PRPF8

Pre-mRNA-splejsningsprocesseringsfaktor 8 ( engelsk  "Pre-mRNA-processing-splejsningsfaktor 8 ") er et protein , som hos mennesker er kodet af PRPF8 -genet . [1] [2]

Præ-mRNA- splejsning gennemgår to på hinanden følgende transesterificeringstrin. Proteinet kodet af dette gen er en komponent af både U2- og U12-afhængige splejsosomer og skaber det nødvendige for at katalysere fase II af præ-mRNA- splejsningsprocessen . Det producerer adskillige WD-gentagelser, der fungerer i protein-til-protein-interaktioner. Dette protein har nogle ligheder med gærproteinet Prp8. Dette gen er en kandidat til autosomal dominant retinitis pigmentosa . [3]

Interaktioner

PRPF8 har vist sig at interagere med WDR57 [4] [5] og EFTUD2. [5]

Noter

1. ↑ McKie AB, McHale JC, Keen TJ, Tarttelin EE, Goliath R., van Lith-Verhoeven JJ, Greenberg J., Ramesar RS, Hoyng CB, Cremers FP, Mackey DA, Bhattacharya SS, Bird AC, Markham AF, Inglehearn CF Mutationer i præ-mRNA-splejsningsfaktorgenet PRPC8 i autosomal dominant retinitis pigmentosa (RP13  )  // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 2001. - Juli ( vol. 10 , nr. 15 ). - S. 1555-1562 . - doi : 10.1093/hmg/10.15.1555 . — PMID 11468273 .
2. ↑ Luo HR, Moreau GA, Levin N., Moore MJ Det humane Prp8-protein er en bestanddel af både U2- og U12-afhængige spliceosomer  //  RNA : journal. - 1999. - Juli ( bind 5 , nr. 7 ). - S. 893-908 . - doi : 10.1017/S1355838299990520 . — PMID 10411133 .
3. ↑ Entrez-gen: PRPF8 PRP8-præ-mRNA-behandlingsfaktor 8-homolog (S. cerevisiae) . (ubestemt)
4. ↑ Ewing, Rob M; Chu Peter, Elisma Fred, Li Hongyan, Taylor Paul, Climie Shane, McBroom-Cerajewski Linda, Robinson Mark D., O'Connor Liam, Li Michael, Taylor Rod, Dharsee Moyez, Ho Yuen, Heilbut Adrian, Moore Lynda, Zhang Shudong , Ornatsky Olga, Bukhman Yury V., Ethier Martin, Sheng Yinglun, Vasilescu Julian, Abu-Farha Mohamed, Lambert Jean-Philippe, Duewel Henry S., Stewart Ian I., Kuehl Bonnie, Hogue Kelly, Colwill Karen, Gladwish Katharine, Muskat Brenda, Kinach Robert, Adams Sally-Lin, Moran Michael F., Morin Gregg B., Topaloglou Thodoros, Figeys Daniel. Storskala kortlægning af humant protein-protein interaktioner ved massespektrometri   // Mol . Syst. Biol. : journal. - England, 2007. - Vol. 3 , nr. 1 . — S. 89 . - doi : 10.1038/msb4100134 . — PMID 17353931 .
5. ↑ 1 2 Achsel, T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp S; Lührmann R. Det menneskelige U5-220kD-protein (hPrp8) danner et stabilt RNA-frit kompleks med flere U5-specifikke proteiner, herunder en RNA-afvikling, en homolog af ribosomal forlængelsesfaktor EF-2 og et nyt WD-40-  protein.)  // Mol. celle. Biol. : journal. - USA, 1998. - November ( bind 18 , nr. 11 ). - P. 6756-6766 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9774689 .

Links

• GeneReviews/NIH/NCBI/UW-indgang om Retinitis Pigmentosa Oversigt

Litteratur

• Grainger RJ, Beggs JD Prp8-protein: I hjertet af spliceosomet  (neopr.)  // RNA. - 2005. - T. 11 , nr. 5 . - S. 533-557 . - doi : 10.1261/rna.2220705 . — PMID 15840809 .
• Garcia-Blanco MA, Anderson GJ, Beggs J., Sharp PA Et pattedyrsprotein på 220 kDa binder præ-mRNA'er i spliceosomet  : en potentiel homolog af gærproteinet PRP8  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of Amerika  : tidsskrift. - 1990. - Bd. 87 , nr. 8 . - s. 3082-3086 . - doi : 10.1073/pnas.87.8.3082 . — PMID 2139226 .
• Pinto AL, Steitz JA Pattedyrsanalogen af ​​gær PRP8-splejsningsproteinet er til stede i U4/5/6 lille nukleare ribonukleoproteinpartikel og spliceosomet   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1989. - Bd. 86 , nr. 22 . - P. 8742-8746 . - doi : 10.1073/pnas.86.22.8742 . — PMID 2479028 .
• Bach M., Winkelmann G., Lührmann R. 20S small nuclear ribonucleoprotein U5 viser en overraskende kompleks proteinsammensætning  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1989. - Bd. 86 , nr. 16 . - P. 6038-6042 . - doi : 10.1073/pnas.86.16.6038 . — PMID 2527369 .
• Anderson GJ, Bach M., Lührmann R., Beggs JD Bevarelse mellem gær og menneske af et protein forbundet med U5 small nuklear ribonucleoprotein  (engelsk)  // Nature : journal. - 1990. - Bd. 342 , nr. 6251 . - s. 819-821 . - doi : 10.1038/342819a0 . — PMID 2532307 .
• Umen JG, Guthrie C. Prp16p, Slu7p og Prp8p interagerer med 3'-splejsningsstedet i to adskilte stadier under det andet katalytiske trin af præ-mRNA-splejsning  //  RNA: journal. - 1996. - Bd. 1 , nr. 6 . - S. 584-597 . — PMID 7489518 .
• Goliat R; Shugart Y; Janssens P; Weissenbach, J; Beighton, P; Ramasar, R; Greenberg, J. Fin lokalisering af locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa på kromosom 17p   // Am . J. Hum. Genet. : journal. - 1995. - Bd. 57 , nr. 4 . - S. 962-964 . — PMID 7573060 .
• Greenberg J., Goliath R., Beighton P., Ramesar R. Et nyt sted for autosomal dominant retinitis pigmentosa på den korte arm af kromosom 17  // Human Molecular  Genetics : journal. - Oxford University Press , 1994. - Vol. 3 , nr. 6 . - S. 915-918 . - doi : 10.1093/hmg/3.6.915 . — PMID 7951236 .
• Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: en simpel metode til at erstatte cap-strukturen af ​​eukaryote mRNA'er med oligoribonukleotider  (engelsk)  // Gene : journal. - Elsevier , 1994. - Vol. 138 , nr. 1-2 . - S. 171-174 . - doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . — PMID 8125298 .
• Kojis TL; Heinzmann C; Flodman P; Ngo, JT; Sparkes, R.S.; Spence, M.A.; Bateman, JB; Heckenlively, JR Kortlægning af forfining af locus RP13 til humant kromosom 17p13.3 i en anden familie med autosomal dominant retinitis pigmentosa   // Am . J. Hum. Genet. : journal. - 1996. - Bd. 58 , nr. 2 . - S. 347-355 . — PMID 8571961 .
• Reyes JL, Kois P., Konforti BB, Konarska MM Det kanoniske GU-dinukleotid på 5'-splejsningsstedet genkendes af p220 af U5 snRNP i spliceosomet  //  RNA: journal. - 1996. - Bd. 2 , nr. 3 . - S. 213-225 . — PMID 8608445 .
• Hinz M., Moore MJ, Bindereif A. Domæneanalyse af humant U5 RNA. Cap-trimethylering, proteinbinding og spliceosomsamling  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 1996. - Bd. 271 , nr. 31 . - S. 19001-19007 . doi : 10.1074 / jbc.271.31.19001 . — PMID 8702566 .
• Chiara MD, Palandjian L., Feld Kramer R., Reed R. Bevis for, at U5 snRNP genkender 3'-splejsningsstedet for katalytisk trin II hos pattedyr  // EMBO  J. : journal. - 1997. - Bd. 16 , nr. 15 . - P. 4746-4759 . - doi : 10.1093/emboj/16.15.4746 . — PMID 9303319 .
• Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagawa K; Maruyama K; Suyama, A; Sugano, S. Konstruktion og karakterisering af et fuldlængde beriget og et 5'-ende beriget cDNA  bibliotek //  Gen : journal. - Elsevier , 1997. - Vol. 200 , nej. 1-2 . - S. 149-156 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . — PMID 9373149 .
• Achsel T; Ahrens K; Brahms H; Teigelkamp, ​​S; Lührmann, R. Det menneskelige U5-220kD-protein (hPrp8) danner et stabilt RNA-frit kompleks med flere U5-specifikke proteiner, herunder en RNA-afvikling, en homolog af ribosomal forlængelsesfaktor EF-2 og et nyt WD-40-protein  ( engelsk)  // Mol. celle. Biol. : journal. - 1998. - Bd. 18 , nr. 11 . - P. 6756-6766 . — PMID 9774689 .
• Reyes JL; Gustafson EH; LuoHR; Moore, Melissa J.; Konarska, Maria M. Den C-terminale region af hPrp8 interagerer med det konserverede GU-dinukleotid på 5'-splejsningsstedet  //  RNA: journal. - 1999. - Bd. 5 , nr. 2 . - S. 167-179 . - doi : 10.1017/S1355838299981785 . — PMID 10024169 .
• Makarov EM, Makarova OV, Achsel T., Lührmann R. Den humane homolog af gærsplejsningsfaktoren prp6p indeholder flere TPR-elementer og er stabilt forbundet med U5 snRNP via protein-protein-interaktioner  (engelsk)  // J. Mol. Biol. : journal. - 2000. - Vol. 298 , nr. 4 . - S. 567-575 . doi : 10.1006 / jmbi.2000.3685 . — PMID 10788320 .
• Le Hir H., Moore MJ, Maquat LE Pre-mRNA-splejsning ændrer mRNP-sammensætning: bevis for stabil association af proteiner ved exon-exon-forbindelser  // Genes Dev  .  : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 9 . - S. 1098-1108 . — PMID 10809668 .
• McHale JC, McKie AB, Tarttelin EE, Inglehearn CF Ekspressionskort over humant kromosomområde 17p13.3, der spænder over det RP13 dominante retinitis pigmentosa locus, Miller-Dieker lissencephaly syndrom (MDLS) regionen og et formodet tumor suppressor  locus  // Cytogenetisk og Genomforskning : journal. — Karger Forlag, 2000. - Vol. 88 , nr. 3-4 . - S. 225-229 . - doi : 10.1159/000015556 . — PMID 10828595 .