Fag T4

Fag T4
Strukturen af ​​T4-fagen
videnskabelig klassifikation
Gruppe:Virus [2]Rige:DuplodnaviriaKongerige:HeunggongviraeType:UroviricotaKlasse:CaudoviricetesBestille:CaudoviralesFamilie:MyovirusUnderfamilie:TevenvirinaeSlægt:TequatrovirusUdsigt:Fag T4
Internationalt videnskabeligt navn
Escherichia virus T4
Synonymer
ifølge ICTV [3] : Kolifag T2 Kolifag T4 Kolifag T6 Enterobakteriefag C16 Enterobakteriefag PST Enterobakteriefag T4 Fase C16 Fag PST
Baltimore-gruppen
I: dsDNA-vira
Systematik hos Wikispecies Billeder på Wikimedia Commons

Fag T4 [4] ( Escherichia virus T4 ,  tidligere Enterobacteria fag T4 ) er en af ​​de mest undersøgte vira , en bakteriofag , der inficerer enterobakterier , herunder Escherichia coli . Den har genomisk DNA i størrelsesordenen 169-170 tusinde basepar, pakket ind i et icosaedrisk hoved [5] . Virionet har også en stilk, stængelbase og stængelprocesser - seks lange og seks korte.

T4-fagen anvender en DNA-polymerase af cirkulær type ; dens glidende manchet er en trimer, der ligner PCNA , men den deler ingen homologi med hverken PCNA eller polymerase β.

T4 er en relativt stor fag, omkring 90 nm i diameter og omkring 200 nm lang. Virussen bruger kun den lytiske udviklingscyklus, men ikke den lysogene [6] .

Nobelprisvinderne Max Delbrück , Salvador Luria , Alfred Hershey , James Watson og Francis Crick , samt andre berømte videnskabsmænd - Michael Rossmann , Vadim Mesyanzhinov , Fumio Arisaka , Seymour Benzer , Bruce Alberts arbejdede med T4-fager eller lignende bakteriofager .

I 2016 ændrede T4, ligesom andre bakteriofager, sit videnskabelige navn til Escherichia virus T4 [7] .

Litteratur

• Proteinsamling T4 (animation)
• Leiman, PG, Kanamaru, S., Mesyanzhinov, VV, Arisaka, F., og Rossmann, MG, "Struktur og morfogenese af bakteriofag T4." [en]
• Karam, J., Petrov, V., Nolan, J., Chin, D., Shatley, C., Krisch, H. og Letarov, A. Det T4-lignende fags genomprojekt. https://web.archive.org/web/20070523215704/http://phage.bioc.tulane.edu/ . (Den T4-lignende fag fuld genomisk sekvensdepot)
• Mosig, G. og F. Eiserling. 2006. T4 og beslægtede fager: struktur og udvikling, R. Calendar og ST Abedon (red.), The Bacteriophages. Oxford University Press, Oxford. (Anmeldelse af fag T4 biologi) ISBN 0-19-514850-9
• Filee J. Tetart F., Suttle CA, Krisch HM Marine T4-type bakteriofager, en allestedsnærværende bestanddel af det mørke stof i biosfæren   // Proc . Natl. Acad. sci. USA: tidsskrift. - 2005. - Bd. 102 , nr. 35 . - P. 12471-12476 . - doi : 10.1073/pnas.0503404102 . — PMID 16116082 . (Indikation af prævalens og T4-lignende fager i naturen)
• Chibani-Chennoufi S., Canchaya C., Bruttin A., Brussow H. Komparativ genomik af den T4-lignende Escherichia coli - fag JS98: implikationer for udviklingen af ​​T4-fager  //  Journal of Bacteriology : journal. - 2004. - Bd. 186 , nr. 24 . - P. 8276-8286 . - doi : 10.1128/JB.186.24.8276-8286.2004 . — PMID 15576776 . (Karakterisering af en T4-lignende fag)
• Desplats C., Krisch HM Diversiteten og udviklingen af ​​T4-type bakteriofager  (engelsk)  // Res. mikrobiol. : journal. - 2003. - Maj ( bd. 154 , nr. 4 ). - S. 259-267 . - doi : 10.1016/S0923-2508(03)00069-X . — PMID 12798230 .
• Miller, ES, Kutter E., Mosig G., Arisaka F., Kunisawa T., Ruger W. Bacteriophage T4-genom  (neopr.)  // Microbiol. Mol. Biol. Rev.. - 2003. - T. 67 , nr. 1 . - S. 86-156 . - doi : 10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003 . — PMID 12626685 . (Anmeldelse af fag T4, set fra dets genom)
• Desplats C., Dez C., Tetart F., Eleaume H., Krisch HM Øjebliksbillede af genomet af pseudo-T-even bakteriofagen RB49  //  Journal of Bacteriology : journal. - 2002. - Bd. 184 , nr. 10 . - P. 2789-2804 . - doi : 10.1128/JB.184.10.2789-2804.2002 . — PMID 11976309 . (Oversigt over RB49-genomet, en T4-lignende fag)
• Malys N., Chang DY, Baumann RG, Xie D., Black LW En bipartit bakteriofag T4 SOC og HOC randomiseret peptid display bibliotek: påvisning og analyse af fag T4 terminase (gp17) og sen sigma faktor (gp55)  interaktion  // J Mol Biol: journal. - 2002. - Bd. 319 , nr. 2 . - S. 289-304 . - doi : 10.1016/S0022-2836(02)00298-X . — PMID 12051907 . (T4 faganvendelse i bioteknologi til undersøgelse af proteininteraktion)
• Tétart F., Desplats C.  ,  Kutateladze M., Monod C., Ackermann H.-W., Krisch HM . : journal. - 2001. - Bd. 183 , nr. 1 . - S. 358-366 . - doi : 10.1128/JB.183.1.358-366.2001 . — PMID 11114936 . (Indikation af forekomsten af ​​T4-type sekvenser i naturen)
• Abedon ST Den skumle oprindelse af Snehvide og hendes T-lige dværge  //  Genetics: journal. - 2000. - Vol. 155 , nr. 2 . - S. 481-486 . — PMID 10835374 . (Historisk beskrivelse af isoleringen af ​​de T4-lignende fag T2, T4 og T6)
• Ackermann HW, Krisch HM Et katalog over T4-type bakteriofager  (neopr.)  // Arch. Virol .. - 1997. - T. 142 , nr. 12 . - S. 2329-2345 . - doi : 10.1007/s007050050246 . — PMID 9672598 . Arkiveret fra originalen den 1. november 2001. (Næsten komplet liste over dengang kendte T4-lignende fager)
• Monod C., Repoila F., Kutateladze M., Tétart F., Krisch HM Genomet af pseudo T-even bakteriofager, en mangfoldig gruppe, der ligner T4  //  J. Mol. Biol. : journal. - 1997. - Marts ( bd. 267 , nr. 2 ). - S. 237-249 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0867 . — PMID 9096222 . (Oversigt over forskellige T4-lignende fager fra deres genoms perspektiv)
• Kutter E., Gachechiladze K., Poglazov A., Marusich E., Shneider M., Aronsson P., Napuli A., Porter D., Mesyanzhinov V. Udvikling af T4-relaterede fager  (neopr.)  // Virusgener. - 1995. - T. 11 , nr. 2-3 . - S. 285-297 . - doi : 10.1007/BF01728666 . — PMID 8828153 .  (ikke tilgængeligt link) (Sammenligning af genomerne af forskellige T4-lignende fager)
• Karam, JD et al. 1994. Molecular Biology of Bacteriophage T4. ASM Press, Washington, DC. (Den anden T4-bibel, gå her, såvel som Mosig og Eiserling, 2006, for at begynde at lære om den biologiske T4-fag) ISBN 1-55581-064-0
• Eddy, S.R. 1992. Introns in the T-Even Bacteriophages. Ph.D. afhandling. University of Colorado i Boulder. (Kapitel 3 giver en oversigt over forskellige T4-lignende fager samt isolering af dengang nye T4-lignende fager)
• Mathews, CK, EM Kutter, G. Mosig og PB Berget. 1983. Bakteriofag T4. American Society for Microbiology, Washington, DC. (Den første T4-bibel; ikke al information her er duplikeret i Karam et al. , 1994; se især det indledende kapitel af Doermann for en historisk oversigt over de T4-lignende fager) ISBN 0-914826-56-5
• Russell, R.L. 1967. Speciation Blandt T-Even Bacteriophages. Ph.D. afhandling. California Institute of Technology. (Isolering af RB-serien af ​​T4-lignende fager)
• Kay D., Fildes P. Hydroxymethylcytosin-holdige og tryptofan-afhængige bakteriofager isoleret fra byspildevand  //  J. Gen. mikrobiol. : journal. - 1962. - Bd. 27 . - S. 143-146 . — PMID 14454648 . (T4-lignende fagisolering, inklusive den for fag Ox2)

Noter

1. ↑ Victor Padilla Sanchez. Strukturel model af bakteriofag T4  // WikiJournal of Science. - 2021. - Vol. 4 , nr. 1 . - S. 5 . - doi : 10.15347/WJS/2021.005 . Arkiveret fra originalen den 28. april 2022.
2. ↑ Taxonomy of Viruses  på webstedet International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
3. ↑ ICTV Taxonomy History: Escherichia virus T4 på ICTV-webstedet  ( Adgang  30. april 2019) .
4. ↑ Pinevich A.V. , Sirotkin A.K. , Gavrilova O.V. , Potekhin A.A. Virologi: lærebog. - Sankt Petersborg.  : St. Petersburg University Press, 2012. - S. 177. - ISBN 978-5-288-05328-3 .
5. ↑ Eric S. Miller, Elizabeth Kutter, Gisela Mosig, Fumio Arisaka, Takashi Kunisawa. Bakteriofag T4-genom  // Mikrobiologi og molekylærbiologi anmeldelser: MMBR. - 2003. - T. 67 , no. 1 . - s. 86-156, indholdsfortegnelse . — ISSN 1092-2172 . - doi : 10.1128/MMBR.67.1.86-156.2003 . Arkiveret fra originalen den 20. august 2018.
6. ↑ HW Ackermann, HM Krisch. Et katalog over T4-type bakteriofager  // Archives of Virology. - 1997. - T. 142 , no. 12 . - S. 2329-2345 . — ISSN 0304-8608 . Arkiveret fra originalen den 29. juni 2018.
7. ↑ For at omdøbe alle (522) eksisterende bakterievirus og 2 arkæiske virusarter  : [ eng. ]  : [ bue. 30. april 2019 ] // ICTV. — Kode tildelt: 2015.025aB. - 2015. - 18 s.

Ordbøger og encyklopædier	Britannica (online)
Taksonomi	IRMNG