IKZF1

Zinkfinger 1 (Ikaros) fra IKAROS-familien
Identifikatorer
SymbolIKZF1  ; Hs.54452; IK1; IKAROS; LYF1; LyF-1; PPP1R92; PRO0758; ZNFN1A1
Eksterne ID'erOMIM:  603023 MGI :  1342540 HomoloGene :  55948 GeneCards : IKZF1 Gene
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez1032022778
EnsembleENSG00000185811ENSMUSG00000018654
UniProtQ13422Q03267
RefSeq (mRNA)NM_001220765NM_001025597
RefSeq (protein)NP_001207694NP_001020768
Locus (UCSC)Chr 7:
50,34 – 50,47 Mb		Chr 11:
11,69 – 11,77 Mb
Søg i PubMed[en][2]

DNA-bindende protein Ikaros , også kendt som zinkfingerprotein 1 af Ikaros-familien ( Eng.  DNA-bindende protein Ikaros, Ikaros-familiens zinkfingerprotein 1, IKZF1 ) er et protein kodet hos mennesker af IKZF1 -genet [1] [2 ] [3] .

Funktioner

Ikaros udfører vigtige funktioner i det hæmatopoietiske system, og tabet af dets funktioner er forbundet med udviklingen af ​​lymfoid leukæmi [4] . Især er det i de senere år blevet vist, at Ikaros er en af ​​de vigtigste tumorundertrykkere involveret i udviklingen af ​​B-celle akut lymfatisk leukæmi hos mennesker [4] . IKZF1 er opreguleret i granulocytter , B-celler, T-celler, der bærer CD4- og CD8 -receptorer , NK-celler , og er nedreguleret i erythroblaster , megakaryocytter og monocytter [5] . I IKZF1 knockout- mus dannes T-celler, men ikke B-celler, stadig sent i udviklingen på grund af sen kompensatorisk ekspression af det nært beslægtede -gen (IKZF3) 6] . Ikaros resulterer i fosterdød hos mutante mus på grund af anæmi ; de har alvorlige defekter i terminal differentiering af erytrocytter og granulocytter og overdreven produktion af makrofager [7] .

Klinisk betydning

Hos mennesker er SNP'er lokaliseret nær IKZF1-genets 3'-region blevet forbundet med modtagelighed for akut lymfatisk leukæmi hos børn (ALL) [8] såvel som type 1 diabetes mellitus [9] . Disse to effekter ser ud til at være i modsatte retninger, dvs. den allel, der er ansvarlig for modtagelighed for ALL, giver beskyttelse mod type 1-diabetes mellitus og omvendt [9] .

Interaktioner med andre proteiner

IKZF1 har vist sig at interagere med: IKZF2 [10] , IKZF3 [11] [12] [13] , IKZF4 [14] [15] , histon deacetylase 5 [16] , HDAC1 [ 17] [16] , HDAC7A [16] , SIN3B [12] [16] , SIN3A [12] [16] [18] og CTBP1 [19] .

Noter

  1. ↑ Georgopoulos K., Moore DD, Derfler B. Ikaros, en tidlig lymfoid-specifik transkriptionsfaktor og en formodet mediator for T-celleforpligtelse  //  Science : journal. - 1992. - December ( bind 258 , nr. 5083 ). - S. 808-812 . - doi : 10.1126/science.1439790 . — PMID 1439790 .
  2. ↑ Hahm K., Ernst P., Lo K., Kim GS, Turck C., Smale ST Den lymfoide transkriptionsfaktor LyF-1 er kodet af specifikke, alternativt splejsede mRNA'er afledt af Ikaros-genet   // Molecular and Cellular Biology : journal. - 1994. - November ( bind 14 , nr. 11 ). - P. 7111-7123 . — PMID 7935426 .
  3. ↑ Entrez-gen: IKZF1 IKAROS-familiens zinkfinger 1 (Ikaros) .
  4. ↑ 1 2 Kastner P., Chan S. Ikaros rolle i T-celle akut lymfatisk leukæmi  (engelsk)  // World J Biol Chem : journal. - 2011. - Juni ( bind 2 , nr. 6 ). - S. 108-114 . - doi : 10.4331/wjbc.v2.i6.108 . — PMID 21765975 .
  5. ↑ Watkins NA, Gusnanto A., de Bono B., De S., Miranda-Saavedra D., Hardie DL, Angenent WG, Attwood AP, Ellis PD, Erber W., Foad NS, Garner SF, Isacke CM, Jolley J ., Koch K., Macaulay IC, Morley SL, Rendon A., Rice KM, Taylor N., Thijssen-Timmer DC, Tijssen MR, van der Schoot CE, Wernisch L., Winzer T., Dudbridge F., Buckley CD , Langford CF, Teichmann S., Göttgens B., Ouwehand WH; Blodomics konsortium. A HaemAtlas: karakterisering af genekspression i differentierede humane   blodceller // Blod : journal. — American Society of Hematology, 2009. - Maj ( bd. 113 , nr. 19 ). - P. e1-9 . - doi : 10.1182/blood-2008-06-162958 . — PMID 19228925 .
  6. ↑ Georgopoulos K., Winandy S., Avitahl N. Ikaros-genets rolle i lymfocytudvikling og homeostase. (engelsk)  // Ann Rev Immunol. : journal. - 1997. - Bd. 15 . - S. 155-176 . - doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.155 . — PMID 9143685 .
  7. ↑ Papathanasiou P., Perkins AC, Cobb BS, Ferrini R., Sridharan R., Hoyne GF, Nelms KA, Smale ST, Goodnow CC. Udbredt svigt af hæmatolymphoid differentiering forårsaget af en recessiv nichefyldende allel af Ikaros transkriptionsfaktoren  //  Immunitet : journal. - 2003. - Juli ( bind 19 , nr. 1 ). - S. 131-144 . - doi : 10.1016/s1074-7613(03)00168-7 .
  8. ↑ Papaemmanuil E., Hosking FJ, Vijayakrishnan J., Price A., Olver B., Sheridan E., Kinsey SE, Lightfoot T., Roman E., Irving JA, Allan JM, Tomlinson IP, Taylor M., Greaves M. ., Holston RS. Loci på 7p12.2, 10q21.2 og 14q11.2 er forbundet med risikoen for akut lymfoblastisk leukæmi hos børn. (engelsk)  // Ann Rev Immunol. : journal. - 2009. - September ( bind 41 , nr. 9 ). - S. 1006-1010 . - doi : 10.1038/ng.430 . — PMID 19684604 .
  9. ↑ 1 2 Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C., Smyth DJ, Schuilenburg H., Maisuria-Armer M., Mistry T., Lenardo MJ, Todd JA. En allel af IKZF1 (Ikaros), der giver følsomhed over for akut lymfoblastisk leukæmi hos børn, beskytter mod type 1-diabetes. (engelsk)  // Diabetes: journal. - 2011. - Februar ( bind 60 , nr. 3 ). - S. 1041-1044 . doi : 10.2337 /db10-0446 . — PMID 21270240 .
  10. ↑ Kelley CM, Ikeda T., Koipally J., Avitahl N., Wu L., Georgopoulos K., Morgan BA. Helios, en ny dimeriseringspartner af Ikaros udtrykt i de tidligste hæmatopoietiske stamceller  // Current Biology  : journal  . - Cell Press , 1998. - April ( vol. 8 , nr. 9 ). - S. 508-915 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70202-7 . — PMID 9560339 .
  11. ↑ Morgan B., Sun L., Avitahl N., Andrikopoulos K., Ikeda T., Gonzales E., Wu P., Neben S., Georgopoulos K. Aiolos, en lymfoid begrænset transkriptionsfaktor, der interagerer med Ikaros for at regulere lymfocytter differentiering. (engelsk)  // EMBO: tidsskrift. - 1997. - April ( bind 16 , nr. 8 ). - S. 2004-2013 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.2004 . — PMID 9155026 .
  12. ↑ 1 2 3 Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Undertrykkelse af Ikaros og Aiolos er medieret gennem histon-deacetylase-komplekser. (engelsk)  // EMBO: tidsskrift. - 1999. - Juni ( bind 18 , nr. 11 ). - S. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  13. ↑ Kim J., Sif S., Jones B., Jackson A., Koipally J., Heller E., Winandy S., Viel A., Sawyer A., ​​​​Ikeda T., Kingston R., Georgopoulos K. Ikaros DNA-bindende proteiner dirigerer dannelsen af ​​kromatin remodeling komplekser i lymfocytter. (engelsk)  // Immunitet: tidsskrift. - 1999. - Marts ( bind 10 , nr. 3 ). - S. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
  14. ↑ Honma, Y; Kiyosawa H., Mori T., Oguri A., Nikaido T., Kanazawa K., Tojo M., Takeda J., Tanno Y., Yokoya S., Kawabata I., Ikeda H., Wanaka A. Eos: a nyt medlem af Ikaros-genfamilien, der overvejende udtrykkes i det udviklende nervesystem  //  FEBS Letters : journal. - NEDERLANDENE, 1999. - Marts ( vol. 447 , nr. 1 ). - S. 76-80 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)00265-3 . — PMID 10218586 .
  15. ↑ Perdomo, J; Holmes M; Chong B; Crossley M. Eos og pegasus, to medlemmer af Ikaros-familien af ​​proteiner med forskellige DNA-bindingsaktiviteter  (engelsk)  // Journal of Biological Chemistry  : tidsskrift. - USA, 2000. - December ( vol. 275 , nr. 49 ). - P. 38347-38354 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M005457200 . — PMID 10978333 .
  16. ↑ 1 2 3 4 5 Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. En molekylær dissektion af undertrykkelseskredsløbet i Ikaros  (engelsk)  // Journal of Biological Chemistry  : tidsskrift. - USA, 2002. - August ( vol. 277 , nr. 31 ). - P. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
  17. ↑ Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Undertrykkelse af Ikaros og Aiolos er medieret gennem histon-deacetylase-komplekser  (engelsk)  // The EMBO Journal : journal. - ENGLAND, 1999. - Juni ( bind 18 , nr. 11 ). - S. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  18. ↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. Ikaros-CtIP-interaktioner kræver ikke C-terminalt bindende protein og deltager i en deacetylase-uafhængig undertrykkelsesmåde  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - USA, 2002. - Juni ( vol. 277 , nr. 26 ). - P. 23143-23149 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
  19. ↑ Koipally, J; Georgopoulos K. Ikaros interaktioner med CtBP afslører en undertrykkelsesmekanisme, der er uafhængig af histon-deacetylase-aktivitet  (engelsk)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - USA, 2000. - Juni ( vol. 275 , nr. 26 ). - P. 19594-19602 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M000254200 . — PMID 10766745 .

Litteratur