SMC3

Strukturel støtte af kromosomer 3
Identifikatorer
SymbolSMC3  ; BAM; BMH; CDLS3; CSPG6; HCAP; SMC3L1
Eksterne ID'erOMIM:  606062 MGI :  1339795 HomoloGene :  3974 GeneCards : SMC3 Gen
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez912613006
EnsembleENSG00000108055ENSMUSG00000024974
UniProtQ9UQE7Q9CW03
RefSeq (mRNA)NM_005445NM_007790
RefSeq (protein)NP_005436NP_031816
Locus (UCSC)Chr 10:
110,57 – 110,6 Mb
Chr 19:
53,6 – 53,65 Mb
Søg i PubMed[en][2]

SMC3 eller Strukturel vedligeholdelse af kromosomer protein 3 er et  protein kodet af SMC4 -genet hos mennesker [1] .

Funktioner

Dette gen tilhører SMC3-underfamilien af ​​SMC-proteiner. Proteinet kodet af dette gen kan være til stede i visse celletyper som et intracellulært, nukleært eller endda udskilt protein. Den nukleare form, kendt som kromosomstrukturelt støtteprotein 3, er en komponent af cohesin , et multiproteinkompleks, der holder søsterkromatider sammen under mitose for at sikre korrekt kromosomadskillelse. Ved afslutningen af ​​syntesen kan dette protein gennemgå post-translationel modifikation - tilføjelse af en kæde af chondroitinsulfat. Som følge heraf dannes den udskilte proteoglycan bamakan, som er indeholdt i store mængder i basalmembranen [1] .

Modelorganismer

Fænotype af Smc3 knockdown-mus

Smc3 tm1a (EUCOMM)Wtsi knockout-mus [7] [8] blev brugt til at studere funktionen af ​​SMC3-genet . Linjen blev oprettet under International Consortium Knockout Mouse Program - en high-throughput analyse af dyremutanter, der repræsenterer sygdomsmodeller af interesse for forskere [9] [10] [11] .

Mandlige og kvindelige individer gennemgik standardiserede fænotypiske tests for at bestemme virkningerne af gendeletionen [5] [12] . Toogtyve forsøg blev udført på mutante mus, og der blev fundet seks signifikante abnormiteter [5] . Homozygoter for denne mutation døde i de tidlige stadier af embryogenese. Alle test blev udført på heterozygote voksne mus. Hos hunner blev der observeret øget dødelighed hos afkommet før overgangen til selvfodring, samt et fald i kropsvægt. Heterozygote hanner havde en kort, opadvendt næseparti [5] [12] .

Se også

Noter

  1. 1 2 Entrez-gen: SMC3-strukturel vedligeholdelse af kromosomer 3 . Arkiveret fra originalen den 7. marts 2010.
  2. Kropsvægtdata for Smc3 . Velkommen Trust Sanger Institute. Hentet 17. november 2015. Arkiveret fra originalen 17. oktober 2012.
  3. Salmonella -infektionsdata for Smc3 . Velkommen Trust Sanger Institute.
  4. Citrobacter -infektionsdata for Smc3 . Velkommen Trust Sanger Institute. Hentet 17. november 2015. Arkiveret fra originalen 17. oktober 2012.
  5. 1 2 3 4 Gerdin AK The Sanger Mouse Genetics Program: High throughput karakterisering af knockout mus  //  Acta Ophthalmologica : journal. - 2010. - Bd. 88 . - S. 925-927 . - doi : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x .
  6. Mouse Resources Portal Arkiveret 24. december 2011 på Wayback Machine , Wellcome Trust Sanger Institute.
  7. International Knockout Mouse Consortium (link ikke tilgængeligt) . Hentet 17. november 2015. Arkiveret fra originalen 3. april 2012. 
  8. Mouse Genome Informatics . Hentet 17. november 2015. Arkiveret fra originalen 18. november 2015.
  9. Skarnes WC, Rosen B., West AP, Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica AO, Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A. En betinget knockout-ressource til den genomomfattende undersøgelse af  musegenfunktion //  Nature: journal. - 2011. - Bd. 474 , nr. 7351 . - s. 337-342 . - doi : 10.1038/nature10163 . — PMID 21677750 .
  10. Dolgin E. Mouse bibliotek indstillet til at blive knockout   // Nature . - 2011. - Bd. 474 , nr. 7351 . - S. 262-263 . - doi : 10.1038/474262a . — PMID 21677718 .
  11. Collins FS, Rossant J., Wurst W. En mus af alle grunde   // Cell . - Cell Press , 2007. - Vol. 128 , nr. 1 . - S. 9-13 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.12.018 . — PMID 17218247 .
  12. 1 2 van der Weyden L., White JK, Adams DJ, Logan DW Musens genetikværktøj: afslørende funktion og mekanisme   // Genome Biology : journal. - 2011. - Bd. 12 , nr. 6 . — S. 224 . - doi : 10.1186/gb-2011-12-6-224 . — PMID 21722353 .

Links