Ku80

Røntgenreparation, der komplementerer defekt reparation i kinesiske hamsterceller 5 (dobbeltstrengsbrud gensammenføjning)

PDB -gengivelse baseret på 1jeq.
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolXRCC5  ; KARP-1; KARP1; KU80; KUB2; Ku86; NFIV
Eksterne ID'erOMIM:  194364 MGI :  104517 HomoloGene :  40681 GeneCards : XRCC5 Gen
EF-nummer3.6.1. EC 3.6.1.
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez752022596
EnsembleENSG00000079246ENSMUSG00000026187
UniProtP13010P27641
RefSeq (mRNA)NM_021141NM_009533
RefSeq (protein)NP_066964NP_033559
Locus (UCSC)Chr 2:
216,11 – 216,21 Mb		Chr 1:
72,31 – 72,39 Mb
Søg i PubMed[en][2]

Ku80  er et protein kodet i mennesker af XRCC5 -genet . [1] Sammen med Ku70 -proteinet danner Ku80-proteinet en heterodimer, der binder til enderne af DNA-dobbeltstrengsbrud og er nødvendig for DNA-reparation ved ikke-homolog endesammenføjning ( NHEJ ). Ku -proteinet er også påkrævet til V(D)J-rekombination , som bruger NHEJ-vejen til at skabe en mangfoldighed af antistof-antigenbindingssteder i pattedyrets immunsystem .

Ku er også påkrævet for at opretholde telomerlængde og dæmpning af nær-telomere gener. [2]

Ku blev først opdaget hos patienter med systemisk lupus erythematosus , som viste høje antistoftitre mod dette protein. [en]

Ku80 har flere andre navne:

Klinisk betydning

En sjælden mikrosatellitpolymorfi af dette gen er forbundet med tumorer hos patienter med varierende følsomhed over for radioaktivitet. [3]

Interaktioner

Protein-protein interaktioner af Ku80 med NCOA6 , [4] [5] GCN5L2 , [6] Ku70 , [6] [7] [8] [9] [10] ATP-afhængig Werner syndrom helicase er vist, [11] [ 12] Tyrosinkinase 2, [13] c-Abl-protein i den homologe kinase-katalytiske region af DNA-afhængig proteinkinase, [14] [15] [7] TERF2IP , [16] telomer revers transkriptase, [17] POU2F1 [18 ] ] [15] og PCNA -proteinet . [15] [19] [20]

Noter

  1. ↑ 1 2 Entrez-gen: XRCC6 røntgenreparation, der komplementerer defekt reparation i kinesiske hamsterceller 6 (Ku autoantigen, 70 kDa) .
  2. ↑ Boulton SJ, Jackson SP Komponenter af den Ku-afhængige ikke-homologe endeforbindelsesvej er involveret i vedligeholdelse af telomer længde og telomer silencing  // EMBO  J. : journal. - 1998. - Marts ( bind 17 , nr. 6 ). - P. 1819-1828 . - doi : 10.1093/emboj/17.6.1819 . — PMID 9501103 .
  3. ↑ Entrez-gen: XRCC5-røntgenreparation, der komplementerer defekt reparation i kinesiske hamsterceller 5 (dobbeltstrengsbrud-gensammenføjning; Ku-autoantigen, 80 kDa) . Arkiveret fra originalen den 8. marts 2010.
  4. ↑ Ko, ​​​​L; Cardona G R., Chin W W. Thyreoideahormonreceptorbindende protein, et LXXLL-motivholdigt protein, fungerer som en generel coactivator  (engelsk)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. — USA, 2000 . - maj ( bd. 97 , nr. 11 ). - P. 6212-6217 . — ISSN 0027-8424 . — PMID 10823961 .
  5. ↑ Ko, ​​​​Lan; Chin William W. Nuklear receptor coactivator thyroidhormon receptor-bindende protein (TRBP) interagerer med og stimulerer dets associerede DNA-afhængige proteinkinase  //  J. Biol. Chem.  : journal. - USA, 2003 . - Marts ( bd. 278 , nr. 13 ). - S. 11471-11479 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M209723200 . — PMID 12519782 .
  6. ↑ 12 Barlev , N.A.; Poltoratsky V., Owen-Hughes T., Ying C., Liu L., Workman JL., Berger S L. Undertrykkelse af GCN5 histonacetyltransferaseaktivitet via bromodæne-medieret binding og phosphorylering af det Ku-DNA-afhængige proteinkinasekompleks  (engelsk)  // Mol. celle. Biol. : journal. — USA, 1998 . - Marts ( bd. 18 , nr. 3 ). - S. 1349-1358 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9488450 .
  7. ↑ 1 2 Gell, D; Jackson S P. Kortlægning af protein-protein-interaktioner inden for det DNA-afhængige proteinkinasekompleks  // Nucleic Acids Res  . : journal. — ENGLAND, 1999 . - september ( bd. 27 , nr. 17 ). - P. 3494-3502 . — PMID 10446239 .
  8. ↑ Yang, C.R.; Yeh S., Leskov K., Odegaard E., Hsu H L., Chang C., Kinsella T J., Chen D J., Boothman D A. Isolation of Ku70-binding proteins (KUBs  )  // Nucleic Acids Res. : journal. — ENGLAND, 1999 . - maj ( bd. 27 , nr. 10 ). - S. 2165-2174 . — ISSN 0305-1048 . — PMID 10219089 .
  9. ↑ Singleton, BK; Torres-Arzayus M I., Rottinghaus S T., Taccioli G E., Jeggo PA . C-terminalen af ​​Ku80 aktiverer den DNA-afhængige proteinkinase-katalytiske underenhed   // Mol . celle. Biol. : journal. — USA, 1999 . - maj ( bd. 19 , nr. 5 ). - s. 3267-3277 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 10207052 .
  10. ↑ Sang, K; Jung D., Jung Y., Lee S G., Lee I. Interaktion af human Ku70 med TRF2  (Eng.)  // FEBS Lett. : journal. — NEDERLANDENE, 2000 . - september ( bd. 481 , nr. 1 ). - S. 81-5 . — ISSN 0014-5793 . — PMID 10984620 .
  11. ↑ Karmakar, Parimal; Snowden Carey M., Ramsden Dale A., Bohr Vilhelm A. Ku-heterodimer binder til begge ender af Werner-proteinet og funktionel interaktion forekommer ved Werner N-terminus  // Nucleic Acids Res  . : journal. - England, 2002 . - August ( bd. 30 , nr. 16 ). - P. 3583-3591 . — PMID 12177300 .
  12. ↑ Li, B; Comai L. Funktionel interaktion mellem Ku og werner-syndromproteinet i DNA-endebehandling  //  J. Biol. Chem.  : journal. — USA, 2000 . - september ( bd. 275 , nr. 37 ). - P. 28349-28352 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074/ jbc.C000289200 . — PMID 10880505 .
  13. ↑ Adam, L; Bandyopadhyay D., Kumar R. Interferon-alfa-signalering fremmer kerne-til-cytoplasmatisk omfordeling af p95Vav og dannelse af et multisubunit-kompleks, der involverer Vav, Ku80 og Tyk2   // Biochem . Biofys. Res. commun. : journal. — USA, 2000 . januar ( bd. 267 , nr. 3 ). - S. 692-696 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1006/bbrc.1999.1978 . — PMID 10673353 .
  14. ↑ Jin, S; Kharbanda S., Mayer B., Kufe D., Weaver D. T. Binding af Ku og c-Abl ved kinasehomologiregionen af ​​DNA-afhængig proteinkinase-katalytisk underenhed  //  J. Biol. Chem.  : journal. — USA, 1997 . - oktober ( bd. 272 , nr. 40 ). - P. 24763-24766 . — ISSN 0021-9258 . — PMID 9312071 .
  15. ↑ 1 2 3 Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T., Price Gerald B., Zannis-Hadjopoulos Maria. Ku-antigen, et oprindelsesspecifikt bindingsprotein, der associeres med replikationsproteiner, er påkrævet til pattedyrs DNA-replikation   // Biochim . Biofys. Acta : journal. - Holland, 2002 . - Oktober ( bd. 1578 , nr. 1-3 ). - S. 59-72 . — ISSN 0006-3002 . — PMID 12393188 .
  16. ↑ O'Connor, Matthew S; Safari Amin, Liu Dan, Qin Jun, Songyang Zhou. Det humane Rap1-proteinkompleks og modulering af telomerlængde  //  J. Biol. Chem.  : journal. - USA, 2004 . juli ( bd. 279 , nr. 27 ). - P. 28585-28591 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M312913200 . — PMID 15100233 .
  17. ↑ Chai, Weihang; Ford Lance P., Lenertz Lisa, Wright Woodring E., Shay Jerry W. Human Ku70/80 forbinder fysisk med telomerase gennem interaktion med hTERT  //  J. Biol. Chem.  : journal. - USA, 2002 . —December ( bd. 277 , nr. 49 ). - P. 47242-47247 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208542200 . — PMID 12377759 .
  18. ↑ Schild-Poulter, C; Pope L., Giffin W., Kochan J C., Ngsee J K., Traykova-Andonova M., Haché R J. Bindingen af ​​Ku-antigen til homeodomæneproteiner fremmer deres phosphorylering af DNA-afhængig  proteinkinase  / J. Biol. Chem.  : journal. - USA, 2001 . - maj ( bd. 276 , nr. 20 ). - P. 16848-16856 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M100768200 . — PMID 11279128 .
  19. ↑ Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi, Sugimoto Katsunori, Obuse Chikashi, Tsurimoto Toshiki. En proteomisk tilgang til at identificere prolifererende cellekerneantigen (PCNA)-bindende proteiner i humane cellelysater. Identifikation af det humane CHL12/RFCs2-5-kompleks som et nyt PCNA-bindende protein  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - USA, 2002 . - oktober ( bd. 277 , nr. 43 ). - P. 40362-40367 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M206194200 . — PMID 12171929 .
  20. ↑ Balajee, AS; Geard CR. Chromatin-bundet PCNA-kompleksdannelse udløst af DNA-skade forekommer uafhængigt af ATM-genproduktet i humane celler  // Nucleic Acids Res  . : journal. - England, 2001 . marts ( bd. 29 , nr. 6 ). - S. 1341-1351 . — PMID 11239001 .

Litteratur