Haplogruppe L3 (mtDNA)

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 15. marts 2013; checks kræver 39 redigeringer .
Haplogruppe L3
Type mtDNA
Udseende tid 104.000–84.000 år siden [1]
Spawn placering Østafrika [2]
Forfædres gruppe Mitokondriel Eva
Underklader L3a , L3b , L3c , L3d , L3e , L3f , L3h , L3i , L3j , L3k , L3x , M , N [3]
Markør mutationer 769, 1018, 16311

Haplogruppe L3  - i populationsgenetik - haplogruppen af ​​humant mitokondrie-DNA.

Oprindelse

Det antages, at haplogruppen opstod for omkring 105-85 tusind år siden. Haplogrupperne M og N stammede fra mitokondriegruppen L3 for omkring 65 tusind år siden (Macaulay et al., 2005) [4] . Sammensmeltningsalderen for alle eurasiske (M, N) og afrikanske L3-linjer er omkring 71 tusind år siden. n. Makrohaplogruppe L3 dukkede op i Eurasien og vendte tilbage til Afrika for omkring 70 tusind år siden [5] [6] . Underkladerne L3h og L3i dateres tilbage til ~55,1 tusinde år siden. n., underkladerne L3h1 og L3h2 dateres tilbage til ~ 47 tusind år siden. n., L3h2 - ~ 31 tusind år siden [7] . Bærere af den mitokondrielle haplogruppe L3 migrerede fra Østafrika til Centralafrika fra ~60 til 35 tusinde år siden. Stigning i antallet af L3-skibe i Centralafrika ca. 4-3 tusinde liter. n. svarer til Bantu- udvidelsen . Omkring 3-2 tusinde liter. n. bærere af forskellige L3-slægter spredte sig til Øst- og Sydafrika [8] .

Paleogenetik

Fordeling

Oftest findes denne haplogruppe i Østafrika , i modsætning til andre dele af Afrika, hvor 2/3 af alt mitokondrielt DNA er haplogrupperne L1 og L2 [18] .

L3 er underopdelt i flere undergrupper, hvoraf den ene antages at være stamfaderen til M- og N -makrohaplogrupperne , hvorfra de fleste ikke-afrikanske folkeslag nedstammer.

En af disse slægter, som er defineret ved tabet af DdeI-regionen ved np 10394, repræsenterer kun en lille procentdel af afrikansk mtDNA, men ser ud til at være forfaderen til næsten halvdelen af ​​alt europæisk, asiatisk og indiansk mtDNA." [ 19]

Ifølge McMayer et al., "L3 er mere relateret til eurasiske haplogrupper, end det er til de mest forskelligartede afrikanske L1- og L2- klynger " [20] L3 er haplogruppen, hvorfra alle moderne mennesker uden for Afrika nedstammer [21] .

I Europa tegner makrohaplogruppe L mtDNA sig for <1%, mens ~65% af europæiske L-slægter ankom i historisk tid (inklusive L3d1b1a), og de resterende 35% af L mtDNA danner europæiske underklader, der ankom til Europa fra Afrika syd for Sahara 11 000 år siden (L1b1, L2a1k) [22] .

Underklasser (efterkommere) af haplogruppe L3

Fylogenetisk træ

Det fylogenetiske træ nedenfor er baseret på en publikation af Van Oven (2008) og efterfølgende publicerede undersøgelser.

Noter

  1. ↑ Tishkoff et al., Whole-mtDNA Genome Sequence Analysis of Ancient African Lineages, Mol. Biol. Evol, 24(3):757-68. 2007
  2. ↑ Salas et al. (2002), The Making of the African mtDNA Landscape Arkiveret 9. maj 2006 på Wayback Machine , Am J Hum Genet. november 2002; 71(5): 1082-1111
  3. ↑ van Oven M, Kayser M. 2009. Opdateret omfattende fylogenetisk træ af global human mitokondriel DNA-variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.org Arkiveret 17. juni 2016 på Wayback Machine , mtDNA tree Build 2 (14. oktober 2008)
  4. ↑ Derenko M.V. Molekylær fylogenografi af den oprindelige befolkning i Nordasien i henhold til variabiliteten af ​​mitokondrielt DNA Arkivkopi dateret 13. januar 2018 på Wayback Machine
  5. ↑ Vicente M Cabrera, Julia Patricia Marrero Rodriguez, Khaled K Abu-Amero, Jose M Larruga . Bærere af mitokondrielle DNA-makrohaplogruppe L3 basale linjer migrerede tilbage til Afrika fra Asien for omkring 70.000 år siden Arkiveret 22. februar 2021 på Wayback Machine , 2018 19. juni
  6. ↑ Vicente M Cabrera, Julia Patricia Marrero Rodriguez, Khaled K Abu-Amero, Jose M Larruga . Bærere af mitokondrielle DNA-makrohaplogruppe L3-grundstammer migrerede tilbage til Afrika fra Asien for omkring 70.000 år siden Arkiveret 14. januar 2018 på Wayback Machine 13. december 2017
  7. ↑ Veronica Gomes et al. Mosaiske moderlige herkomst i området ved de store søer i Østafrika Arkiveret 29. september 2017 på Wayback Machine , Human Genetics, september 2015, bind 134, udgave 9, s . 1013-1027
  8. ↑ Soares P., Alshamali F., Pereira JB, Fernandes V., Silva NM, Afonso C., Costa MD, Musilová E., Macaulay V., Richards MB, Cerny V., Pereira L. The Expansion of mtDNA Haplogroup L3 inden for og ud af Afrika Arkiveret 17. februar 2018 på Wayback Machine // Mol Biol Evol. 2012 Mar;29(3):915-27. doi: 10.1093/molbev/msr245. Epub 2011 16. november.
  9. ↑ Fernandez, 2014 .
  10. ↑ Tabel 1. Gamle individer rapporteret i denne undersøgelse, sorteret efter start af kalibreret radiocarbon-datointerval // Mary E. Prendergast et al. Gammelt DNA afslører en flertrinsspredning af de første hyrder til Afrika syd for Sahara. Videnskab. 5 juli 2019
  11. ↑ Anna Linderholm et al. Corded Ware kulturel kompleksitet afdækket ved hjælp af genomisk og isotopanalyse fra det sydøstlige Polen Arkiveret 12. maj 2020 på Wayback Machine , 2020 14. apr.
  12. ↑ Verena J. Schuenemann et al. Gamle egyptiske mumie-genomer tyder på en stigning i afrikanske herkomst syd for Sahara i post-romerske perioder Arkiveret 30. september 2019 på Wayback Machine , 30. maj 2017
  13. ↑ Det gamle etiopiske genom afslører omfattende eurasisk blanding i hele det afrikanske kontinent . Hentet 10. oktober 2015. Arkiveret fra originalen 10. oktober 2015.
  14. ↑ E. B. Yatsishina, E. S. Bulygina, S. V. Vasiliev, R. M. Galeev, N. V. Slobodova, S. V. Tsygankova, F. S. Sharko . Palæogenetisk undersøgelse af gamle mumier ved Kurchatov Institute , 2020
  15. ↑ EB Yatsishina, ES Bulygina, SV Vasilyev, RM Galeev, NV Slobodova, SV Tsygankova, FS Sharko . Palæogenetisk undersøgelse af antikke mumier på Kurchatov Instituttet Arkiveret 3. august 2021 på Wayback Machine , 22. marts 2021
  16. ↑ Rodrigo Barquera et al. Oprindelse og sundhedsstatus for førstegenerationsafrikanere fra det tidlige koloniale Mexico Arkiveret 10. maj 2020 på Wayback Machine 30. april 2020
  17. ↑ Peyroteo Stjerna et al. Tværfaglig undersøgelse afslører en person af vestafrikansk oprindelse begravet for fire århundreder siden i en portugisisk mesolitisk skal Midden Arkiveret 1. januar 2022 på Wayback Machine , 13. december 2021
  18. ↑ Wallace DC et al. (2000), Oprindelse af haplogruppe M i Etiopien, Am J Hum Genet 67(Suppl):217
  19. ↑ Wallace et al., Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease, Gene, 1999 Sep 30;238(1):211-30
  20. ↑ Maca-Meyer et al. (2001), Større genomiske mitokondrielle afstamninger afgrænser tidlige menneskelige udvidelser Arkiveret 17. oktober 2015 på Wayback Machine , BMC Genetics 2001, 2:13
  21. ↑ Cambridge DNA Services Arkiveret 8. juli 2011 på Wayback Machine
  22. ↑ Maria Cerezo et al. "Rekonstruering af gamle mitokondrielle DNA-forbindelser mellem Afrika og Europa" , 2012
  23. ↑ Kivisild et al. november 2004 "Ethiopian Mitochondrial DNA Heritage: Tracking Gene Flow Across and Around the Gate of Tears" American Journal of Human Genetics 75(5): 759
  24. ↑ Černý et al., (2009). Migration af chadisktalende pastoralister i Afrika baseret på befolkningsstrukturen i Chad-bassinet og fylogenografi af mitokondriel L3f-haplogruppe Arkiveret 8. marts 2011 på Wayback Machine . BMC Evolutionary Biology, 9:63, 2.

Publikationer

2014

Se også

Humant mtDNA haplogruppetræ

Mitokondriel Eva
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
cz D E G Q R O EN S x Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 præ-JT P Storbritannien jeg N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Ældre IWX- klynger


Links

Generel information

Haplogruppe L3