Ektomi (fra andet græsk ἐκτομή "skæring, afskæring"), udskæring ( latin excīsiō "skæring, udskæring") eller ekstirpation ( latin exstirpātiō "oprettelse") - som regel fuldstændig fjernelse af et organ eller en klart defineret anatomisk del af kroppen , i modsætning til resektion ( lat. resectiō "trunkering"), som involverer delvis fjernelse.
Normalt udføres en ektomi, hvis organet er påvirket af en tumor (især hvis tumoren er ondartet). Også en ektomi udføres i tilfælde af akut eller kronisk betændelse (for eksempel tonsillitis i mandlerne ), eller hvis der er indikationer for infertilitet ( vasektomi eller kastration ), og en tandektomi , hvis det er umuligt at redde en ødelagt tand .