CTBP1

C-terminalt bindende protein 1

FBF er baseret på 1hku.
Tilgængelige strukturer
FBF Ortholog søgning: PDBe , RCSB
Identifikatorer
SymbolCTBP1  ; BARER
Eksterne ID'erOMIM:  602618 MGI :  1201685 HomoloGene :  1015 GeneCards : CTBP1-gen
RNA-ekspressionsprofil
Mere information
ortologer
UdsigtHumanMus
Entrez148713016
EnsembleENSG00000159692ENSMUSG00000037373
UniProtQ13363O88712
RefSeq (mRNA)NM_001012614NM_001198859
RefSeq (protein)NP_001012632NP_001185788
Locus (UCSC)Chr 4:
1,21 - 1,24 Mb		Chr 5:
33,25 – 33,28 Mb
Søg i PubMed[en][2]

C-terminalt bindende protein 1 , også kendt som CtBP1  , er et protein kodet i mennesker af CTBP1 -genet [1] .

Funktion

CtBP1 -proteinet blev oprindeligt identificeret som et humant protein, der er forbundet med PLDLS-motivet ved C-terminalen af ​​adenovirus E1A-proteiner. Dette og dets relaterede CTBP2-protein er transkriptionelle corepressorer [2] . Disse er regulatoriske proteiner, der binder til stedspecifikke DNA-bindende proteiner og hjælper med at slukke for genet. De gør dette ved at rekruttere histon-modificerende enzymer , som deaktiverer histoner og fjerner aktiveringsmærker. CtBP-proteiner kan også selv-associere og formentlig samle genkomplekser [3] .

CtBP1 udtrykkes bredt på alle udviklingsstadier, fra embryo til voksen, mens CtBP2 udtrykkes over et snævrere aldersinterval. Disse proteiner har mange biologiske funktioner og ser ud til at være vigtige i reguleringen af ​​epitel-mesenkymal overgangen samt indflydelse på stofskiftet . De har en effekt på stofskiftet ved at binde NADH, men dårligt binde NAD+. Disse proteiner er således følsomme over for NAD+/NADH-forholdet. Når de først er bundet til NADH, gennemgår de konformationelle ændringer, der gør det muligt for dem at danne en dimer og interagere med partnerbeks, hvilket dæmper specifikke gener .

Under skelet- og T-lymfocytudvikling associerer CtBP1 og CtBP2 med PLDLSL- domænet af δEF1, homeodomænets zinkfinger, og øger derved δEF1-afhængig transkriptionel silencing . CtBP binder også de Krüppel-lignende faktorer af zinkfingerproteinfamilien KLF3 , KLF8 og KLF12 . Derudover danner CtBP og CTIP et 125 kDa kompleks, der genkender helt forskellige CtBP-proteinmotiver. CTIP binder til BRCT-gentagelsen af ​​BRCA1- brystcancergenet , hvilket gør det muligt for CtBP at påvirke BRCA1-aktiviteten. Begge proteiner kan også interagere med polycomb-proteinkomplekset , som er involveret i reguleringen af ​​genekspression under udvikling. Genet gennemgår alternativ splejsning og eksisterer i form af flere transskriptioner [4] .

Interaktioner

CTBP1 har vist sig at interagere med:

Noter

  1. ↑ 1 2 Schaeper U., Subramanian T., Lim L., Boyd JM, Chinnadurai G. Interaktion mellem et cellulært protein, der binder til den C-terminale region af adenovirus E1A (CtBP), og et nyt cellulært protein forstyrres af E1A gennem et konserveret PLDLS-motiv  (engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 1998. - April ( bd. 273 , nr. 15 ). - P. 8549-8552 . doi : 10.1074/ jbc.273.15.8549 . — PMID 9535825 .
  2. ↑ 1 2 Turner J., Crossley M. Kloning og karakterisering af mCtBP2, en co-repressor, der associeres med grundlæggende Krüppel-lignende faktor og andre transkriptionelle regulatorer fra pattedyr  // EMBO  J. : journal. - 1998. - September ( bind 17 , nr. 17 ). - P. 5129-5140 . - doi : 10.1093/emboj/17.17.5129 . — PMID 9724649 .
  3. ↑ Chinnadurai G. CtBP, en ukonventionel transkriptionel corepressor i udvikling og onkogenese   // Mol . celle : journal. - 2002. - Bd. 9 , nr. 2 . - S. 213-224 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00443-4 . — PMID 11864595 .
  4. ↑ Entrez-gen: CTBP1 C-terminalt bindende protein 1 .
  5. ↑ Oma Y., Nishimori K., Harata M. Det hjernespecifikke actin-relaterede protein ArpN alpha interagerer med den transkriptionelle co-repressor CtBP   // Biochem . Biofys. Res. commun. : journal. - 2003. - Februar ( bind 301 , nr. 2 ). - s. 521-528 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)03073-5 . — PMID 12565893 .
  6. ↑ Paliwal S., Pande S., Kovi RC, Sharpless NE, Bardeesy N., Grossman SR Targeting of C-Terminal Binding Protein (CtBP) by ARF Results in p53-Independent Apoptosis   // Mol . celle. Biol. : journal. - 2006. - Marts ( bind 26 , nr. 6 ). - P. 2360-2372 . - doi : 10.1128/MCB.26.6.2360-2372.2006 . — PMID 16508011 .
  7. ↑ Chakraborty S., Senyuk V., Sitailo S., Chi Y., Nucifora G. Interaktion af EVI1 med cAMP-responsive element-bindende protein-bindende protein (CBP) og p300/CBP-associeret faktor (P/CAF) resultater i reversibel acetylering af EVI1 og i co-lokalisering i nukleare pletter  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2001. - November ( bind 276 , nr. 48 ). - P. 44936-44943 . - doi : 10.1074/jbc.M106733200 . — PMID 11568182 .
  8. ↑ Izutsu K., Kurokawa M., Imai Y., Maki K., Mitani K., Hirai H.  Corepressoren CtBP interagerer med Evi-1 for at undertrykke transformerende vækstfaktor beta-signalering  // Blod : journal. — American Society of Hematology, 2001. - Maj ( vol. 97 , nr. 9 ). - P. 2815-2822 . - doi : 10.1182/blod.V97.9.2815 . — PMID 11313276 .
  9. ↑ Li S., Weidenfeld J., Morrisey EE Transkriptionel og DNA-bindingsaktivitet af Foxp1/2/4-familien er moduleret af heterotypiske og homotypiske proteininteraktioner   // Mol . celle. Biol. : journal. - 2004. - Januar ( bind 24 , nr. 2 ). - s. 809-822 . - doi : 10.1128/MCB.24.2.809-822.2004 . — PMID 14701752 .
  10. ↑ Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) and MEF2-interacting transcription repressor (MITR) bidrager til transkriptionel undertrykkelse af MEF2-transkriptionsfaktoren  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2001. - Januar ( bind 276 , nr. 1 ). - S. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
  11. ↑ 1 2 Melhuish TA, Wotton D. Interaktionen mellem det carboxylterminus-bindende protein og Smad-corepressoren TGIF forstyrres af en holoprosencephaly-mutation i TGIF  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2000. - December ( bind 275 , nr. 50 ). - P. 39762-39766 . - doi : 10.1074/jbc.C000416200 . — PMID 10995736 .
  12. ↑ Sundqvist A., Sollerbrant K., Svensson C. Den carboxyterminale region af adenovirus E1A aktiverer transkription gennem målretning af et C-terminalt bindende protein-histondeacetylasekompleks  // FEBS Lett  . : journal. - 1998. - Juni ( bd. 429 , nr. 2 ). - S. 183-188 . - doi : 10.1016/S0014-5793(98)00588-2 . — PMID 9650586 .
  13. ↑ Koipally J., Georgopoulos K. Ikaros interaktioner med CtBP afslører en undertrykkelsesmekanisme, der er uafhængig af histon-deacetylase-aktivitet  //  J. Biol. Chem.  : journal. - 2000. - Juni ( bind 275 , nr. 26 ). - P. 19594-19602 . - doi : 10.1074/jbc.M000254200 . — PMID 10766745 .
  14. ↑ Perdomo J., Crossley M. Ikaros-familieproteinet Eos associerer med C-terminal-bindende protein-corepressorer   // Eur . J Biochem. : journal. - 2002. - December ( bind 269 , nr. 23 ). - P. 5885-5892 . - doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03313.x . — PMID 12444977 .
  15. ↑ van Vliet J., Turner J., Crossley M. Human Krüppel-lignende faktor 8: et CACCC-boks-bindende protein, der associerer med CtBP og undertrykker transkription  // Nucleic Acids Res  . : journal. - 2000. - Maj ( bind 28 , nr. 9 ). - S. 1955-1962 . - doi : 10.1093/nar/28.9.1955 . — PMID 10756197 .
  16. ↑ Mirnezami AH, Campbell SJ, Darley M., Primrose JN, Johnson PW, Blaydes JP Hdm2 rekrutterer en hypoxi-følsom corepressor til negativt at regulere p53-afhængig transkription   // Curr . Biol.  : journal. - 2003. - Juli ( bind 13 , nr. 14 ). - S. 1234-1239 . - doi : 10.1016/S0960-9822(03)00454-8 . — PMID 12867035 .
  17. ↑ Xia ZB, Anderson M., Diaz MO, Zeleznik-Le NJ MLL-repressionsdomæne interagerer med histon-deacetylaser, polycomb-gruppeproteinerne HPC2 og BMI-1 og corepressor C-terminal-bindende protein  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : tidsskrift. - 2003. - Juli ( bind 100 , nr. 14 ). - P. 8342-8347 . - doi : 10.1073/pnas.1436338100 . — PMID 12829790 .
  18. ↑ Castet A., Boulahtouf A., Versini G., Bonnet S., Augereau P., Vignon F., Khochbin S., Jalaguier S., Cavaillès V. Flere domæner af Receptor-Interacting Protein 140 bidrager til transkriptionshæmning  ( engelsk)  // Nucleic Acids Res. : journal. - 2004. - Bd. 32 , nr. 6 . - P. 1957-1966 . doi : 10.1093 / nar/gkh524 . — PMID 15060175 .
  19. ↑ Perissi V., Scafoglio C., Zhang J., Ohgi KA, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG TBL1 og TBLR1 Phosphorylation on Regulated Gen Promoters Overcomes Dual CtBP and NCoR/SMRT transcriptional repression checkpoints   // Mol . celle : journal. - 2008. - Marts ( bind 29 , nr. 6 ). - S. 755-766 . - doi : 10.1016/j.molcel.2008.01.020 . — PMID 18374649 .
  20. ↑ Alpatov R., Munguba GC, Caton P., Joo JH, Shi Y., Shi Y., Hunt ME, Sugrue SP Nuclear Speckle-Associated Protein Pnn/DRS binder til den transkriptionelle korepressor CtBP og lindrer CtBP-medieret undertrykkelse af E-Cadherin Gene  (engelsk)  // Mol. celle. Biol. : journal. - 2004. - December ( bind 24 , nr. 23 ). - S. 10223-10235 . - doi : 10.1128/MCB.24.23.10223-10235.2004 . — PMID 15542832 .
  21. ↑ Li S., Chen PL, Subramanian T., Chinnadurai G., Tomlinson G., Osborne CK, Sharp ZD, Lee WH Binding af CtIP til BRCT-gentagelserne af BRCA1 involveret i transkriptionsreguleringen af ​​p21 afbrydes ved DNA-skade  ( engelsk)  // J. Biol. Chem.  : journal. - 1999. - April ( bd. 274 , nr. 16 ). - S. 11334-11338 . doi : 10.1074 / jbc.274.16.11334 . — PMID 10196224 .

Litteratur