Alfa-galactosidase
Melibiaser (eller α-galactosidaser ) ( EC 3.2.1.22 ) er glycosylhydrolaser , der som regel med bevarelse af deres optiske konfiguration kan spalte terminale ikke-reducerende rester af α-D-galactose fra α-D- galactosider , herunder fra galactooligosaccharider , galactomannaner og galactolipider . Deres enkleste naturlige substrater er disaccharidet melibiose og trisaccharidet raffinose . I en række tilfælde blev transgalactosidaseaktivitet fundet i melibiaser. α-N-acetylgalactosaminidase ligner biokemisk og evolutionært α-galactosidaser ( EC 3.2.1.49 ).
Familier melibiasis
Baseret på deres struktur er de katalytiske domæner af alle a-galactosidaser blevet tildelt seks familier: GH4 , GH27 , GH36 , GH57 , GH97 og GH110 .
- GH27- og GH36-familierne på et højere hierarkisk niveau udgør GH-D-klanen. Domænerne af denne klan har en tredimensionel (β/α) 8 -tønde struktur, også kendt som TIM-tønden. Denne tredimensionelle struktur er den mest almindelige blandt de katalytiske domæner af alle glycosylhydrolaser, og også en af de mest almindelige blandt alle proteiner. Alle flercellede organismer og de fleste af de undersøgte encellede eukaryoter og bakterier besidder α-galactosidaser. Blandt archaea findes de kun hos visse arter. De fleste eukaryote α-galactosidaser tilhører GH27-familien, mens de fleste bakterielle α-galactosidaser tilhører GH36-familien. Disse to familier indeholder næsten udelukkende α-galactosidaser og α-N-acetylgalactosaminidase. Fylogenetisk analyse af GH36-familien viste dens polyfyletiske oprindelse, hvilket gjorde det muligt at opdele denne familie i otte nye. Disse otte familier danner sammen med GH27- og GH31- familierne α-galactosidase-superfamilien.
- Katalytiske domæner af GH97-familien har også en (β/α) 8 -tønde struktur. På nuværende tidspunkt har kun én repræsentant for denne familie vist sig at have α-galactosidaseaktivitet - i et af proteinerne fra bakterien Bacteroides thetaiotaomicron .
- De katalytiske domæner i GH57-familien har en struktur svarende til TIM-tønden, (β/α) 7 - tønden. GH57-familien indeholder både arkæale α-galactosidaser kendt til dato, såvel som en række prokaryote glycosylhydrolaser med andre aktiviteter.
- GH4-familien inkluderer bakterielle glycosidaser med bred substratspecificitet. Tre af dem viste sig at have a-galactosidaseaktivitet.
- GH110-familien inkluderer unikke α-galactosidaser, der er i stand til at fraspalte α-D-galactoserester ved at invertere deres optiske konfiguration. Sådanne enzymer er blevet fundet i bakterierne Bacteroides fragilis , B. thetaiotaomicron og Streptomyces avermitilis .
Det er sandsynligt, at α-galactosidasegenerne fra GH27, GH36, GH57 og GH97 familierne har en fælles evolutionær oprindelse.
Arvelige sygdomme forbundet med insufficiens melibiasis
Mange mutationer i α-galactosidasegenet hos mennesker fører til Fabrys sygdom , og i α-N-acetylgalactosaminidasegenet til Schindlers sygdom , også kendt
sygdomKanzakissom
Se også
