Nukleotidsekvens
Nukleotidsekvens , genetisk sekvens - rækkefølgen af nukleotidrester i nukleinsyrer . Bestemt ved sekventering .
For at registrere nukleotidsekvenserne af DNA , i henhold til IUPAC - anbefalingen , bruges tegn fra det latinske alfabet. [en]
- A = adenin [2]
- C = cytosin
- G = guanin
- T = thymin
- R = GA guanin eller adenin - purin (pu rin ) baser
- Y = TC pyrimidin (pyrimidin ) baser
- K = GT indeholdende en ketogruppe
- M = AC indeholdende en aminogruppe
- S = GC "stærk" ( stærk) danner 3 hydrogenbindinger
- W = AT "svag" ( svag ) danner 2 hydrogenbindinger
- B = GTC (alle andre end A)
- D = GAT (alle undtagen C)
- H = ACT (enhver anden end G)
- V = GCA (enhver anden end T)
- N = AGCT (enhver)
Symboler, der angiver sekvensubestemmelse, er nødvendige, når den nøjagtige sekvens er ukendt, irrelevant, eller forskellige varianter af den er kendt.
Symbolerne A, C, G, U ( uridin )
er normalt tilstrækkelige til at skrive RNA- sekvenser.
Alle sekvenser er skrevet uden mellemrum, fra venstre mod højre, fra 5'-enden til 3'-enden .
Noter
- ↑ Nomenklatur for ufuldstændigt specificerede baser i nukleinsyresekvenser Arkiveret 21. august 2017 på Wayback Machine , NC-IUB, 1984.
- ↑ basenavne bruges for nemheds skyld, ikke nukleosider
Se også