Ku

X-ray skade reparation krydskomplementerende protein 5

Krystalstruktur af humant Ku-protein forbundet med DNA. Ku70 er vist i magenta, Ku80 i blåt og DNA-strenge i grønt. [en]
Notation
Symboler XRCC5 ; Ku80
Entrez Gene 7520
HGNC 12833
OMIM 194364
FBF 1JEY
RefSeq NM_021141
UniProt P13010
Andre data
Locus 2. højderyg , 2q35
Oplysninger i Wikidata  ?
X-ray skade reparation krydskomplementerende protein 6
Notation
Symboler XRCC6 ; Ku70, G22P1
Entrez Gene 2547
HGNC 4055
OMIM 152690
FBF 1JEY
RefSeq NM_001469
UniProt P12956
Andre data
Locus 22. kap. , 22q11 -q13
Oplysninger i Wikidata  ?

Ku  er et protein , der binder til dobbeltstrengsbrud i DNA -strukturen . Ku er påkrævet til DNA-reparation via den ikke-homologe endeforbindelse (NHEJ)-vejen. Ku er evolutionært konservativ fra bakterier til mennesker. Den gamle bakterielle Ku er en homodimer, [2] den eukaryote Ku-homolog er en heterodimer bestående af to polypeptider, Ku70 (et produkt af XRCC6-genet) og Ku80 (kodet af XRCC5-genet), molekylvægten af ​​disse polypeptider er 70 og 80 kDa , henholdsvis. Ku-underenhederne danner en kurvlignende struktur knyttet til enden af ​​DNA-molekylet. [3]Efter binding kan Ku glide langs DNA-kæden, i enden af ​​hvilken nye Ku-molekyler kan spændes. I højere eukaryoter danner Ku et kompleks med den katalytiske underenhed af den DNA-afhængige proteinkinase ( DNA-PKcs)) og danner en komplet DNA-afhængig proteinkinase, DNA-PK. [4] Ku ser ud til at fungere som en molekylær rygrad , som andre proteiner involveret i NHEJ-processen knytter sig til.

Begge Ku-underenheder er blevet eksperimentelt fjernet fra musegenomet. Disse mus havde forskellige kromosomale omlejringer , hvilket indikerer behovet for NHEJ for at opretholde genomets integritet . [5] [6]

I mange organismer har Ku yderligere funktioner til at opretholde telomerstrukturen . [7]

Overfloden af ​​Ku80 ser ud til at påvirke organismers levetid. [otte]

Noter

  1. FBF 1JEY ; Walker JR, Corpina RA, Goldberg J. Strukturen af ​​Ku-heterodimeren bundet til DNA og dens implikationer for reparation af dobbeltstrengsbrud  //  Nature: journal. - 2001. - August ( bd. 412 , nr. 6847 ). - s. 607-614 . - doi : 10.1038/35088000 . — PMID 11493912 .
  2. Doherty AJ, Jackson SP, Weller GR Identifikation af bakterielle homologer af Ku DNA reparationsproteinerne  //  FEBS Letters : journal. - 2001. - Juli ( bind 500 , nr. 3 ). - S. 186-188 . - doi : 10.1016/S0014-5793(01)02589-3 . — PMID 11445083 .
  3. Walker JR, Corpina RA, Goldberg J. Strukturen af ​​Ku-heterodimeren bundet til DNA og dens implikationer for reparation af dobbeltstrengsbrud  //  Nature: journal. - 2001. - August ( bd. 412 , nr. 6847 ). - s. 607-614 . - doi : 10.1038/35088000 . — PMID 11493912 .
  4. Carter T., Vancurová I., Sun I., Lou W., DeLeon S. En DNA-aktiveret proteinkinase fra HeLa-cellekerner  //  Molecular and Cellular Biology : journal. - 1990. - December ( bind 10 , nr. 12 ). - P. 6460-6471 . — PMID 2247066 .
  5. Difilippantonio MJ, Zhu J., Chen HT, Meffre E., Nussenzweig MC, Max EE, Ried T., Nussenzweig A. DNA-reparationsprotein Ku80 undertrykker kromosomafvigelser og malign transformation  //  Nature : journal. - 2000. - Marts ( bind 404 , nr. 6777 ). - S. 510-514 . - doi : 10.1038/35006670 . — PMID 10761921 .
  6. Ferguson DO, Sekiguchi JM, Chang S., Frank KM, Gao Y., DePinho RA, Alt FW Den ikke-homologe endeforbindelsesvej for DNA-reparation er påkrævet for genomisk stabilitet og undertrykkelse af translokationer   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidsskrift. - 2000. - Juni ( bind 97 , nr. 12 ). - P. 6630-6633 . - doi : 10.1073/pnas.110152897 . PMID 10823907 .
  7. Boulton SJ, Jackson SP Komponenter af den Ku-afhængige ikke-homologe endeforbindelsesvej er involveret i vedligeholdelse af telomer længde og telomer silencing  //  The EMBO Journal : journal. - 1998. - Marts ( bind 17 , nr. 6 ). - P. 1819-1828 . - doi : 10.1093/emboj/17.6.1819 . — PMID 9501103 .
  8. Lorenzini A., Johnson FB, Oliver A., ​​​​Tresini M., Smith JS, Hdeib M., Sell C., Cristofalo VJ, Stamato TD Signifikant korrelation af arternes levetid med genkendelse af DNA-dobbeltstrengsbrud, men ikke med telomerlængde  .)  // Mech Aging Dev. : journal. - 2009. - Nov-Dec ( bind 130 , nr. 11-12 ). - s. 784-792 . - doi : 10.1016/j.mad.2009.10.004 . — PMID 19896964 .