Pribnov kasse

Pribnow-boks ( også kendt som Pribnow- Schaller-boks ) er en specifik nukleotidsekvens  , der kræves til promotorregionen af ​​bakterier, som RNA-polymerase binder til [1] [2] . Pribnow-box-nukleotidsekvensen anses for at være konsensussekvensen, fordi den forekommer i mange organismer med ringe variation. Denne sekvens er opkaldt efter David Pribnow og Heinz Schaller [1] [2] . ТАТААТ

Pribnow-boksen kaldes også -10-sekvensen, fordi den er placeret ca. 10 basepar opstrøms for transkriptionsstartpunktet .

Funktionerne af denne sekvens ligner TATA-boksen, der findes i eukaryoter og archaea : den genkendes og bindes af RNA-polymerasestedet under transkriptionsinitiering . Det er også det første punkt, hvor komplementære DNA - strenge divergerer for at tillade RNA- syntese at begynde på DNA-skabelonen. Dette lettes af et stort antal AT-par, da bindingerne mellem adenin og thymin er mindre stærke end mellem guanin og cytosin [3] .

Sandsynlighed for at finde hvert nukleotid

Noter

1. ↑ 1 2 Pribnow D. Nukleotidsekvens af et RNA-polymerasebindingssted ved en tidlig T7-promotor.  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1975. - Bd. 72, nr. 3 . - s. 784-788. — PMID 1093168 .
2. ↑ 1 2 Schaller H. , Gray C. , Herrmann K. Nukleotidsekvens af et RNA-polymerasebindingssted fra DNA'et fra bakteriofag fd.  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1975. - Bd. 72, nr. 2 . - s. 737-741. — PMID 1054851 .
3. ↑ Yakovchuk P. , Protozanova E. , Frank-Kamenetskii MD Base-stabling og baseparring bidrager til termisk stabilitet af DNA-dobbelthelixen. (engelsk)  // Nukleinsyreforskning. - 2006. - Bd. 34, nr. 2 . - S. 564-574. doi : 10.1093 / nar/gkj454 . — PMID 16449200 .  
4. ↑ Harley CB , Reynolds RP Analyse af E. coli-promotorsekvenser.  (engelsk)  // Nukleinsyreforskning. - 1987. - Bd. 15, nr. 5 . - P. 2343-2361. — PMID 3550697 .