PRPF31

PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (S. cerevisiae [  1] ) , også kendt som PRPF31 , er et protein kodet af det humane genom PRPF31. [2]

Funktion

PRPF31 er genet, der koder for hPRP31-splejsningsfaktoren. Dette er vigtigt for dannelsen af ​​hPRP31 splejser forbundet med U4/U4 di-snRNP'er og interagerer med en anden hPRP6 splejsningsfaktor for at danne U4/U6-U5 tri-snRNP'er. Det har vist sig, at når hPRP31 RNAi fejler, akkumuleres U4/U6 di-snPRNP'er i Cajal - kroppe, og U4/U6-U5 tri-snRNP kan ikke dannes. [3]

PRPF31 får introner efter tilsætning af U4 og U6 RNA'er og 15,5K af NHP2L1 proteinet. Tilsætningen af ​​PRPF31 er kritisk for overgangen af ​​spliceosomkomplekset til en aktiveret tilstand. [fire]

Klinisk betydning

En mutation i PRPF31 er en af ​​4 kendte splejsningsfaktormutationer, der vides at forårsage retinitis pigmentosa . Den første mutation i PRPF31 blev opdaget af Vithana et al. i 2001. [2] Retinitis pigmentosa (RP) er en klinisk og genetisk heterogen gruppe af retinal dystrofi karakteriseret ved progressiv degeneration af fotoreceptorer , der i sidste ende fører til alvorlig synsnedsættelse. [5]

Arv

Mutationer i PRPF31 nedarves på en autosomal dominant måde, hvilket resulterer i 2,5% af tilfældene af autosomal dominant retinitis pigmentosa (adRP) i den britiske blandede befolkning. [6] Mønstret for nedarvning af PRPF31-mutationer er dog typisk ikke dominerende arv, hvilket viser fænomenet med delvis penetrering, hvor dominerende mutationer optræder med "spring"-generationer. Dette menes at skyldes tilstedeværelsen af ​​to vildtype alleler , en højekspressionsallel og en  lavekspressionsallel . Hvis patienten har en mutant allel og en højt udtrykt allel, repræsenterer de ikke en sygdomsfænotype. Hvis patienten har en mutant allel og en allel med lav udtryksevne, falder det resterende proteinniveau under tærsklen for normal funktion, i hvilket tilfælde de repræsenterer en sygdomsfænotype. Derfor kan mønsteret af PRPF31-arvning betragtes som en type haploinsufficiens. Denne haploinsufficiensvariant ses kun i to andre humane sygdomme: erythrocytprotoporfyri forårsaget af mutationer i FECH-genet; og arvelig ovalocytose forårsaget af mutationer i spektringenet . [7] [8]

Noter

1. ↑ Sandsynligvis er Saccharomyces cerevisiae en bagegær, hvilket betyder den menneskelige homolog af denne svamp
2. ↑ 1 2 Vithana EN, Abu-Safieh L., Allen MJ, Carey A., Papaioannou M., Chakarova C., Al-Maghtheh M., Ebenezer ND, Willis C., Moore AT, Bird AC, Hunt DM, Bhattacharya SS En human homolog af præ-mRNA-splejsningsgen fra gær, PRP31, ligger til grund for autosomal dominant retinitis pigmentosa på kromosom 19q13.4 (RP11  )  // Molecular Cell : journal. - 2001. - August ( bind 8 , nr. 2 ). - s. 375-381 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . — PMID 11545739 .
3. ↑ Schaffert N., Hossbach M., Heintzmann R., Achsel T., Lührmann R. RNAi knockdown af hPrp31 fører til en ophobning af U4/U6 di-snRNP'er i Cajal-kroppe  //  The EMBO Journal : journal. - 2004. - August ( bind 23 , nr. 15 ). - S. 3000-3009 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600296 . — PMID 15257298 .
4. ↑ Liu S., Li P., Dybkov O., Nottrott S., Hartmuth K., Lührmann R., Carlomagno T., Wahl MC Binding af det humane Prp31 Nop-domæne til en sammensat RNA-proteinplatform i U4  snRNP.)  // Videnskab: tidsskrift. - 2007. - April ( bd. 316 , nr. 5821 ). - S. 115-120 . - doi : 10.1126/science.1137924 . — PMID 17412961 .
5. ↑ Entrez-gen: PRPF31 PRP31-præ-mRNA-bearbejdningsfaktor 31-homolog (S. cerevisiae) . (ubestemt)
6. ↑ Waseem NH, Vaclavik V., Webster A., ​​​​Jenkins SA, Bird AC, Bhattacharya SS Mutationer i genet, der koder for præ-mRNA-splejsningsfaktoren, PRPF31, hos patienter med autosomal dominant retinitis pigmentosa   // Undersøgende oftalmologi og visuel Videnskab : journal. - 2007. - Marts ( bd. 48 , nr. 3 ). - S. 1330-1334 . - doi : 10.1167/iovs.06-0963 . — PMID 17325180 .
7. ↑ Randon J., Boulanger L., Marechal J., Garbarz M., Vallier A., ​​​​Ribeiro L., Tamagnini G., Dhermy D., Delaunay J. En variant af spektrin lavekspressionsallel alpha LELY, der bærer en arvelig elliptocytosemutation i codon 28  // British  Journal of Hematology : journal. - 1994. - November ( bind 88 , nr. 3 ). - S. 534-540 . - doi : 10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x . — PMID 7819065 .
8. ↑ Gouya L., Puy H., Lamoril J., Da Silva V., Grandchamp B., Nordmann Y., Deybach JC. Arv i erytropoietisk protoporfyri: en almindelig vildtype ferrochelatase allelvariant med lav ekspression tegner sig for klinisk manifestation  // American  Journal of Human Genetics : journal. - 1998. - Juni ( bind 93 , nr. 6 ). - S. 2150-2110 . — PMID 10068685 .

Litteratur

• Tarizzo ML Verdenssundhedsorganisationen og forebyggelse af blindhed  (engelsk)  // Transaktioner. Afsnit om oftalmologi. American Academy of Ophthalmology and Otolaryngology: tidsskrift. - 1975. - Bd. 79 , nr. 3 Pt 2 . - P. OP453-6 . — PMID 1154573 .
• al-Maghtheh M., Inglehearn CF, Keen TJ, et al. Identifikation af et sjette locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa på kromosom 19  // Human  Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 1994. - Vol. 3 , nr. 2 . - s. 351-354 . - doi : 10.1093/hmg/3.2.351 . — PMID 8004108 .
• Al-Maghtheh M., Vithana E., Tarttelin E., et al. Beviser for en større retinitis pigmentosa locus på 19q13.4 (RP11) og association med en unik bimodal ekspressivitetsfænotype  //  American Journal of Human Genetics : journal. - 1996. - Bd. 59 , nr. 4 . - s. 864-871 . — PMID 8808602 .
• Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA-kloning ved hjælp af in vitro stedspecifik  rekombination  // Genomforskning : journal. - 2001. - Bd. 10 , nej. 11 . - S. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
• Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Mod et katalog over menneskelige gener og proteiner: sekventering og analyse af 500 nye komplette proteinkodende humane  cDNA'er  // Genomforskning : journal. - 2001. - Bd. 11 , nr. 3 . - S. 422-435 . - doi : 10.1101/gr.GR1547R . — PMID 11230166 .
• Simpson JC, Wellenreuther R., Poustka A., et al. Systematisk subcellulær lokalisering af nye proteiner identificeret ved storskala cDNA-sekventering  //  EMBO - rapporter : journal. - 2001. - Bd. 1 , nr. 3 . - S. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
• Vithana EN, Abu-Safieh L., Allen MJ, et al. En human homolog af gær-pre-mRNA-splejsningsgen, PRP31, ligger til grund for autosomal dominant retinitis pigmentosa på kromosom 19q13.4 (RP11  )  // Molecular Cell : journal. - 2001. - Bd. 8 , nr. 2 . - s. 375-381 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00305-7 . — PMID 11545739 .
• Makarova OV, Makarov EM, Liu S., et al. Protein 61K, kodet af et gen (PRPF31) knyttet til autosomal dominant retinitis pigmentosa, er påkrævet for U4/U6 U5 tri-snRNP-dannelse og præ-mRNA-splejsning  //  The EMBO Journal : journal. - 2002. - Bd. 21 , nr. 5 . - S. 1148-1157 . - doi : 10.1093/emboj/21.5.1148 . — PMID 11867543 .
• Deery EC, Vithana EN, Newbold RJ, et al. Sygdomsmekanisme for retinitis pigmentosa (RP11) forårsaget af mutationer i splejsningsfaktorgenet PRPF31   // Human Molecular Genetics : journal. - Oxford University Press , 2003. - Vol. 11 , nr. 25 . - P. 3209-3219 . - doi : 10.1093/hmg/11.25.3209 . — PMID 12444105 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2003. - Bd. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
• Martínez-Gimeno M., Gamundi MJ, Hernan I., et al. Mutationer i præ-mRNA-splejsningsfaktorgenerne PRPF3, PRPF8 og PRPF31 i spanske familier med autosomal dominant retinitis pigmentosa   // Undersøgende oftalmologi og visuel videnskab : journal. - 2003. - Bd. 44 , nr. 5 . - S. 2171-2177 . - doi : 10.1167/iovs.02-0871 . — PMID 12714658 .
• Scanlan MJ, Gout I., Gordon CM, et al. Humoral immunitet mod human brystkræft: antigendefinition og kvantitativ analyse af mRNA-ekspression  (engelsk)  // Cancer Immun. : journal. - 2003. - Bd. 1 . — S. 4 . — PMID 12747765 .
• Wang L., Ribaudo M., Zhao K., et al. Ny sletning i præ-mRNA-splejsningsgenet PRPF31 forårsager autosomal dominant retinitis Pigmentosa i en stor kinesisk familie  // American  Journal of Medical Genetics : journal. - 2003. - Bd. 121 , nr. 3 . - S. 235-239 . - doi : 10.1002/ajmg.a.20224 . — PMID 12923864 .
• Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q., et al. Gær to-hybrid screeninger indebærer involvering af Fanconi anæmiproteiner i transkriptionsregulering, cellesignalering, oxidativ metabolisme og cellulær transport  //  Eksperimentel celleforskning : journal. - 2003. - Bd. 289 , nr. 2 . - S. 211-221 . - doi : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . — PMID 14499622 .
• Vithana EN, Abu-Safieh L., Pelosini L., et al. Ekspression af PRPF31 mRNA hos patienter med autosomal dominant retinitis pigmentosa: et molekylært spor for ufuldstændig penetrance? (engelsk)  // Undersøgende oftalmologi & visuel videnskab : journal. - 2003. - Bd. 44 , nr. 10 . - P. 4204-4209 . - doi : 10.1167/iovs.03-0253 . — PMID 14507862 .
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Komplet sekventering og karakterisering af 21.243 fuldlængde humane cDNA'er  // Nature Genetics  : tidsskrift  . - 2004. - Bd. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
• Grimwood J., Gordon LA, Olsen A., et al. DNA-sekvensen og biologien af ​​humant kromosom 19  (engelsk)  // Nature : journal. - 2004. - Bd. 428 , nr. 6982 . - S. 529-535 . - doi : 10.1038/nature02399 . — PMID 15057824 .
• Xia K., Zheng D., Pan Q., et al. En ny PRPF31 splejsningssted mutation i en kinesisk familie med autosomal dominant retinitis pigmentosa   // Molecular Vision : journal. - 2004. - Bd. 10 . - S. 361-365 . — PMID 15162096 .
• Schaffert N., Hossbach M., Heintzmann R., et al. RNAi knockdown af hPrp31 fører til en ophobning af U4/U6 di-snRNP'er i Cajal-kroppe  //  The EMBO Journal : journal. - 2005. - Bd. 23 , nr. 15 . - S. 3000-3009 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600296 . — PMID 15257298 .
• Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet og udvidelse af NIH fuldlængde cDNA-projektet: Mammalian Gene Collection (MGC  )  // Genome Research : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .