Haplogruppe R (mtDNA)

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 2. juli 2021; checks kræver 7 redigeringer .
Haplogruppe R
Type mtDNA
Udseende tid 55 tusind år siden
Spawn placering Sydvestasien
Forfædres gruppe N
søstergrupper A , S , X , Y , N1 , N2
Underklader B , F , R0 , præ-JT , P , UK
Markør mutationer 12705, 16223

Haplogruppe R  er en human mitokondriel DNA- haplogruppe .

Oprindelse

Haplogruppen R er en efterkommer af makrogruppen N , og ifølge dens oldtid, udbredelsesbredde og antallet af efterkommergrupper, kan den i sig selv kaldes en makrogruppe. Det opstod sandsynligvis i det nære østen kort (kun et par tusinde år) efter, at det blev bosat af mennesker (ca. 55 tusind år siden). Senere blev der ekspanderet fra denne region, så bærerne af R-gruppen (ofte sammen med andre underklader af N-gruppen) spredte sig: sydpå til Arabien og det nordøstlige Afrika , østpå langs det iranske plateau , videre til Centralasien til Altai og Hindustan , nordpå ind i Anatolien , Kaukasus og videre ind i Østeuropa .

Underkladerne R5, R6 , R7 , R8, R30, R31 er autoktone haplogrupper i Indien. I datasættet for Centralasien (Comas et al. 2004) hører kun 2 ud af 232 slægter til R5 [1] .

Efterkommerne af denne gruppe inkluderer B , UK (og dets efterkommere U og K ), F , R0 (og dets efterkommere HV , H og V ) og præ-JT (og dets efterkommere JT , J og T ).

Paleogenetik

Den mitokondrielle haplogruppe R* blev opdaget i en paleo-sibirisk fra Ust-Ishim ( Ust-Ishim man ), som levede for 45 tusind år siden [2] , men i 2016 klassificerede Pozniks hold den mitokondrielle haplogruppe U* i Ust-Ishim [3 ] .

Haplogruppe R blev bestemt i den sene palæolitiske prøve CC7-2289 (for ca. 44 tusind år siden) fra Bacho Kiro- hulen i Bulgarien [4]

Haplogruppen R* omfatter mitokondrie-genomet af en mælketand fra Fumane Cave ( det: Grotta di Fumane ), fundet i et lag 41.110-38.500 år gammelt (Proto-Aurignacian) [5] .

Resterne af pigen Paglichci 23 ( en: Paglicci 23 ) fra den italienske hule Paglichci , omkring 28 tusind år gammel, viste sig at have Cambridge referencesekvensen ( en: Cambridge Reference Sequence ) HVR1, hvilket indikerer, at individet havde enten mitokondriel haplogruppe R eller den mitokondrielle haplogruppe H [6] . Analyse af DNA'et fra Cro-Magnon Paglicci-12 , der levede for omkring 24 tusind år siden, viste, at han tilhørte den mitokondrielle haplogruppe R [7] .

R1b-underlaget blev fundet i indbyggeren af ​​Mount Afontova AG-3, som levede for 16.930-16.490 år siden.

R1 blev bestemt i prøve yak025 (14865-14590 f.Kr.) fra Khaiyrgas Cave (Khaiyrgas Cave, Dyuktai kultur ) [8] . I Khaiyrgas-1 prøven fra Yakutia (16,9 tusind år siden) blev R1b bestemt [9] .

R9c1b blev identificeret i en Qihe3- prøve (11.747-11.356 år siden ) fra Fujian-provinsen i Kina [10] .

R2-a* blev identificeret i AH2-prøven (8205-7756 f.Kr.) fra Tepe Abdul Hosein i Iran (Shahrestan Nurabad ) [11] .

R11 [12] blev bestemt i prøve NE35 (AR8.9K, ARpost9K, 9131-8770 år siden ) fra Amur-regionen ( Kina ) [13] .

R3 findes i en repræsentant for yngre stenalder af Ungarn, som levede ca. 7500 år siden [14] .

R1b blev identificeret hos en mesolitisk indbygger på South Deer Island [15] .

R1a blev bestemt i de eneolitiske prøver I2055 (Unakozovskaya, for 6533 år siden) og I2056 (Unakozovskaya, for 6477,5 år siden) fra Nordkaukasus (Unakozovsky-hulen ved Meshoko-strømmen) [16] .

R1b1 blev identificeret fra en repræsentant for den estiske stridsøksekultur SOP002 (2864-2495 f.Kr.) fra Sope -gravpladsen i Ida-Viru County [17] .

R1a blev identificeret i en repræsentant for Novosvobodnensky-stadiet af Maikop-kulturen I6268 (5564 år siden) fra Klady -kanalen i Adygea [16] .

R1a1a blev bestemt i prøve MK5009.A0101 fra Nordkaukasus (Marinskaya for 5, 4710 år siden) [16] .

R1b1 blev bestemt i prøve GLZ003 fra Glazkovo (Glazkovskoe predmestie), dateret for 4519-4417 år siden. n. (Baikals tidlige bronzealder) [18] .

R1a blev identificeret blandt repræsentanter for Darkveti-Meshokovskaya-kulturen (perlekeramik) fra det sene eneolitikum [19] .

R1b blev bestemt ud fra bronzealderprøven Anosovo-1 fra Transbaikalia (ca. 4 tusind år siden) [9] .

R1b blev identificeret i en repræsentant for post-Catacomb Lolin kulturen NV3001 (Nevinnomiskiy 3, 3970,5 år siden) i Kalmykia ( Lola ) [16] .

R1b1 blev identificeret i prøven BIY002.A0101 (3.–2. århundrede f.Kr., Sargat-horisonten) fra Gornaya Bitiya-kanalen ved Ishim-floden, beliggende 8 km sydvest for landsbyen Nizhnyaya Ilyinka (Omsk-regionen) [20] .

R1b1 blev identificeret i Tarim-mumien L5213 (2000-1800 år siden) [21] .

R11 [12] blev fundet i det uklassificerede eksemplar KHI001 (middel-sen bronzealder) fra den østeurasiske steppe fra Altai [22] .

R1a blev bestemt i prøven ALA135 (1876-1636 f.Kr.) fra Tell-Atchan ( Alalakh , Tyrkiet) [23] .

R1b1 blev identificeret i repræsentanter for Unetice- kulturen fra Tjekkiet I14191 (Czech_EBA_Unetice, for 3850 år siden) [24] .

R1b1 blev fundet i prøve I3860 (Oy-Dzhaylau III, for 3626 år siden) fra middel-sen bronzealder i Kasakhstan (Oy_Dzhaylau_MLBA_o) [25] .

R9b1a3 blev identificeret i LayiKD01-prøven (1532-1403 år siden), R9b1b i QinchangKD14-prøven (1545-1407 år siden) fra Kina (Guangxi Zhuang Autonome Region) [10] .

R1a1a blev fundet i en prøve fra Kanagegh-gravpladsen (Kanagegh, Armenien) dateret 1500-1300 f.Kr. [26] .

R1b1 blev fundet hos en indbygger i Nerkin Getashen (Nerqin Getashen, Armenien), som levede 1400-1200 f.Kr. [26] .

Mitokondrielle haplogrupper R2 og R5 blev identificeret i prøver fra Haft-Tape- regionen i Middle Elam -perioden [27] .

R6 blev identificeret i en repræsentant for Koban-kulturen fra Zayukovo-3-gravpladsen, beliggende nær landsbyen Zayukovo i Baksan-regionen i den Kabardino-Balkariske Republik (VIII-VI århundreder f.Kr.) [28] .

R9 blev bestemt ud fra en prøve af hængende kister fra Yunnan [29] .

R30 blev bestemt hos en person med en sydasiatisk blanding på 40-50% fra kirkegården i Wat Komnou (Vat Komnou) i Angkor Borei ( Cambodja ), som levede i begyndelsen af ​​det 1. årtusinde (95% konfidensinterval - 78- 234, kalibreret dato) [30] .

R0a1 blev bestemt i prøver fra den kristne kirkegård R (~650-1000) på øen Kulubnarti i det nordlige Sudan [31] .

R11a blev fundet i det sene middelalderlige eksemplar DEC01/SHR001 fra Mongoliet [22] .

R1a1a blev fundet i det norske eksemplar VK114 fra Trondheim (12.-13. århundrede) [32] .

R9b1b blev bestemt i HuatuyanNL18-prøven (500 år siden), R+16189 i HuatuyanNL19-prøven (455-294 år siden) fra Kina (Guangxi Zhuang Autonome Region) [10] .

Noter

  1. ↑ Malliya gounder Palanichamy et al. Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Impplications for the People of South Asia Arkiveret 5. maj 2021 på Wayback Machine , december 2004
  2. ↑ SUPPLERENDE OPLYSNINGER 8. MITOCHONDRIEL GENOMANALYSE . Hentet 23. oktober 2014. Arkiveret fra originalen 24. marts 2016.
  3. ↑ Posnik GD et al. (2016) Punkterede udbrud i menneskelig mandlig demografi udledt af 1.244 verdensomspændende Y-kromosomsekvenser Arkiveret 28. maj 2017 på Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593-599 (Poznik supp. fig. 15).
  4. ↑ Jean-Jacques Hublin et al. Indledende øvre palæolitiske Homo sapiens fra Bacho Kiro Cave, Bulgarien Arkiveret 19. juni 2020 på Wayback Machine 11. maj 2020
  5. ↑ Palæogenetiske data bekræftede, at skaberne af den Proto-Aurignacian kultur var moderne mennesker Arkiveret 29. april 2015 på Wayback Machine , 27/04/2015
  6. ↑ En 28.000 år gammel Cro-Magnon mtDNA-sekvens adskiller sig fra alle potentielt kontaminerende moderne sekvenser
  7. ↑ Gammelt DNA . Dato for adgang: 1. februar 2015. Arkiveret fra originalen 23. april 2015.
  8. ↑ Gülşah Merve Kılınç et al. Undersøgelse af holocæn menneskelig befolkningshistorie i Nordasien ved hjælp af ældgamle mitogenomer Arkiveret 31. juli 2020 på Wayback Machine , 12. juni 2018 // Datasæt 1 / Tabel S4
  9. ↑ 1 2 Gülşah Merve Kılınç et al. Menneskelig befolkningsdynamik og Yersinia pestis i det gamle nordøstlige Asien Arkiveret 17. juni 2021 på Wayback Machine , 2021
  10. ↑ 1 2 3 Tianyi Wang et al. Menneskelig befolkningshistorie ved krydsfeltet mellem Øst- og Sydøstasien siden 11.000 år siden // Cell, 24. juni 2021
  11. ↑ Broushaki F. et al. (juli 2016). "Tidlige neolitiske genomer fra den østlige frugtbare halvmåne" . videnskab . 353 (6298). doi : 10.1126/science.aaf7943 . PMC  5113750 . PMID  27417496 . Arkiveret fra originalen 2020-02-22 . Hentet 2021-05-30 . Forældet parameter brugt |deadlink=( hjælp );Tjek datoen på |date=( hjælp på engelsk )
  12. ↑ 12 R11 MTree
  13. ↑ Xiaowei Mao et al. Den dybe befolkningshistorie i det nordlige Østasien fra sen pleistocæn til holocæn Arkiveret 28. juni 2021 på Wayback Machine 27. maj 2021
  14. ↑ Fu. Q. et al. Ice Age Europes genetiske historie , Nature, offentliggjort online 2. maj 2016.
  15. ↑ Alissa Mittnik et al. The Genetic History of Northern Europe Arkiveret 25. april 2017 på Wayback Machine , 03/03/2017
  16. ↑ 1 2 3 4 Chuan-Chao Wang et al. Den genetiske forhistorie af Greater Kaukasus Arkiveret 9. maj 2020 på Wayback Machine , 16. maj 2018
  17. ↑ Lehti Saag, Sergey V. Vasilyev, Svetlana V. Oshibkina et al. Genetiske herkomstændringer i overgangen fra sten til bronzealder i den østeuropæiske slette Arkiveret 23. januar 2021 ved Wayback Machine (tabel 1), 3. juli 2020 ( bioRxiv Arkiveret 30. januar 2021 ved Wayback Machine )
  18. ↑ He Yu et al. Paleolithic til bronzealder sibirere afslører forbindelser med de første amerikanere og på tværs af Eurasien Arkiveret 2. juli 2020 på Wayback Machine , 20. maj 2020
  19. ↑ Chuan-Chao Wang et al. Den genetiske forhistorie af Greater Kaukasus Arkiveret 18. maj 2018 på Wayback Machine 16. maj 2018
  20. ↑ Guido Alberto Gnecchi-Ruscone et al. Gamle genomiske tidstransekter fra den centralasiatiske steppe afslører skyternes historie Arkiveret 18. august 2021 på Wayback Machine // Science Advances. Vol. 7, udgave 13, 26. maj 2021
  21. ↑ Udvidede datatabel 1 Et resumé af bronzealderens Xinjiang-individer rapporteret i denne undersøgelse Arkiveret 29. oktober 2021 på Wayback Machine . Fra: Fan Zhang et al. Den genomiske oprindelse af bronzealderens Tarim Basin mumier Arkiveret 30. oktober 2021 på Wayback Machine // Nature, 2021
  22. ↑ 1 2 Choongwon Jeong et al. En dynamisk 6.000-årig genetisk historie om Eurasiens østlige steppe Arkiveret 3. november 2020 på Wayback Machine , 2020
  23. ↑ Tara Ingman et al. Menneskelig mobilitet ved Tell Atchana (Alalakh), Hatay, Tyrkiet i løbet af det 2. årtusinde f.Kr.: Integration af isotopisk og genomisk evidens Arkiveret 24. maj 2022 på Wayback Machine // Plos One, 30. juni 2021
  24. ↑ Nick Patterson et al. Storstilet migration til Storbritannien under middel til sen bronzealder Arkiveret 1. januar 2022 ved Wayback Machine // Nature, 22. december 2021
  25. ↑ Vagheesh M. Narasimhan et al. Dannelsen af ​​menneskelige populationer i Syd- og Centralasien  (engelsk)  // Videnskab. - 2019-09-06. — Bd. 365 , udg. 6457 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.aat7487 . Arkiveret fra originalen den 4. april 2021. ( The Genomic Formation of South and Central Asia, bioRxiv Arkiveret 17. marts 2021 på Wayback Machine )
  26. ↑ 1 2 Margaryan, Derenko et al. Otte årtusinder af matrilineær genetisk kontinuitet i det sydlige Kaukasus
  27. ↑ ت lf تالی DNA میک ICLES (mtDNA) قای ا icles ی دره‌ی ایلام inct محه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی Lf تالی & ‌ et . Hentet 21. marts 2020. Arkiveret fra originalen 21. marts 2020.
  28. ↑ Eugenia Boulygina et al. Mitokondriel og Y-kromosomdiversitet af den forhistoriske Koban-kultur i Nordkaukasus , 2020
  29. ↑ Xiaoming Zhang et al. Et matrilineært genetisk perspektiv af hængende kistebrug i det sydlige Kina og det nordlige Thailand , 24. april, 20.
  30. ↑ Piya Changmai et al. Gammelt DNA fra den protohistoriske periode Cambodia indikerer, at sydasiater blandet sig med lokale befolkninger så tidligt som i det 1.-3. århundrede e.Kr. , 5. juli 2022
  31. ↑ Kendra A. Sirak et al. Social stratificering uden genetisk differentiering på stedet for Kulubnarti i Christian Period Nubia Arkiveret 6. marts 2021 på Wayback Machine 17. februar 2021 ( Supplerende figur 5, 6 Arkiveret 23. oktober 2021 på Wayback Machine )
  32. ↑ Ashot Margaryan et al. Vikingeverdenens befolkningsgenomik Arkiveret 12. februar 2020 på Wayback Machine , 2019

Se også

Humant mtDNA haplogruppetræ

Mitokondriel Eva
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G Q R O EN S x Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 præ-JT P Storbritannien jeg N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Ældre IWX- klynger


Links

Generel information

Haplogruppe R