SIN3B

Medlem B af SIN3-familien af transkriptionelle regulatorer

FBF er baseret på 1e91.

Tilgængelige strukturer

Ortholog søgning: PDBe , RCSB

Liste over PDB-id'er
1e91 , 1pd7 , 2cr7 , 2czy , 2f05

Identifikatorer

Symbol

SIN3B ; KIAA0700

Eksterne ID'er

OMIM: 607777 MGI : 107158 HomoloGene : 81810 GeneCards : SIN3B Gene

Gen-ontologi
Fungere	• kromatinbinding • transskription corepressor aktivitet • proteinbinding
celle komponent	• Xkromosom • Y-kromosom • XY-legeme • kerne • nukleoplasma • cytoplasma • autosome
biologisk proces	• transkription, DNA-templeret • udvikling af skeletmuskelvæv • cellulær lipid metabolisk proces • lille molekyle metabolisk proces • negativ regulering af transkription, DNA-templeret • rytmisk proces • udvikling af hjertemuskelvæv
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
16,94 – 16,99 Mb

Chr 8:
72,72 – 72,76 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

SIN3B ( Pared amphipathic helix protein Sin3a ) er et protein kodet i mennesker af SIN3B genet [1] [2] .

Interaktioner med andre proteiner

SIN3B har vist sig at interagere med HDAC1 [3] [4] , zink finger og BTB domæne indeholdende protein 16 [5] , SUDS3 [6] og IKZF1 [4] [7] .

Noter

↑ Ishikawa K., Nagase T., Suyama M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. Forudsigelse af de kodende sekvenser af uidentificerede humane gener. X. De komplette sekvenser af 100 nye cDNA-kloner fra hjernen, som kan kode for store proteiner in vitro // DNA Res : journal. - 1998. - December ( bind 5 , nr. 3 ). - S. 169-176 . - doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . — PMID 9734811 .
↑ Entrez-gen: SIN3B SIN3-homolog B, transkriptionsregulator (gær) . Arkiveret fra originalen den 5. december 2010. (ubestemt)
↑ Zhang, Y; NgHH; Erdjument Bromage H; TempstP; Fugl A; Reinberg D. Analyse af NuRD-underenhederne afslører et histon-deacetylase-kernekompleks og en forbindelse med DNA-methylering // Genes Dev . : journal. - USA, 1999. - August ( bind 13 , nr. 15 ). - S. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
↑ 1 2 Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Undertrykkelse af Ikaros og Aiolos er medieret gennem histon-deacetylase-komplekser (engelsk) // EMBO J. : journal. - ENGLAND, 1999. - Juni ( bind 18 , nr. 11 ). - S. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
↑ David, G; Alland L; Hong S.H.; Wong CW; DePinho RA; Dejean A. Histon-deacetylase associeret med mSin3A medierer undertrykkelse af det akut promyelocytiske leukæmi-associeret PLZF- protein // Onkogen : journal. - ENGLAND, 1998. - Maj ( bind 16 , nr. 19 ). - P. 2549-2556 . — ISSN 0950-9232 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
↑ Alland, Leila; David Gregory, Shen-Li Hong, Potes Jason, Muhle Rebecca, Lee Hye-Chun, Hou Harry, Chen Ken, DePinho Ronald A. Identifikation af Mammalian Sds3 som en integreret komponent af Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex / Mol. celle. Biol. : journal. - USA, 2002. - April ( vol. 22 , nr. 8 ). - P. 2743-2750 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
↑ Koipally, Joseph; Georgopoulos Katia. En molekylær dissektion af undertrykkelseskredsløbet i Ikaros // J. Biol. Chem. : journal. - USA, 2002. - August ( vol. 277 , nr. 31 ). - P. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .

Litteratur

Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN Mad-Max transkriptionel undertrykkelse medieres af ternær kompleksdannelse med pattedyrshomologer af gærrepressor Sin3 // Cell : journal. - Cell Press , 1995. - Vol. 80 , nr. 5 . - s. 767-776 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . — PMID 7889570 .
David G., Alland L., Hong SH, et al. Histon-deacetylase associeret med mSin3A medierer undertrykkelse af det akutte promyelocytiske leukæmi-associeret PLZF- protein // Onkogen : journal. - 1998. - Bd. 16 , nr. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Undertrykkelse af Ikaros og Aiolos er medieret gennem histon-deacetylase-komplekser // EMBO J. : journal. - 1999. - Bd. 18 , nr. 11 . - S. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
Naruse Y., Aoki T., Kojima T., Mori N. Neural restriktiv lyddæmperfaktor rekrutterer mSin3 og histondeacetylasekompleks til at undertrykke neuronspecifikke målgener // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2000. - Vol. 96 , nr. 24 . - P. 13691-13696 . - doi : 10.1073/pnas.96.24.13691 . — PMID 10570134 .
Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, et al. Mad1-Sin3B-interaktionen involverer en ny spiralformet fold // Nat . Struktur. Biol. : journal. - 2001. - Bd. 7 , nr. 12 . - S. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
Spronk CA, Jansen JF, Tessari M., et al. Sekvensspecifik tildeling af PAH2-domænet af Sin3B frit og bundet til Mad1 // J. Biomol . NMR : journal. - 2001. - Bd. 19 , nr. 4 . - s. 377-378 . - doi : 10.1023/A:1011262214741 . — PMID 11370785 .
Alland L., David G., Shen-Li H., et al. Identifikation af pattedyr Sds3 som en integreret komponent af Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex // Mol . celle. Biol. : journal. - 2002. - Bd. 22 , nr. 8 . - P. 2743-2750 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
Rayman JB, Takahashi Y., Indian VB, et al. E2F medierer cellecyklusafhængig transkriptionel undertrykkelse in vivo ved rekruttering af et HDAC1/mSin3B corepressorkompleks // Genes Dev. : journal. - 2002. - Bd. 16 , nr. 8 . - S. 933-947 . - doi : 10.1101/gad.969202 . — PMID 11959842 .
Koipally J., Georgopoulos K. En molekylær dissektion af undertrykkelseskredsløbet i Ikaros // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Bd. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
Yang L., Mei Q., Zielinska-Kwiatkowska A., et al. En ERG (ets-relateret gen)-associeret histonmethyltransferase interagerer med histon-deacetylaser 1/2 og transkriptionsco-repressorer mSin3A/B // Biochem . J. : journal. - 2003. - Bd. 369 , nr. Pt 3 . - s. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. Generering og indledende analyse af mere end 15.000 fuldlængde humane og muse cDNA-sekvenser // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Bd. 99 , nr. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Petrie K., Guidez F., Howell L., et al. Histon-deacetylase 9-genet koder for flere proteinisoformer // J. Biol. Chem. : journal. - 2003. - Bd. 278 , nr. 18 . - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, et al. Human Sin3 deacetylase og trithorax-relateret Set1/Ash2 histon H3-K4 methyltransferase er bundet sammen selektivt af celleproliferationsfaktoren HCF-1 // Genes Dev . : journal. - 2003. - Bd. 17 , nr. 7 . - S. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Komplet sekventering og karakterisering af 21.243 fuldlængde humane cDNA'er // Nat . Genet. : journal. - 2004. - Bd. 36 , nr. 1 . - S. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Dugast-Darzacq C., Pirity M., Blanck JK, et al. Mxi1- SRalpha : en ny Mxi1 isoform med forbedret transkriptionelt undertrykkelsespotentiale // Onkogen : journal. - 2004. - Bd. 23 , nr. 55 . - P. 8887-8899 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208107 . — PMID 15467743 .
Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA, et al. Status, kvalitet og udvidelse af NIH fuldlængde cDNA-projektet: Mammalian Gene Collection (MGC ) // Genome Res. : journal. - 2004. - Bd. 14 , nr. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Rampalli S., Pavithra L., Bhatt A., et al. Tumorsuppressor SMAR1 medierer Cyclin D1-undertrykkelse ved rekruttering af SIN3/Histone-deacetylase 1-komplekset // Mol . celle. Biol. : journal. - 2005. - Bd. 25 , nr. 19 . - P. 8415-8429 . - doi : 10.1128/MCB.25.19.8415-8429.2005 . — PMID 16166625 .
Xu Y., Sengupta PK, Seto E., Smith BD RFX-familieproteiner interagerer differentielt med HDAC'er for at undertrykke kollagen alfa 2(I) gen (COL1A2) ekspression (engelsk) // J. Biol. Chem. : journal. - 2006. - Bd. 281 , nr. 14 . - P. 9260-9270 . - doi : 10.1074/jbc.M511724200 . — PMID 16464847 .