Histon deacetylase 5

Identifikatorer

HDAC5 ; HD5; NY-CO-9

Eksterne ID'er

OMIM: 605315 MGI : 1333784 Homologen : 3995 IUPHAR : ChEMBL : 2563 GeneCards : HDAC5-gen

3.5.1.98

Gen-ontologi
Fungere	• transskription corepressor aktivitet • histondeacetylaseaktivitet • proteinkinase C-binding • proteinbinding • transkriptionsfaktorbinding • NAD-afhængig histon-deacetylaseaktivitet (H3-K14-specifik) • transkriptionsregulerende region DNA-binding • metalionbinding • NAD-afhængig histon-deacetylaseaktivitet (H3-K9) specifik) • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H4-K16-specifik) • undertrykker transkriptionsfaktorbinding • NAD-afhængig histon-deacetylase-aktivitet (H3-K18-specifik)
celle komponent	• histon deacetylase kompleks • kerne • nukleoplasma • nukleolus • cytoplasma • Golgi-apparat • cytosol • nuklear krop
biologisk proces	• negativ regulering af transkription fra RNA-polymerase II-promotor • osteoblastudvikling • kromatinorganisation • kromatinremodellering • kromatindæmpning • transkription, DNA- templeret • inflammatorisk respons • Notch-signalvej • hjerteudvikling • regulering af myotubedifferentiering • negativ regulering af myotubedifferentiering • kromatinmodifikation • histoncelledifferentiering • Bhistoncelledifferentiering cellulær respons på insulinstimulus • multicellulær organismerespons på stress • B-celleaktivering • respons på kokain • respons på lægemiddel • regulering af proteinbinding • negativ regulering af osteoblastdifferentiering • negativ regulering af transkription, DNA-templeret • positiv regulering af transkription fra RNA polymerase II-promotor • regulering af skeletmuskelfiberudvikling • positiv regulering af sekvensspecifik DNA-bindende transkriptionsfaktoraktivitet • histon H3 deacetylering • histon H4 deacetylering • negativ regulering af cellemigration involveret i spirende angiogenese
Kilder: Amigo / QuickGO

RNA-ekspressionsprofil

Mere information

ortologer

Udsigt

Human

Mus

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 17:
42,15 - 42,2 Mb

Chr 11:
102,19 – 102,23 Mb

Søg i PubMed

[en]

[2]

Histondeacetylase 5 er et enzym kodet i mennesker af HDAC5 -genet [1] [2] [3] .

Funktion

Histoner spiller en afgørende rolle i reguleringen af transkription , cellecyklus og udviklingshændelser. Acetylering/deacetylering af histoner ændrer den kromosomale struktur og påvirker transkriptionsfaktorers adgang til DNA . Proteinet kodet af dette gen tilhører klasse II af histon-deacetylase /acuc/Apha-familien. Det har histondeacetylases evne til at undertrykke transkription , når det er bundet til en promotor . Det interagerer også med myocyte enhancer factor-2 (MEF2) proteiner, hvilket resulterer i undertrykkelse af MEF2-afhængige gener. Disse gener menes at være forbundet med tyktarmskræft. To varianter af transkripter, der koder for forskellige isoformer , blev fundet for dette gen [3] .

AMP-aktiveret proteinkinase regulerer glukosetransportøren GLUT4 ved phosphorylering ved HDAC5 [4] .

HDAC5 er involveret i hukommelseskonsolidering og foreslår, at HDAC5-målretning [5] bør undgås ved udvikling af HDAC-hæmmere med større selektivitet til behandling af Alzheimers sygdom .

Interaktioner

Histon deacetylase 5 har vist sig at interagere med:

BCL6 [6] ,
CBX5 [7] ,
GATA1 [8] ,
HDAC3 [9] [10] [11] [12] ,
IKZF1 [13] ,
MEF2A [14] ,
NRIP1 [15] ,
NCOR1 [10] [16] ,
NCOR2 [16] ,
YWHAQ [17] og
ZBTB16 [6] [18] .

Se også

Histon deacetylase

Noter

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tre proteiner definerer en klasse af humane histon-deacetylaser relateret til gær Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - Juni ( bind 96 , nr. 9 ). - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B., Gure AO, Stockert E., Gordan JD, Tureci O., Sahin U., Pfreundschuh M., Old LJ Karakterisering af humane tyktarmskræftantigener genkendt af autologe antistoffer // Int J Cancer : journal. - 1998. - Juni ( bind 76 , nr. 5 ). - S. 652-658 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P . — PMID 9610721 .
↑ 1 2 Entrez-gen: HDAC5-histondeacetylase 5 . (ubestemt)
↑ McGee SL, van Denderen BJ, Howlett KF, Mollica J., Schertzer JD, Kemp BE, Hargreaves M. AMP-aktiveret proteinkinase regulerer GLUT4-transkription ved at fosforylere histondeacetylase 5 // Diabetes ( journal) : journal. - 2008. - Bd. 57 , nr. 4 . - S. 860-867 . - doi : 10.2337/db07-0843 . — PMID 18184930 .
↑ Agis-Balboa RC, Pavelka Z., Kerimoglu C., Fischer A. Tab af HDAC5 forringer hukommelsesfunktionen: implikationer for Alzheimers sygdom // J Alzheimers Dis : journal. - 2013. - Januar ( bind 33 , nr. 1 ). - S. 35-44 . - doi : 10.3233/JAD-2012-121009 . — PMID 22914591 .
↑ 1 2 Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Klasse II histondeacetylaser rekrutteres direkte af BCL6 transkriptionel repressor (engelsk) // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Bd. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
↑ Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN Association of class II histon deacetylases with heterochromatin protein 1: potentiel rolle for histon methylation in control of muscle differentiation // Mol . celle. Biol. : journal. - 2002. - Bd. 22 , nr. 20 . - P. 7302-7312 . - doi : 10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
↑ Watamoto K., Towatari M., Ozawa Y., Miyata Y., Okamoto M., Abe A., Naoe T., Saito H. Ændret interaktion mellem HDAC5 og GATA-1 under MEL- celledifferentiering // Onkogen : journal. - 2003. - Bd. 22 , nr. 57 . - P. 9176-9184 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206902 . — PMID 14668799 .
↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tre proteiner definerer en klasse af humane histon-deacetylaser relateret til gær Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - Bd. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ 1 2 Zhang J., Kalkum M., Chait BT, Roeder RG N-CoR-HDAC3-kernereceptor-corepressorkomplekset hæmmer JNK-vejen gennem den integrerede underenhed GPS2 // Mol . celle : journal. - 2002. - Bd. 9 , nr. 3 . - s. 611-623 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00468-9 . — PMID 11931768 .
↑ Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Enzymatisk aktivitet forbundet med klasse II HDAC'er er afhængig af et multiproteinkompleks indeholdende HDAC3 og SMRT/N- CoR // Mol. celle : journal. - 2002. - Bd. 9 , nr. 1 . - S. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
↑ Grozinger CM, Schreiber SL Regulering af histon-deacetylase 4 og 5 og transkriptionel aktivitet ved 14-3-3-afhængig cellulær lokalisering // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2000. - Vol. 97 , nr. 14 . - P. 7835-7840 . - doi : 10.1073/pnas.140199597 . — PMID 10869435 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. En molekylær dissektion af Ikaros' undertrykkelseskredsløb // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Bd. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
↑ Lemercier C., Verdel A., Galloo B., Curtet S., Brocard MP, Khochbin S. mHDA1/HDAC5 histon deacetylase interagerer med og undertrykker MEF2A transkriptionel aktivitet // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
↑ Castet A., Boulahtouf A., Versini G., Bonnet S., Augereau P., Vignon F., Khochbin S., Jalaguier S., Cavaillès V. Flere domæner af Receptor-Interacting Protein 140 bidrager til transkriptionshæmning ( engelsk) // Nucleic Acids Res. : journal. - 2004. - Bd. 32 , nr. 6 . - P. 1957-1966 . doi : 10.1093 / nar/gkh524 . — PMID 15060175 .
↑ 1 2 Huang EY, Zhang J., Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T., Lazar MA Nuclear receptor corepressors partner with class II histon deacetylases in a Sin3-udependent repression pathway (Eng.) // Genes Dev. : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 45-54 . — PMID 10640275 .
↑ Vega RB, Harrison BC, Meadows E., Roberts CR, Papst PJ, Olson EN, McKinsey TA Proteinkinaser C og D medierer agonist-afhængig hjertehypertrofi gennem nuklear eksport af histon-deacetylase 5 // Mol . celle. Biol. : journal. - 2004. - Bd. 24 , nr. 19 . - P. 8374-8385 . - doi : 10.1128/MCB.24.19.8374-8385.2004 . — PMID 15367659 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 medierer transkriptionel undertrykkelse af det akutte promyelocytiske leukæmi-associeret protein PLZF . ) / / Onkogen : journal. - 2004. - Bd. 23 , nr. 54 . - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Litteratur

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Klasse II histon-deacetylaser: alsidige regulatorer // Trends Genet . : journal. - 2003. - Bd. 19 , nr. 5 . - S. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Huang EY; Zhang J; Miska EA; Guenther, M.G.; Kouzarides, T; Lazar, MA Nuklear receptor corepressorer samarbejder med klasse II histon deacetylaser i en Sin3-uafhængig repressionsvej // Genes Dev . : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - S. 45-54 . — PMID 10640275 .
Lemercier C; Verdel A; Galloo B; Curtet, S; Brocard, MP; Khochbin, S. mHDA1/HDAC5 histon deacetylase interagerer med og undertrykker MEF2A transkriptionel aktivitet // J. Biol. Chem. : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
Grozinger CM, Schreiber SL Regulering af histon-deacetylase 4 og 5 og transkriptionel aktivitet ved 14-3-3-afhængig cellulær lokalisering (engelsk) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2000. - Vol. 97 , nr. 14 . - P. 7835-7840 . - doi : 10.1073/pnas.140199597 . — PMID 10869435 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, en ny corepressor involveret i BCL-6-undertrykkelse // Genes Dev . : journal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 14 . - S. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
Mahlknecht U ; Schnittger S; Ottmann OG; Schoch, C; Mosebach, M; Hiddemann, W; Hoelzer, D. Kromosomal organisation og lokalisering af det humane histondeacetylase 5-gen (HDAC5 ) // Biochim. Biofys. Acta : journal. - 2000. - Vol. 1493 , nr. 3 . - S. 342-348 . - doi : 10.1016/S0167-4781(00)00191-3 . — PMID 11018260 .
Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Association of COOH-terminal-binding protein (CtBP) and MEF2-interacting transcription repressor (MITR) bidrager til transkriptionel undertrykkelse af MEF2-transkriptionsfaktoren // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Bd. 276 , nr. 1 . - S. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
McKinsey TA, Zhang CL, Lu J., Olson EN Signalafhængig nuklear eksport af en histondeacetylase regulerer muskeldifferentiering // Nature . - 2000. - Vol. 408 , nr. 6808 . - S. 106-111 . - doi : 10.1038/35040593 . — PMID 11081517 .
McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN Aktivering af myocyt enhancer factor-2 transkriptionsfaktoren ved calcium/calmodulin-afhængig proteinkinase-stimuleret binding af 14-3-3 til histon deacetylase 5 // Proceedings of the National Academy of Sciences of the National Academy of Sciences. Amerikas Forenede Stater : tidsskrift. - 2001. - Bd. 97 , nr. 26 . - P. 14400-14405 . - doi : 10.1073/pnas.260501497 . — PMID 11114197 .
Fischle W; Dequiedt F; Fillion M; Hendzel, MJ; Voelter, W; Verdin, E. Human HDAC7 histon deacetylase aktivitet er forbundet med HDAC3 in vivo // J. Biol. Chem. : journal. - 2001. - Bd. 276 , nr. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN Identifikation af en signalresponsiv nuklear eksportsekvens i klasse II histondeacetylaser // Mol . celle. Biol. : journal. - 2001. - Bd. 21 , nr. 18 . - P. 6312-6321 . - doi : 10.1128/MCB.21.18.6312-6321.2001 . — PMID 11509672 .
Ozawa Y; Towatari M; Tsuzuki S; Hayakawa, F; Maeda, T; Miyata, Y; Tanimoto, M; Saito, H. Histon deacetylase 3 associerer med og undertrykker transkriptionsfaktoren GATA- 2 // Blod : journal. — American Society of Hematology, 2001. - Vol. 98 , nr. 7 . - S. 2116-2123 . - doi : 10.1182/blod.V98.7.2116 . — PMID 11567998 .
Potter GB; Beaudoin GM; Derenzo CL; Zarach, JM; Chen, S.H.; Thompson, CC Det hårløse gen muteret i medfødte hårtabssygdomme koder for en ny nuklear receptor corepressor // Genes Dev . : journal. - 2001. - Bd. 15 , nr. 20 . - P. 2687-2701 . - doi : 10.1101/gad.916701 . — PMID 11641275 .
Fischle W; Dequiedt F; Henzel MJ; Guenther, Matthew G; Lazar, Mitchell A; Voelter, Wolfgang; Verdin, Erik. Enzymatisk aktivitet forbundet med klasse II HDAC'er er afhængig af et multiproteinkompleks indeholdende HDAC3 og SMRT/N-CoR // Mol . celle : journal. - 2002. - Bd. 9 , nr. 1 . - S. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
Lemercier C; Brocard MP; Puvion-Dutilleul F; Kao, HY; Albagli, O; Khochbin, S. Klasse II histondeacetylaser rekrutteres direkte af BCL6 transkriptionel repressor // J. Biol. Chem. : journal. - 2002. - Bd. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
Huang Y; Tan M; Gosink M; Wang, KK; Sun, Y. Histon-deacetylase 5 er ikke et p53-målgen, men dets overekspression hæmmer tumorcellevækst og inducerer apoptose , Cancer Res . : journal. - 2002. - Bd. 62 , nr. 10 . - S. 2913-2922 . — PMID 12019172 .