS, Ayer DE Pf1, et nyt PHD zinkfingerprotein, der forbinder TLE-corepressoren til mSin3A-histondeacetylasekomplekset. (engelsk) // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2001. - Bd. 21 , nr. 13 . - P. 4110-4118 . - doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . — PMID 11390640 .
Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., et al. Rolle af Sin3-histondeacetylasekomplekset i vækstregulering af kandidattumorsuppressoren p33(ING1). (engelsk) // Molecular and Cellular Biology : journal. - 2002. - Bd. 22 , nr. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
Saito M., Ishikawa F. Det mCpG-bindende domæne af human MBD3 binder ikke til mCpG, men interagerer med NuRD/Mi2-komponenterne HDAC1 og MTA2. (engelsk) // Journal of Biological Chemistry : tidsskrift. - 2002. - Bd. 277 , nr. 38 . - P. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser. (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2003. - Bd. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, et al. Human Sin3-deacetylase og trithorax-relateret Set1/Ash2-histon H3-K4-methyltransferase bindes selektivt sammen af celleproliferationsfaktoren HCF-1. (engelsk) // Gener & Development : tidsskrift. - 2003. - Bd. 17 , nr. 7 . - S. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
Huang NE, Lin CH, Lin YS, Yu WC Modulering af YY1 aktivitet ved SAP30. (engelsk) // Biokemisk og biofysisk forskningskommunikation : journal. - 2003. - Bd. 306 , nr. 1 . - S. 267-275 . - doi : 10.1016/S0006-291X(03)00966-5 . — PMID 12788099 .
Sironi E., Cerri A., Tomasini D., et al. Tab af heterozygositet på kromosom 4q32-35 i sporadiske basalcellekarcinomer: bevis for involvering af p33ING2/ING1L og SAP30 gener. (engelsk) // J. Cutan. Pathol. : journal. - 2004. - Bd. 31 , nr. 4 . - s. 318-322 . - doi : 10.1111/j.0303-6987.2004.0187.x . — PMID 15005689 .