Bakteriochlorophyller

Bakteriochlorophyller  er en heterogen gruppe af fotosyntetiske tetrapyrrolpigmenter , der syntetiseres af forskellige anoxygene fototrofiske bakterier , der udfører fotosyntese uden iltudvikling .

De spektrale egenskaber af bakteriochlorophyller i celler adskiller sig væsentligt fra opløsninger og bestemmes af ikke-kovalente interaktioner mellem deres molekyler med proteiner, der indeholder dem, såvel som med hinanden.

Kemisk struktur af bakteriochlorophyller

Bakteriochlorophyller a , b og g  er bakteriochloriner , det vil sige, at de indeholder en bakteriochlorin -makrocyklus med to reducerede pyrrolringe (II og IV).

Bakteriochlorophyller c-f har ligesom klorofyler en chlormakrocyklisk ring med en enkelt fuldstændig reduceret pyrrolring IV. I modsætning til alle andre klorofyler og bakteriochlorophyller mangler de -COOCH 3 -resten i R5 - positionen , hvilket er karakteristisk for alle andre klorofyler og bakteriochlorophyller. Hver af disse bakteriochlorophyller har flere former, der adskiller sig i radikalerne R 3 og R 4 , såvel som i den esterificerende alkohol R 5 [1] [2] .

Navn Struktur R1 _ R2 _ R3 _ Kommunikation C7-C8 R4 _ R5 R6 _ R7 _
Bakteriochlorophyll a –CO–CH 3 –CH3a _ _ –CH 2 CH 3 enkelt -CH 3 -CO-O-CH 3 -væge

-geranylgeranil

-H
Bakteriochlorophyll  b -CO-CH 3 -CH3a _ _ =CH- CH3 enkelt –CH3 _ –CO–O–CH 3 -væge –H
Bakteriochlorophyll c -CHOH- CH3 –CH3 _ –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
dobbelt –CH3 –C2H5 _ _ _ _
–H Farnezil osv. –CH3 _
Bakteriochlorophyll d -CHOH- CH3 –CH3 _ –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
dobbelt –CH3 –C2H5 _ _ _ _
–H Farnezil osv. –H
Bakteriochlorophyll e -CHOH- CH3 –CHO –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
dobbelt –CH3 –C2H5 _ _ _ _
–H Farnezil osv. –CH3 _
Bakteriochlorophyll f -CHOH- CH3 –CHO –C 2 H 5 b
– C 3 H 7
– C 4 H 9
dobbelt ––CH3 – C2H5 _ _ _
–H Farnezil osv. –H
Bakteriochlorophyll g –CH = CH2 –CH3a _ _ \u003d CH-CH 2 enkelt –CH3 _ –CO–O–CH 3 -geranylgeranil –H

Kemiske egenskaber

Bakteriochlorophyller er ustabile over for lys, syrer og oxidationsmidler. I polære opløsningsmidler (f.eks. i methanol) gennemgår de let allomerisering; i nærværelse af syrer mister de det centrale magnesiumatom (de er pheophytinized) og/eller den esterificerende rest (phytol/farnesol/geranylgeriniol osv.) [3] .

Bakteriochlorophyller b   og g , der har en ethylidenrest ved C-8, isomeriserer i et let surt medium til dannelse af chloriner. Bakteriochlorophyll g er særlig let at isomerisere , hvilket resulterer i klorofyl a G [4] .

Under påvirkning af oxygen i bakteriochlorophyllernes molekyler opstår et oxidativt brud af den femleddede ring V; i fremtiden kan de dannede syrerester ved C-13 og C-14 atomerne igen lukke sig ind i en seksleddet anhydridring med dannelse af bakteriopurpuriner eller purpuriner [3] [5] .  

Biosyntese

Et forenklet skema for biosyntesen af ​​bakteriochlorophyllider a, b og g , samt (E,M)-bakteriochlorophyllider c-e [6] [7] er vist i figuren.

Tidligere blev det antaget, at det første trin i biosyntesen af ​​bakteriochlorophyller c-e, dannelsen af ​​ring V uden en carboxymethylsubstituent ved C13 2 , kan forekomme allerede før dannelsen af ​​3,8-divinyl-protochlorophyllid a [8] . Dette anses i øjeblikket for usandsynligt [6] [9] .

Den sidste fase af biosyntesen, omdannelsen af ​​bakteriochlorophyller til bakteriochlorophyller, udføres ved hjælp af esteraser kodet af BchG-generne i bakteriochlorophyller a, b og g og BchK i chlorobium-chlorophyller. I syntesen af ​​methylerede former af bakteriochlorophyller c-e deltager også methylase C121 - carbon BchR og C82 - methylase BchQ. Tilsyneladende er deres substrater alle chlorophyllider med en hydroxymethylrest ved C3, dvs. methylering kan forekomme på et hvilket som helst trin efter dannelsen af ​​8-ethyl-12-methyl-bakteriochlorophyllid d .

Fordeling

Det mest udbredte pigment af anoxygene fototrofiske bakterier er bakteriochlorophyll a . Det er det fremherskende klorpigment i reaktionscentrene for de fleste fototrofiske proteobakterier, alle grønne svovlbakterier (Chlorobiaceae) og filamentøse anoxygene fototrofer (Chloroflexia). I nogle få fototrofiske proteobakterier er bakteriochlorophyll a fuldstændig erstattet af bakteriochlorophyll b . Bakteriochlorophyll g findes kun i én gruppe bakterier, lille i forhold til antallet af arter og udbredelse, heliobakterier .

Bakteriochlorophyller c-f er udelukkende til stede i klorosomer, specielle fotosyntetiske antennekomplekser, der findes i alle grønne svovlbakterier (Chlorobiales) , nogle filamentøse anoxygene fototrofer (Chloroflexia), såvel som i den nyligt opdagede fotoheterotrofiske acidobacterium Chloracidobacterium thermophilum .

Pigment Bakteriegruppe Maksimal infrarød absorption in vivo ( nm )
Bakteriochlorophyll  a Lilla bakterier (flertal), Chlorobiaceae, Chloroflexales og Chloracidobacterium thermophilum 805-815, 830-890
Bakteriochlorophyll b Lilla bakterier (nogle) 835-850, 1020-1040
Bakteriochlorophyll c Chlorobiaceae (grønne stammer) mest Chloroflexia , Chloracidibacterium thermophilum 745-755
Bakteriochlorophyll  d grønne stammer af Chlorobiaceae , Chloronema ( Chloroflexia ) 705-740
Bakteriochlorophyll e brune stammer af Chlorobiaceae 719-726
Bakteriochlorophyll f nogle laboratoriestammer af Chlorobiaceae ~705-707
Bakteriochlorophyll g Heliobakterier 670-788

Noter

  1. Scheer, H. (2006). En oversigt over klorofyler og bakteriochlorophyller: biokemi, biofysik, funktioner og anvendelser   I: B. Grimm et al. (red): Klorofyler og bakterioklorofyler. Springer Holland. (s. 1-26)
  2. Orf, GS, Blankenship, RE (2013). Klorosomantennekomplekser fra grønne fotosyntetiske bakterier. Fotosynteseforskning ,  116 (2-3), s. 15-331.
  3. 1 2 Keely, BJ (2006). Geokemi af klorofyler. I  Chlorophylls and Bacteriochlorophylls  (s. 535-561). Springer Holland.
  4. Kobayashi, M., Hamano, T., Akiyama, M., Watanabe, T., Inoue, K., Oh-oka, H., Amesz J., Yamamura M., Kise, H. (1998). Lysuafhængig isomerisering af bakteriochlorophyll g til klorofyl a katalyseret af svage syrer in vitro. Analytica chimica acta ,  365 (1), 199-203.
  5. Grin, MA, & Mironov, AF (2008). Syntetiske og naturlige bakteriochloriner: syntese, egenskaber og anvendelser. I: Kemiske processer med deltagelse af biologiske og relaterede forbindelser: biofysiske og kemiske aspekter af porfyriner, pigmenter, lægemidler, biologisk nedbrydelige polymerer og nanofibre , 5.
  6. 1 2 Liu, Z., & Bryant, D.A. (2011). Identifikation af et gen, der er afgørende for det første forpligtede trin i biosyntesen af ​​bakteriochlorophyll c. Journal of Biological Chemistry ,  286 (25), 22393-22402.
  7. Tsukatani Y., Yamamoto H., Harada J., Yoshitomi T., Nomata J., Kasahara M., Mizoguchi T., Fujita Y., Tamiaki H. (2013). En uventet forgrenet biosyntesevej for bakteriochlorophyll b er i stand til at absorbere nær-infrarødt lys. Videnskabelige rapporter ,  3 .
  8. Frigaard, NU, Chew, AGM, Maresca, JA, & Bryant, D.A. (2006). Bakteriochlorophyllbiosyntese i grønne bakterier. I  Chlorophylls and Bacteriochlorophylls  (s. 201-221). Springer Holland.
  9. Harada, J., Teramura, M., Mizoguchi, T., Tsukatani, Y., Yamamoto, K., & Tamiaki, H. (2015). Stereokemisk omdannelse af C3-vinylgruppe til 1-hydroxyethylgruppe i bakteriochlorophyll c af hydrataserne BchF og BchV: tilpasning af grønne svovlbakterier til miljøer med begrænset lys. Molecular Microbiology ,  98 (6), 1184-1198.
  10. Bryant, Donald A.; Costas, A.M.; Maresca, JA & Chew, AG (2007-07-27), Candidatus Chloracidobacterium thermophilum: An Airobic Phototrophic Acidobacterium , Science T. 317 (5837): 523-526, PMID 17656724 , doi : 3/2612 : 3/2612 : http: 10. //www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/317/5837/523 > Arkiveret 14. september 2009 på Wayback Machine