Kodon

Den aktuelle version af siden er endnu ikke blevet gennemgået af erfarne bidragydere og kan afvige væsentligt fra den version , der blev gennemgået den 24. april 2016; checks kræver 37 redigeringer .

Et kodon ( kodende trinukleotid ) er en enhed af den genetiske kode , en triplet af nukleotidrester ( triplet ) i DNA eller RNA , som normalt koder for inklusion af en aminosyre . Sekvensen af ​​kodoner i et gen bestemmer sekvensen af ​​aminosyrer i polypeptidkæden af ​​proteinet kodet af det gen.

Klassifikation

Da der er 4 forskellige nitrogenholdige baser ( adenin , guanin , cytosin , thymin ), og aminosyrer er kodet af et kodon bestående af kombinationer af tre nukleotider, så er det samlede antal kodoner ifølge kombinatorikkens love lig med antallet af placeringer med gentagelser : kombinationer , hvoraf 61 kombinationer koder for visse aminosyrer, og de 3 resterende kodoner (UGA, UAG og UAA) signalerer stop af translation af polypeptidkæden og kaldes stopkodoner .

Startkodonet i eukaryote organismer er AUG-tripletten i mRNA , der koder for methionin , hvorfra dannelsen af ​​polypeptidkæden begynder under translation.

I nogle prokaryoter er startkodonerne også GUG, AUU, CUG, UUG.

Da kun 20 aminosyrer er involveret i processen med proteinbiosyntese i polypeptidkæden, kan forskellige kodoner kode for de samme aminosyrer, sådanne kodoner kaldes almindeligvis isoacceptorkodoner .

RNA-kodon tabel

ikke-polær polar grundlæggende syre (stopkodon)
standard genetisk kode
1.
base 		2. base 3.
base
U C EN G
U UUU (Phe/F) Phenylalanin UCU (Ser/S) Serine UAU (Tyr/Y) Tyrosin UGU (Cys/C) Cystein U
UUC UCC UAC UGC C
UUA (Leu/L) Leucin UCA UAA Stop ( Okker ) UGA Stop ( Opal ) EN
UUG UCG UAG Stop ( rav ) UGG (Trp/W) Tryptofan     G
C CUU CCU (Pro/P) Proline CAU (His/H) Histidin CGU (Arg/R) Arginin U
CUC CCC CAC CGC C
CUA CCA CAA (Gln/Q) Glutamin CGA EN
CUG CCG CAG CGG G
EN AUU (Ile/I) Isoleucin ACU (Thr/T) Threonin         AAU (Asn/N) Asparagin AGU (Ser/S) Serine U
AUC ACC AAC AGC C
AUA ACA AAA (Lys/K) Lysin AGA (Arg/R) Arginin EN
AUG [A] (Met/M) Methionin ACG AAG AGG G
G GUU (Val/V) Valine GCU (Ala/A) Alanine GAU (Asp/D) Asparaginsyre GGU (Gly/G) Glycin U
GUC GCC GAC GGC C
GUA GCA GAA (Glu/E) Glutaminsyre GGA EN
GUG GCG GAG GGG G
A   AUG-kodonet koder for methionin og er også stedet for translationsinitiering: det første AUG-kodon i den kodende regionaf mRNAtjener som starten på proteinsyntese[1].

Dekryptering afsluttet i 1966 [2] .

Ikke-kanoniske kodonværdier

Mindst 16 typer af organismer har en genetisk kode, der adskiller sig fra den kanoniske. For eksempel oversætter mange arter af grønalger Acetabularia standard stopkodonerne UAG og UAA til aminosyren glycin, og svampen Candida fortolker CUG RNA codonen ikke som leucin, men som serin. Og i mitokondrierne af bagegær ( Saccharomyces cerevisiae ) er fire af de seks kodoner normalt oversat til leucinkode for threonin .

Eksistensen af ​​sådanne variationer indikerer den mulige udvikling af den genetiske kode.

Repræsentanter for alle tre domæner af levende organismer læser nogle gange standard stopkodonet UGA som den 21. aminosyre selenocystein , som ikke er relateret til standard 20. Selenocystein dannes under den kemiske modifikation af serin på det stadium, hvor sidstnævnte endnu ikke er løsrevet fra tRNA'et i ribosomet.

Tilsvarende læses stopkodonet UAG i repræsentanter for to domæner ( arkæbakterier og bakterier ) som den 22. aminosyre pyrrolysin .

Forskelle fra den universelle kode findes også i mitokondrie-DNA ( se afsnittet Funktioner ).

Se også

Noter

  1. ↑ Nakamoto T. Evolution og universaliteten af ​​mekanismen for initiering af proteinsyntese.  (engelsk)  // Gene. - 2009. - 1. marts ( bd. 432 , nr. 1-2 ). - S. 1-6 . - doi : 10.1016/j.gene.2008.11.001 . — PMID 19056476 .
  2. ↑ Ayala F. D. Moderne genetik. 1987.
 Aminosyrer
Standard
ikke standard
se også